<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU407123.9 1 GAATTCTTCACAATAAATTTATAATTAATTACATTTAAGATATTTTATGG 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 149956 GAATTCTTCACAATAAATTTATAATTAATTACATTTAAGATATTTTATGG 150005 CU407123.9 51 GAAGTTTGCGGTGATCTTGACTGTTGAAAGATGATTTTGTGCACTGTGTT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150006 GAAGTTTGCGGTGATCTTGACTGTTGAAAGATGATTTTGTGCACTGTGTT 150055 CU407123.9 101 TTCAAATTCAGATTTCTGTACCCAGATACCTGGTTGTAGCCCAGACTTTG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150056 TTCAAATTCAGATTTCTGTACCCAGATACCTGGTTGTAGCCCAGACTTTG 150105 CU407123.9 151 GTATTGTCACTATTAGAAGTATCAATAAGTATTTAAAAAATATTTTCCTG 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150106 GTATTGTCACTATTAGAAGTATCAATAAGTATTTAAAAAATATTTTCCTG 150155 CU407123.9 201 CATGTTCTTCATGGACAATAATCTTAGAACTGAACATGCAATAGCTTGGC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150156 CATGTTCTTCATGGACAATAATCTTAGAACTGAACATGCAATAGCTTGGC 150205 CU407123.9 251 CATAGAGGAAAAGGCTGCAATTTCAGGCCCAGAGTGAGTGTGTGTTAGGG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150206 CATAGAGGAAAAGGCTGCAATTTCAGGCCCAGAGTGAGTGTGTGTTAGGG 150255 CU407123.9 301 GTGGGGGGAGCTCAAATGAGTGTATAGTAAAGAAGCAGGGAAGAGCTTGG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150256 GTGGGGGGAGCTCAAATGAGTGTATAGTAAAGAAGCAGGGAAGAGCTTGG 150305 CU407123.9 351 CTAAGATGGCAGGTAACAGGTCACATGGCTGAGAAGGGTTCTAGTCCAGC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150306 CTAAGATGGCAGGTAACAGGTCACATGGCTGAGAAGGGTTCTAGTCCAGC 150355 CU407123.9 401 ATTCCAGGATTAGAATAGCTCAGAATTGTTGTACCTAAAGTTGTTAATAC 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150356 ATTCCAGGATTAGAATAGCTCAGAATTGTTGTACCTAAAGTTGTTAATAC 150405 CU407123.9 451 ATATAAAGGTCTTTATGTCATTATTCAGAGTAAGGGCAGAGCTATAAAAC 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150406 ATATAAAGGTCTTTATGTCATTATTCAGAGTAAGGGCAGAGCTATAAAAC 150455 CU407123.9 501 TGGTTGTTTAAAATTTACAACTGATTTTTGTGATAATTTTAATTTAAATG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150456 TGGTTGTTTAAAATTTACAACTGATTTTTGTGATAATTTTAATTTAAATG 150505 CU407123.9 551 TGTGACTATTAAAACATTTAAGATCTTAGGCAAACCATGACGTCCTTTAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150506 TGTGACTATTAAAACATTTAAGATCTTAGGCAAACCATGACGTCCTTTAA 150555 CU407123.9 601 AAGTAACACTATGGACACAATACATACTGTATATACAATGCTCTCCTATG 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150556 AAGTAACACTATGGACACAATACATACTGTATATACAATGCTCTCCTATG 150605 CU407123.9 651 GATGTCGATGCAGCAGACATCTAACGATTCAATGACGTCGCAAGTTCACA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150606 GATGTCGATGCAGCAGACATCTAACGATTCAATGACGTCGCAAGTTCACA 150655 CU407123.9 701 GGGAAAAATAACCTTAAAGAAGTGCCTCATGTACACATTTAGTAATGTGT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150656 GGGAAAAATAACCTTAAAGAAGTGCCTCATGTACACATTTAGTAATGTGT 150705 CU407123.9 751 CAAAGGCAAACACTCCAATGGGTCCTGCCATTCATCACTAAGTTTTAATG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150706 CAAAGGCAAACACTCCAATGGGTCCTGCCATTCATCACTAAGTTTTAATG 150755 CU407123.9 801 ACTCTGAGTGCATGGGTATTTTGTCTTTATGCATGTCTCTGTACCCCAAG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150756 ACTCTGAGTGCATGGGTATTTTGTCTTTATGCATGTCTCTGTACCCCAAG 150805 CU407123.9 851 CTTTCCAGAAAAGGGTTTGGGGTCCTAGTAGACTGGAGTCCTAGAGAGTT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150806 CTTTCCAGAAAAGGGTTTGGGGTCCTAGTAGACTGGAGTCCTAGAGAGTT 150855 CU407123.9 901 GTGAGCAGCCATGTGGATACTAGGAATCCAACACAGTTTTCCTGGAAGAC 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150856 GTGAGCAGCCATGTGGATACTAGGAATCCAACACAGTTTTCCTGGAAGAC 150905 CU407123.9 951 TAGACAGTGCTTTTACCTGCTGAGCTCTCTCTCTAGCCCATACCTTTTGC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150906 TAGACAGTGCTTTTACCTGCTGAGCTCTCTCTCTAGCCCATACCTTTTGC 150955 CU407123.9 1001 CATTAAGCTCAGCATAGAGAAGGCAGATGCAAAGGGATCTTGGTGTTCCA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 150956 CATTAAGCTCAGCATAGAGAAGGCAGATGCAAAGGGATCTTGGTGTTCCA 151005 CU407123.9 1051 GACCACCTTGATCTACATAACAAGTCCTAGACCAGGACAGGTTATATAAC 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151006 GACCACCTTGATCTACATAACAAGTCCTAGACCAGGACAGGTTATATAAC 151055 CU407123.9 1101 TATACCTCATCTCCAAAAAATATTCCATGGTATTAATAAAAACATATAAT 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151056 TATACCTCATCTCCAAAAAATATTCCATGGTATTAATAAAAACATATAAT 151105 CU407123.9 1151 TATCTTATAAAATATTTAAAAATTATTTCAAGAAGAACAAAGACCAAAGT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151106 TATCTTATAAAATATTTAAAAATTATTTCAAGAAGAACAAAGACCAAAGT 151155 CU407123.9 1201 GTGGACACTTTGCCTATTCTTAGAATTGGGAACAAAATACCCATGGAAGG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151156 GTGGACACTTTGCCTATTCTTAGAATTGGGAACAAAATACCCATGGAAGG 151205 CU407123.9 1251 AGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGTTGAGAAGAAAGGATGGACCATCTAGA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151206 AGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGTTGAGAAGAAAGGATGGACCATCTAGA 151255 CU407123.9 1301 GACTGCCATACCTGGGGATCCATCCCATCATCAGCCTCCAAACGCTGACA 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151256 GACTGCCATACCTGGGGATCCATCCCATCATCAGCCTCCAAACGCTGACA 151305 CU407123.9 1351 TCATTGCATATACCAGCAAGATTTTGATGAAAGAACCCTGATATAGCTGT 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151306 TCATTGCATATACCAGCAAGATTTTGATGAAAGAACCCTGATATAGCTGT 151355 CU407123.9 1401 CTCTTGTGAGGCTATGCCGGGGCCTGGCAAACATAGAAGTGGATGCTCAC 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151356 CTCTTGTGAGGCTATGCCGGGGCCTGGCAAACATAGAAGTGGATGCTCAC 151405 CU407123.9 1451 AGTCAGCTAATGGATGGATCACAGGGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151406 AGTCAGCTAATGGATGGATCACAGGGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAA 151455 CU407123.9 1501 GTACCCAAGGAGCTAAAGGGGTCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATA 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151456 GTACCCAAGGAGCTAAAGGGGTCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATA 151505 CU407123.9 1551 TGAACTAACCAGTACCCCCGGAGCTTGTGTCTCTAGCTGCATATGTATCA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151506 TGAACTAACCAGTACCCCCGGAGCTTGTGTCTCTAGCTGCATATGTATCA 151555 CU407123.9 1601 GAAGATGGCCTAGTCGGCCATTATTGGAAAGAAAGGCCCCTTGGTCTTGC 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151556 GAAGATGGCCTAGTCGGCCATTATTGGAAAGAAAGGCCCCTTGGTCTTGC 151605 CU407123.9 1651 AAACTTTATCTGCCTCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAGAAGTGGGAG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151606 AAACTTTATCTGCCTCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAGAAGTGGGAG 151655 CU407123.9 1701 TGGGTGGGTAGGGGAGTGGCGGGGAGGGTATGGGGGACTTTTGGGATAGC 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151656 TGGGTGGGTAGGGGAGTGGCGGGGAGGGTATGGGGGACTTTTGGGATAGC 151705 CU407123.9 1751 ATTTGAAATGTAAATGAAGAAAATACCTAATTAAAATATTAAAATAACTT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151706 ATTTGAAATGTAAATGAAGAAAATACCTAATTAAAATATTAAAATAACTT 151755 CU407123.9 1801 TTTATTAAAATTATTTAATACTAATAAATTCATTCTCCTGTGGCTGCTGA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151756 TTTATTAAAATTATTTAATACTAATAAATTCATTCTCCTGTGGCTGCTGA 151805 CU407123.9 1851 GATGACTCAGCAATGAAAAGCACTTGCTAATTTTGCAAAGGACCAGAACT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151806 GATGACTCAGCAATGAAAAGCACTTGCTAATTTTGCAAAGGACCAGAACT 151855 CU407123.9 1901 TTATTTCTAGCATAGACTTGTCAGTCACAACCTTCTTTAATTACACTTCA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151856 TTATTTCTAGCATAGACTTGTCAGTCACAACCTTCTTTAATTACACTTCA 151905 CU407123.9 1951 AGTATTTATGGTGACTCTTTGTCCTATACAGGCAACTGTATATTCTGTTA 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU463040.8 151906 AGTATTTATGGTGACTCTTTGTCCTATACAGGCAACTGTATATTCTGTTA 151955