<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU406967.7	1	GAATTCTGTCGTCTTTGCTGGGGGCATTTTGGAGCGCCCACCACGGGAGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	117783	GAATTCTGTCGTCTTTGCTGGGGGCATTTTGGAGCGCCCACCACGGGAGT	117832

CU406967.7	51	TCTGTCAACCACCCGCCCTGTCACAGTGAGTGCACTCTAAGGCCAGAGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	117833	TCTGTCAACCACCCGCCCTGTCACAGTGAGTGCACTCTAAGGCCAGAGGC	117882

CU406967.7	101	CATGGCATGTGAACTCTCTAGAGGCTCAGCCTGTCCTGGGCACTGGAGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	117883	CATGGCATGTGAACTCTCTAGAGGCTCAGCCTGTCCTGGGCACTGGAGTG	117932

CU406967.7	151	ACAGGAGAGGCACTGGACACAGCAGGGAGCCTGGTCTGGCCAGCAGTGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	117933	ACAGGAGAGGCACTGGACACAGCAGGGAGCCTGGTCTGGCCAGCAGTGAC	117982

CU406967.7	201	GAGATTCTGGAAAGACTTCCCAGAGCCAGAGGGCTGCTTACACAGTCTGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	117983	GAGATTCTGGAAAGACTTCCCAGAGCCAGAGGGCTGCTTACACAGTCTGT	118032

CU406967.7	251	CCCCACTCCCTGCCCCTGGAGATTCAGATTGATTTAATTCTGGGATGTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118033	CCCCACTCCCTGCCCCTGGAGATTCAGATTGATTTAATTCTGGGATGTGG	118082

CU406967.7	301	AAGAACTCAGAGCCAGGATGTGGGGGATCCTCTGATAAACAAGTGAGGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118083	AAGAACTCAGAGCCAGGATGTGGGGGATCCTCTGATAAACAAGTGAGGCC	118132

CU406967.7	351	CTGCTCTGAGAATTTCCATTCTGTTGAGACAGAGACACCCCCAGTTTCTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118133	CTGCTCTGAGAATTTCCATTCTGTTGAGACAGAGACACCCCCAGTTTCTT	118182

CU406967.7	401	GTTCATCAAGGATATAGACAAGTACTCTCTAAACATCAAACTGCCTTAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118183	GTTCATCAAGGATATAGACAAGTACTCTCTAAACATCAAACTGCCTTAAG	118232

CU406967.7	451	CTCCCTGCCCTGCCCCCCTCCCCACGAGCCTCTCCCCATCCCCCACCCCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118233	CTCCCTGCCCTGCCCCCCTCCCCACGAGCCTCTCCCCATCCCCCACCCCC	118282

CU406967.7	501	TTTTCCCAAGACAGGGTTTCTCTGTGTAACCCTGGCTGTACTGGAACTCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118283	TTTTCCCAAGACAGGGTTTCTCTGTGTAACCCTGGCTGTACTGGAACTCT	118332

CU406967.7	551	CTCTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCACAGAGATCTGCCTGCCTCTGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118333	CTCTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCACAGAGATCTGCCTGCCTCTGT	118382

CU406967.7	601	CTCCCAAGTGCTGAGATTAAAGGCGTGCACCACCACCGCCTGGAGTCACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118383	CTCCCAAGTGCTGAGATTAAAGGCGTGCACCACCACCGCCTGGAGTCACT	118432

CU406967.7	651	TTTAGGACTGTCACTCTTGTCACTTCTCCATCTCTGGAGCCCACACACGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118433	TTTAGGACTGTCACTCTTGTCACTTCTCCATCTCTGGAGCCCACACACGC	118482

CU406967.7	701	ACTATCTTCTACTGTACCAGTAGCAAGCCAGAGAGCTTGGCCCAAGACCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118483	ACTATCTTCTACTGTACCAGTAGCAAGCCAGAGAGCTTGGCCCAAGACCT	118532

CU406967.7	751	AGAGGAAAGATCAGAGTCAAACAAGAAAACCAAATCCACCTCCTTGGTTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118533	AGAGGAAAGATCAGAGTCAAACAAGAAAACCAAATCCACCTCCTTGGTTC	118582

CU406967.7	801	TGGTCTTAAACTCAAGTCATTTGGACATGAGCCATGGTCCAGACATCAGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118583	TGGTCTTAAACTCAAGTCATTTGGACATGAGCCATGGTCCAGACATCAGC	118632

CU406967.7	851	AACCATGCATAAAATACCCTCAAACATAGTGGCCTTGCGCAACCATTGAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118633	AACCATGCATAAAATACCCTCAAACATAGTGGCCTTGCGCAACCATTGAT	118682

CU406967.7	901	TAGACAATCCTTGGGGCTCTGAGTTGATGTGGTTTGGCTGGGCTCCATCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118683	TAGACAATCCTTGGGGCTCTGAGTTGATGTGGTTTGGCTGGGCTCCATCT	118732

CU406967.7	951	CCTATGGAGCTGTGGTCAGATGGTGGCTAGGACTGGAGCCAGAGAAAGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118733	CCTATGGAGCTGTGGTCAGATGGTGGCTAGGACTGGAGCCAGAGAAAGCC	118782

CU406967.7	1001	TTGACTAAACGAGGCATCTAAGAAGATGATGGAGAGCCATGTACAGCTTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118783	TTGACTAAACGAGGCATCTAAGAAGATGATGGAGAGCCATGTACAGCTTC	118832

CU406967.7	1051	TCCAAGGCACCTGGCTTTGTCACAGCGTGGACGTTCTCGAAGACTCTGCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118833	TCCAAGGCACCTGGCTTTGTCACAGCGTGGACGTTCTCGAAGACTCTGCA	118882

CU406967.7	1101	GAAGGTATGGTGTTCACACCACTGGGATTCACACCATGCAAACTCCCGCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118883	GAAGGTATGGTGTTCACACCACTGGGATTCACACCATGCAAACTCCCGCC	118932

CU406967.7	1151	ACATTCTACTGTGTGCCCTATGCCAGCTGAGGGCCAGTGAAGGAGGACAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118933	ACATTCTACTGTGTGCCCTATGCCAGCTGAGGGCCAGTGAAGGAGGACAG	118982

CU406967.7	1201	GACACAAGGTGTAAACAGCTGGAACCTGAAGATCTAAGGGCCATCTCTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	118983	GACACAAGGTGTAAACAGCTGGAACCTGAAGATCTAAGGGCCATCTCTGG	119032

CU406967.7	1251	ACTTAGACACTGCCTGAGGTCACTGGCACGTGGGAGGACCAGACAGGAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119033	ACTTAGACACTGCCTGAGGTCACTGGCACGTGGGAGGACCAGACAGGAGG	119082

CU406967.7	1301	GAGACATCCTACCATCTAGCTGTCTGCTGGCTGGGTTCTCTGGGCAGTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119083	GAGACATCCTACCATCTAGCTGTCTGCTGGCTGGGTTCTCTGGGCAGTGG	119132

CU406967.7	1351	GCACTGAGGTCTGCTGACATTGTGAAGCAGTAAACACAGCATACAAGCTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119133	GCACTGAGGTCTGCTGACATTGTGAAGCAGTAAACACAGCATACAAGCTC	119182

CU406967.7	1401	CCTTCCCACTGCAGCCAGGGAGGTGGGGTGGGGGTGGGAGGGAAGGGAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119183	CCTTCCCACTGCAGCCAGGGAGGTGGGGTGGGGGTGGGAGGGAAGGGAAG	119232

CU406967.7	1451	GGAGGGACGCAGGCATAGATCTGGAGAACTGTCTCCCAGTTTAGAGCTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119233	GGAGGGACGCAGGCATAGATCTGGAGAACTGTCTCCCAGTTTAGAGCTTT	119282

CU406967.7	1501	TCCCATCAACTTTTGGCTACTGTCACTGGTTCCAGAGCAGCCTACTCAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119283	TCCCATCAACTTTTGGCTACTGTCACTGGTTCCAGAGCAGCCTACTCAGG	119332

CU406967.7	1551	GCATGTGGAAGGAAATAGGCCAGTCTGTGTGGCTCTGTACTTATCAGAGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119333	GCATGTGGAAGGAAATAGGCCAGTCTGTGTGGCTCTGTACTTATCAGAGG	119382

CU406967.7	1601	TCTCAGAGGCCCACTTGTGACTGACAACTCATTCCAGGAGTGGGCCTCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119383	TCTCAGAGGCCCACTTGTGACTGACAACTCATTCCAGGAGTGGGCCTCTA	119432

CU406967.7	1651	CTTCTGAACCCCGGAAACAGCAAAGCTACGCAATGACCCACAGTCGGGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119433	CTTCTGAACCCCGGAAACAGCAAAGCTACGCAATGACCCACAGTCGGGCC	119482

CU406967.7	1701	TGAAAATGTGCTTTGCAATTTCATTCTTTAACTATGCCGCTCAACTTGAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119483	TGAAAATGTGCTTTGCAATTTCATTCTTTAACTATGCCGCTCAACTTGAC	119532

CU406967.7	1751	AAATGGGCCTTGGAGGACAGGCAAGTCATTCTTTTATCCCTCAGGATTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119533	AAATGGGCCTTGGAGGACAGGCAAGTCATTCTTTTATCCCTCAGGATTGT	119582

CU406967.7	1801	GGTTTCAAAACGAGGCCCTAACAGAAGACTCTACCCCTGGGATAACAGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119583	GGTTTCAAAACGAGGCCCTAACAGAAGACTCTACCCCTGGGATAACAGAG	119632

CU406967.7	1851	GCTGCAGCATCTTCCTGTCGAGGATATGTCAAATGCCTACTGGGAGTTCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119633	GCTGCAGCATCTTCCTGTCGAGGATATGTCAAATGCCTACTGGGAGTTCA	119682

CU406967.7	1901	CAGGGTTCTGCATGTCTGTATTGCATGGGCGAGAGACCGCTTCTCACTGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119683	CAGGGTTCTGCATGTCTGTATTGCATGGGCGAGAGACCGCTTCTCACTGC	119732

CU406967.7	1951	CATCCATCTCACTTCCTCCTCCTCCCTCCCCCATGCCCCCATTCCCAGTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU442701.7	119733	CATCCATCTCACTTCCTCCTCCTCCCTCCCCCATGCCCCCATTCCCAGTG	119782

Overview

Query
CU406967.7 - 258144 bps
Hit
CU442701.7 - 119782 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link