<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207391.12	1	GAATTCAATGATAAGAGTCTAACACGGAAATGGCCACTTTAAAGACCAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	36787	GAATTCAATGATAAGAGTCTAACACGGAAATGGCCACTTTAAAGACCAGA	36836

CU207391.12	51	GATGCAAAAGTCACAGATCCACACCCACAGCCAACTCCTTCTGACACTAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	36837	GATGCAAAAGTCACAGATCCACACCCACAGCCAACTCCTTCTGACACTAT	36886

CU207391.12	101	TGGTCTCCTGTGTGGACTGGTATTACTAGGAGGTACAAATGTGGTTCCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	36887	TGGTCTCCTGTGTGGACTGGTATTACTAGGAGGTACAAATGTGGTTCCTC	36936

CU207391.12	151	CACTCTTTCAGCATCATTATAGCCCGGAACAGACCAAAAAGGACCAAGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	36937	CACTCTTTCAGCATCATTATAGCCCGGAACAGACCAAAAAGGACCAAGCA	36986

CU207391.12	201	TTTGTCCTCAGCCTTTGTAAATCATCTCAAGACTGTCCTGCCCCCACTTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	36987	TTTGTCCTCAGCCTTTGTAAATCATCTCAAGACTGTCCTGCCCCCACTTC	37036

CU207391.12	251	ATTTAACTCCATGGGAGGACTAACCATCACACAGTCTTGCTTTTAGGTTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37037	ATTTAACTCCATGGGAGGACTAACCATCACACAGTCTTGCTTTTAGGTTG	37086

CU207391.12	301	CTTTGAGAACAGGGTTTATGTAGCCCAGGATAGCCTAGAATGTACTATGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37087	CTTTGAGAACAGGGTTTATGTAGCCCAGGATAGCCTAGAATGTACTATGT	37136

CU207391.12	351	AGCCAAGACTTCCCTTAAACTTCTGGTCTTCCTACTGCTACTCATCAAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37137	AGCCAAGACTTCCCTTAAACTTCTGGTCTTCCTACTGCTACTCATCAAAG	37186

CU207391.12	401	GATGAGGTTAGAGGTGAGGTCACACTTTCAGGTTATGCAGGATGGGGTTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37187	GATGAGGTTAGAGGTGAGGTCACACTTTCAGGTTATGCAGGATGGGGTTG	37236

CU207391.12	451	AACCCAGCACCTCCTGGATACTGAGCAAGCACTTCACATTTCCAGCCACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37237	AACCCAGCACCTCCTGGATACTGAGCAAGCACTTCACATTTCCAGCCACA	37286

CU207391.12	501	GAGAGTCATATTTTGTTCATCACTCATTGATTCATTTATTCATTCAGCAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37287	GAGAGTCATATTTTGTTCATCACTCATTGATTCATTTATTCATTCAGCAA	37336

CU207391.12	551	ATATCAAAAGAATACCTACTGTGTATATCAGTCTATAAAGGATTTAGCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37337	ATATCAAAAGAATACCTACTGTGTATATCAGTCTATAAAGGATTTAGCAA	37386

CU207391.12	601	TAACATTTAAAAAATAAAACAATAAAAATAAAATTCCTGTCCTCACAAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37387	TAACATTTAAAAAATAAAACAATAAAAATAAAATTCCTGTCCTCACAAAG	37436

CU207391.12	651	CTTATCAGATAGGTGATTGCACACTGTTGCTTTTCTGACTCGATTGACCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37437	CTTATCAGATAGGTGATTGCACACTGTTGCTTTTCTGACTCGATTGACCA	37486

CU207391.12	701	TATGTTTCCCCCATGAGGACATCTCTGTGCCTTATGCATTTATTCTCTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37487	TATGTTTCCCCCATGAGGACATCTCTGTGCCTTATGCATTTATTCTCTGA	37536

CU207391.12	751	CACACAGTCCAGCCTTGTTTAGTGCCTGGTGGTCAGTACATGGCTATAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37537	CACACAGTCCAGCCTTGTTTAGTGCCTGGTGGTCAGTACATGGCTATAGC	37586

CU207391.12	801	ATTGAATCAATATTTATCTATGTTTAGTGAAGATGTCCATTTGGCTATAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37587	ATTGAATCAATATTTATCTATGTTTAGTGAAGATGTCCATTTGGCTATAG	37636

CU207391.12	851	AGTGTCTCCCAAGGGGTTATGGGCTGGAATCTGAGCCCCTAGTACGGTGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37637	AGTGTCTCCCAAGGGGTTATGGGCTGGAATCTGAGCCCCTAGTACGGTGG	37686

CU207391.12	901	AATTGATGTAGTGAGCATTTAAAGAGAGATGTAGCTAGCACAAGACAATC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37687	AATTGATGTAGTGAGCATTTAAAGAGAGATGTAGCTAGCACAAGACAATC	37736

CU207391.12	951	AGGTGATGACCATGTTCTGCTGGACTCTGAGAGTGAGTTCTTTCACAAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37737	AGGTGATGACCATGTTCTGCTGGACTCTGAGAGTGAGTTCTTTCACAAAA	37786

CU207391.12	1001	ATACACGTGCATTATAATCAGGGTCACCCCACAGACATGACCCCTTCTAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37787	ATACACGTGCATTATAATCAGGGTCACCCCACAGACATGACCCCTTCTAC	37836

CU207391.12	1051	ACATAGCTAGAGGGGTCCTCGCCAGAGGCCAGACAGATAAGGCCATTTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37837	ACATAGCTAGAGGGGTCCTCGCCAGAGGCCAGACAGATAAGGCCATTTGT	37886

CU207391.12	1101	TCTAGCTCAATCTCCAGTCTGTGAGCTCAATAAACCCCTTTATTTATAAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37887	TCTAGCTCAATCTCCAGTCTGTGAGCTCAATAAACCCCTTTATTTATAAG	37936

CU207391.12	1151	TTTACCCACCACCAACATTCTGTCATAGTAGCAGATAACAGATAGTATCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37937	TTTACCCACCACCAACATTCTGTCATAGTAGCAGATAACAGATAGTATCT	37986

CU207391.12	1201	TATCCCTAAAGTCAGAAAGAACATTACTGAAGACCCATTCAAGGGTAATG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	37987	TATCCCTAAAGTCAGAAAGAACATTACTGAAGACCCATTCAAGGGTAATG	38036

CU207391.12	1251	TGGAACATGAAAGGACTCTGACAGCGGGTTGGGTATGGGGAGCAGAAGGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38037	TGGAACATGAAAGGACTCTGACAGCGGGTTGGGTATGGGGAGCAGAAGGC	38086

CU207391.12	1301	CTGCAGCTTGGTCCCCTAAGCACAGGGATAACATGTCTACAATGTGCTCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38087	CTGCAGCTTGGTCCCCTAAGCACAGGGATAACATGTCTACAATGTGCTCA	38136

CU207391.12	1351	GGGTGTTGGCTGAGCAGAGACAGAGATTTCCACAGACCTAGAGAGTCATC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38137	GGGTGTTGGCTGAGCAGAGACAGAGATTTCCACAGACCTAGAGAGTCATC	38186

CU207391.12	1401	TAAGAGGGACCTGAAAGCCCTCTTTCAACAACAGCTAAGTGTGCGAGCCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38187	TAAGAGGGACCTGAAAGCCCTCTTTCAACAACAGCTAAGTGTGCGAGCCT	38236

CU207391.12	1451	ACAGAAGCTGGCCGGAAGCCACTGTGCCCACAGTAAGTGGGTGGGTCACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38237	ACAGAAGCTGGCCGGAAGCCACTGTGCCCACAGTAAGTGGGTGGGTCACA	38286

CU207391.12	1501	CAGAGAGATACAGACATGCTTGCAGTGATAGGAATCAATGTCAGAACTAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38287	CAGAGAGATACAGACATGCTTGCAGTGATAGGAATCAATGTCAGAACTAC	38336

CU207391.12	1551	ATCTTCTGGCTAGAGATGGAGGTAAAGGAAGGACGGGGTAGAGATGAAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38337	ATCTTCTGGCTAGAGATGGAGGTAAAGGAAGGACGGGGTAGAGATGAAAA	38386

CU207391.12	1601	TGGATAAGGAGGTATCCCTAAAACATAGAAGCCTAGTAATGACAAACAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38387	TGGATAAGGAGGTATCCCTAAAACATAGAAGCCTAGTAATGACAAACAAA	38436

CU207391.12	1651	CCGTGGGCAGAGGGAAGGGGCTCTGAAGTGGGGCTTCTGGCCATGACAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38437	CCGTGGGCAGAGGGAAGGGGCTCTGAAGTGGGGCTTCTGGCCATGACAGA	38486

CU207391.12	1701	GGCAAGGGATGGTGCACAGCTCTTAGGGCCTTTGTTTGGTTTCGATGTAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38487	GGCAAGGGATGGTGCACAGCTCTTAGGGCCTTTGTTTGGTTTCGATGTAG	38536

CU207391.12	1751	GGTCTCACTCCATGGCCCAAGCTGGCTTCGAACTGTGCCAATACTTTAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38537	GGTCTCACTCCATGGCCCAAGCTGGCTTCGAACTGTGCCAATACTTTAAC	38586

CU207391.12	1801	CTTCTGAGTGCTGCAGCTAGACCTGAGCCACCACATCCAACGTAGCAGCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38587	CTTCTGAGTGCTGCAGCTAGACCTGAGCCACCACATCCAACGTAGCAGCC	38636

CU207391.12	1851	CTGGTGAAGGGGTTGAGCTGTAGACTGAGAATTGCCAGATCCAGCAATCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38637	CTGGTGAAGGGGTTGAGCTGTAGACTGAGAATTGCCAGATCCAGCAATCA	38686

CU207391.12	1901	GTTCAAACTTTCTGGCCTGTAAGTGCTACACAGGCTGCTCAGGGAGGAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38687	GTTCAAACTTTCTGGCCTGTAAGTGCTACACAGGCTGCTCAGGGAGGAAA	38736

CU207391.12	1951	GTCATCAGCACCCTTACCCAGATGCGAACTCCAAGAGGTACGGTAACATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU458742.8	38737	GTCATCAGCACCCTTACCCAGATGCGAACTCCAAGAGGTACGGTAACATC	38786

Overview

Query
CU207391.12 - 221432 bps
Hit
CU458742.8 - 38786 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link