<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
C CU468017.6 2000 GATCAACGGTGAGCTAAATATCGATCTTAGTTACTTATGTCTGCATTATG 1951 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1 GATCAACGGTGAGCTAAATATCGATCTTAGTTACTTATGTCTGCATTATG 50 C CU468017.6 1950 ATATGATGTATGCCAACTGGCATCAGTACATTGAATGTACGAGTATGCGA 1901 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 51 ATATGATGTATGCCAACTGGCATCAGTACATTGAATGTACGAGTATGCGA 100 C CU468017.6 1900 GTTGGAATTCTAAACAACAACTGAAGCTTGAAAAGGAGTAATAAGGAACA 1851 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 101 GTTGGAATTCTAAACAACAACTGAAGCTTGAAAAGGAGTAATAAGGAACA 150 C CU468017.6 1850 ATTACCTTGGATCTACTCAACTCATGAATAACTAACTCATTTTAGTATAA 1801 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 151 ATTACCTTGGATCTACTCAACTCATGAATAACTAACTCATTTTAGTATAA 200 C CU468017.6 1800 AGCAATTTTAAAAAAGTGCAACATAACAAAAAATTATTTGAAAACAAGTT 1751 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 201 AGCAATTTTAAAAAAGTGCAACATAACAAAAAATTATTTGAAAACAAGTT 250 C CU468017.6 1750 ATAAACTATAGATGTATACAAGGATACAATTAACTCTGAGATGTATGTAA 1701 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 251 ATAAACTATAGATGTATACAAGGATACAATTAACTCTGAGATGTATGTAA 300 C CU468017.6 1700 AAATACAAATAACTTATGCATATAAACAAATCCATTTAACTTCTGTGGGA 1651 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 301 AAATACAAATAACTTATGCATATAAACAAATCCATTTAACTTCTGTGGGA 350 C CU468017.6 1650 GTTTCTCTAATCGACAACCGTCACTTAAGAGTTATAGTGATGATACATCG 1601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 351 GTTTCTCTAATCGACAACCGTCACTTAAGAGTTATAGTGATGATACATCG 400 C CU468017.6 1600 ATCTACCTCATGTTGTCAGCACATCCTATACCTAACCAAAGGTATAAGAC 1551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 401 ATCTACCTCATGTTGTCAGCACATCCTATACCTAACCAAAGGTATAAGAC 450 C CU468017.6 1550 CTAAACTGCCTAAAGGATCCACTAGTCTACAGTGAAAAGGGTTCATCTAA 1501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 451 CTAAACTGCCTAAAGGATCCACTAGTCTACAGTGAAAAGGGTTCATCTAA 500 C CU468017.6 1500 AAAGTATGGCCTTTTTCTACCTTTGGTGTCTACATGGTTTTACGGAGATG 1451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 501 AAAGTATGGCCTTTTTCTACCTTTGGTGTCTACATGGTTTTACGGAGATG 550 C CU468017.6 1450 TGAGTTCACTCATGCTTGTCCCCAATTCGCTGCTTAAAACTACTCCCAGA 1401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 551 TGAGTTCACTCATGCTTGTCCCCAATTCGCTGCTTAAAACTACTCCCAGA 600 C CU468017.6 1400 ATATACTGACCCTTATGTTTTTAAAACAAACTTCTTCTATGGTTTGAGAT 1351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 601 ATATACTGACCCTTATGTTTTTAAAACAAACTTCTTCTATGGTTTGAGAT 650 C CU468017.6 1350 TAGTGCTCAAAACTCAGCTCAAAGGCTAATTTAGAAATCTTAGCTTCCCT 1301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 651 TAGTGCTCAAAACTCAGCTCAAAGGCTAATTTAGAAATCTTAGCTTCCCT 700 C CU468017.6 1300 ACTTGCTCTATTTATAAATTTATTACTCCTTTCTTATAACTAGGTCGAAG 1251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 701 ACTTGCTCTATTTATAAATTTATTACTCCTTTCTTATAACTAGGTCGAAG 750 C CU468017.6 1250 GCTCTCTGGAAATCAAAGTTTCCGTACTTGTTAAATATGAAAACATTTTA 1201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 751 GCTCTCTGGAAATCAAAGTTTCCGTACTTGTTAAATATGAAAACATTTTA 800 C CU468017.6 1200 AATCTCTTTGGGGATACTTGATTCCCATATACTTTTGAAGATTGGAGCTT 1151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 801 AATCTCTTTGGGGATACTTGATTCCCATATACTTTTGAAGATTGGAGCTT 850 C CU468017.6 1150 CAAATTTATTCTTTACTGTTTACTCCTTACTCTTTAGTTAGCTTGAATTT 1101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 851 CAAATTTATTCTTTACTGTTTACTCCTTACTCTTTAGTTAGCTTGAATTT 900 C CU468017.6 1100 GAGTCTTGAAAAAAAAGTTTAAACGTTGTTAAACGACATAGAGAACTCTT 1051 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 901 GAGTCTTGAAAAAAAAGTTTAAACGTTGTTAAACGACATAGAGAACTCTT 950 C CU468017.6 1050 AAAATATTATTTTGACTTGCTTCTTGAATTCTAGACTCGACTCTTAACTT 1001 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 951 AAAATATTATTTTGACTTGCTTCTTGAATTCTAGACTCGACTCTTAACTT 1000 C CU468017.6 1000 CTTTGACTTTGATACTAACTTTCCTTGAATTGGATTATGGATTCAAGGTT 951 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1001 CTTTGACTTTGATACTAACTTTCCTTGAATTGGATTATGGATTCAAGGTT 1050 C CU468017.6 950 CATGATCTCATGTTTAGGGATGATTCCATGATGTTTAGATGTACCTTAGA 901 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1051 CATGATCTCATGTTTAGGGATGATTCCATGATGTTTAGATGTACCTTAGA 1100 C CU468017.6 900 GTGTTGGAATCAACTAGGAAACATGGGTACATCTCTTAGGAACTAGAACG 851 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1101 GTGTTGGAATCAACTAGGAAACATGGGTACATCTCTTAGGAACTAGAACG 1150 C CU468017.6 850 AAAAGATGGGGAATGAATACGGTGAACTGGCGTCCTTATCTCTCTTACAG 801 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1151 AAAAGATGGGGAATGAATACGGTGAACTGGCGTCCTTATCTCTCTTACAG 1200 C CU468017.6 800 GCATCGGGTTCCAGGACCCAAACTTCATAGTACAATTTGGCCCGCTCTAG 751 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1201 GCATCGGGTTCCAGGACCCAAACTTCATAGTACAATTTGGCCCGCTCTAG 1250 C CU468017.6 750 CTCGCGTGATGCCCCAAGGCCCCTACGGACAGACACTTTCATGTGGGGCT 701 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1251 CTCGCGTGATGCCCCAAGGCCCCTACGGACAGACACTTTCATGTGGGGCT 1300 C CU468017.6 700 ATGGGAGGCGCGGCAACCCAGGTTTCTGCGAACAGGCATTTAGACTTTTC 651 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1301 ATGGGAGGCGCGGCAACCCAGGTTTCTGCGAACAGGCATTTAGACTTTTC 1350 C CU468017.6 650 TTCTTTGTTTTTCATCTCTAAACCTTTAAACTTCCATGGTTCTTTCTCCA 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1351 TTCTTTGTTTTTCATCTCTAAACCTTTAAACTTCCATGGTTCTTTCTCCA 1400 C CU468017.6 600 AACACTTAGGATCACTAATACCCAAAATATTAGACTCGAAAAACAACAGC 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1401 AACACTTAGGATCACTAATACCCAAAATATTAGACTCGAAAAACAACAGC 1450 C CU468017.6 550 AAACACAAATCAAATCAACTCTAGGCTTGTAACAACTCAACCAACAAGAA 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1451 AAACACAAATCAAATCAACTCTAGGCTTGTAACAACTCAACCAACAAGAA 1500 C CU468017.6 500 CTCATCAATATTCTTCAAGAACTTCACTTTTCGTCCTTCAATCTACTCAA 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1501 CTCATCAATATTCTTCAAGAACTTCACTTTTCGTCCTTCAATCTACTCAA 1550 C CU468017.6 450 AATCACTTAGTTAAACATGTTGGTGTGTGGGTGGACTAACCCAACATGAA 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1551 AATCACTTAGTTAAACATGTTGGTGTGTGGGTGGACTAACCCAACATGAA 1600 C CU468017.6 400 AAGATCTTACATACCGTGATAGGGTTAACCCCCCACGAATTCCATTCGCA 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1601 AAGATCTTACATACCGTGATAGGGTTAACCCCCCACGAATTCCATTCGCA 1650 C CU468017.6 350 AAACCTTAGCGTTCTTGGTGAGTCCTTGATCTTTCTCCCTTTTCCTTATT 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1651 AAACCTTAGCGTTCTTGGTGAGTCCTTGATCTTTCTCCCTTTTCCTTATT 1700 C CU468017.6 300 CTCATCTCTTTTCTCCAATCCCTAAGCTTAAAATAAATTCTCTAATCTGA 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1701 CTCATCTCTTTTCTCCAATCCCTAAGCTTAAAATAAATTCTCTAATCTGA 1750 C CU468017.6 250 AATAGAACTTATTTTTACACCAAATAAATCCCTAAAACTAAATAAGAAAT 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1751 AATAGAACTTATTTTTACACCAAATAAATCCCTAAAACTAAATAAGAAAT 1800 C CU468017.6 200 AAATGGGTAAAAGACTAGTTTCCCCTTACTTAAAACGGGAACCAGACTTT 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1801 AAATGGGTAAAAGACTAGTTTCCCCTTACTTAAAACGGGAACCAGACTTT 1850 C CU468017.6 150 CCTCACTTTCAGCAGCCCAACATCCGATAAGCATATCTTCCACATACAAT 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1851 CCTCACTTTCAGCAGCCCAACATCCGATAAGCATATCTTCCACATACAAT 1900 C CU468017.6 100 ATCAAAAATATGCAAACTTGACATCATTGGAAAGATCTCTCCAAGAGATT 51 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1901 ATCAAAAATATGCAAACTTGACATCATTGGAAAGATCTCTCCAAGAGATT 1950 C CU468017.6 50 CCCAACCATATCAAGAACTACCCCTAACTCATCCTGATCTAGAAGTTATG 1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU457804.4 1951 CCCAACCATATCAAGAACTACCCCTAACTCATCCTGATCTAGAAGTTATG 2000
Overview
- Query
- CU468017.6 - 29896 bps
- Hit
- CU457804.4 - 125747 bps
- Total alignments
- 5
- Best alignment
- alignment #1 (HSP: 2000 bps)
- Best alignment cartoon