<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU462863.24	1	TAAATAATTTATAATAAACAGAACAAGTATTAGTTTCATCAAATGAGATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214318	TAAATAATTTATAATAAACAGAACAAGTATTAGTTTCATCAAATGAGATG	214367

CU462863.24	51	ACATGAAAGATAATTCTATAGATTTCATGATAATTTTAGATAATGTTTGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214368	ACATGAAAGATAATTCTATAGATTTCATGATAATTTTAGATAATGTTTGG	214417

CU462863.24	101	AAAATAGAAAGCTATAATAATTATATTAATATTTTCCTATGATCAAATAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214418	AAAATAGAAAGCTATAATAATTATATTAATATTTTCCTATGATCAAATAA	214467

CU462863.24	151	TAAATTATAATATTACATTTCATTTCATATCACAGGATGAAGAGAGCATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214468	TAAATTATAATATTACATTTCATTTCATATCACAGGATGAAGAGAGCATA	214517

CU462863.24	201	CAACAGCACTTATCATTAAAGTTAATCATTCATTACATTTATTTCTGATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214518	CAACAGCACTTATCATTAAAGTTAATCATTCATTACATTTATTTCTGATT	214567

CU462863.24	251	TGTTCACCAATTACATTTACTTCTTTTCCTTCCAAATTAGCATTTGTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214568	TGTTCACCAATTACATTTACTTCTTTTCCTTCCAAATTAGCATTTGTCTG	214617

CU462863.24	301	CAAACTCTGACAGAGCTGTCCAGTCTGACCCTCAAGGGGAGACTGAGACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214618	CAAACTCTGACAGAGCTGTCCAGTCTGACCCTCAAGGGGAGACTGAGACT	214667

CU462863.24	351	GCCTCCTGACACTTCATTGAGGAAAAAAAAAAAAACTAGAAATCTCCTGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214668	GCCTCCTGACACTTCATTGAGGAAAAAAAAAAAAACTAGAAATCTCCTGG	214717

CU462863.24	401	GGAGAGTGAGAGAATCAGATCTCTGAGCACAGAGGATAGCAGTAAAATAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214718	GGAGAGTGAGAGAATCAGATCTCTGAGCACAGAGGATAGCAGTAAAATAT	214767

CU462863.24	451	ATTTATAATCATTGATTTCAGAAATGTGGAAATCTCAATATATCATTGTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214768	ATTTATAATCATTGATTTCAGAAATGTGGAAATCTCAATATATCATTGTG	214817

CU462863.24	501	TGAATACAATAAGATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214818	TGAATACAATAAGATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA	214867

CU462863.24	551	TCTATCTATCTACACATCTATCGGTCATTATCATCTATTTACCTCCCTAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214868	TCTATCTATCTACACATCTATCGGTCATTATCATCTATTTACCTCCCTAT	214917

CU462863.24	601	CACCTATCTATTTATTTACCTTCCTGTATCTATCATCTTTCATCTTGTGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214918	CACCTATCTATTTATTTACCTTCCTGTATCTATCATCTTTCATCTTGTGT	214967

CU462863.24	651	GTGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTGATGTTGAATTATTTCCTCAAAGGACAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	214968	GTGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTGATGTTGAATTATTTCCTCAAAGGACAT	215017

CU462863.24	701	AGTGTTCTCTCTGGGATACACAGACCTCCTGATCTCAGATGTTATTCTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215018	AGTGTTCTCTCTGGGATACACAGACCTCCTGATCTCAGATGTTATTCTTT	215067

CU462863.24	751	ACTGCAGCGAAGGTTTTTTAATGCACAGGCTTAAAGATGATAATGAGAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215068	ACTGCAGCGAAGGTTTTTTAATGCACAGGCTTAAAGATGATAATGAGAAT	215117

CU462863.24	801	GTGGTAAGGAGAGGGCACAGAGAAAGCCCGAAGGTGGCTAATCAGAAGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215118	GTGGTAAGGAGAGGGCACAGAGAAAGCCCGAAGGTGGCTAATCAGAAGCA	215167

CU462863.24	851	AAAGGAGTAATTCTCCAATATTGTGCTGAAATTGAAGGTATGTGCTACAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215168	AAAGGAGTAATTCTCCAATATTGTGCTGAAATTGAAGGTATGTGCTACAG	215217

CU462863.24	901	CTAAGTTGCCAATACTGGACTTAGAGAAAGTGAACTAAAGTGTAAAAATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215218	CTAAGTTGCCAATACTGGACTTAGAGAAAGTGAACTAAAGTGTAAAAATG	215267

CU462863.24	951	AACAACTGACACTCAAAACACTTTTGAGTTCTTGCTGTTATTTTATTTTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215268	AACAACTGACACTCAAAACACTTTTGAGTTCTTGCTGTTATTTTATTTTA	215317

CU462863.24	1001	TCTCCATCTCAGGGAATGTAACAGTCAACTCAGAATCATGGCTTCTTTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215318	TCTCCATCTCAGGGAATGTAACAGTCAACTCAGAATCATGGCTTCTTTCT	215367

CU462863.24	1051	TTCTCAGAAAATAGCTTAAGTCCATGGGAAATCAACACAATGCAATGCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215368	TTCTCAGAAAATAGCTTAAGTCCATGGGAAATCAACACAATGCAATGCTG	215417

CU462863.24	1101	AGACTGGAGACTCTCATTACATAGTGCACCTTAATCTAGTTAAGTAATCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215418	AGACTGGAGACTCTCATTACATAGTGCACCTTAATCTAGTTAAGTAATCT	215467

CU462863.24	1151	AACAATTTCTATTGTGTCGGGCTAAAGTGTCACTCAGCTGGTGACACATG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215468	AACAATTTCTATTGTGTCGGGCTAAAGTGTCACTCAGCTGGTGACACATG	215517

CU462863.24	1201	GTCCTTTGGTGAGTTATTGTGGGGCATGAGCATCCAAATAATCTTTTCCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215518	GTCCTTTGGTGAGTTATTGTGGGGCATGAGCATCCAAATAATCTTTTCCT	215567

CU462863.24	1251	AACAATCTACATAAACCATGTGTACTATTATAGAATTTTAGAAATAGTGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215568	AACAATCTACATAAACCATGTGTACTATTATAGAATTTTAGAAATAGTGA	215617

CU462863.24	1301	CTACATTGTGGTGATAATGAACATTTTCCTGAGAATTTCTGCACAGACAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215618	CTACATTGTGGTGATAATGAACATTTTCCTGAGAATTTCTGCACAGACAC	215667

CU462863.24	1351	TGATGCGTTTCAGAAAGAGAATTAATAGTGTTTCATGCTTTCCATCTGCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215668	TGATGCGTTTCAGAAAGAGAATTAATAGTGTTTCATGCTTTCCATCTGCT	215717

CU462863.24	1401	AACAGAAGATTAAAAAAACATTTATGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215718	AACAGAAGATTAAAAAAACATTTATGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAG	215767

CU462863.24	1451	ACAGAGAATAAAATAAGGAATCCAGTCCACCAATGCACATTTCTAATCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215768	ACAGAGAATAAAATAAGGAATCCAGTCCACCAATGCACATTTCTAATCTT	215817

CU462863.24	1501	TTAAAGCTGACCAGTGTTTACTACACATGGAATCTTTATAACACTGAAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215818	TTAAAGCTGACCAGTGTTTACTACACATGGAATCTTTATAACACTGAAGA	215867

CU462863.24	1551	TCTATGTAATAGACAGAACACATAATCGTTATGTAAAATATTATATTGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215868	TCTATGTAATAGACAGAACACATAATCGTTATGTAAAATATTATATTGCA	215917

CU462863.24	1601	CCTCTATGTGAATGGCTTCATTCTGTTACTAGATGGGTGACTGCAGAGGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215918	CCTCTATGTGAATGGCTTCATTCTGTTACTAGATGGGTGACTGCAGAGGA	215967

CU462863.24	1651	TAGCCACATGATGCACCTAACTTCCTCCACAAGAGGCTTCTCAGCGCAGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	215968	TAGCCACATGATGCACCTAACTTCCTCCACAAGAGGCTTCTCAGCGCAGG	216017

CU462863.24	1701	CACTTTTGCACTTCAATGAACATTTTACTATGTATTCACATTGGGCTCCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	216018	CACTTTTGCACTTCAATGAACATTTTACTATGTATTCACATTGGGCTCCA	216067

CU462863.24	1751	AAGTATTTGCAGCTTTAGTCTGAAACAGCTCAAAATGATGAATGTGAAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	216068	AAGTATTTGCAGCTTTAGTCTGAAACAGCTCAAAATGATGAATGTGAAAT	216117

CU462863.24	1801	TTTACTTGAAGAAAATTACTTTAAGATTTGAGACAGTGGCTTATCCTTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	216118	TTTACTTGAAGAAAATTACTTTAAGATTTGAGACAGTGGCTTATCCTTTT	216167

CU462863.24	1851	CAGCCTATTCTGATACTTCCATCTTTCTGAAAAGCCTTCATATCTGTATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	216168	CAGCCTATTCTGATACTTCCATCTTTCTGAAAAGCCTTCATATCTGTATG	216217

CU462863.24	1901	TGGACATATATTTGTCTATATACAGTACATGAGACACCATTCTCCTTTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	216218	TGGACATATATTTGTCTATATACAGTACATGAGACACCATTCTCCTTTCA	216267

CU462863.24	1951	TGGGTCATTATGAAAATAGAACTTTCTGGTATGAATCTCAAGTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459042.15	216268	TGGGTCATTATGAAAATAGAACTTTCTGGTATGAATCTCAAGTGGAATTC	216317

Overview

Query
CU462863.24 - 162979 bps
Hit
CU459042.15 - 216317 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link