<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  CU302294.10	189986	GAATTCCAGGAGCACACCACCATGACTGGCTTAAAAATGACACCAGTCAG	189937
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192465	GAATTCCAGGAGCACACCACCATGACTGGCTTAAAAATGACACCAGTCAG	192514

C  CU302294.10	189936	AATGGCTAAGATGAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTG	189887
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192515	AATGGCTAAGATGAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTG	192564

C  CU302294.10	189886	GAGAAAGGGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAA	189837
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192565	GAGAAAGGGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAA	192614

C  CU302294.10	189836	CCACTCTGGAAATCCGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACT	189787
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192615	CCACTCTGGAAATCCGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACT	192664

C  CU302294.10	189786	ACCGGAAGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCC	189737
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192665	ACCGGAAGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCC	192714

C  CU302294.10	189736	CAACCGATAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTT	189687
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192715	CAACCGATAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTT	192764

C  CU302294.10	189686	ATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATG	189637
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192765	ATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATG	192814

C  CU302294.10	189636	GATACAGAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTA	189587
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192815	GATACAGAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTA	192864

C  CU302294.10	189586	AAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGC	189537
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192865	AAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGC	192914

C  CU302294.10	189536	ATCATCCTGAGTGAGGTAACCCAATCACAAAGGAACTCTCACAATATGTA	189487
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192915	ATCATCCTGAGTGAGGTAACCCAATCACAAAGGAACTCTCACAATATGTA	192964

C  CU302294.10	189486	CTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAAACTTAGGATACCCAAGATATA	189437
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	192965	CTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAAACTTAGGATACCCAAGATATA	193014

C  CU302294.10	189436	AGATATAATTTGCTAAAAACATTAAACTCAAGAGAACGAAGACCAAAGTG	189387
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193015	AGATATAATTTGCTAAAAACATTAAACTCAAGAGAACGAAGACCAAAGTG	193064

C  CU302294.10	189386	TGGACACTTTGCCCCTTCTTAGAATAGGAAACAAAACACCCATGGAAGGA	189337
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193065	TGGACACTTTGCCCCTTCTTAGAATAGGAAACAAAACACCCATGGAAGGA	193114

C  CU302294.10	189336	GTTACAGAGACAAAATCTGGAAGTGTGACGAAAGGATGGACCATCTAGTG	189287
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193115	GTTACAGAGACAAAATCTGGAAGTGTGACGAAAGGATGGACCATCTAGTG	193164

C  CU302294.10	189286	ATTGCCATATCCAGAGATCCATCCCATGATCAGCTTGCAAACGCTGACAC	189237
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193165	ATTGCCATATCCAGAGATCCATCCCATGATCAGCTTGCAAACGCTGACAC	193214

C  CU302294.10	189236	CATTGTATACACTAGCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCAGATATAGCTGTC	189187
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193215	CATTGTATACACTAGCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCAGATATAGCTGTC	193264

C  CU302294.10	189186	TCTTGTGAGACTATGCCAGGGCCTGGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACA	189137
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193265	TCTTGTGAGACTATGCCAGGGCCTGGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACA	193314

C  CU302294.10	189136	GTCAGCTATTGAATGGACCACAGGGCCCCCAATGGAGGAACTAGAGAAAG	189087
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193315	GTCAGCTATTGAATGGACCACAGGGCCCCCAATGGAGGAACTAGAGAAAG	193364

C  CU302294.10	189086	CACCCAAGGAACTAAAGGGAACTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATAT	189037
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193365	CACCCAAGGAACTAAAGGGAACTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATAT	193414

C  CU302294.10	189036	GAACTAAGCAGTACCCCGGAGCTCTTGTCTCTAGCTGCATATGTATCAAA	188987
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193415	GAACTAAGCAGTACCCCGGAGCTCTTGTCTCTAGCTGCATATGTATCAAA	193464

C  CU302294.10	188986	AGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGCAAAGAGAGGCCCATTGGACTTGCAA	188937
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193465	AGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGCAAAGAGAGGCCCATTGGACTTGCAA	193514

C  CU302294.10	188936	ACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAAAAGGGGGAATG	188887
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193515	ACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAAAAGGGGGAATG	193564

C  CU302294.10	188886	GGTGGGTAGGGGAGTGGGGGGGGGGTTATGGGGGACTTTTGGTATAGCAT	188837
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193565	GGTGGGTAGGGGAGTGGGGGGGGGGTTATGGGGGACTTTTGGTATAGCAT	193614

C  CU302294.10	188836	TGGAAATGTAAATGAGCTAAATACCTAATAAAAAATGGAAAAAAAAGAAA	188787
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193615	TGGAAATGTAAATGAGCTAAATACCTAATAAAAAATGGAAAAAAAAGAAA	193664

C  CU302294.10	188786	AAAAATGATGTTGTTCAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGACGAAAGGATGG	188737
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193665	AAAAATGATGTTGTTCAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGACGAAAGGATGG	193714

C  CU302294.10	188736	ACCATGTAGAGACTGCCATATCCAGAGATCCATCCCATGATCAGCTTCCA	188687
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193715	ACCATGTAGAGACTGCCATATCCAGAGATCCATCCCATGATCAGCTTCCA	193764

C  CU302294.10	188686	AACACTGACACCATTGCATACACTAGCAAGACTTTATCAAAAGGACCCAG	188637
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193765	AACACTGACACCATTGCATACACTAGCAAGACTTTATCAAAAGGACCCAG	193814

C  CU302294.10	188636	ATGTAGCTGTCTCTTGTGAGACTAGGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAGT	188587
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193815	ATGTAGCTGTCTCTTGTGAGACTAGGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAGT	193864

C  CU302294.10	188586	GGATGCTCACGGTCAGCTAATGGATGGATCACAGGGCTCCCAATGGAGGA	188537
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193865	GGATGCTCACGGTCAGCTAATGGATGGATCACAGGGCTCCCAATGGAGGA	193914

C  CU302294.10	188536	GCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCTATAGGTGG	188487
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193915	GCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCTATAGGTGG	193964

C  CU302294.10	188486	AACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCTGCA	188437
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	193965	AACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCTGCA	194014

C  CU302294.10	188436	TATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGAAAAGAGAGGCCCAT	188387
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	194015	TATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGAAAAGAGAGGCCCAT	194064

C  CU302294.10	188386	TGGACACGCAAACTGTATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCAAA	188337
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	194065	TGGACACGCAAACTGTATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCAAA	194114

C  CU302294.10	188336	AAAAATGGGAATGAGTGGGTAGAGGAGTGGGGGAGAGGGTATGGGGAACT	188287
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	194115	AAAAATGGGAATGAGTGGGTAGAGGAGTGGGGGAGAGGGTATGGGGAACT	194164

C  CU302294.10	188286	TTTGGGATAGCATTGGAAATGTAATTGAGGAAATATGTAATAAAAAAAAT	188237
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	194165	TTTGGGATAGCATTGGAAATGTAATTGAGGAAATATGTAATAAAAAAAAT	194214

C  CU302294.10	188236	GATGTTGTTCTATGCTGTGTGGTTTTTTTATTTTCTCTACGTCCTATTCA	188187
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	194215	GATGTTGTTCTATGCTGTGTGGTTTTTTTATTTTCTCTACGTCCTATTCA	194264

C  CU302294.10	188186	CACCAAGGAATCCAGATATGAGCACAAATTAAATCGATTTTTTCTTTATT	188137
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	194265	CACCAAGGAATCCAGATATGAGCACAAATTAAATCGATTTTTTCTTTATT	194314

C  CU302294.10	188136	TCTTTGAATCCTAACAACAGCTGGTAAACAAGAATTTAAAAGCCACTAAA	188087
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	194315	TCTTTGAATCCTAACAACAGCTGGTAAACAAGAATTTAAAAGCCACTAAA	194364

C  CU302294.10	188086	ATATTTTATCTTTTATAAATAATAAATTATGTGTTTGCTTGACACTCTCC	188037
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	194365	ATATTTTATCTTTTATAAATAATAAATTATGTGTTTGCTTGACACTCTCC	194414

C  CU302294.10	188036	CTTGGTGATCTAGTAGTTGCTGCCATTGAACACTCAGGATGAACAAACAG	187987
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU424479.8	194415	CTTGGTGATCTAGTAGTTGCTGCCATTGAACACTCAGGATGAACAAACAG	194464

Overview

Query
CU302294.10 - 189986 bps
Hit
CU424479.8 - 194464 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110002000187987189986-11924651944641
Short-link