<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463327.8	1	GGCCTCTGGCCTCTGTGGGGACTTGCACTCAGGCCCCGTCCCAAGCACAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217163	GGCCTCTGGCCTCTGTGGGGACTTGCACTCAGGCCCCGTCCCAAGCACAT	217212

CU463327.8	51	AATCTGAAAATAAATTATTTTTTAAAACACGCCCATGCAGATGTACCCTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217213	AATCTGAAAATAAATTATTTTTTAAAACACGCCCATGCAGATGTACCCTC	217262

CU463327.8	101	CCATTCTCACCTCTCCCTCGGCTGGAGTCCACAGGGCATGTCCCCAGGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217263	CCATTCTCACCTCTCCCTCGGCTGGAGTCCACAGGGCATGTCCCCAGGCC	217312

CU463327.8	151	TGTCTCCGAGGCTCCCGAACTCGCTCAGGACTCTGCGCCTTGTGCACCGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217313	TGTCTCCGAGGCTCCCGAACTCGCTCAGGACTCTGCGCCTTGTGCACCGA	217362

CU463327.8	201	CTACGGCTCACTTTTGGTTTGTCCAAGTTTCCCTCTGTTCACGTATAACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217363	CTACGGCTCACTTTTGGTTTGTCCAAGTTTCCCTCTGTTCACGTATAACA	217412

CU463327.8	251	TGGGTGTCGCCCGTGTGTCACATGCTCATCCGAAACCCAATGGAGACAGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217413	TGGGTGTCGCCCGTGTGTCACATGCTCATCCGAAACCCAATGGAGACAGT	217462

CU463327.8	301	GTCCTAGAGAGGGCTCGGCACAGCTGGCACTTGATTCTGATGTTCTAGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217463	GTCCTAGAGAGGGCTCGGCACAGCTGGCACTTGATTCTGATGTTCTAGAA	217512

CU463327.8	351	TGTGCTCGCTCGTTCCCTGAACAAAGATCACTGTGAGCCAGTCTTCCTGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217513	TGTGCTCGCTCGTTCCCTGAACAAAGATCACTGTGAGCCAGTCTTCCTGG	217562

CU463327.8	401	TTACCACACCTGGCCCAACACATGAACACTGCCTCTGGCTGTGACCCAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217563	TTACCACACCTGGCCCAACACATGAACACTGCCTCTGGCTGTGACCCAAG	217612

CU463327.8	451	CACTGGAATGCCATCCCACGGAAGACCAAGATTAAGGACTCCACTAAACC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217613	CACTGGAATGCCATCCCACGGAAGACCAAGATTAAGGACTCCACTAAACC	217662

CU463327.8	501	AGAGGTCAGTGAATTTGCTTTGTGAATGGCCAGATAGTAAATATTTTAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217663	AGAGGTCAGTGAATTTGCTTTGTGAATGGCCAGATAGTAAATATTTTAGG	217712

CU463327.8	551	CTTTTCAGACAGTATGTAAATAAATGGGTGTGGCTATGTCCAATAATACT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217713	CTTTTCAGACAGTATGTAAATAAATGGGTGTGGCTATGTCCAATAATACT	217762

CU463327.8	601	TTAAGAAAACAGAGAGCTGGATTTAGCCCATAGCCGTGGTTTACTGACTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217763	TTAAGAAAACAGAGAGCTGGATTTAGCCCATAGCCGTGGTTTACTGACTG	217812

CU463327.8	651	TGAAAAACTGCTGACCTGCTCTTCCAAAATACCTGGACATGGAGCTCAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217813	TGAAAAACTGCTGACCTGCTCTTCCAAAATACCTGGACATGGAGCTCAGG	217862

CU463327.8	701	GTGGGGTGGGTATGTGCCACCCATGTGTGCTGAGTGACAGGAACATGGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217863	GTGGGGTGGGTATGTGCCACCCATGTGTGCTGAGTGACAGGAACATGGGC	217912

CU463327.8	751	AGGTCTTCACAGTGTGGTTAACACTGGACAGGACAGGTTTCCTTGAGCCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217913	AGGTCTTCACAGTGTGGTTAACACTGGACAGGACAGGTTTCCTTGAGCCA	217962

CU463327.8	801	GTAAAGACTGACAGTGGGTATTGTTAGCAGAAGTGGGGGACCCAGTACAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	217963	GTAAAGACTGACAGTGGGTATTGTTAGCAGAAGTGGGGGACCCAGTACAG	218012

CU463327.8	851	ATGCTGGCTCTGGCTCACCTCCAGTTCCATCTCCTGCTGTTTGGAAAGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218013	ATGCTGGCTCTGGCTCACCTCCAGTTCCATCTCCTGCTGTTTGGAAAGCA	218062

CU463327.8	901	AAGCAGAGACTCAAGCTAGGTCCAATTCAAATGTGCCACATGAGAGCTAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218063	AAGCAGAGACTCAAGCTAGGTCCAATTCAAATGTGCCACATGAGAGCTAG	218112

CU463327.8	951	GGCCTGAGGTTCTCCGGGGCAGCAGACGGCAAACCTCAGAGAGGTGGGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218113	GGCCTGAGGTTCTCCGGGGCAGCAGACGGCAAACCTCAGAGAGGTGGGAG	218162

CU463327.8	1001	GACTCAGCCGTCATCCCTACCCTGGAGCCACCAAATCATGAAGGGTAGGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218163	GACTCAGCCGTCATCCCTACCCTGGAGCCACCAAATCATGAAGGGTAGGA	218212

CU463327.8	1051	AGGAGCGGTTATGTGTCTGTTGCCTTGTAGGCTGAAACTAGACAGCAGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218213	AGGAGCGGTTATGTGTCTGTTGCCTTGTAGGCTGAAACTAGACAGCAGGG	218262

CU463327.8	1101	AGCCCACAGGGCTGGTCTGCCATCACCATGTCCCATCAGCCACGGCACCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218263	AGCCCACAGGGCTGGTCTGCCATCACCATGTCCCATCAGCCACGGCACCC	218312

CU463327.8	1151	ACAGATGCCTACACAGACAGGCACATGTGCCCGTGTGCACAGGAGTACCG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218313	ACAGATGCCTACACAGACAGGCACATGTGCCCGTGTGCACAGGAGTACCG	218362

CU463327.8	1201	CTGAGTGAAGTGACATCAGAGGTCACTGAAGTGGAGGAGCAGGACAGAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218363	CTGAGTGAAGTGACATCAGAGGTCACTGAAGTGGAGGAGCAGGACAGAAG	218412

CU463327.8	1251	CCTAGAAATTGGGGGCTCCTACTTGAGTCCCTTAATCTCATGCTCAGCAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218413	CCTAGAAATTGGGGGCTCCTACTTGAGTCCCTTAATCTCATGCTCAGCAA	218462

CU463327.8	1301	GTGAACTCTGGCATTCACCAGCAAGACCCTCCACACAGCACCTGCTGGGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218463	GTGAACTCTGGCATTCACCAGCAAGACCCTCCACACAGCACCTGCTGGGC	218512

CU463327.8	1351	ATCCTCATGGCCAGCTAATCCCCAAACAAAGCCCTAGTCGGTGGTACTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218513	ATCCTCATGGCCAGCTAATCCCCAAACAAAGCCCTAGTCGGTGGTACTCC	218562

CU463327.8	1401	GCTTGCCCTAGCAACCTCTGGCCACCCTGAACTGAACACCTCCCACTGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218563	GCTTGCCCTAGCAACCTCTGGCCACCCTGAACTGAACACCTCCCACTGTG	218612

CU463327.8	1451	CATAGTCTCTAGGGCTGCTTTTGTCAGCTGTCACACAGCTACAATTTTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218613	CATAGTCTCTAGGGCTGCTTTTGTCAGCTGTCACACAGCTACAATTTTGG	218662

CU463327.8	1501	TGATCCCCAAAGACCAGCAACACTCCTAAAAGAGGGCTGAAGAGGAGACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218663	TGATCCCCAAAGACCAGCAACACTCCTAAAAGAGGGCTGAAGAGGAGACA	218712

CU463327.8	1551	TACAATGTCATTAATCCATCATGGCTCCAGTGCAGCAGGCAAGTGTCCCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218713	TACAATGTCATTAATCCATCATGGCTCCAGTGCAGCAGGCAAGTGTCCCA	218762

CU463327.8	1601	GCTAAGAGATTATGCACACAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218763	GCTAAGAGATTATGCACACAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	218812

CU463327.8	1651	TGTGTGCACCCATGTGTACATGTGTGCATGTGTGTTTGTGTATGCTGTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218813	TGTGTGCACCCATGTGTACATGTGTGCATGTGTGTTTGTGTATGCTGTGT	218862

CU463327.8	1701	GTGCACATGTATGTATGTATGTATGCGTGTGTGCACGGGCTCTAACTGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218863	GTGCACATGTATGTATGTATGTATGCGTGTGTGCACGGGCTCTAACTGCA	218912

CU463327.8	1751	GGTCTGTTACCCGTATTGGGCAGCAGGGAATACATATAGTCCTTCTCTCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218913	GGTCTGTTACCCGTATTGGGCAGCAGGGAATACATATAGTCCTTCTCTCA	218962

CU463327.8	1801	GCAATGTTTTTCTCCAGGTAAAATCAGATTAAAGACCAACCAAGGACAGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	218963	GCAATGTTTTTCTCCAGGTAAAATCAGATTAAAGACCAACCAAGGACAGC	219012

CU463327.8	1851	GTGGGTAGGGGGTGGGGGGTGGGGGGGATGGGGCTGCCCATCAGCCAAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	219013	GTGGGTAGGGGGTGGGGGGTGGGGGGGATGGGGCTGCCCATCAGCCAAGG	219062

CU463327.8	1901	GTGAGTGGGCTGCTTAGGAGAGAAAGGATGTTCTCTGCACAATAGACTAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	219063	GTGAGTGGGCTGCTTAGGAGAGAAAGGATGTTCTCTGCACAATAGACTAG	219112

CU463327.8	1951	AACTTGGTGAGTCATAAAAGAGTCCTATCCCTTGTTTGGAGTATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459142.15	219113	AACTTGGTGAGTCATAAAAGAGTCCTATCCCTTGTTTGGAGTATGAATTC	219162

Overview

Query
CU463327.8 - 115822 bps
Hit
CU459142.15 - 219162 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link