<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU329676.6	1	GAATTCACTTTCTCAAGCATCTGTTATAATTCCGCAGGTGTTATTTCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	71614	GAATTCACTTTCTCAAGCATCTGTTATAATTCCGCAGGTGTTATTTCCTT	71663

CU329676.6	51	TAATCCACACAAATGTCTGCAAATGTGTCATTCAAAGCCCAATTTAAAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	71664	TAATCCACACAAATGTCTGCAAATGTGTCATTCAAAGCCCAATTTAAAAG	71713

CU329676.6	101	GGAGGAATCTGGCATTCAGAGGTGTTAAATAGCTTCTATACAGAAAATGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	71714	GGAGGAATCTGGCATTCAGAGGTGTTAAATAGCTTCTATACAGAAAATGT	71763

CU329676.6	151	GAAGCTGGTGGGTGACTTTGATTAGTGTTCTGGATTCTAAACCCTCTTAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	71764	GAAGCTGGTGGGTGACTTTGATTAGTGTTCTGGATTCTAAACCCTCTTAA	71813

CU329676.6	201	CGTTCCACAAGTGAGAATGGGGAGGCGCTAAGTGGGGTTCACAAGGGGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	71814	CGTTCCACAAGTGAGAATGGGGAGGCGCTAAGTGGGGTTCACAAGGGGAA	71863

CU329676.6	251	GGTATTTCAAACTATTTGAAAGCGCTTCCCCACCCCTCACCCCCACCTTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	71864	GGTATTTCAAACTATTTGAAAGCGCTTCCCCACCCCTCACCCCCACCTTG	71913

CU329676.6	301	GGTCTGTATTGCTTACTCTGCAGTTCTTTGCTTGAGGAAATTAAATCATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	71914	GGTCTGTATTGCTTACTCTGCAGTTCTTTGCTTGAGGAAATTAAATCATT	71963

CU329676.6	351	GTTTACCATTAGAGGGCAGTCATCACCCATATGCAAAAGTATGAGGGTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	71964	GTTTACCATTAGAGGGCAGTCATCACCCATATGCAAAAGTATGAGGGTTT	72013

CU329676.6	401	TTTGGTGTTTGTTTGTTTGTTGTTGTTGTTTTTTGCTTTCTAAAGTGTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72014	TTTGGTGTTTGTTTGTTTGTTGTTGTTGTTTTTTGCTTTCTAAAGTGTTT	72063

CU329676.6	451	ACTGTTGTTTACAGTATGTTCAAAACAAAAACATTAGAAATGCAATTTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72064	ACTGTTGTTTACAGTATGTTCAAAACAAAAACATTAGAAATGCAATTTTG	72113

CU329676.6	501	GTGATATCCACACACTGCCATTCAGATATTCCACAGACTCTGGTGAGGCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72114	GTGATATCCACACACTGCCATTCAGATATTCCACAGACTCTGGTGAGGCC	72163

CU329676.6	551	ATCGACCACAAAGCTGAGGAGTGCCTCATGCTGTTGTCTGCAGAAAAGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72164	ATCGACCACAAAGCTGAGGAGTGCCTCATGCTGTTGTCTGCAGAAAAGAA	72213

CU329676.6	601	GTCTGAGAATGACTGGCTGCGTGCCCTGATTTTGATTTTAGGCTCATTGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72214	GTCTGAGAATGACTGGCTGCGTGCCCTGATTTTGATTTTAGGCTCATTGC	72263

CU329676.6	651	AATGTTACCAGTTTCCTTATTATTCCAATTTACTGATGTGGGCAATGCAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72264	AATGTTACCAGTTTCCTTATTATTCCAATTTACTGATGTGGGCAATGCAT	72313

CU329676.6	701	GTGCCACAGTAAAACCAAGGTTTTGAAATCGGTAATTCAGGTCAAAATTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72314	GTGCCACAGTAAAACCAAGGTTTTGAAATCGGTAATTCAGGTCAAAATTG	72363

CU329676.6	751	GCCGGGATCCTATTAGCAATTGGAAAATAAACACACAAAGGAAAGAAACT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72364	GCCGGGATCCTATTAGCAATTGGAAAATAAACACACAAAGGAAAGAAACT	72413

CU329676.6	801	GCAGAAGCCTTTCCCTTTCTTTGGAAAGGATTTCAGGCCTTCATAAGGAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72414	GCAGAAGCCTTTCCCTTTCTTTGGAAAGGATTTCAGGCCTTCATAAGGAA	72463

CU329676.6	851	GCTATTCATATAGAGTTACACCAGTAGCCAATACTGATTTTTTTTGTTTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72464	GCTATTCATATAGAGTTACACCAGTAGCCAATACTGATTTTTTTTGTTTG	72513

CU329676.6	901	TTTGTTTCCTGCTTCAGTCTCTTGTGCAACTTTATTTTAATACTTCTTAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72514	TTTGTTTCCTGCTTCAGTCTCTTGTGCAACTTTATTTTAATACTTCTTAG	72563

CU329676.6	951	TGTGGGATACTCTAGTTATAAAGAAACAAAAAATAAGTCAAAGAGAACTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72564	TGTGGGATACTCTAGTTATAAAGAAACAAAAAATAAGTCAAAGAGAACTT	72613

CU329676.6	1001	CAAAACAAATATTTGTTTTTAACCTACACTTCTTATGTTCTCTCTACCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72614	CAAAACAAATATTTGTTTTTAACCTACACTTCTTATGTTCTCTCTACCCC	72663

CU329676.6	1051	AGCCTACCAAGGAAAGACATCTATCAGCACTGTAGGCACATCCACTTCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72664	AGCCTACCAAGGAAAGACATCTATCAGCACTGTAGGCACATCCACTTCTG	72713

CU329676.6	1101	CCTACCGCCTGAGCCTGGCCACCATGTCTCGCTCCAACACAGGCACAGGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72714	CCTACCGCCTGAGCCTGGCCACCATGTCTCGCTCCAACACAGGCACAGGC	72763

CU329676.6	1151	ACTGTCTGGGAGCAGGACAGCGAACCATCCCAACAGGCTTCCCAAGACAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72764	ACTGTCTGGGAGCAGGACAGCGAACCATCCCAACAGGCTTCCCAAGACAC	72813

CU329676.6	1201	CCTCAGTCGGACCGATGAGGAGGACGAGGAAAGTAGGTCACAGAGCAGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72814	CCTCAGTCGGACCGATGAGGAGGACGAGGAAAGTAGGTCACAGAGCAGAA	72863

CU329676.6	1251	CCTAGGCAAGCAATATGTCCTGCCTGGCCATGCCAGCGAGGGTCTAGGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72864	CCTAGGCAAGCAATATGTCCTGCCTGGCCATGCCAGCGAGGGTCTAGGAA	72913

CU329676.6	1301	AGATGTCTGCCTTCCAGCCACTTCCAGGACTGCCCCCATGGTCATTCATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72914	AGATGTCTGCCTTCCAGCCACTTCCAGGACTGCCCCCATGGTCATTCATT	72963

CU329676.6	1351	TTTAAAGAGGCTTCAAATGAAGTTGATATCCTTGGACATTCAAGGGGAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	72964	TTTAAAGAGGCTTCAAATGAAGTTGATATCCTTGGACATTCAAGGGGAAA	73013

CU329676.6	1401	ATATGTATCTGATCTTTCGCTAGAAATTTCATTTAAACTCGCCTGGGCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73014	ATATGTATCTGATCTTTCGCTAGAAATTTCATTTAAACTCGCCTGGGCAT	73063

CU329676.6	1451	CCAGGTTAGAGGAACGGTCAGCTCTCACAAGGTCCCATTTGTCAAAGAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73064	CCAGGTTAGAGGAACGGTCAGCTCTCACAAGGTCCCATTTGTCAAAGAAA	73113

CU329676.6	1501	AGTGGTGAGCATATGTATGTGGTATTCAGAAAACACCAGCTATCAATATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73114	AGTGGTGAGCATATGTATGTGGTATTCAGAAAACACCAGCTATCAATATA	73163

CU329676.6	1551	TCAGCCAGGATGAAATTAAGAGGATGCCTGAAGGAAAACAGCTTAAATTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73164	TCAGCCAGGATGAAATTAAGAGGATGCCTGAAGGAAAACAGCTTAAATTT	73213

CU329676.6	1601	GAGTTTAGAGGCTCTCCTGTAATGCATTTATCCAAGGAATTTCTAATGTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73214	GAGTTTAGAGGCTCTCCTGTAATGCATTTATCCAAGGAATTTCTAATGTG	73263

CU329676.6	1651	TGTGCTAAAGATTTACTGTTGCAAAGATAGCAGATCTATAAAGGCTGCAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73264	TGTGCTAAAGATTTACTGTTGCAAAGATAGCAGATCTATAAAGGCTGCAT	73313

CU329676.6	1701	GTGGATGGTTAAGCAAGTAGTGTTTAAAAGCAAAAGACTGGTGAATTCCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73314	GTGGATGGTTAAGCAAGTAGTGTTTAAAAGCAAAAGACTGGTGAATTCCC	73363

CU329676.6	1751	ATTAAATGTCTCCATCATATATGGGGCTTCTTAAACTGCATTGGTTATCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73364	ATTAAATGTCTCCATCATATATGGGGCTTCTTAAACTGCATTGGTTATCT	73413

CU329676.6	1801	TCCACTTGTGTTTTTAGATGCTCTTATATAATGCTTATTGAACAGTTGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73414	TCCACTTGTGTTTTTAGATGCTCTTATATAATGCTTATTGAACAGTTGTA	73463

CU329676.6	1851	CCTTTAGAGTTGAGAACAATATCCAAGAGCTCCTCTATACTAAACAGAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73464	CCTTTAGAGTTGAGAACAATATCCAAGAGCTCCTCTATACTAAACAGAAC	73513

CU329676.6	1901	CCACAATAGGCCCCTTTCTATATTAAAGTAGGGGAAATGGAAGTTGAGCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73514	CCACAATAGGCCCCTTTCTATATTAAAGTAGGGGAAATGGAAGTTGAGCT	73563

CU329676.6	1951	TAGAATTTTTTTTATTTTTTTTCCCTTTTTTGTTAGATATTTTCTTCATT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442760.6	73564	TAGAATTTTTTTTATTTTTTTTCCCTTTTTTGTTAGATATTTTCTTCATT	73613

Overview

Query
CU329676.6 - 67988 bps
Hit
CU442760.6 - 73613 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link