<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210856.14	1	GAATTCATGGGCTGGCTATCATGTATTTTTATAAGGCACATTAAAATAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72104	GAATTCATGGGCTGGCTATCATGTATTTTTATAAGGCACATTAAAATAAA	72153

CU210856.14	51	TTTATCACTATAAAAGCAAAATTGTCTGTCTGCAGATTGTTTAAACTGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72154	TTTATCACTATAAAAGCAAAATTGTCTGTCTGCAGATTGTTTAAACTGAT	72203

CU210856.14	101	GTCACACAGGGTAGGTATGCCTTATCCCTCTCCTCGGAACCGGCTCTGCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72204	GTCACACAGGGTAGGTATGCCTTATCCCTCTCCTCGGAACCGGCTCTGCA	72253

CU210856.14	151	CCTGGCTCTCCAGACCACGGTAGTATTACCGCAGGCTGTCTGTCATGATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72254	CCTGGCTCTCCAGACCACGGTAGTATTACCGCAGGCTGTCTGTCATGATT	72303

CU210856.14	201	TGTGTCTGTCCATCACCTTTCCAGCCATCAGATCCCAGGGGCCTTGGGGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72304	TGTGTCTGTCCATCACCTTTCCAGCCATCAGATCCCAGGGGCCTTGGGGT	72353

CU210856.14	251	TTCCCAGAAGTGCTCAGTTCTACTCCAGGGCATCCACCCTGGTCCCTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72354	TTCCCAGAAGTGCTCAGTTCTACTCCAGGGCATCCACCCTGGTCCCTCTG	72403

CU210856.14	301	CTGCTCTCCTTACCCAGCTGGAAGTTGTCAGGATTCGAACCCAGGCTACG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72404	CTGCTCTCCTTACCCAGCTGGAAGTTGTCAGGATTCGAACCCAGGCTACG	72453

CU210856.14	351	AGTCCTTTTATGTCAGGGCTCAGCAAGACTTTTGAAGAAGAAAGTGACTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72454	AGTCCTTTTATGTCAGGGCTCAGCAAGACTTTTGAAGAAGAAAGTGACTT	72503

CU210856.14	401	TCAAATGAAGTATTGAAGGGATGACCAGGTCTGCCAGGAGCTTGTGTGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72504	TCAAATGAAGTATTGAAGGGATGACCAGGTCTGCCAGGAGCTTGTGTGTG	72553

CU210856.14	451	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGCCAGGTGTTGAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72554	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGCCAGGTGTTGAC	72603

CU210856.14	501	TCTGAGTGTCTTTCTCAATGGCTCTCCATATTAGTTTTGGAGACAGGTTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72604	TCTGAGTGTCTTTCTCAATGGCTCTCCATATTAGTTTTGGAGACAGGTTC	72653

CU210856.14	551	TCTCACTCAACCCGGAGTTCACCTACCGGATTGCAGATGGGCCACCTTAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72654	TCTCACTCAACCCGGAGTTCACCTACCGGATTGCAGATGGGCCACCTTAC	72703

CU210856.14	601	CAAGCCAGCACACGTGTGCTGGGAACCTGAACTCAGGACCTCAGGTCCTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72704	CAAGCCAGCACACGTGTGCTGGGAACCTGAACTCAGGACCTCAGGTCCTC	72753

CU210856.14	651	AAGCTTGCTTGGCAAATACTCTATCGATTAAGCTATCCCCCCAGTGCTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72754	AAGCTTGCTTGGCAAATACTCTATCGATTAAGCTATCCCCCCAGTGCTCA	72803

CU210856.14	701	ACCTGCCTGATTTTGTTGCCCTGACAGGACAACTCTTTTCAAGATGAGTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72804	ACCTGCCTGATTTTGTTGCCCTGACAGGACAACTCTTTTCAAGATGAGTA	72853

CU210856.14	751	TGCTGGGGGCCGTTTCTAATCTCTCCTGGGGCAAAAAATGCTGTGGTGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72854	TGCTGGGGGCCGTTTCTAATCTCTCCTGGGGCAAAAAATGCTGTGGTGTC	72903

CU210856.14	801	CAATCCAAACTCCACAGTGTCACAGGACACCTGCTTGGGGCTTCCCACAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72904	CAATCCAAACTCCACAGTGTCACAGGACACCTGCTTGGGGCTTCCCACAG	72953

CU210856.14	851	GTCTGAGCAAGGGCTTCTTGTCCCTTCCTTTATTGCAGCGTGGGTCATTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	72954	GTCTGAGCAAGGGCTTCTTGTCCCTTCCTTTATTGCAGCGTGGGTCATTT	73003

CU210856.14	901	ATCCCCTGAGACATCAGGGAAGAGTCTTAAGTCAGGGAAGAGTCTCAAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73004	ATCCCCTGAGACATCAGGGAAGAGTCTTAAGTCAGGGAAGAGTCTCAAAC	73053

CU210856.14	951	TTACTAATTCCAACGTTTCTTAGAGAGTGGGGAAGAACGCACAATCCCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73054	TTACTAATTCCAACGTTTCTTAGAGAGTGGGGAAGAACGCACAATCCCAG	73103

CU210856.14	1001	GTTTCTGTCTCGAGGGACCCTGCAAAGCGGGTTCGGCCAGGGGTCTCCCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73104	GTTTCTGTCTCGAGGGACCCTGCAAAGCGGGTTCGGCCAGGGGTCTCCCA	73153

CU210856.14	1051	GATCTCCTCCAGGGGTTACAGACCACAAGAGAAAGAGCCTATTACAGGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73154	GATCTCCTCCAGGGGTTACAGACCACAAGAGAAAGAGCCTATTACAGGGG	73203

CU210856.14	1101	CCTGGTACACACTCATGCCTATGGCTTCCCATGTGACAATTCTTCAGAGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73204	CCTGGTACACACTCATGCCTATGGCTTCCCATGTGACAATTCTTCAGAGC	73253

CU210856.14	1151	CCAGAGTGAGGAGGAGATGGAGATGTGTGAGAAGCCCAGCTTCAGGGAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73254	CCAGAGTGAGGAGGAGATGGAGATGTGTGAGAAGCCCAGCTTCAGGGAGG	73303

CU210856.14	1201	GCCTCTAGGGCAGCGGTTCTCAACCTTCCTGGTGCTGTGGTCCTTTAACA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73304	GCCTCTAGGGCAGCGGTTCTCAACCTTCCTGGTGCTGTGGTCCTTTAACA	73353

CU210856.14	1251	CAGTTAGTTCCTCATGCTGTGGTGATCCCCACCCATAAAATTATGTTTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73354	CAGTTAGTTCCTCATGCTGTGGTGATCCCCACCCATAAAATTATGTTTTG	73403

CU210856.14	1301	TTGCTACCTCATAACTGTAATTTTACTTCTGCTATGAGTTGTAATGTAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73404	TTGCTACCTCATAACTGTAATTTTACTTCTGCTATGAGTTGTAATGTAAA	73453

CU210856.14	1351	TATCTGATATCCAGAATATCTGATATGTGACTCCCATGAAAGGGTCGGCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73454	TATCTGATATCCAGAATATCTGATATGTGACTCCCATGAAAGGGTCGGCC	73503

CU210856.14	1401	GACCCCTGGACAGGTTATGATCCACAGGTTGAGAATTACTACTCTAGAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73504	GACCCCTGGACAGGTTATGATCCACAGGTTGAGAATTACTACTCTAGAGG	73553

CU210856.14	1451	CAGTTGGCCTCCGTTCCAGTTCCCACTCCTTTTTAGACTATCTTGGTGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73554	CAGTTGGCCTCCGTTCCAGTTCCCACTCCTTTTTAGACTATCTTGGTGAC	73603

CU210856.14	1501	TGCAAGGGAGAAATGGCTTCATCCTGTGCCTCAGTTTTTTCATCTGTGCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73604	TGCAAGGGAGAAATGGCTTCATCCTGTGCCTCAGTTTTTTCATCTGTGCA	73653

CU210856.14	1551	ATGGGGATAAGAATAGCACCTCCTCCTGGGAAGTGACAGTATTCGCCTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73654	ATGGGGATAAGAATAGCACCTCCTCCTGGGAAGTGACAGTATTCGCCTTT	73703

CU210856.14	1601	AATCCCAACACTTGGTAGGGAGAAGCAGGCAGATCTCTATAAGTTTGAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73704	AATCCCAACACTTGGTAGGGAGAAGCAGGCAGATCTCTATAAGTTTGAGG	73753

CU210856.14	1651	CCAGCCTGCTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTCTACAAAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73754	CCAGCCTGCTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTCTACAAAGA	73803

CU210856.14	1701	AACCCTGCCCCCCCCCTCCCCCCGCAAACCAAACCAAATCAGACCAGACC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73804	AACCCTGCCCCCCCCCTCCCCCCGCAAACCAAACCAAATCAGACCAGACC	73853

CU210856.14	1751	AAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAACAGTCCCTCCCTGGAACA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73854	AAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAACAGTCCCTCCCTGGAACA	73903

CU210856.14	1801	GCCCAGGTAAGGAGCTAAGCTTCACAGGATCTCGAAGGAGCAGTTTACTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73904	GCCCAGGTAAGGAGCTAAGCTTCACAGGATCTCGAAGGAGCAGTTTACTG	73953

CU210856.14	1851	ACAGCTACTGTTTTTACAACCAGACACATTTGAGTTTGAATCCTTCCATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	73954	ACAGCTACTGTTTTTACAACCAGACACATTTGAGTTTGAATCCTTCCATT	74003

CU210856.14	1901	AGAACTACTGTTTGATTAGGGACAGATTTCCATATCGGATTCTTTTTCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	74004	AGAACTACTGTTTGATTAGGGACAGATTTCCATATCGGATTCTTTTTCTA	74053

CU210856.14	1951	GAAAAGGGCTTCTAGGGCGGTGTTCAGCATCCAGGAAGCAGAGTGCATAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU459017.18	74054	GAAAAGGGCTTCTAGGGCGGTGTTCAGCATCCAGGAAGCAGAGTGCATAT	74103

Overview

Query
CU210856.14 - 136353 bps
Hit
CU459017.18 - 74103 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link