<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU459049.7	1	GAATTCTCTCATCTTTGAGTAGGAAACTCTCTGGATTATTATTATTTTTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	21843	GAATTCTCTCATCTTTGAGTAGGAAACTCTCTGGATTATTATTATTTTTG	21892

CU459049.7	51	TTGTTGTTGTTGTTGTTTTAAAATGGGAGTCTCCCTGGTTTCTTTCTAGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	21893	TTGTTGTTGTTGTTGTTTTAAAATGGGAGTCTCCCTGGTTTCTTTCTAGT	21942

CU459049.7	101	TTTACTATAGAAGAAACTCCACATGCTGTGGGTTATGTTGTGTTAAAGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	21943	TTTACTATAGAAGAAACTCCACATGCTGTGGGTTATGTTGTGTTAAAGTG	21992

CU459049.7	151	CCATACTTCTTTAATTCCTGTGCATGAAGACAGAGACAGGAGGATCTCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	21993	CCATACTTCTTTAATTCCTGTGCATGAAGACAGAGACAGGAGGATCTCTG	22042

CU459049.7	201	TGAGTTTAAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCTAGGACAGCCAGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22043	TGAGTTTAAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCTAGGACAGCCAGAG	22092

CU459049.7	251	CCTGCCTTGAAAAAACTAAAAACAAAACAAAAAACAACAAACAACAACAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22093	CCTGCCTTGAAAAAACTAAAAACAAAACAAAAAACAACAAACAACAACAA	22142

CU459049.7	301	CATCCTAAAATCCTATGTAAAGTATAGAATAATGATATGGACAGCAAGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22143	CATCCTAAAATCCTATGTAAAGTATAGAATAATGATATGGACAGCAAGAA	22192

CU459049.7	351	AAACAACGTACAAAGGGCATTGAGAACCTGTAAACAAAATAAAGTGGAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22193	AAACAACGTACAAAGGGCATTGAGAACCTGTAAACAAAATAAAGTGGAAA	22242

CU459049.7	401	TGAAACAAAATGAATGGAAAAGAAATAAATATTAACTATGTTGTTGAATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22243	TGAAACAAAATGAATGGAAAAGAAATAAATATTAACTATGTTGTTGAATG	22292

CU459049.7	451	TGAATTAAGATACACCCCCTGTTTCTCTGTCTGTCTCTGTGTCTCTGTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22293	TGAATTAAGATACACCCCCTGTTTCTCTGTCTGTCTCTGTGTCTCTGTCT	22342

CU459049.7	501	TCCTCTTCCTCTTCCATAGACACCTGATAGTAAATACAAACTCATCCTAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22343	TCCTCTTCCTCTTCCATAGACACCTGATAGTAAATACAAACTCATCCTAG	22392

CU459049.7	551	ATAGGGCGCCAAAAGTAGGTCAAATAAATTATTCCATTCAAGTCCAGGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22393	ATAGGGCGCCAAAAGTAGGTCAAATAAATTATTCCATTCAAGTCCAGGTT	22442

CU459049.7	601	GGTCAATCAATGAGTTTGTTTATTGTAGTTACAGAAGAATGGGTGATAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22443	GGTCAATCAATGAGTTTGTTTATTGTAGTTACAGAAGAATGGGTGATAAA	22492

CU459049.7	651	TTACAGCTGTATGTCTGAAAGCCTCACTTAAGCATGGATGAGGACACTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22493	TTACAGCTGTATGTCTGAAAGCCTCACTTAAGCATGGATGAGGACACTTG	22542

CU459049.7	701	TAAGTTGTTTCACTAGGGTCTGGTGTACAACTTGCTTGCAGCTAGATCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22543	TAAGTTGTTTCACTAGGGTCTGGTGTACAACTTGCTTGCAGCTAGATCTT	22592

CU459049.7	751	TGGAGAGGTATCTCTCTTCCAATTGTTTACAGGAAATGCCATCTCAAGGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22593	TGGAGAGGTATCTCTCTTCCAATTGTTTACAGGAAATGCCATCTCAAGGA	22642

CU459049.7	801	GGAATCATCAGAGTCCTGTAAATTTCATGAACTTCCTGAGTTTTGTAAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22643	GGAATCATCAGAGTCCTGTAAATTTCATGAACTTCCTGAGTTTTGTAAGA	22692

CU459049.7	851	TTTTTTTTCCTTCCTTCTAAATTTCTTGAGTCAGATGAGTTTCCTTGGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22693	TTTTTTTTCCTTCCTTCTAAATTTCTTGAGTCAGATGAGTTTCCTTGGTC	22742

CU459049.7	901	AGTCCAGGTAAGAATGCTTCCTTTTGGAAGAAACACTTAGCACTCTTCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22743	AGTCCAGGTAAGAATGCTTCCTTTTGGAAGAAACACTTAGCACTCTTCCC	22792

CU459049.7	951	ACTCATCTGCTGCTTCTGCTTCTCTCCTTCTCACTACCCATCCCCCTCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22793	ACTCATCTGCTGCTTCTGCTTCTCTCCTTCTCACTACCCATCCCCCTCCA	22842

CU459049.7	1001	CTATAGACTGCCACTCACTAGGTCTACTGTTGTGGCTTGGAAGAGTAAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22843	CTATAGACTGCCACTCACTAGGTCTACTGTTGTGGCTTGGAAGAGTAAGT	22892

CU459049.7	1051	AGACTCAGGAGTTCATTTTTTTTTAACAAAGGCTCAAATTCATCTTAATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22893	AGACTCAGGAGTTCATTTTTTTTTAACAAAGGCTCAAATTCATCTTAATT	22942

CU459049.7	1101	TGGAAAGTATGCTAAGTATTTCTTCCTCAGCTCTCCTCAGAGTCCTCATC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22943	TGGAAAGTATGCTAAGTATTTCTTCCTCAGCTCTCCTCAGAGTCCTCATC	22992

CU459049.7	1151	TTTCCTTAGCAGCTTCCAGAATGCTCTTTTTACCTCCTTGTTCCTCAGGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	22993	TTTCCTTAGCAGCTTCCAGAATGCTCTTTTTACCTCCTTGTTCCTCAGGG	23042

CU459049.7	1201	TATATACAAGAGGGTTGAGTGTGGGGGTACCCACTGCATAAAAGAGACCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23043	TATATACAAGAGGGTTGAGTGTGGGGGTACCCACTGCATAAAAGAGACCA	23092

CU459049.7	1251	AAGAACTTGCCCCTCTCTCGGGCATACGGGTTTTTGGGCTGCAGATAAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23093	AAGAACTTGCCCCTCTCTCGGGCATACGGGTTTTTGGGCTGCAGATAAAC	23142

CU459049.7	1301	AGCAATGACTGAGCTGTAGAAGAGAGTGACCACAATGAGGTGGGATGAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23143	AGCAATGACTGAGCTGTAGAAGAGAGTGACCACAATGAGGTGGGATGAGC	23192

CU459049.7	1351	AGGTCCCAAAAGCTTTCCTGCGCCCCTTTGCAGAGCTTATCTTCAGCACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23193	AGGTCCCAAAAGCTTTCCTGCGCCCCTTTGCAGAGCTTATCTTCAGCACT	23242

CU459049.7	1401	GCCCTGGCAATGGCACCATAAGAGACAAGGATGAGGCTCAGAGGAACAAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23243	GCCCTGGCAATGGCACCATAAGAGACAAGGATGAGGCTCAGAGGAACAAC	23292

CU459049.7	1451	CACAATGAAGATACTAGCAACAGCCATCTGGATCTCATTATAGGTGGTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23293	CACAATGAAGATACTAGCAACAGCCATCTGGATCTCATTATAGGTGGTGT	23342

CU459049.7	1501	CCCCACAAGAGAGTTGAATTAGAGATGGGACTTCACACAGAAAGTTGTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23343	CCCCACAAGAGAGTTGAATTAGAGATGGGACTTCACACAGAAAGTTGTCT	23392

CU459049.7	1551	ATCTGCCTGTAGGAACAAAATGGCAGTTTGAGGGTGGGAGGTGTCTGAAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23393	ATCTGCCTGTAGGAACAAAATGGCAGTTTGAGGGTGGGAGGTGTCTGAAC	23442

CU459049.7	1601	TATGGATTGGACCAAACCTATAGCCCAAGCTATACCTGCCAACTGGCGAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23443	TATGGATTGGACCAAACCTATAGCCCAAGCTATACCTGCCAACTGGCGAC	23492

CU459049.7	1651	ATAGGTGGGGGTTGATTTTGGTGGCATAGTGCAGGGGTTGGCACACAGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23493	ATAGGTGGGGGTTGATTTTGGTGGCATAGTGCAGGGGTTGGCACACAGCC	23542

CU459049.7	1701	ACATAGCGGTCAAAGGCCATTACAGTCAGGAGGATGCACTCTGTTGTACC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23543	ACATAGCGGTCAAAGGCCATTACAGTCAGGAGGATGCACTCTGTTGTACC	23592

CU459049.7	1751	CAGGGACATGAAGATGAAGAGCTGGACAAAGCATCCCAGGAAGCTGATGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23593	CAGGGACATGAAGATGAAGAGCTGGACAAAGCATCCCAGGAAGCTGATGG	23642

CU459049.7	1801	TCTTTGCAGGGCCCCAGAGGTTGAACAGCATCTGGGGGACACAGGTTGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23643	TCTTTGCAGGGCCCCAGAGGTTGAACAGCATCTGGGGGACACAGGTTGTG	23692

CU459049.7	1851	GTGAAGCAGAGGTCCAAGAAGGAGAGGTTAGAGAGGAAGAAGTACATTGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23693	GTGAAGCAGAGGTCCAAGAAGGAGAGGTTAGAGAGGAAGAAGTACATTGG	23742

CU459049.7	1901	AGAGTGGAGCCTGGGGTCCAGGGTGGACAGCAGGAGGATGAGTGTGTTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23743	AGAGTGGAGCCTGGGGTCCAGGGTGGACAGCAGGAGGATGAGTGTGTTTC	23792

CU459049.7	1951	CTAGGAGGGTAAGGAGGTAGGAGCACAAGACAACGACAAACAGAACCTTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459195.4	23793	CTAGGAGGGTAAGGAGGTAGGAGCACAAGACAACGACAAACAGAACCTTT	23842

Overview

Query
CU459049.7 - 241982 bps
Hit
CU459195.4 - 23842 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link