<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1583 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU406965.9	1	GAATTCACTCTGTAGACCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	154740	GAATTCACTCTGTAGACCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCT	154789

CU406965.9	51	GGGATTAAAGGCATTGCCACCACTGCCCGGCTATTTTTTTTTTAACACCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	154790	GGGATTAAAGGCATTGCCACCACTGCCCGGCTATTTTTTTTTTAACACCT	154839

CU406965.9	101	TTCATAGACATGTGCTCCTTTCCCACCCCATCCATGGTCCCCAATGAATA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	154840	TTCATAGACATGTGCTCCTTTCCCACCCCATCCATGGTCCCCAATGAATA	154889

CU406965.9	151	AAGTGTCAAAGTTGGCCCCACACTGAATACCAAAGGTGCTGAGTCACAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	154890	AAGTGTCAAAGTTGGCCCCACACTGAATACCAAAGGTGCTGAGTCACAGT	154939

CU406965.9	201	TTGGGAAGATGCCCCCACCCTGCTAGCCTTCAAAGATTGGGAAGATGCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	154940	TTGGGAAGATGCCCCCACCCTGCTAGCCTTCAAAGATTGGGAAGATGCCA	154989

CU406965.9	251	AGAGGGTGAGGCCAGCCCCCCAACATAGTTCAGAGAGGCATGGGGGAGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	154990	AGAGGGTGAGGCCAGCCCCCCAACATAGTTCAGAGAGGCATGGGGGAGAC	155039

CU406965.9	301	ACAAGAAACACCCAATTCTTTGTTTGCCCAGTGCCAAGAGAAGGGTCAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155040	ACAAGAAACACCCAATTCTTTGTTTGCCCAGTGCCAAGAGAAGGGTCAGA	155089

CU406965.9	351	TTTTTCCAAGAGTTGGGAAGGGAAACAGGAAGAGTGCTGATGTTGACAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155090	TTTTTCCAAGAGTTGGGAAGGGAAACAGGAAGAGTGCTGATGTTGACAGA	155139

CU406965.9	401	AGAAGGGATGGGAAGGGCCTGAGAAAGAGGCTCTGGGGTGTGGTCTATGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155140	AGAAGGGATGGGAAGGGCCTGAGAAAGAGGCTCTGGGGTGTGGTCTATGG	155189

CU406965.9	451	GGCCACACCTGTCTTCTCGATCAACCCTGATGAAGCCAATGGGGTTTCCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155190	GGCCACACCTGTCTTCTCGATCAACCCTGATGAAGCCAATGGGGTTTCCA	155239

CU406965.9	501	TACTTTTTCCTGCTATAGAGAGCCTCCATGAGAGAGAAAATTCAGTTGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155240	TACTTTTTCCTGCTATAGAGAGCCTCCATGAGAGAGAAAATTCAGTTGCT	155289

CU406965.9	551	CATAAGAGACTGGACATCTAGATGCCCCCGGGGTGTGGAGGGAGCAAGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155290	CATAAGAGACTGGACATCTAGATGCCCCCGGGGTGTGGAGGGAGCAAGAA	155339

CU406965.9	601	GTGTGTACCCTCTGCTCCCCACTTGGAAAGAGCAGCTCCCGTGCTGCTCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155340	GTGTGTACCCTCTGCTCCCCACTTGGAAAGAGCAGCTCCCGTGCTGCTCA	155389

CU406965.9	651	CACTACAGCTCAGTTCTCAGCTGCCCTCTGTGCCATTGTAACCCACTTTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155390	CACTACAGCTCAGTTCTCAGCTGCCCTCTGTGCCATTGTAACCCACTTTC	155439

CU406965.9	701	TTAGCCACCCACCAGCAACCAGGCGTGGGGCAGCCATGGGGGGAAATGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155440	TTAGCCACCCACCAGCAACCAGGCGTGGGGCAGCCATGGGGGGAAATGGC	155489

CU406965.9	751	TTGCCTAAGTGGCTCACAGGCCTGCAGAAATACCGCCTCATTCCCGTTGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155490	TTGCCTAAGTGGCTCACAGGCCTGCAGAAATACCGCCTCATTCCCGTTGC	155539

CU406965.9	801	TACGTGCATGGGTGCATAGGTACACTCATATCTCTGTCTGTGGACATACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155540	TACGTGCATGGGTGCATAGGTACACTCATATCTCTGTCTGTGGACATACA	155589

CU406965.9	851	CGGGTGGCTGTATTCACATAAGCCACACATTAGTGTGTGTGGGCACCCGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155590	CGGGTGGCTGTATTCACATAAGCCACACATTAGTGTGTGTGGGCACCCGT	155639

CU406965.9	901	GCCTGGCAAGAGAGTGACAGGTGGGGTAGGCCAGAGCTCCCTCTCAGAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155640	GCCTGGCAAGAGAGTGACAGGTGGGGTAGGCCAGAGCTCCCTCTCAGAAA	155689

CU406965.9	951	TGGATGTTCCCTCAGAGGGAAGCACAGCCTTGAGTCTGGTCCTCTTGCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155690	TGGATGTTCCCTCAGAGGGAAGCACAGCCTTGAGTCTGGTCCTCTTGCCA	155739

CU406965.9	1001	GGGGCAGGCACTTCACATGGACACAGTCTGTCCCTTGTCTCTCCCATCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155740	GGGGCAGGCACTTCACATGGACACAGTCTGTCCCTTGTCTCTCCCATCTC	155789

CU406965.9	1051	TTTATGTTAGTCTGTGAGACAGGGTCTTATACAGCCCAGACTATTCTTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155790	TTTATGTTAGTCTGTGAGACAGGGTCTTATACAGCCCAGACTATTCTTAA	155839

CU406965.9	1101	ATCTGCTGTGTAGCCAAGCCTGCCCTTGGCCTGCTAGTCCCTCTGCCTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155840	ATCTGCTGTGTAGCCAAGCCTGCCCTTGGCCTGCTAGTCCCTCTGCCTCT	155889

CU406965.9	1151	ATCTCCCACGTGTTGACATTACAGGCATGTGCCACCACACCTAGTTATGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155890	ATCTCCCACGTGTTGACATTACAGGCATGTGCCACCACACCTAGTTATGT	155939

CU406965.9	1201	GATTCAGGGGATCATACTTAGAGCCTTCTGTATGCTAGGCAGGCACCCCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155940	GATTCAGGGGATCATACTTAGAGCCTTCTGTATGCTAGGCAGGCACCCCA	155989

CU406965.9	1251	GCAACTGAGTAGCATCCTTCTGTCTCTTGATCACCAGTCATGGAGAGGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	155990	GCAACTGAGTAGCATCCTTCTGTCTCTTGATCACCAGTCATGGAGAGGCT	156039

CU406965.9	1301	ATGCAAACACCTTCCTCTTTGGCCCAGAGGAACCTAGGATGTGTGTCCAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	156040	ATGCAAACACCTTCCTCTTTGGCCCAGAGGAACCTAGGATGTGTGTCCAT	156089

CU406965.9	1351	TGGGAGAGGGGGAGTCACAGTCCTTCCTTCCTGGCCAGCCAACACTCCCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	156090	TGGGAGAGGGGGAGTCACAGTCCTTCCTTCCTGGCCAGCCAACACTCCCA	156139

CU406965.9	1401	CTGTTCACTCTGCCTCCTGCCCTCTCAGCCTCTCTGTTTCAGAGGATCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	156140	CTGTTCACTCTGCCTCCTGCCCTCTCAGCCTCTCTGTTTCAGAGGATCTG	156189

CU406965.9	1451	GGCACCTGCCAACATGGCACAACTCTTACCCCAGTTCAAACCTACCCTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	156190	GGCACCTGCCAACATGGCACAACTCTTACCCCAGTTCAAACCTACCCTGT	156239

CU406965.9	1501	CTCTTCCTGCTCCCTGTTCAAGCCCTCTCTCCTACCTCATACATTTCTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	156240	CTCTTCCTGCTCCCTGTTCAAGCCCTCTCTCCTACCTCATACATTTCTTC	156289

CU406965.9	1551	TCAAACTGTCTCTCCAGTTTTCCCAGAGAATTC	1583
			|||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407310.14	156290	TCAAACTGTCTCTCCAGTTTTCCCAGAGAATTC	156322

Overview

Query
CU406965.9 - 229613 bps
Hit
CU407310.14 - 156322 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1583 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link