<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU457480.8	1	TGTGCCCTCTGCCACATCACAGCAGACAAGGGGCAGGTACAGCTCTCCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151176	TGTGCCCTCTGCCACATCACAGCAGACAAGGGGCAGGTACAGCTCTCCCA	151225

CU457480.8	51	CATCTATACCCTTGGGGCCAGCTCACCCACACCCCTGTCACTAAGACCAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151226	CATCTATACCCTTGGGGCCAGCTCACCCACACCCCTGTCACTAAGACCAG	151275

CU457480.8	101	GTCCACGGTGCTGCTTGGGCAGGGGGCAGGTTCCACTTTCCCAAGTGCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151276	GTCCACGGTGCTGCTTGGGCAGGGGGCAGGTTCCACTTTCCCAAGTGCTG	151325

CU457480.8	151	CCAGTGATGAGAGATGGGGCTAGCTCTCCAGAAGTGCTGTACAGTGAGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151326	CCAGTGATGAGAGATGGGGCTAGCTCTCCAGAAGTGCTGTACAGTGAGAG	151375

CU457480.8	201	GCGGGGCCAGCTATGCACAGTTTCTGAAGAGCTAGGTGATCCCCAGTGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151376	GCGGGGCCAGCTATGCACAGTTTCTGAAGAGCTAGGTGATCCCCAGTGGC	151425

CU457480.8	251	TGCCCCAACTAGGAACATCCCTGTATTGTTTAGTGATAATATGAGCCATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151426	TGCCCCAACTAGGAACATCCCTGTATTGTTTAGTGATAATATGAGCCATG	151475

CU457480.8	301	GACATTGGCAACAACTCCTGCTACTGAATAGCTACTGCATAGCTGTGGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151476	GACATTGGCAACAACTCCTGCTACTGAATAGCTACTGCATAGCTGTGGGA	151525

CU457480.8	351	TCAGGCTTGGCCCTCAGTGGCAAGTTGGGCTGGGACCTCACCATGGCCCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151526	TCAGGCTTGGCCCTCAGTGGCAAGTTGGGCTGGGACCTCACCATGGCCCC	151575

CU457480.8	401	AGGTGGAAAGACTGGCCACTCACAGCAGGTTCCTCCTCTCCACTCTCAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151576	AGGTGGAAAGACTGGCCACTCACAGCAGGTTCCTCCTCTCCACTCTCAAG	151625

CU457480.8	451	TCTCCAGTTCCATCTCTCTTCATAATGCTTAAGCTGCTCCACTTCTCTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151626	TCTCCAGTTCCATCTCTCTTCATAATGCTTAAGCTGCTCCACTTCTCTTT	151675

CU457480.8	501	CTCTCCCATCTGAACATTATGCACATTGTGGTGTCTCTGGGTGACATCTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151676	CTCTCCCATCTGAACATTATGCACATTGTGGTGTCTCTGGGTGACATCTA	151725

CU457480.8	551	TCCTTTTGCATGATGTGAAGGCAAGTGGGCACCCCTGGCCTGTATGTTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151726	TCCTTTTGCATGATGTGAAGGCAAGTGGGCACCCCTGGCCTGTATGTTCT	151775

CU457480.8	601	GATTGCAGAAGAGCAGGTCTGTTGGGTGACATTGCATTGCAGTCCACAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151776	GATTGCAGAAGAGCAGGTCTGTTGGGTGACATTGCATTGCAGTCCACAGA	151825

CU457480.8	651	TCTCTGTATCCCTCCCGTGCTGTGTTGCCTGCATTTGATTTGATCTGATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151826	TCTCTGTATCCCTCCCGTGCTGTGTTGCCTGCATTTGATTTGATCTGATT	151875

CU457480.8	701	TGATTTTTATGAGTCAGCTTTGGCCACTGTCTTAGTTAGGATTTTATTGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151876	TGATTTTTATGAGTCAGCTTTGGCCACTGTCTTAGTTAGGATTTTATTGC	151925

CU457480.8	751	TGTGAACAGACACCATGACCAAGATAAGTCTTATAAAGGACAACATTTAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151926	TGTGAACAGACACCATGACCAAGATAAGTCTTATAAAGGACAACATTTAA	151975

CU457480.8	801	TTGGGTCTGGCTTATAGGTTCAGAGGTTCAGTCCAATATCATCAAGGTGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	151976	TTGGGTCTGGCTTATAGGTTCAGAGGTTCAGTCCAATATCATCAAGGTGG	152025

CU457480.8	851	GAGCATGGCAGCATCCAGGCAGAGATGATGCAGGAGGAGCTGAGGGTTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152026	GAGCATGGCAGCATCCAGGCAGAGATGATGCAGGAGGAGCTGAGGGTTCT	152075

CU457480.8	901	ACATCTCCATCTGAAGGCTGATAGCACAATACTGACTTCCGTGCAGCTAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152076	ACATCTCCATCTGAAGGCTGATAGCACAATACTGACTTCCGTGCAGCTAG	152125

CU457480.8	951	GATGAGGGTCTTAAGCCCACACGCACAGTGACACACCCACTCCAACAAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152126	GATGAGGGTCTTAAGCCCACACGCACAGTGACACACCCACTCCAACAAGA	152175

CU457480.8	1001	CTATACCTCCTAATAGGGCCACTCCCTGGGCCAAGTATATACAAACTTTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152176	CTATACCTCCTAATAGGGCCACTCCCTGGGCCAAGTATATACAAACTTTC	152225

CU457480.8	1051	ACAGCCACCAAACCTACCATCAAGCTATGATGAACAAAGGACTGCCATCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152226	ACAGCCACCAAACCTACCATCAAGCTATGATGAACAAAGGACTGCCATCT	152275

CU457480.8	1101	TCTCTGCCCGTGATTGATGTACAAACACCACCACCAATAAGATGTCTCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152276	TCTCTGCCCGTGATTGATGTACAAACACCACCACCAATAAGATGTCTCTT	152325

CU457480.8	1151	TGCCCCTGGCTGGGAGGGATTCACTGGTGTTTTAATAATTTCTTTAAAAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152326	TGCCCCTGGCTGGGAGGGATTCACTGGTGTTTTAATAATTTCTTTAAAAC	152375

CU457480.8	1201	TTTTTTTATTCTACATTTTCATTTTTAGTAGTTTCAGTTGCTTTCTACAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152376	TTTTTTTATTCTACATTTTCATTTTTAGTAGTTTCAGTTGCTTTCTACAA	152425

CU457480.8	1251	TGAGTTGAACTATTTGATTTCCTTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152426	TGAGTTGAACTATTTGATTTCCTTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT	152475

CU457480.8	1301	TCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152476	TCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCC	152525

CU457480.8	1351	CTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTTCTTTCTTTCCTTCTTTCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152526	CTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTTCTTTCTTTCCTTCTTTCAT	152575

CU457480.8	1401	GCTGTAATAGTTATTCTACCACTGAGTTAAATCCTCAAACTCTTGAACTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152576	GCTGTAATAGTTATTCTACCACTGAGTTAAATCCTCAAACTCTTGAACTC	152625

CU457480.8	1451	ATTGGTATTTTATTCTGTGACACCCAGTTTGTTGTACATCTTAAACATCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152626	ATTGGTATTTTATTCTGTGACACCCAGTTTGTTGTACATCTTAAACATCA	152675

CU457480.8	1501	GATATTATAATATTCACCTTCAAAAGTTTGGTCACACACACACATACGTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152676	GATATTATAATATTCACCTTCAAAAGTTTGGTCACACACACACATACGTA	152725

CU457480.8	1551	CAAGTATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152726	CAAGTATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATA	152775

CU457480.8	1601	TGACATCATACTTAAAATGGTTATAATGTTCTAGAGATGACTGTGAGCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152776	TGACATCATACTTAAAATGGTTATAATGTTCTAGAGATGACTGTGAGCAT	152825

CU457480.8	1651	CCACTTCTGTGTTTGCCAGGCACTGGGATAGCCTCACACGAGACAGCTAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152826	CCACTTCTGTGTTTGCCAGGCACTGGGATAGCCTCACACGAGACAGCTAT	152875

CU457480.8	1701	ATCAGGGTTGTTTCAGCAAAATCTTGCTGGCATATGCAATAGTGTCTGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152876	ATCAGGGTTGTTTCAGCAAAATCTTGCTGGCATATGCAATAGTGTCTGCA	152925

CU457480.8	1751	TTTGGTAGCTGATTATGGGATGGATCCCCGGTTGGGGCAGTCTCTGGATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152926	TTTGGTAGCTGATTATGGGATGGATCCCCGGTTGGGGCAGTCTCTGGATG	152975

CU457480.8	1801	GTCCATCCTTTCGTCTTAGCTCCAAACTTTGTCTCTGCAACTCTTTCCAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	152976	GTCCATCCTTTCGTCTTAGCTCCAAACTTTGTCTCTGCAACTCTTTCCAC	153025

CU457480.8	1851	GGATATTTTATTCCCTATTCTAGGGAGGAATGAAGTATCCATGAGTTGGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	153026	GGATATTTTATTCCCTATTCTAGGGAGGAATGAAGTATCCATGAGTTGGT	153075

CU457480.8	1901	CTTCCTTCTTGCTTTTCTTGTATTTTAGAAGTTGTATCTTGGGTATTCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	153076	CTTCCTTCTTGCTTTTCTTGTATTTTAGAAGTTGTATCTTGGGTATTCTA	153125

CU457480.8	1951	GGTTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTGCATATCAAGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407305.6	153126	GGTTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTGCATATCAAGTGAATTC	153175

Overview

Query
CU457480.8 - 144649 bps
Hit
CU407305.6 - 153175 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link