<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463185.6	1	TGTCCATTGATGAGAGTGTGGTGTTGAAATCTCCCACTATTATTGTGTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	239983	TGTCCATTGATGAGAGTGTGGTGTTGAAATCTCCCACTATTATTGTGTGT	240032

CU463185.6	51	GGTGCAATCTGTCCTTTGAGCATTAGCAAAGTTTCTTTTATGATTGTGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240033	GGTGCAATCTGTCCTTTGAGCATTAGCAAAGTTTCTTTTATGATTGTGGC	240082

CU463185.6	101	TGCCCTTGCATTTGGAGAATAGATGTTCAGAATTGAGAATTCATCTTGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240083	TGCCCTTGCATTTGGAGAATAGATGTTCAGAATTGAGAATTCATCTTGGT	240132

CU463185.6	151	AGATTTTACCTTTGATGAGTATGAATTATCTATTCCTCCTTATCTTTTGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240133	AGATTTTACCTTTGATGAGTATGAATTATCTATTCCTCCTTATCTTTTGT	240182

CU463185.6	201	GATAACTTTATATTGAATGTCGATTTTATTCAGTATTAGAATGGCTACTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240183	GATAACTTTATATTGAATGTCGATTTTATTCAGTATTAGAATGGCTACTC	240232

CU463185.6	251	CAGCTTCTTTCTTTGAACAGTTTGCTTGGAAAAATTGTTTACCAGGCATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240233	CAGCTTCTTTCTTTGAACAGTTTGCTTGGAAAAATTGTTTACCAGGCATT	240282

CU463185.6	301	TACTCTGAGGTAGTGTCTGTCTTTGTCACTGATGTTGGTTTCCTGTATGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240283	TACTCTGAGGTAGTGTCTGTCTTTGTCACTGATGTTGGTTTCCTGTATGC	240332

CU463185.6	351	AGCAAAATGTTGGATCCTGTTTATGTAAGCAGTTTGTTAGTTTATGTCTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240333	AGCAAAATGTTGGATCCTGTTTATGTAAGCAGTTTGTTAGTTTATGTCTT	240382

CU463185.6	401	TTTATCGGGAAATTGAGTCCATTGATATTAAGATATATTAAGGAAAAGTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240383	TTTATCGGGAAATTGAGTCCATTGATATTAAGATATATTAAGGAAAAGTA	240432

CU463185.6	451	ATTGTTGTTTCATGTTATTTTTGTTGTTAGAGTTGGAATTCTGTTCATGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240433	ATTGTTGTTTCATGTTATTTTTGTTGTTAGAGTTGGAATTCTGTTCATGT	240482

CU463185.6	501	GGCTATCTTCTTTTAGGTTTGTTGAAAGATTACTTTCTTGTTTTTTTCTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240483	GGCTATCTTCTTTTAGGTTTGTTGAAAGATTACTTTCTTGTTTTTTTCTA	240532

CU463185.6	551	GGGTGTAGCTTCCCTCCTTGTGTTAGAGTTTCCCATTTATTATTGCTTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240533	GGGTGTAGCTTCCCTCCTTGTGTTAGAGTTTCCCATTTATTATTGCTTGA	240582

CU463185.6	601	ATGGCTGGATTTGTGGAAAGATATTGTGTAAATTTTGTTTTGTCATGGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240583	ATGGCTGGATTTGTGGAAAGATATTGTGTAAATTTTGTTTTGTCATGGAA	240632

CU463185.6	651	TGCCTTGGTTTCTCCATCTATGGTAATTGTGAATTTTGTTTGGTATAGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240633	TGCCTTGGTTTCTCCATCTATGGTAATTGTGAATTTTGTTTGGTATAGTA	240682

CU463185.6	701	GCCTGGGCTAGCATATGTGTTTTCTTTTTCTTTTTTTTCTTTCCATTTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240683	GCCTGGGCTAGCATATGTGTTTTCTTTTTCTTTTTTTTCTTTCCATTTTT	240732

CU463185.6	751	TATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAAAGTCCCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240733	TATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAAAGTCCCC	240782

CU463185.6	801	CATACCCACCCACCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240783	CATACCCACCCACCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCC	240832

CU463185.6	851	CTGGCGTTCCCCTGTTCTGGGGCATATAAAGTTTGCGTGTCCAATGGGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240833	CTGGCGTTCCCCTGTTCTGGGGCATATAAAGTTTGCGTGTCCAATGGGCC	240882

CU463185.6	901	TCTCTTTCCAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240883	TCTCTTTCCAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCT	240932

CU463185.6	951	AGAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGATCCACCTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240933	AGAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGATCCACCTA	240982

CU463185.6	1001	TAGGGTTGCAGATCCCGTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCTAGCTCCTCCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	240983	TAGGGTTGCAGATCCCGTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCTAGCTCCTCCA	241032

CU463185.6	1051	TTGGGAGCCCTGTGATCCATCCATTAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241033	TTGGGAGCCCTGTGATCCATCCATTAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTG	241082

CU463185.6	1101	TGTTTGCTAGGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241083	TGTTTGCTAGGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTC	241132

CU463185.6	1151	CTTTCGATAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGATGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241133	CTTTCGATAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGATGC	241182

CU463185.6	1201	TGATTATGGGGTGGATCCCTGGATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241183	TGATTATGGGGTGGATCCCTGGATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCT	241232

CU463185.6	1251	TTCATCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGAGTGTTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241233	TTCATCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGAGTGTTTT	241282

CU463185.6	1301	GTTCCCACTTCTAAGGAGGGGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241283	GTTCCCACTTCTAAGGAGGGGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTTT	241332

CU463185.6	1351	TCTTGAGTTTCATGTGTTTAGGAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241333	TCTTGAGTTTCATGTGTTTAGGAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCT	241382

CU463185.6	1401	AGGTTTTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241383	AGGTTTTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTC	241432

CU463185.6	1451	CTTTGTGAATGTGTTACCTCAATCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241433	CTTTGTGAATGTGTTACCTCAATCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCA	241482

CU463185.6	1501	TTTGGCTAGGAATTTCATAAATTCGTTCTTTTTAATAGCTGAGTAGTACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241483	TTTGGCTAGGAATTTCATAAATTCGTTCTTTTTAATAGCTGAGTAGTACT	241532

CU463185.6	1551	CCATTGTGTAGATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241533	CCATTGTGTAGATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGG	241582

CU463185.6	1601	CATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241583	CATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAA	241632

CU463185.6	1651	CATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCAGTTGGGGCATCTTCTGGATATA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241633	CATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCAGTTGGGGCATCTTCTGGATATA	241682

CU463185.6	1701	TGCCCAGGAGAGGTATTGCTGGATCCTTCGGTAGTACTATGTCCAATTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241683	TGCCCAGGAGAGGTATTGCTGGATCCTTCGGTAGTACTATGTCCAATTTT	241732

CU463185.6	1751	CTGAGGAACGCCAGACGGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCTGCAATCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241733	CTGAGGAACGCCAGACGGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCTGCAATCC	241782

CU463185.6	1801	CACCAACAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCCAGCATCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241783	CACCAACAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCCAGCATCT	241832

CU463185.6	1851	GCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGATGTGAGGTGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241833	GCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGATGTGAGGTGGA	241882

CU463185.6	1901	ATCTCAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241883	ATCTCAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAA	241932

CU463185.6	1951	CATTTTTTCAGGTGCTTCTCTGCCATTCGGTATTCCTCAGGTGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459049.7	241933	CATTTTTTCAGGTGCTTCTCTGCCATTCGGTATTCCTCAGGTGAGAATTC	241982

Overview

Query
CU463185.6 - 135018 bps
Hit
CU459049.7 - 241982 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link