<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU459074.36	1	TTCTTTAAAATAATGAAAAGAAGAGGAAATGCGTCCTTTCATTGAAATGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	142650	TTCTTTAAAATAATGAAAAGAAGAGGAAATGCGTCCTTTCATTGAAATGA	142699

CU459074.36	51	CATTTTGTGTAAACCAGTCTAATAATACTACTTTGAAGAATTAATGTAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	142700	CATTTTGTGTAAACCAGTCTAATAATACTACTTTGAAGAATTAATGTAAA	142749

CU459074.36	101	TCAATTTAAACAACAGGCATGTGTTTAAAGAGGGTTGGAAGAAAAAGTCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	142750	TCAATTTAAACAACAGGCATGTGTTTAAAGAGGGTTGGAAGAAAAAGTCT	142799

CU459074.36	151	TTGAATATTGTAAGTTATATTTATCTTCCACTTTCCTATACCCTGAATCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	142800	TTGAATATTGTAAGTTATATTTATCTTCCACTTTCCTATACCCTGAATCT	142849

CU459074.36	201	TCAGGGTCACTGCTTTAGCCACTGTCTCACAAGCCAATAAAGCAATGACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	142850	TCAGGGTCACTGCTTTAGCCACTGTCTCACAAGCCAATAAAGCAATGACT	142899

CU459074.36	251	TTGTGCAGAACTTTATAGTAATTTGAAAAGGTAAAGAAAATGTTACTTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	142900	TTGTGCAGAACTTTATAGTAATTTGAAAAGGTAAAGAAAATGTTACTTTT	142949

CU459074.36	301	TTAAAAAAAGAGGGAAGTAATTTTTTTTTTTTTTTTGCTTACTTGAGTGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	142950	TTAAAAAAAGAGGGAAGTAATTTTTTTTTTTTTTTTGCTTACTTGAGTGC	142999

CU459074.36	351	TCCTCATTTCCAACTTTCCATTGCATTGCCAAAGTGCCAAGATTCAGAGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143000	TCCTCATTTCCAACTTTCCATTGCATTGCCAAAGTGCCAAGATTCAGAGT	143049

CU459074.36	401	AAATCTATTTAAGAGCACTTTCACTTAGGTATTTAGAAGGAAGGATACAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143050	AAATCTATTTAAGAGCACTTTCACTTAGGTATTTAGAAGGAAGGATACAG	143099

CU459074.36	451	TTGAATACATCTTAGTCACATATGTTGTATCCTATTGGCACATGTTACTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143100	TTGAATACATCTTAGTCACATATGTTGTATCCTATTGGCACATGTTACTG	143149

CU459074.36	501	AAGAATCGGTTCTATTGCTACAGAGAAATAGTGACCTGCTTTGCATAGTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143150	AAGAATCGGTTCTATTGCTACAGAGAAATAGTGACCTGCTTTGCATAGTG	143199

CU459074.36	551	CCAGTGGGTTAAGATTAGCTGTTGACAATGAATACTGAAGAAACAGGGTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143200	CCAGTGGGTTAAGATTAGCTGTTGACAATGAATACTGAAGAAACAGGGTG	143249

CU459074.36	601	AGAGGAATTATGGTCTGGGCTGAACCCTGTTAACCATCAAGAACAACTAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143250	AGAGGAATTATGGTCTGGGCTGAACCCTGTTAACCATCAAGAACAACTAT	143299

CU459074.36	651	CTAGAACCCAGAAAATACTGATGCTGTGAATCAGACAGCATAATCATGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143300	CTAGAACCCAGAAAATACTGATGCTGTGAATCAGACAGCATAATCATGGG	143349

CU459074.36	701	GCTATGGCAATTGCTGGGGGCATCAGGGATTTTGGGGGTCCCACCCTTAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143350	GCTATGGCAATTGCTGGGGGCATCAGGGATTTTGGGGGTCCCACCCTTAA	143399

CU459074.36	751	GTTCTTAGACTTTTTGCTTTGATTTAATGACCTTGTGATTACATGGAATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143400	GTTCTTAGACTTTTTGCTTTGATTTAATGACCTTGTGATTACATGGAATT	143449

CU459074.36	801	AAAACGCAGCTTAGACAAAAAGATACCTTTCTTCTGTATTGGAACTAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143450	AAAACGCAGCTTAGACAAAAAGATACCTTTCTTCTGTATTGGAACTAGAG	143499

CU459074.36	851	ATTGCCTGGTACTGTTCAATCAAACGTAGTATACCTTATTTCTGAATTGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143500	ATTGCCTGGTACTGTTCAATCAAACGTAGTATACCTTATTTCTGAATTGG	143549

CU459074.36	901	TAAAGGATACTCACCTACTTTCCCCTTCACCCTTTCCAGTGGGTCTGCCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143550	TAAAGGATACTCACCTACTTTCCCCTTCACCCTTTCCAGTGGGTCTGCCA	143599

CU459074.36	951	TGAACGTGGTATTCTCTGAGGATGAGATGAAAAGGTTTCTTGAGGAGGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143600	TGAACGTGGTATTCTCTGAGGATGAGATGAAAAGGTTTCTTGAGGAGGCC	143649

CU459074.36	1001	ACTCGAGTCTCTCAGGTAGTGTCCCATTTCTTTGCAACAATCTTGTTTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143650	ACTCGAGTCTCTCAGGTAGTGTCCCATTTCTTTGCAACAATCTTGTTTTG	143699

CU459074.36	1051	TATCCTGTAACTTGTTTTCTATGCAGGTTTTGTTTTCTCATGAAGTTGTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143700	TATCCTGTAACTTGTTTTCTATGCAGGTTTTGTTTTCTCATGAAGTTGTT	143749

CU459074.36	1101	GGGGTAAAGATTCCCTTTACTAGTTTCTTACACATGTGTACTAGTTTCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143750	GGGGTAAAGATTCCCTTTACTAGTTTCTTACACATGTGTACTAGTTTCTT	143799

CU459074.36	1151	ACACATGAGAATGAAAACCTAAAAAGGAAAAAGAAAAATGTCTTTAAGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143800	ACACATGAGAATGAAAACCTAAAAAGGAAAAAGAAAAATGTCTTTAAGTG	143849

CU459074.36	1201	ATGGCTGGATTCTTAGTGTTTGTGGAATAAGCAGAAGACCTGGGCATCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143850	ATGGCTGGATTCTTAGTGTTTGTGGAATAAGCAGAAGACCTGGGCATCTT	143899

CU459074.36	1251	TCATCATCACATTAATTTGTTTGGAGACTCTGGGAGTGTAAAAGGATGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143900	TCATCATCACATTAATTTGTTTGGAGACTCTGGGAGTGTAAAAGGATGAA	143949

CU459074.36	1301	CGCCCATGCTGGATGCTTAATAAGTATCTTGTCCTTTTCGTGAGCTGCAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	143950	CGCCCATGCTGGATGCTTAATAAGTATCTTGTCCTTTTCGTGAGCTGCAT	143999

CU459074.36	1351	GCTGGTCAAGTTATTCCAGGGGCTCCCAGCCTCCAGGAAGAGCCAGCCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144000	GCTGGTCAAGTTATTCCAGGGGCTCCCAGCCTCCAGGAAGAGCCAGCCAT	144049

CU459074.36	1401	GTTTATAACTATCAGGTGAAAGCTTTCTTTGCTTTTAATCCTCACACCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144050	GTTTATAACTATCAGGTGAAAGCTTTCTTTGCTTTTAATCCTCACACCTG	144099

CU459074.36	1451	GGGATTGGCCTTAATCAACCACACAACTTTATTAGTAAGTCACCTTGTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144100	GGGATTGGCCTTAATCAACCACACAACTTTATTAGTAAGTCACCTTGTTC	144149

CU459074.36	1501	ACCTATTGATTTCTGTTTCCATCCTGCTACACCGCATTTGCGAGTTAATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144150	ACCTATTGATTTCTGTTTCCATCCTGCTACACCGCATTTGCGAGTTAATA	144199

CU459074.36	1551	AAAATGTTTATGATTTTGAAGTGACTTAAGACACCCTTCTTAACTGCCCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144200	AAAATGTTTATGATTTTGAAGTGACTTAAGACACCCTTCTTAACTGCCCC	144249

CU459074.36	1601	AAGCTTTCACTTCCTCCTTTGGTGTTACCTTGGTGTGATCCATTTAAGAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144250	AAGCTTTCACTTCCTCCTTTGGTGTTACCTTGGTGTGATCCATTTAAGAT	144299

CU459074.36	1651	TTACCCAGCAGGGTTATTGATTTGCAGACCTCGCACTGTGGAGGATGAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144300	TTACCCAGCAGGGTTATTGATTTGCAGACCTCGCACTGTGGAGGATGAAA	144349

CU459074.36	1701	GTAATGTTTTCCTTTAAAAAGCTTTCAAAGGCTACTTGGGATTTTTTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144350	GTAATGTTTTCCTTTAAAAAGCTTTCAAAGGCTACTTGGGATTTTTTTTT	144399

CU459074.36	1751	TTTAAAAAGAACAATTCAGAGGAGAGTTTGATGTTAGGTAAGTGGAGTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144400	TTTAAAAAGAACAATTCAGAGGAGAGTTTGATGTTAGGTAAGTGGAGTTT	144449

CU459074.36	1801	GAAGGGAGCTGAAGAATGGAGTCTGAGGCATTTCAGAGTGGGAAAACAAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144450	GAAGGGAGCTGAAGAATGGAGTCTGAGGCATTTCAGAGTGGGAAAACAAG	144499

CU459074.36	1851	CATGGATTGTTCTGAACACATGAACCCTGGTCCCTTTCCTCCATGACAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144500	CATGGATTGTTCTGAACACATGAACCCTGGTCCCTTTCCTCCATGACAGC	144549

CU459074.36	1901	TGTTCTTCAAGGATGCTTGGTCATAAAGAAGGTGGAGAAGGAGAATGAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144550	TGTTCTTCAAGGATGCTTGGTCATAAAGAAGGTGGAGAAGGAGAATGAGC	144599

CU459074.36	1951	AAGAAGAGACTGATAACTCTAAAGAAAGGAAATTAGTGGGGTTAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU457480.8	144600	AAGAAGAGACTGATAACTCTAAAGAAAGGAAATTAGTGGGGTTAGAATTC	144649

Overview

Query
CU459074.36 - 113704 bps
Hit
CU457480.8 - 144649 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link