<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5477 bps / non-identical: 450 bps

Full alignment

CU464032.8	1	AAGCTTGTCATTCATTCCTTTTGACAGGCATATCAGCTTCCTGATTATAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171211	AAGCTTGTCATTCATTCCTTTTGACAGGCATATCAGCTTCCTGATTATAT	171260

CU464032.8	51	TAATTTTGATTGGAATACTAACACCAGCTTCATGGAGCTCCCCTTCACTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171261	TAATTTTGATTGGAATACTAACACCAGCTTCATGGAGCTCCCCTTCACTC	171310

CU464032.8	101	TGCCCACTCCAGAAAAGGTGTATCCAGCTCCAACTTCAGTAAGCTGGCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171311	TGCCCACTCCAGAAAAGGTGTATCCAGCTCCAACTTCAGTAAGCTGGCCT	171360

CU464032.8	151	TCATTTGCCAATCTTGTTTCACTCAGGGCTACAATTTAGATGTGATACCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171361	TCATTTGCCAATCTTGTTTCACTCAGGGCTACAATTTAGATGTGATACCT	171410

CU464032.8	201	GTTGAGTTCTATTGCAACAAGAGTAGCTTTTCTTTCAGGTTGACTGGTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171411	GTTGAGTTCTATTGCAACAAGAGTAGCTTTTCTTTCAGGTTGACTGGTTT	171460

CU464032.8	251	TTCTGTTGTCTATTAGTGTGTGCATGTTCCATGTGCTACGGTAAGTGGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171461	TTCTGTTGTCTATTAGTGTGTGCATGTTCCATGTGCTACGGTAAGTGGAA	171510

CU464032.8	301	TCATCTTTGCAGATGTTTTCGTACATTTTGTACATTGTTTTTTGTGTTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171511	TCATCTTTGCAGATGTTTTCGTACATTTTGTACATTGTTTTTTGTGTTTT	171560

CU464032.8	351	GATTGCATAGTGGAATTCTCTGCCTGCCACGGTAATCAGGCCAGGGTGGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171561	GATTGCATAGTGGAATTCTCTGCCTGCCACGGTAATCAGGCCAGGGTGGG	171610

CU464032.8	401	GTAAGCAGACAATGTTTAGGGCATCTTTTCTAGCCCCCTTCCTCACACCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171611	GTAAGCAGACAATGTTTAGGGCATCTTTTCTAGCCCCCTTCCTCACACCA	171660

CU464032.8	451	GGATGTGAGCAGTACAATCCTTAAAAGGTTGCTCAAACACCTAGGGACGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171661	GGATGTGAGCAGTACAATCCTTAAAAGGTTGCTCAAACACCTAGGGACGT	171710

CU464032.8	501	ACTGAGTTACACTGCTGCTTCCAGTGAGAAACGATTATATGACCTGGGCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171711	ACTGAGTTACACTGCTGCTTCCAGTGAGAAACGATTATATGACCTGGGCC	171760

CU464032.8	551	ATCTGTGTGCAGGGTTGTGACTATAGCCCCCAGTGTATCCACACCTGCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171761	ATCTGTGTGCAGGGTTGTGACTATAGCCCCCAGTGTATCCACACCTGCTG	171810

CU464032.8	601	TTTCATCATTTGCCCATCACCATAGGACTTTGAGGCATAATAGTGAAATG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171811	TTTCATCATTTGCCCATCACCATAGGACTTTGAGGCATAATAGTGAAATG	171860

CU464032.8	651	GTATGGGTGATGTCTTTTGATTCATGCATAAATTAGATTTTAAGTGAGGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171861	GTATGGGTGATGTCTTTTGATTCATGCATAAATTAGATTTTAAGTGAGGC	171910

CU464032.8	701	AGAGTTGCACGAGGTTGTCAGTCTCACTCTCTCCTCCAGAGTCATCATAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171911	AGAGTTGCACGAGGTTGTCAGTCTCACTCTCTCCTCCAGAGTCATCATAG	171960

CU464032.8	751	TCCAGTGACAGTCCAGAGTCAAGATGGCTGGTGATGGTTCAGGATGCAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	171961	TCCAGTGACAGTCCAGAGTCAAGATGGCTGGTGATGGTTCAGGATGCAGT	172010

CU464032.8	801	GGAAGACTTTGGCATCTTCAGTGTCTAACCAAGCTCTAAGTTCTCCACAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172011	GGAAGACTTTGGCATCTTCAGTGTCTAACCAAGCTCTAAGTTCTCCACAT	172060

CU464032.8	851	CTCCTGCTTGATCTGCCTTCTCGGTCATTGGAACAAATTTTTTTCATCCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172061	CTCCTGCTTGATCTGCCTTCTCGGTCATTGGAACAAATTTTTTTCATCCA	172110

CU464032.8	901	CCCATTCCACCACAGAAAGTTTTCACATGCTTGGGGTAGACATCCCCCTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172111	CCCATTCCACCACAGAAAGTTTTCACATGCTTGGGGTAGACATCCCCCTA	172160

CU464032.8	951	ACTCACCAATGGATTTGACAATCCTTGGTTACCCTCAACTTGATTTAGCC	1000
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172161	ACTCACCAATGGGTTTGACAATCCTTGGTTACCCTCAACTTGATTTAGCC	172210

CU464032.8	1001	TGTCTTTTGAAATGGTTTATCAGGTGTGGCCACTGCACATGCTGCAGTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172211	TGTCTTTTGAAATGGTTTATCAGGTGTGGCCACTGCACATGCTGCAGTTG	172260

CU464032.8	1051	CTTGGAGCCACAGGTGAGAGTTAGGTGGAACAGGTGGACACCAAAGGTGG	1100
			||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172261	CTTGGAGCCACAGGTGAGAATTAGGTGGAACAGGTGGACACCAAAGGTGG	172310

CU464032.8	1101	AAAGAGCCCCAAAAAGGACTTGGCAACCATCACACCAAAGGTACTTGTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172311	AAAGAGCCCCAAAAAGGACTTGGCAACCATCACACCAAAGGTACTTGTCC	172360

CU464032.8	1151	TCCCTGAACACACCCTACACCCCAGGTTTGCCACGCTGTAGTATGATTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172361	TCCCTGAACACACCCTACACCCCAGGTTTGCCACGCTGTAGTATGATTGG	172410

CU464032.8	1201	CAGTCAGGATGGAATTTTTGTCTTTTCTGCTTTCCACCCTCACAGGTAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172411	CAGTCAGGATGGAATTTTTGTCTTTTCTGCTTTCCACCCTCACAGGTAGT	172460

CU464032.8	1251	ATGAAAAGGTACTGAAGGAAGACACTGAGATTTAAATCCTAGGCAAACAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172461	ATGAAAAGGTACTGAAGGAAGACACTGAGATTTAAATCCTAGGCAAACAT	172510

CU464032.8	1301	TTGCCCAATGATGAATTGTGGGGAAAGAGGGGTTAAAAGGAGATGTAGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172511	TTGCCCAATGATGAATTGTGGGGAAAGAGGGGTTAAAAGGAGATGTAGCC	172560

CU464032.8	1351	TGAACTTCATTCAACTCACAAAACAGATCTTCTGGTTTGGGTGATTAGTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172561	TGAACTTCATTCAACTCACAAAACAGATCTTCTGGTTTGGGTGATTAGTG	172610

CU464032.8	1401	TTCTACCTCAACAGCTCTTTCTAGCTTTTTGCCCAAACTAGTTCCTCTTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172611	TTCTACCTCAACAGCTCTTTCTAGCTTTTTGCCCAAACTAGTTCCTCTTC	172660

CU464032.8	1451	TCCATTGCCCTGCCCCCATCATTTCCTTGTTCATTTACCATCCTCAAAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172661	TCCATTGCCCTGCCCCCATCATTTCCTTGTTCATTTACCATCCTCAAAGA	172710

CU464032.8	1501	AATTTCAGTTCCTCTTGAATTCCCCTGCTTGAAATGACAAGTTCAGTGTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172711	AATTTCAGTTCCTCTTGAATTCCCCTGCTTGAAATGACAAGTTCAGTGTC	172760

CU464032.8	1551	CATTCCATGCTCTTTGATGAAGTCAGAAGGGGAAAAAGGAAGACCCAAGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172761	CATTCCATGCTCTTTGATGAAGTCAGAAGGGGAAAAAGGAAGACCCAAGC	172810

CU464032.8	1601	AGCACGGTGCCCTGCTTGGTTTCTATTATGTGGTCTCAGGGTAGAAGTTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172811	AGCACGGTGCCCTGCTTGGTTTCTATTATGTGGTCTCAGGGTAGAAGTTC	172860

CU464032.8	1651	AAAAGAACACCAATCTTTTTCTCTTGTAATTCTTTAGAGAAAACATTTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172861	AAAAGAACACCAATCTTTTTCTCTTGTAATTCTTTAGAGAAAACATTTTT	172910

CU464032.8	1701	CCCCAATTTTGTAAAAGGCAAGTCAAACGCAAATTTTTGATAATTATAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
CU463175.2	172911	CCCCAATTTTGTAAAAGGCAAGTCAAACGCAAATTTTTGGTAATTATAAA	172960

CU464032.8	1751	AGATTGACCCATTACAGGTGTGGGGACTAGAAGTCCCTCCCTCTGTAAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172961	AGATTGACCCATTACAGGTGTGGGGACTAGAAGTCCCTCCCTCTGTAAAG	173010

CU464032.8	1801	AAGGATCTTGGAGTAAACCTCAAAAAAGAAACATATGAGAAATGAGCTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173011	AAGGATCTTGGAGTAAACCTCAAAAAAGAAACATATGAGAAATGAGCTCC	173060

CU464032.8	1851	CAACCTGAGAAACATGCTCACCTTTAACAAAGAACAATACTTGTGAAATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173061	CAACCTGAGAAACATGCTCACCTTTAACAAAGAACAATACTTGTGAAATT	173110

CU464032.8	1901	AGGAAAGCTTTTGTTAATTTTTACATTCATTTCCCCGGAATGAACAGGTA	1950
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
CU463175.2	173111	AGGAAAGCTTTTGTTAATTTTTACATTCATTTCCCCAGAATGAACAGGTA	173160

CU464032.8	1951	GTTCCTATAGCAGAGCTATAATTATTCTGACCAATGCAAGTCCCTTTATA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173161	GTTCCTATAGCAGAGCTATAATTATTCTGACCAATGCAAGTCCCTTTATA	173210

CU464032.8	2001	CTGTACAAATTGGAATCTCCTGTCTTGCCACCTATTGGATAAATGAAGCC	2050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173211	CTGTACAAATTGGAATCTCCTGTCTTGCCACCTATTGGATAAATGAAGCC	173260

CU464032.8	2051	TCTTGAACACCTCACTTCATGTTCTCATCTCTGAGAGGCTTCCCCTCAAA	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173261	TCTTGAACACCTCACTTCATGTTCTCATCTCTGAGAGGCTTCCCCTCAAA	173310

CU464032.8	2101	TAGCTTGTCAAGTCTACATACAAGTTTCTGACCTTTTACCTGATCATGCT	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173311	TAGCTTGTCAAGTCTACATACAAGTTTCTGACCTTTTACCTGATCATGCT	173360

CU464032.8	2151	AGATCACAACTCTGATTAGCTGCTATCACTCAAAGCTAGGAGGAGACCTG	2200
			||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173361	AGATCACAACTCTGATTAGGTGCTATCACTCAAAGCTAGGAGGAGACCTG	173410

CU464032.8	2201	TGGAAACAAAATTCCTTCTTTTATTTCCCTCAAACAAAAGAACAAAAATA	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173411	TGGAAACAAAATTCCTTCTTTTATTTCCCTCAAACAAAAGAACAAAAATA	173460

CU464032.8	2251	GCACCTGAAGTCTTCCCAATTCCCTAGGGTCAAGACAATCGAGAGAATTT	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173461	GCACCTGAAGTCTTCCCAATTCCCTAGGGTCAAGACAATCGAGAGAATTT	173510

CU464032.8	2301	GGCATTAGCTTCCCAATAAGGCTTTACAAAGTGTGCCCAGGTCCATGGCC	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173511	GGCATTAGCTTCCCAATAAGGCTTTACAAAGTGTGCCCAGGTCCATGGCC	173560

CU464032.8	2351	TAGAACATAATCAATGGACCAAGAATCTGAGAGGGTCAGGCTGAGTGAGA	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173561	TAGAACATAATCAATGGACCAAGAATCTGAGAGGGTCAGGCTGAGTGAGA	173610

CU464032.8	2401	GACAGTCTCCTAATTTTCTGACCCAATGGTGATAGGGTAAAGACTCTGGG	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173611	GACAGTCTCCTAATTTTCTGACCCAATGGTGATAGGGTAAAGACTCTGGG	173660

CU464032.8	2451	AACCTCCTTGAACTCTTCTTGAATCTTCCCATTTATCTGACTTTTCATAC	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173661	AACCTCCTTGAACTCTTCTTGAATCTTCCCATTTATCTGACTTTTCATAC	173710

CU464032.8	2501	CCAAGTCTGTTACTCTTAATCTAGCCTGACTCTCCATTTTCCATTACCTC	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173711	CCAAGTCTGTTACTCTTAATCTAGCCTGACTCTCCATTTTCCATTACCTC	173760

CU464032.8	2551	TGACTGATTCCCATCCTGGATTACATTCCACCCAAGCCCTCTATTGTGTG	2600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173761	TGACTGATTCCCATCCTGGATTACATTCCACCCAAGCCCTCTATTGTGTG	173810

CU464032.8	2601	ATACCTCCCAATTACCTCCAGCTGTTTCCCACCCTTGATTACATCACTAG	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173811	ATACCTCCCAATTACCTCCAGCTGTTTCCCACCCTTGATTACATCACTAG	173860

CU464032.8	2651	TTATTCCAGTCCAATCAAGATCTTGCTTAGACACCTCCTCCCAGACTATT	2700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173861	TTATTCCAGTCCAATCAAGATCTTGCTTAGACACCTCCTCCCAGACTATT	173910

CU464032.8	2701	AGACTACCCCCAAACCCCTCTTACAGTCTTTCTGGATATAAACTCCATCT	2750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173911	AGACTACCCCCAAACCCCTCTTACAGTCTTTCTGGATATAAACTCCATCT	173960

CU464032.8	2751	CGCCTTCATGAAGGTGGTCAGATTAAATCCAGATCTGATTCTGTCTAGGT	2800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173961	CGCCTTCATGAAGGTGGTCAGATTAAATCCAGATCTGATTCTGTCTAGGT	174010

CU464032.8	2801	GAGGTTCCATCTGGCCTCCTTGTAAATACAAGTGCCACAAATGGTTAGAC	2850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174011	GAGGTTCCATCTGGCCTCCTTGTAAATACAAGTGCCACAAATGGTTAGAC	174060

CU464032.8	2851	TTCTTCAGAGTCAACTCAATGTGGTGAATCTTTAATAAACTTTGTTATTA	2900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174061	TTCTTCAGAGTCAACTCAATGTGGTGAATCTTTAATAAACTTTGTTATTA	174110

CU464032.8	2901	ATTGGCTGAAAGAAGTGTTGAGTTGAATTCATTCAACAGTACTCAGTGTG	2950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174111	ATTGGCTGAAAGAAGTGTTGAGTTGAATTCATTCAACAGTACTCAGTGTG	174160

CU464032.8	2951	TTCGTACTTTGGGGTCCCAAGAACCCCAGACCTCAGTAATATGGTTCCCT	3000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174161	TTCGTACTTTGGGGTCCCAAGAACCCCAGACCTCAGTAATATGGTTCCCT	174210

CU464032.8	3001	GACCTCAACATTGGAATCTGAGAGATCAGGCCCAAAAAATACCTCCAAGT	3050
			||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174211	GACCTCAGCATTGGAATCTGAGAGATCAGGCCCAAAAAATACCTCCAAGT	174260

CU464032.8	3051	TGCTTGGAGGGTGAGAAGTGGACAGGGAGAGGGTGAGCGTTATATACCTT	3100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174261	TGCTTGGAGGGTGAGAAGTGGACAGGGAGAGGGTGAGCGTTATATACCTT	174310

CU464032.8	3101	CCAGTCTTGGCTGGGGAAGAGTGTGCTTAGCAGTTTACCAGTGTGAGGGA	3150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174311	CCAGTCTTGGCTGGGGAAGAGTGTGCTTAGCAGTTTACCAGTGTGAGGGA	174360

CU464032.8	3151	ACAAAAATGTTGAAGTTTGGAGGGGCTGGGAACCCAGAATAGTGTCACAT	3200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174361	ACAAAAATGTTGAAGTTTGGAGGGGCTGGGAACCCAGAATAGTGTCACAT	174410

CU464032.8	3201	GAATCCTGAACGAATCTGACCCAAGCATTCTTTCAGTTAAAGAAAAATAC	3250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174411	GAATCCTGAACGAATCTGACCCAAGCATTCTTTCAGTTAAAGAAAAATAC	174460

CU464032.8	3251	AGTTTATAAAAATATTGGGCAGACTCCTAAGGAATCTGAGCATTTATATT	3300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174461	AGTTTATAAAAATATTGGGCAGACTCCTAAGGAATCTGAGCATTTATATT	174510

CU464032.8	3301	GATAATGCCAGTGGGCTAGATTGGATCTGAGCACTTTCATGGAAACAAGA	3350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174511	GATAATGCCAGTGGGCTAGATTGGATCTGAGCACTTTCATGGAAACAAGA	174560

CU464032.8	3351	TGGATCTTGTATACAGAAAGACTGAGGGAGGAATTCGGGGTGTCTGGAGT	3400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174561	TGGATCTTGTATACAGAAAGACTGAGGGAGGAATTCGGGGTGTCTGGAGT	174610

CU464032.8	3401	AGGGAGGGGTTCTAGGGAGGGATTTGATGGGAGTGGTCAATAGCCTGGAG	3450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174611	AGGGAGGGGTTCTAGGGAGGGATTTGATGGGAGTGGTCAATAGCCTGGAG	174660

CU464032.8	3451	AATGGTATTAAAGGTGGAAAGTAGCTCAATAGAGATTTGGGCATAGCCAC	3500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174661	AATGGTATTAAAGGTGGAAAGTAGCTCAATAGAGATTTGGGCATAGCCAC	174710

CU464032.8	3501	AATGACAGGTTTATAACCTCAGGTGAAAGTCAGATAGATCAAGTAGGGAG	3550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174711	AATGACAGGTTTATAACCTCAGGTGAAAGTCAGATAGATCAAGTAGGGAG	174760

CU464032.8	3551	AATCAAGCAGAGTTCAAGGCATTCCTAGAGCCTATACCCCATCAACTTTA	3600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174761	AATCAAGCAGAGTTCAAGGCATTCCTAGAGCCTATACCCCATCAACTTTA	174810

CU464032.8	3601	GCAGCAAAAAGGCATCTCTGATGGTTAGATCTTTCTCCCAGACTGAAAAG	3650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174811	GCAGCAAAAAGGCATCTCTGATGGTTAGATCTTTCTCCCAGACTGAAAAG	174860

CU464032.8	3651	TCCCACAATTTCCTCAGGACAGTAGTCTATTGAATTGGATTTGAGAGAGA	3700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174861	TCCCACAATTTCCTCAGGACAGTAGTCTATTGAATTGGATTTGAGAGAGA	174910

CU464032.8	3701	TGATCATTAAACCTCATCTGTCACTGTCCCTGCTGTTCCAAAATATCAGC	3750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174911	TGATCATTAAACCTCATCTGTCACTGTCCCTGCTGTTCCAAAATATCAGC	174960

CU464032.8	3751	CCCTTCCACTGCTCTCAGGAGCCTCCAAAGTGATTCACATATTCAAACCA	3800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174961	CCCTTCCACTGCTCTCAGGAGCCTCCAAAGTGATTCACATATTCAAACCA	175010

CU464032.8	3801	GTGGATCGATGTGAAATACTTTTGTCAACTAAAAGGAAATGAGCTCCACA	3850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175011	GTGGATCGATGTGAAATACTTTTGTCAACTAAAAGGAAATGAGCTCCACA	175060

CU464032.8	3851	GTACTGTCTCATTTCCCCATACTAAGACACAGATAGCATTTCATATCATT	3900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175061	GTACTGTCTCATTTCCCCATACTAAGACACAGATAGCATTTCATATCATT	175110

CU464032.8	3901	ATGTGCCTTCAGTAATGGCCAGAGCCTGAATTAATTAATCAGAAGAAGAA	3950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175111	ATGTGCCTTCAGTAATGGCCAGAGCCTGAATTAATTAATCAGAAGAAGAA	175160

CU464032.8	3951	CCTGGACCTAACAGAATCTTTGTTTTCTGAAGTAAACTAAGAGAATACCT	4000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175161	CCTGGACCTAACAGAATCTTTGTTTTCTGAAGTAAACTAAGAGAATACCT	175210

CU464032.8	4001	TTTCCTATGTCAACAAGGCCAGATGGAGCTGACTTAGCATACTTTACGAG	4050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175211	TTTCCTATGTCAACAAGGCCAGATGGAGCTGACTTAGCATACTTTACGAG	175260

CU464032.8	4051	ACCCTTAAACTGAGAAGCTTTTCTTGAATAATGGGACTTTTTCTGCACCT	4100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175261	ACCCTTAAACTGAGAAGCTTTTCTTGAATAATGGGACTTTTTCTGCACCT	175310

CU464032.8	4101	TAATGTTTTGTGGACTTATACTATGTTATAGCATTATTAATGGTAAAGAA	4150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175311	TAATGTTTTGTGGACTTATACTATGTTATAGCATTATTAATGGTAAAGAA	175360

CU464032.8	4151	AACCTAGATATCTTGGGTTGTAATTGCAACTGTCACTTTGTCAACTCTCT	4200
			|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
CU463175.2	175361	AACCTAGATATCTTGGGTTGTAATTGCAACTGCCACTTTGTCAACTCTCT	175410

CU464032.8	4201	TATCTTATTGTGTTTACAACTTATTTAATTAAGAAAATTTCTTTCTCATG	4250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175411	TATCTTATTGTGTTTACAACTTATTTAATTAAGAAAATTTCTTTCTCATG	175460

CU464032.8	4251	GAATAGTTAAACACATGTAGAAACCATAAATCTGAAGGACATAGACATCC	4300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175461	GAATAGTTAAACACATGTAGAAACCATAAATCTGAAGGACATAGACATCC	175510

CU464032.8	4301	TTGGTTTGTCTTAAAAGAGATGTAAGCCTTGTCATTCCCATAACATTCAG	4350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175511	TTGGTTTGTCTTAAAAGAGATGTAAGCCTTGTCATTCCCATAACATTCAG	175560

CU464032.8	4351	CCAGAGGTTTCTGTCTAGCTCATGTAACAGCTAGCTTTAAGGGAATAAAC	4400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175561	CCAGAGGTTTCTGTCTAGCTCATGTAACAGCTAGCTTTAAGGGAATAAAC	175610

CU464032.8	4401	AATATGCATTTAGCCTGTTTGCC-TTTTTAACCAAACTTTGAAGTCAATA	4449
			||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175611	AATATGCATTTAGCCTGTTTGCCTTTTTTAACCAAACTTTGAAGTCAATA	175660

CU464032.8	4450	GTTACAATGCTGTAACTTGCATTGGAGCTGATAGTTTGGGAGAGAATGGC	4499
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175661	GTTACAATGCTGTAACTTGCATTGGAGCTGATAGTTTGGGAGAGAATGGC	175710

CU464032.8	4500	TCCCCACCTTGCCAGTGCCAAAAAGCTTAAGTGCCTCAGGATTCATCTTT	4549
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175711	TCCCCACCTTGCCAGTGCCAAAAAGCTTAAGTGCCTCAGGATTCATCTTT	175760

CU464032.8	4550	CCTGAAGTCTTAAACCTTGCAGGGGTCAGGTCAGTCCTGCTATTCTCATC	4599
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175761	CCTGAAGTCTTAAACCTTGCAGGGGTCAGGTCAGTCCTGCTATTCTCATC	175810

CU464032.8	4600	TTCCAAACGACTCCCACTATTTTGGTTGAAGTCTGCAAATTCCCTTTAAG	4649
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175811	TTCCAAACGACTCCCACTATTTTGGTTGAAGTCTGCAAATTCCCTTTAAG	175860

CU464032.8	4650	CTAGTTTTGGGACAGGGATCAATTCCCGTTAAACCACTTTGCATTACTTA	4699
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175861	CTAGTTTTGGGACAGGGATCAATTCCCGTTAAACCACTTTGCATTACTTA	175910

CU464032.8	4700	GGACTCCTTTGACTATTGATCTTAGGAAAATTAGTACAACTATTGCTCAC	4749
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175911	GGACTCCTTTGACTATTGATCTTAGGAAAATTAGTACAACTATTGCTCAC	175960

CU464032.8	4750	AATAGTGTCAATTAACTAAAGAAATTCCTAAATTATGTTGGCCACAATAG	4799
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175961	AATAGTGTCAATTAACTAAAGAAATTCCTAAATTATGTTGGCCACAATAG	176010

CU464032.8	4800	GGCTCTTTTGGACCTGTCAAAGTTACTTTATCTTAAAACCAAATTAAGTT	4849
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176011	GGCTCTTTTGGACCTGTCAAAGTTACTTTATCTTAAAACCAAATTAAGTT	176060

CU464032.8	4850	TAAAGGCCAACAAAACATGTAGCCAGGAGTGGAAATGTTTTCATCTTGAG	4899
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176061	TAAAGGCCAACAAAACATGTAGCCAGGAGTGGAAATGTTTTCATCTTGAG	176110

CU464032.8	4900	CCCATTGGAATGGATGAGGAAGAACAAAAGGTAGGAGCCTCTTTCCTTAA	4949
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176111	CCCATTGGAATGGATGAGGAACAACAAAAGGTAGGAGCCTCTTTCCTTAA	176160

CU464032.8	4950	GGCTCCCAAAGCTGTTTCAGCTCCAGCCAGAGTACCTGCTTACTCCCTTT	4999
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176161	GGCTCCCAAAGCTGTTTCAGCTCCAGCCAGAGTACCTGCTTACTCCCTTT	176210

CU464032.8	5000	ACCCCAAGGGCTCCAGCCTGTCTTTTCCTTTAACTCCCTCTGCCCTATTC	5049
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176211	ACCCCAAGGGCTCCAGCCTGTCTTTTCCTTTAACTCCCTCTGCCCTATTC	176260

CU464032.8	5050	CTCACCTCCTTCCTTCCCCCCCTTACCTTAAAGGCTTTGATCTGGGGAGG	5099
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176261	CTCACCTCCTTCCTTCCCCCCCTTACCTTAAAGGCTTTGATCTGGGGAGG	176310

CU464032.8	5100	ATGACTGCACCTTGCCATTATCTCCTCCCCTTCTCTTACCTACTCTAGCC	5149
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176311	ATGACTGCACCTTGCCATTATCTCCTCCCCTTCTCTTACCTACTCTAGCC	176360

CU464032.8	5150	CTGAGGAGGACAACTTCTTTCAGCCTTCATTGCTTCCTCCTCCTCCTTGC	5199
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176361	CTGAGGAGGACAACTTCTTTCAGCCTTCATTGCTTCCTCCTCCTCCTTGC	176410

CU464032.8	5200	CCTTCCCCACTTTCCCCTAAGGGCTCTGGTCTTGAAGAGCATAGTTACAA	5249
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176411	CCTTCCCCACTTTCCCCTAAGGGCTCTGGTCTTGAAGAGCATAGTTACAA	176460

CU464032.8	5250	TCCACCTACAGATAAGAGACCTAAACCTATTCCCATAGGGCCTATGACTT	5299
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176461	TCCACCTACAGATAAGAGACCTAAACCTATTCCCATAGGGCCTATGACTT	176510

CU464032.8	5300	AAAATAGTCTAAGGTATTAACTTTGGGGCTCCAAGGCTCTCTGCCTCCCA	5349
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176511	AAAATAGTCTAAGGTATTAACTTTGGGGCTCCAAGGCTCTCTGCCTCCCA	176560

CU464032.8	5350	CAACCATAGAAGTGTTCTGAGCAAATGTTTGCAGGATCCACTCTTACTCT	5399
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176561	CAACCATAGAAGTGTTCTGAGCAAATGTTTGCAGGATCCACTCTTACTCT	176610

CU464032.8	5400	GTCAGGTCTTGCAGCCTTGCAACCCCCTTTCCTTTGAATAATAACAGCCA	5449
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176611	GTCAGGTCTTGCAGCCTTGCAACCCCCTTTCCTTTGAATAATAACAGCCA	176660

CU464032.8	5450	ATTCATGATGGGGATTTCTAACAAGCTT	5477
			||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176661	ATTCATGATGGGGATTTCTAACAAGCTT	176688

Compact alignment

skip 950 bps 100% identity alignment

CU464032.8	951	ACTCACCAATGGATTTGACAATCCTTGGTTACCCTCAACTTGATTTAGCC	1000
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172161	ACTCACCAATGGGTTTGACAATCCTTGGTTACCCTCAACTTGATTTAGCC	172210

skip 50 bps 100% identity alignment

CU464032.8	1051	CTTGGAGCCACAGGTGAGAGTTAGGTGGAACAGGTGGACACCAAAGGTGG	1100
			||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	172261	CTTGGAGCCACAGGTGAGAATTAGGTGGAACAGGTGGACACCAAAGGTGG	172310

skip 600 bps 100% identity alignment

CU464032.8	1701	CCCCAATTTTGTAAAAGGCAAGTCAAACGCAAATTTTTGATAATTATAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
CU463175.2	172911	CCCCAATTTTGTAAAAGGCAAGTCAAACGCAAATTTTTGGTAATTATAAA	172960

skip 150 bps 100% identity alignment

CU464032.8	1901	AGGAAAGCTTTTGTTAATTTTTACATTCATTTCCCCGGAATGAACAGGTA	1950
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
CU463175.2	173111	AGGAAAGCTTTTGTTAATTTTTACATTCATTTCCCCAGAATGAACAGGTA	173160

skip 200 bps 100% identity alignment

CU464032.8	2151	AGATCACAACTCTGATTAGCTGCTATCACTCAAAGCTAGGAGGAGACCTG	2200
			||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	173361	AGATCACAACTCTGATTAGGTGCTATCACTCAAAGCTAGGAGGAGACCTG	173410

skip 800 bps 100% identity alignment

CU464032.8	3001	GACCTCAACATTGGAATCTGAGAGATCAGGCCCAAAAAATACCTCCAAGT	3050
			||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	174211	GACCTCAGCATTGGAATCTGAGAGATCAGGCCCAAAAAATACCTCCAAGT	174260

skip 1100 bps 100% identity alignment

CU464032.8	4151	AACCTAGATATCTTGGGTTGTAATTGCAACTGTCACTTTGTCAACTCTCT	4200
			|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
CU463175.2	175361	AACCTAGATATCTTGGGTTGTAATTGCAACTGCCACTTTGTCAACTCTCT	175410

skip 200 bps 100% identity alignment

CU464032.8	4401	AATATGCATTTAGCCTGTTTGCC-TTTTTAACCAAACTTTGAAGTCAATA	4449
			||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	175611	AATATGCATTTAGCCTGTTTGCCTTTTTTAACCAAACTTTGAAGTCAATA	175660

skip 450 bps 100% identity alignment

CU464032.8	4900	CCCATTGGAATGGATGAGGAAGAACAAAAGGTAGGAGCCTCTTTCCTTAA	4949
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
CU463175.2	176111	CCCATTGGAATGGATGAGGAACAACAAAAGGTAGGAGCCTCTTTCCTTAA	176160

skip 528 bps 100% identity alignment

Overview

Query
CU464032.8 - 190632 bps
Hit
CU463175.2 - 176688 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5477 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.85054771547711712111766881
Short-link