<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU467817.5	1	AGTCACTGCTACCTGCTGAGAGGCTGAACCTGCCTTCCTGAGAAATTCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162480	AGTCACTGCTACCTGCTGAGAGGCTGAACCTGCCTTCCTGAGAAATTCCT	162529

CU467817.5	51	GAGAGAGCTGACAACTTGGCAACTGACAACCTACTGCTAACAGCGCTGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162530	GAGAGAGCTGACAACTTGGCAACTGACAACCTACTGCTAACAGCGCTGGC	162579

CU467817.5	101	AGACTAATTGCTACAGGCATGGCAGCAAAGCATCAAGAACCTGGCATGGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162580	AGACTAATTGCTACAGGCATGGCAGCAAAGCATCAAGAACCTGGCATGGG	162629

CU467817.5	151	GGTTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTGCCTAGCAAGCACAAGGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162630	GGTTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTGCCTAGCAAGCACAAGGC	162679

CU467817.5	201	CCTGGGTTCAGTCCTCAGGTCTGGAAAAAACAAACAAAAAAGAACCTGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162680	CCTGGGTTCAGTCCTCAGGTCTGGAAAAAACAAACAAAAAAGAACCTGGC	162729

CU467817.5	251	ATGGCAGGGGATGGACCTTCCCTCTTTATAAGCACAGACTCTTAGTAAAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162730	ATGGCAGGGGATGGACCTTCCCTCTTTATAAGCACAGACTCTTAGTAAAC	162779

CU467817.5	301	ATTGGGCTTTGATCGGAATCTGTCTTGTCTCGTTTCTTTTTTTTTTTTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162780	ATTGGGCTTTGATCGGAATCTGTCTTGTCTCGTTTCTTTTTTTTTTTTTT	162829

CU467817.5	351	TCAAATTTTTTTTTTTCAAATTTTTTTTTTAGGTTTTCCGAGACAGGGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162830	TCAAATTTTTTTTTTTCAAATTTTTTTTTTAGGTTTTCCGAGACAGGGTT	162879

CU467817.5	401	TCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162880	TCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGG	162929

CU467817.5	451	CCTCAAACTCAGAAATCCTCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGACTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162930	CCTCAAACTCAGAAATCCTCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGACTAA	162979

CU467817.5	501	AGGTGTGCACCACCACGCCCGGTTCTTGTCTCGTTTCTTCTCTCACCATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	162980	AGGTGTGCACCACCACGCCCGGTTCTTGTCTCGTTTCTTCTCTCACCATT	163029

CU467817.5	551	TCCTCCCTTACAGCTACAGCTTTCCACTCAGGAACCCATTTTGTGTGGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163030	TCCTCCCTTACAGCTACAGCTTTCCACTCAGGAACCCATTTTGTGTGGCT	163079

CU467817.5	601	GCAAACACTGACAATGCAAGGTTGAAAGCTCTCAGGGTTCTCTGGGTTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163080	GCAAACACTGACAATGCAAGGTTGAAAGCTCTCAGGGTTCTCTGGGTTCT	163129

CU467817.5	651	CTGCTCTCCACAGATCCTGTAGCGCCCCCGTCCCCGTCCCCCCCCCCCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163130	CTGCTCTCCACAGATCCTGTAGCGCCCCCGTCCCCGTCCCCCCCCCCCCC	163179

CU467817.5	701	ACGCTGTCACAGCAGGGGCACTACCTGGTAGGCAGAAAGGACCTTGAATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163180	ACGCTGTCACAGCAGGGGCACTACCTGGTAGGCAGAAAGGACCTTGAATG	163229

CU467817.5	751	TGGTTTTGGGTAGAGACTTGGTCTACATTCAATCCTCAGAAGAGGATATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163230	TGGTTTTGGGTAGAGACTTGGTCTACATTCAATCCTCAGAAGAGGATATC	163279

CU467817.5	801	ACCCCTGCTTGTGTAGTGCACCCCCCAATACAGGCCAACTTTCTAGTTGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163280	ACCCCTGCTTGTGTAGTGCACCCCCCAATACAGGCCAACTTTCTAGTTGC	163329

CU467817.5	851	TTCCAGAAGAGCTCTTCCCCAACCATTTCTGAAGGACAGACCCTAATGAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163330	TTCCAGAAGAGCTCTTCCCCAACCATTTCTGAAGGACAGACCCTAATGAA	163379

CU467817.5	901	AAGGTTCAATTCCTCCCCAGCAAGTTCCCATGACTAAAACCCCTGGCATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163380	AAGGTTCAATTCCTCCCCAGCAAGTTCCCATGACTAAAACCCCTGGCATT	163429

CU467817.5	951	TTGTTCCTATGTGAATAGTGAGTGTTTTACAGCCTGCTTCCCTTCCCTGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163430	TTGTTCCTATGTGAATAGTGAGTGTTTTACAGCCTGCTTCCCTTCCCTGT	163479

CU467817.5	1001	GCAGACACTTCCTCCCTTCCCAGCAGATGTGTCTAGCCTAGTAAAGTCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163480	GCAGACACTTCCTCCCTTCCCAGCAGATGTGTCTAGCCTAGTAAAGTCTG	163529

CU467817.5	1051	CAACTAGCAGTGTGGGACCGACCCCAGGTGTGGGTCCTGTCCTCATGAGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163530	CAACTAGCAGTGTGGGACCGACCCCAGGTGTGGGTCCTGTCCTCATGAGC	163579

CU467817.5	1101	TCATCTGGGTCAAAGGGCCAAGGCTCTGTTAGAGTTTTTACAGTCTCAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163580	TCATCTGGGTCAAAGGGCCAAGGCTCTGTTAGAGTTTTTACAGTCTCAGA	163629

CU467817.5	1151	AGAAAACTCATGATGTGCTGGCAAATCAGCTTGTGGGGGAGACAGAGACC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163630	AGAAAACTCATGATGTGCTGGCAAATCAGCTTGTGGGGGAGACAGAGACC	163679

CU467817.5	1201	CCTCGTTCTCAGAGGTTACCGCTCCCTATTGGATAAACAATCTACTGGAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163680	CCTCGTTCTCAGAGGTTACCGCTCCCTATTGGATAAACAATCTACTGGAC	163729

CU467817.5	1251	AGTGGCTCTGAGCTGGGTAACAGCCCCTCTGGAACTGACTGGAGGAAGGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163730	AGTGGCTCTGAGCTGGGTAACAGCCCCTCTGGAACTGACTGGAGGAAGGG	163779

CU467817.5	1301	GCTGTCCTGCTAGAATGTTGGGTGGGCCTTAGAAAGAGTGGGAACTCCAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163780	GCTGTCCTGCTAGAATGTTGGGTGGGCCTTAGAAAGAGTGGGAACTCCAG	163829

CU467817.5	1351	GCTGGGGAGCTGATGCACTCCCAGTAAAGTGCTTGCCACACACACACACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163830	GCTGGGGAGCTGATGCACTCCCAGTAAAGTGCTTGCCACACACACACACA	163879

CU467817.5	1401	CAGGGACCACAGTTCAATCCTCAGCACCCACATAAACATCCAGGGTGAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163880	CAGGGACCACAGTTCAATCCTCAGCACCCACATAAACATCCAGGGTGAGC	163929

CU467817.5	1451	AACATGAACTTTAAACCCAGTGCTGGAAACATAGAGACAGAAGGCCCCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163930	AACATGAACTTTAAACCCAGTGCTGGAAACATAGAGACAGAAGGCCCCTT	163979

CU467817.5	1501	GGCTTGCTGATCAGGCAGCCTCATCTAATCTGTGTGCCTCAGGTCTCAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	163980	GGCTTGCTGATCAGGCAGCCTCATCTAATCTGTGTGCCTCAGGTCTCAGA	164029

CU467817.5	1551	GAAAGACCCTGTCTCACTCTGTGACTTTAGGTAAATTCCAGCATCCTCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	164030	GAAAGACCCTGTCTCACTCTGTGACTTTAGGTAAATTCCAGCATCCTCTG	164079

CU467817.5	1601	CCGAATTGGGTTGATAAAACTCCTGTAGGAGCGAGCGCTCTGAAGGCCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	164080	CCGAATTGGGTTGATAAAACTCCTGTAGGAGCGAGCGCTCTGAAGGCCTG	164129

CU467817.5	1651	CAGTCAGCTTAGCCGCTGTGAACTCCCAGCTTTGCCTAACTTCCCTGGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	164130	CAGTCAGCTTAGCCGCTGTGAACTCCCAGCTTTGCCTAACTTCCCTGGAG	164179

CU467817.5	1701	TGTAAGCAAATACTCTCTAAAAATCAAACATCGGCCCCCGGCAATGTAGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	164180	TGTAAGCAAATACTCTCTAAAAATCAAACATCGGCCCCCGGCAATGTAGC	164229

CU467817.5	1751	AGGAGGACATTTTTAAGAAGCAGAGATGTTTGTTTGGTTTGGTTTTAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	164230	AGGAGGACATTTTTAAGAAGCAGAGATGTTTGTTTGGTTTGGTTTTAAAA	164279

CU467817.5	1801	GACAGGATCTCTACGTAGCCCCAAGTGGCCTGAAACTTGCTTACAATGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	164280	GACAGGATCTCTACGTAGCCCCAAGTGGCCTGAAACTTGCTTACAATGTA	164329

CU467817.5	1851	GATCAGGCTGGCCTGAAGCTTACAGAGACCCTCCCGCCCTGCCACCTGAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	164330	GATCAGGCTGGCCTGAAGCTTACAGAGACCCTCCCGCCCTGCCACCTGAG	164379

CU467817.5	1901	TGCTGGATTAAAGGCACTTACCTGCTTTTCATTTTCCTAAGCAACACTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	164380	TGCTGGATTAAAGGCACTTACCTGCTTTTCATTTTCCTAAGCAACACTTA	164429

CU467817.5	1951	TTTTTTTCTTCTAAGGTTGTTCCTTGCCCTCATTATAAGAGTCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463153.7	164430	TTTTTTTCTTCTAAGGTTGTTCCTTGCCCTCATTATAAGAGTCAGAATTC	164479

Overview

Query
CU467817.5 - 77356 bps
Hit
CU463153.7 - 164479 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link