<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  CU207418.11	197391	GAATTCAAATGCCATTTGTGTGTGGGCAATATTAAAGTTATTTAATGCTG	197342
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85450	GAATTCAAATGCCATTTGTGTGTGGGCAATATTAAAGTTATTTAATGCTG	85499

C  CU207418.11	197341	TTATACTTCATTAAAAAGCTGCCTCTGGAATCGGCTTCTTCAGACCCAGG	197292
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85500	TTATACTTCATTAAAAAGCTGCCTCTGGAATCGGCTTCTTCAGACCCAGG	85549

C  CU207418.11	197291	CATGCTTTTGAAATCTTGATGTCCAAGATCAGGGGAGCCTCCTGACACTG	197242
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85550	CATGCTTTTGAAATCTTGATGTCCAAGATCAGGGGAGCCTCCTGACACTG	85599

C  CU207418.11	197241	TAACAGGGAGGAGGGAGCAAAGCAGAGCAGATAAGGAGGAGATTATTGGT	197192
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85600	TAACAGGGAGGAGGGAGCAAAGCAGAGCAGATAAGGAGGAGATTATTGGT	85649

C  CU207418.11	197191	TTCATTTCATTGCCTTGGACTATTAATGGCCTTTCTGATCCTCAAGATTT	197142
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85650	TTCATTTCATTGCCTTGGACTATTAATGGCCTTTCTGATCCTCAAGATTT	85699

C  CU207418.11	197141	ATAAGTTTCTTGGGTATGGTTGAAAATCCGTGGGAAAAAAAGTTAACTTA	197092
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85700	ATAAGTTTCTTGGGTATGGTTGAAAATCCGTGGGAAAAAAAGTTAACTTA	85749

C  CU207418.11	197091	AAACTTGTAACACACATTGCCAAGATATTTTAGATTAGAATGAATTTTTA	197042
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85750	AAACTTGTAACACACATTGCCAAGATATTTTAGATTAGAATGAATTTTTA	85799

C  CU207418.11	197041	TATGATGATTCCTGTCATGAAGGCAAAGCTTATGAAAAAGAAGATTGGCA	196992
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85800	TATGATGATTCCTGTCATGAAGGCAAAGCTTATGAAAAAGAAGATTGGCA	85849

C  CU207418.11	196991	ACAATGCTCGTTTAATAAGGTATTAAAGCTGTACTTCCATGTGCTCATGT	196942
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85850	ACAATGCTCGTTTAATAAGGTATTAAAGCTGTACTTCCATGTGCTCATGT	85899

C  CU207418.11	196941	ACAAGAATGCACCTCGTGCTGGCAGCCAAACTTTATGATGTAGGAGCTGC	196892
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85900	ACAAGAATGCACCTCGTGCTGGCAGCCAAACTTTATGATGTAGGAGCTGC	85949

C  CU207418.11	196891	CAGGTGGTATTGATTTTAAAGGCAGGAAGGAGTCAGGGAGAAGAGCTGAC	196842
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	85950	CAGGTGGTATTGATTTTAAAGGCAGGAAGGAGTCAGGGAGAAGAGCTGAC	85999

C  CU207418.11	196841	ACTTGGAACTTTGGGGCAGGCAGGGAGTTCCTTAAGCGAGGCCAGATGCA	196792
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86000	ACTTGGAACTTTGGGGCAGGCAGGGAGTTCCTTAAGCGAGGCCAGATGCA	86049

C  CU207418.11	196791	ATGGAGAGCCCACAAGTTTTGGAAATGTCGCTGCCATGTGTTAGTCACCA	196742
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86050	ATGGAGAGCCCACAAGTTTTGGAAATGTCGCTGCCATGTGTTAGTCACCA	86099

C  CU207418.11	196741	GAAACACCAGCTGTAATGAAACAGGCTGGCTGGGACCTAGACTGCAGGCT	196692
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86100	GAAACACCAGCTGTAATGAAACAGGCTGGCTGGGACCTAGACTGCAGGCT	86149

C  CU207418.11	196691	CTATAGGCTGCCGGGGATCAGGGCACAGAGGGGATCCAAGCCCCATGGGA	196642
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86150	CTATAGGCTGCCGGGGATCAGGGCACAGAGGGGATCCAAGCCCCATGGGA	86199

C  CU207418.11	196641	AAGCTCAGAGGATTGTGAATGAATTCCAGAGACCAAACGTTGGATTGTTT	196592
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86200	AAGCTCAGAGGATTGTGAATGAATTCCAGAGACCAAACGTTGGATTGTTT	86249

C  CU207418.11	196591	GTACTGTTGGAGCTTGGTTGCGTCTCGTGCAGATTGTGGTTGTAGCCTGC	196542
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86250	GTACTGTTGGAGCTTGGTTGCGTCTCGTGCAGATTGTGGTTGTAGCCTGC	86299

C  CU207418.11	196541	ATCTTCCCTCTGGAAATTAAAAAGGTACTTTATTTTTGATACTGTAGGAG	196492
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86300	ATCTTCCCTCTGGAAATTAAAAAGGTACTTTATTTTTGATACTGTAGGAG	86349

C  CU207418.11	196491	CACGCAGTTGAGGCATTCTAAACTTCTTTGAGAGGAAATTTTAGAGTTCT	196442
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86350	CACGCAGTTGAGGCATTCTAAACTTCTTTGAGAGGAAATTTTAGAGTTCT	86399

C  CU207418.11	196441	ATAGGAAATTTAAATTAAAAAAACTGGATACTTTTTAAAAATAGCTTTTA	196392
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86400	ATAGGAAATTTAAATTAAAAAAACTGGATACTTTTTAAAAATAGCTTTTA	86449

C  CU207418.11	196391	AAAATATTTAAATTTATAAGATGTTTTATTAAAGTGTCTATATTAATATG	196342
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86450	AAAATATTTAAATTTATAAGATGTTTTATTAAAGTGTCTATATTAATATG	86499

C  CU207418.11	196341	TGATCTTGATATAAAATAGGTAGATAAAAGGCTAAAAATTAGGGCTATAG	196292
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86500	TGATCTTGATATAAAATAGGTAGATAAAAGGCTAAAAATTAGGGCTATAG	86549

C  CU207418.11	196291	CTGTGAGCACTAAACACTAAACACCAGAGACTGAGGTATTCCTCTTAGGA	196242
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86550	CTGTGAGCACTAAACACTAAACACCAGAGACTGAGGTATTCCTCTTAGGA	86599

C  CU207418.11	196241	GGCAGCAAGGTAGAGACCTAAACAGTGTGGGAAGGGGTTTCTTCTCACCT	196192
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86600	GGCAGCAAGGTAGAGACCTAAACAGTGTGGGAAGGGGTTTCTTCTCACCT	86649

C  CU207418.11	196191	AAGGTCTATTTGGACTAACCGACTGGTTTAAGAATATATGTCTAGGGGGC	196142
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86650	AAGGTCTATTTGGACTAACCGACTGGTTTAAGAATATATGTCTAGGGGGC	86699

C  CU207418.11	196141	TGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAAAGATCC	196092
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86700	TGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAAAGATCC	86749

C  CU207418.11	196091	TGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCCATGATGA	196042
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86750	TGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCCATGATGA	86799

C  CU207418.11	196041	GATCTGGCGCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTAA	195992
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86800	GATCTGGCGCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTAA	86849

C  CU207418.11	195991	AGCATACAATAAATAAATAAATCTAAAAAAAAAAAAAAGAATATATGTCT	195942
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86850	AGCATACAATAAATAAATAAATCTAAAAAAAAAAAAAAGAATATATGTCT	86899

C  CU207418.11	195941	AGCCGCTTTGTTTTTGCTAGCTATCTTTGGTAAAGAGAGCCATACAGGAA	195892
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86900	AGCCGCTTTGTTTTTGCTAGCTATCTTTGGTAAAGAGAGCCATACAGGAA	86949

C  CU207418.11	195891	ACCGCTGTGTTCTATGATGGTCCACTGTGTAAGGACCAGGAAGTTGCCGC	195842
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	86950	ACCGCTGTGTTCTATGATGGTCCACTGTGTAAGGACCAGGAAGTTGCCGC	86999

C  CU207418.11	195841	CCAGTCTCTTTGTGAGCTATATTTATGAGTTAAAAAATCTTATCTCGATA	195792
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	87000	CCAGTCTCTTTGTGAGCTATATTTATGAGTTAAAAAATCTTATCTCGATA	87049

C  CU207418.11	195791	CTAAAAAGCTTCAATTCAGGAATTGTTATTATTATTAAACTGCTAAGAGA	195742
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	87050	CTAAAAAGCTTCAATTCAGGAATTGTTATTATTATTAAACTGCTAAGAGA	87099

C  CU207418.11	195741	TAAATAAGCAGCCAGGCCTGGTATCACACGCCTTTAATCCCAGCACTCGG	195692
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	87100	TAAATAAGCAGCCAGGCCTGGTATCACACGCCTTTAATCCCAGCACTCGG	87149

C  CU207418.11	195691	GAGGCAGAGGCAGGCATATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAA	195642
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	87150	GAGGCAGAGGCAGGCATATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAA	87199

C  CU207418.11	195641	GTGAGTTCCAGGACAGCCAGAGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAA	195592
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	87200	GTGAGTTCCAGGACAGCCAGAGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAA	87249

C  CU207418.11	195591	ACCAAACCAAACAAACAAACAAAAAAGATAAATAAGCTTTGGTATGCACA	195542
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	87250	ACCAAACCAAACAAACAAACAAAAAAGATAAATAAGCTTTGGTATGCACA	87299

C  CU207418.11	195541	GAACTATGCTTCTCGTCATGCTAAATACTAATGTAATTAATTATAGAAAA	195492
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	87300	GAACTATGCTTCTCGTCATGCTAAATACTAATGTAATTAATTATAGAAAA	87349

C  CU207418.11	195491	GGGCTTTGTTTCACTTTCTATGTATGCTTTCAAGGTGTAGCCTAAAGCAA	195442
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	87350	GGGCTTTGTTTCACTTTCTATGTATGCTTTCAAGGTGTAGCCTAAAGCAA	87399

C  CU207418.11	195441	GTAGCTAAAAACAAGCAAGGGTTATTTCACTCCTATACCTATTTAATAGA	195392
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU457817.14	87400	GTAGCTAAAAACAAGCAAGGGTTATTTCACTCCTATACCTATTTAATAGA	87449

Overview

Query
CU207418.11 - 197391 bps
Hit
CU457817.14 - 87449 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110002000195392197391-185450874491
Short-link