<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR855994.1	1	AAGCTTAGGAGTCACGAGAAGGGCCAGGCAGGTGCTGAGGGGTTGCTATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76450	AAGCTTAGGAGTCACGAGAAGGGCCAGGCAGGTGCTGAGGGGTTGCTATG	76499

CR855994.1	51	GGGGTGGGGGAGGGACTTCCCAGTCTGCCCAGCTCCCATCATCCCCTGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76500	GGGGTGGGGGAGGGACTTCCCAGTCTGCCCAGCTCCCATCATCCCCTGTG	76549

CR855994.1	101	GGTGCTGACGCACAGGGTCCAGGGCCTCAGCATCTCTCAGATACACATCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76550	GGTGCTGACGCACAGGGTCCAGGGCCTCAGCATCTCTCAGATACACATCC	76599

CR855994.1	151	TAAGCCCCCGTCCTAAGCCCCTGACCCCACTGAAGCCCTGGCCTTCCTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76600	TAAGCCCCCGTCCTAAGCCCCTGACCCCACTGAAGCCCTGGCCTTCCTCT	76649

CR855994.1	201	TCTCCTAGGGGTGAGTCATACTAGGTGGGTGGGGTCCCTGGAAACAGGCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76650	TCTCCTAGGGGTGAGTCATACTAGGTGGGTGGGGTCCCTGGAAACAGGCC	76699

CR855994.1	251	TTTGGTGCCTGGAAAACCAGTTGTTTTTAAATAGTCTCACCCTCTCCCAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76700	TTTGGTGCCTGGAAAACCAGTTGTTTTTAAATAGTCTCACCCTCTCCCAC	76749

CR855994.1	301	TCCCTCCCTCTGGTTTCCTCCATTTTCCAAACCAGCTGGGATGACTATCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76750	TCCCTCCCTCTGGTTTCCTCCATTTTCCAAACCAGCTGGGATGACTATCC	76799

CR855994.1	351	CAGAGGGTTAGGGGCTGACCTCTTGCTAGGTGCTTCCATGGGCCTGACTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76800	CAGAGGGTTAGGGGCTGACCTCTTGCTAGGTGCTTCCATGGGCCTGACTC	76849

CR855994.1	401	CCCTTCCCTCCCCGGCCCTCCTGGGCTGGGGTGGCCCACACACTTACCCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76850	CCCTTCCCTCCCCGGCCCTCCTGGGCTGGGGTGGCCCACACACTTACCCC	76899

CR855994.1	451	TCATCTCCCTTTACCCACCTCAGCTCCTAACCCAAGATGGAAGATAAATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76900	TCATCTCCCTTTACCCACCTCAGCTCCTAACCCAAGATGGAAGATAAATT	76949

CR855994.1	501	ATCTGGGGTAATAGGGAACAGCACCCCCAAACACACACACACACACACAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	76950	ATCTGGGGTAATAGGGAACAGCACCCCCAAACACACACACACACACACAC	76999

CR855994.1	551	ACACACACACACACACACACACCACACACACACACACACACACACACACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77000	ACACACACACACACACACACACCACACACACACACACACACACACACACC	77049

CR855994.1	601	ACCCGACAGTAGTTGTCCAATCTGAAGAGGGGGACACAGACCCTCAGGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77050	ACCCGACAGTAGTTGTCCAATCTGAAGAGGGGGACACAGACCCTCAGGAA	77099

CR855994.1	651	GCTCATGCCTGGAGACTAGCCTGGGGAAGGACCTGGAGTCCCTGTGACAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77100	GCTCATGCCTGGAGACTAGCCTGGGGAAGGACCTGGAGTCCCTGTGACAG	77149

CR855994.1	701	GAAAACAGCCGACCCGGCAGAAGAGAAACCTTGGGCATGATCTCATGATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77150	GAAAACAGCCGACCCGGCAGAAGAGAAACCTTGGGCATGATCTCATGATG	77199

CR855994.1	751	TTTTCCAGAGTGGGGTGGGTGGGTCTGTAGCTGGCTACCCCAGAGGCCAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77200	TTTTCCAGAGTGGGGTGGGTGGGTCTGTAGCTGGCTACCCCAGAGGCCAA	77249

CR855994.1	801	AGCCCCAAAGTCTCCCTTCTTCCCCAGTTTCCCGTGTCTGCTGAGGGCAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77250	AGCCCCAAAGTCTCCCTTCTTCCCCAGTTTCCCGTGTCTGCTGAGGGCAC	77299

CR855994.1	851	AGCCATCCCTCTGTCCTCTCCAGCCCTTGCTGGCTCTGCCTCACAGCATC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77300	AGCCATCCCTCTGTCCTCTCCAGCCCTTGCTGGCTCTGCCTCACAGCATC	77349

CR855994.1	901	TCTACAGTCCATCACCTTGTCCCTCGGCCACTGCTGTCACTCACATCCTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77350	TCTACAGTCCATCACCTTGTCCCTCGGCCACTGCTGTCACTCACATCCTA	77399

CR855994.1	951	ACTGGTTCCCTTGCCTGGACTTTGCAATGGCTTCCAATCCCTCCCCTACT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77400	ACTGGTTCCCTTGCCTGGACTTTGCAATGGCTTCCAATCCCTCCCCTACT	77449

CR855994.1	1001	TGATCACTCATTTCCTAACCAAAAAGCTCCCCTGGCTCCCTCCTGCCCGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77450	TGATCACTCATTTCCTAACCAAAAAGCTCCCCTGGCTCCCTCCTGCCCGC	77499

CR855994.1	1051	TCCCTGCTCCCCTTGGGGTGGCACAGGGAAGAGCATGACCTTGAGGCAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77500	TCCCTGCTCCCCTTGGGGTGGCACAGGGAAGAGCATGACCTTGAGGCAGG	77549

CR855994.1	1101	AAGGTTTGAATTTAAATCCAGCCTCCAACACTTCTCAGATGTGACCCTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77550	AAGGTTTGAATTTAAATCCAGCCTCCAACACTTCTCAGATGTGACCCTTC	77599

CR855994.1	1151	TCTCAGCCTCAGTTTCCTCATCTGTAAAATGGGACTCCAGGATAAAATGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77600	TCTCAGCCTCAGTTTCCTCATCTGTAAAATGGGACTCCAGGATAAAATGC	77649

CR855994.1	1201	AAACTCCCTTGTCACTCAAAGTTCTTTATGACCCGACTTCAGTGACCATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77650	AAACTCCCTTGTCACTCAAAGTTCTTTATGACCCGACTTCAGTGACCATT	77699

CR855994.1	1251	CCAGCATTGTACATTGCTCCCCTTCCTCCACTCTGTCCAGCTCTTACACA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77700	CCAGCATTGTACATTGCTCCCCTTCCTCCACTCTGTCCAGCTCTTACACA	77749

CR855994.1	1301	CATAGATGACTCTCCCTTTCCTACCTCAATGGCTTTGTATTGGCTATACC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77750	CATAGATGACTCTCCCTTTCCTACCTCAATGGCTTTGTATTGGCTATACC	77799

CR855994.1	1351	CCATGCCTGCACTGCCCTCCCTCCTCAGAACACCTCTGAGAATCCCTGGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77800	CCATGCCTGCACTGCCCTCCCTCCTCAGAACACCTCTGAGAATCCCTGGT	77849

CR855994.1	1401	TCCCTTTGTGATTTAGCTTTGAGTGTGGCTTTCCCCAAATGGCCACCTCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77850	TCCCTTTGTGATTTAGCTTTGAGTGTGGCTTTCCCCAAATGGCCACCTCC	77899

CR855994.1	1451	TCCATCTGCCATGGTTGTCTGATGGAGTCACCAGAATCTTCAAGGCCCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77900	TCCATCTGCCATGGTTGTCTGATGGAGTCACCAGAATCTTCAAGGCCCTT	77949

CR855994.1	1501	TTAGGCTGTTACCTCCTCCCCTTCCCTGCCCCCCTCCAGTCTCTGGACTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	77950	TTAGGCTGTTACCTCCTCCCCTTCCCTGCCCCCCTCCAGTCTCTGGACTC	77999

CR855994.1	1551	CCCCCTCTGCTTGGCCAGTACTGGACTTCTCCCAGTTATCTGTGCCCATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	78000	CCCCCTCTGCTTGGCCAGTACTGGACTTCTCCCAGTTATCTGTGCCCATG	78049

CR855994.1	1601	CCCAGCAAGCCCAGGACCTTCCCTGGATTCCAGTTTGTCCAACTGATTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	78050	CCCAGCAAGCCCAGGACCTTCCCTGGATTCCAGTTTGTCCAACTGATTGG	78099

CR855994.1	1651	GATTGAACTGAGCAAATGGAAACTGGGGAGGCTGCCATCAGCTTGACAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	78100	GATTGAACTGAGCAAATGGAAACTGGGGAGGCTGCCATCAGCTTGACAGA	78149

CR855994.1	1701	AAGAATCCTCAAAGACTGGCCACCAGGGCTGCCAGTGGGAATGTGGTAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	78150	AAGAATCCTCAAAGACTGGCCACCAGGGCTGCCAGTGGGAATGTGGTAAT	78199

CR855994.1	1751	GGGGTGGTCTGCAGGTGGTAGACTAGAACCATAGTACCTCATTCTGCAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	78200	GGGGTGGTCTGCAGGTGGTAGACTAGAACCATAGTACCTCATTCTGCAGG	78249

CR855994.1	1801	GAAACTGAGACTGCACCCAGAGGGACAGTAGGAGCAGAGGAGGAGTTGGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	78250	GAAACTGAGACTGCACCCAGAGGGACAGTAGGAGCAGAGGAGGAGTTGGG	78299

CR855994.1	1851	CTCAGCTTGACCATCTCCCCCTTGGTTCCATCCATTGCCAGGACCTGCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	78300	CTCAGCTTGACCATCTCCCCCTTGGTTCCATCCATTGCCAGGACCTGCCT	78349

CR855994.1	1901	GGGGTAGTACCCAGTCAGTTAGGACTGGAGCCCCGCCTCACTCCCTGAGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	78350	GGGGTAGTACCCAGTCAGTTAGGACTGGAGCCCCGCCTCACTCCCTGAGT	78399

CR855994.1	1951	GTCTGACTCCTATCCTGAGTACTCTTGTACACTGTGCTCTCTATTCCCCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458744.1	78400	GTCTGACTCCTATCCTGAGTACTCTTGTACACTGTGCTCTCTATTCCCCT	78449

Overview

Query
CR855994.1 - 174698 bps
Hit
CU458744.1 - 78449 bps
Total alignments
2
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001975200012000176450784491
289.8438584202842085-165009650671
Short-link