<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU369188.7	1	GAATTCACTTTGGACTTACAGCCACCAACAGGGAGTTCACAACCGGTTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	225765	GAATTCACTTTGGACTTACAGCCACCAACAGGGAGTTCACAACCGGTTTT	225814

CU369188.7	51	ACTACAAGTCTGATGGTGAAGAGGAGGCCAGGACTAATCCCTGCAAAGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	225815	ACTACAAGTCTGATGGTGAAGAGGAGGCCAGGACTAATCCCTGCAAAGAT	225864

CU369188.7	101	GTGGAGTTGGAGGCCCCAGGACTTCCCAGCTTCCCAAGCATTTTCCTCTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	225865	GTGGAGTTGGAGGCCCCAGGACTTCCCAGCTTCCCAAGCATTTTCCTCTT	225914

CU369188.7	151	TCCCTTTGTCTGTGAACCTCAGTAAAACTTCAGACCTGCTCCCCTTCCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	225915	TCCCTTTGTCTGTGAACCTCAGTAAAACTTCAGACCTGCTCCCCTTCCTG	225964

CU369188.7	201	GTGAGCACGATAAGGTCTTCCTTCAACACTCCCCAGGTTTTTATCCCTGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	225965	GTGAGCACGATAAGGTCTTCCTTCAACACTCCCCAGGTTTTTATCCCTGT	226014

CU369188.7	251	AACTGATGTCTCACATCCCCAGGAAGCACAGTAAAATTGTTCTGAACCCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226015	AACTGATGTCTCACATCCCCAGGAAGCACAGTAAAATTGTTCTGAACCCC	226064

CU369188.7	301	CACATGTAACAATTCTTTTTTTCTCCAGGACATATATAAAAAGTTCTCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226065	CACATGTAACAATTCTTTTTTTCTCCAGGACATATATAAAAAGTTCTCCA	226114

CU369188.7	351	CCCACATGGTAGGTATGAATGCCATAAAGTCTGTTGGGTGTCAGGCCATG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226115	CCCACATGGTAGGTATGAATGCCATAAAGTCTGTTGGGTGTCAGGCCATG	226164

CU369188.7	401	AGTTATCAGACAACTGGCACAGATCAAAGGCAAAGTCTGGAAACCATGGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226165	AGTTATCAGACAACTGGCACAGATCAAAGGCAAAGTCTGGAAACCATGGT	226214

CU369188.7	451	GTCCCAAGTGGCTTTTTTGTATTAGCCAGTTGGGCCCCAGTAACCTGTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226215	GTCCCAAGTGGCTTTTTTGTATTAGCCAGTTGGGCCCCAGTAACCTGTTT	226264

CU369188.7	501	CAGGATTCTCAATTGTCCAAGTCAAGTCATAAGGCTGGTGTGAGTTTTTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226265	CAGGATTCTCAATTGTCCAAGTCAAGTCATAAGGCTGGTGTGAGTTTTTG	226314

CU369188.7	551	ATCTGTGAATGGAGACATGGGCTGGGAACATTAGTGCATGCAACCAGTAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226315	ATCTGTGAATGGAGACATGGGCTGGGAACATTAGTGCATGCAACCAGTAA	226364

CU369188.7	601	AAACAGTAAGCTTGGGACCTAGTTAATTATAACTTGAAGGGATGAGTGCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226365	AAACAGTAAGCTTGGGACCTAGTTAATTATAACTTGAAGGGATGAGTGCT	226414

CU369188.7	651	CCTTTGGATCCTCTATTCCAGCATTGGCAGCTGTGAATTCTGACCATCTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226415	CCTTTGGATCCTCTATTCCAGCATTGGCAGCTGTGAATTCTGACCATCTT	226464

CU369188.7	701	CTTCTGGAAAGAATGGATCAGCATGTCTAATGTGAGTGCAGTGTATCCAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226465	CTTCTGGAAAGAATGGATCAGCATGTCTAATGTGAGTGCAGTGTATCCAA	226514

CU369188.7	751	ACAGTGACCCTGTCCACCTATACAACTGTTGGAGCTGTTAGCAGGATGAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226515	ACAGTGACCCTGTCCACCTATACAACTGTTGGAGCTGTTAGCAGGATGAC	226564

CU369188.7	801	TTAAGGTCCCTGCCACTAAGACTCCAGCTCTTCCTGGCGAAACCTAGTCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226565	TTAAGGTCCCTGCCACTAAGACTCCAGCTCTTCCTGGCGAAACCTAGTCT	226614

CU369188.7	851	CCAGGTTGAAACTTGTGGGACTCTGGAACCCGGTCTATTTCATAGAGGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226615	CCAGGTTGAAACTTGTGGGACTCTGGAACCCGGTCTATTTCATAGAGGGC	226664

CU369188.7	901	ACCCAGTTTAGGCCACACCTGCTCATGTACCCATTGTGTTGCTCTGACCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226665	ACCCAGTTTAGGCCACACCTGCTCATGTACCCATTGTGTTGCTCTGACCT	226714

CU369188.7	951	TAGTTATTAATACATCATCTTCTAATTCTACGATGGTTGCTGACTGAAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226715	TAGTTATTAATACATCATCTTCTAATTCTACGATGGTTGCTGACTGAAGG	226764

CU369188.7	1001	TTAGGAACAATAGGGGCCGGGACACCATACATGATTTCAAAAGGAGTTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226765	TTAGGAACAATAGGGGCCGGGACACCATACATGATTTCAAAAGGAGTTGG	226814

CU369188.7	1051	TCCTAACCAGTAAGAGCAAAGGGAAGGCATGCCACTAGTCTATGGCAGTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226815	TCCTAACCAGTAAGAGCAAAGGGAAGGCATGCCACTAGTCTATGGCAGTC	226864

CU369188.7	1101	TCCAGGGCTAATTTAGTCAAGGTCTCCTGAAGTGTCTGATTCATTCTTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226865	TCCAGGGCTAATTTAGTCAAGGTCTCCTGAAGTGTCTGATTCATTCTTTC	226914

CU369188.7	1151	TACCTGTCCTGAACTTTGGGGCCTGTACACAAAATGTAATTTCCAATCCG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226915	TACCTGTCCTGAACTTTGGGGCCTGTACACAAAATGTAATTTCCAATCCG	226964

CU369188.7	1201	CCCCAATATATCTCACTATATCCTGGCTTACTTTGGACACAAATGCTGGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	226965	CCCCAATATATCTCACTATATCCTGGCTTACTTTGGACACAAATGCTGGT	227014

CU369188.7	1251	CCATTGTCTGACCCTATCGTATGCGTGAAGCCATACCTGGATAGGATATA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227015	CCATTGTCTGACCCTATCGTATGCGTGAAGCCATACCTGGATAGGATATA	227064

CU369188.7	1301	TTCCAGTAACTTCTTAGCTACTACGTTTGCAGTCTCAGTCTTCGTTGGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227065	TTCCAGTAACTTCTTAGCTACTACGTTTGCAGTCTCAGTCTTCGTTGGAA	227114

CU369188.7	1351	AGGCTCTGACCATATGGAGAATGTATCCACGAACACTAGTAAGTACCTGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227115	AGGCTCTGACCATATGGAGAATGTATCCACGAACACTAGTAAGTACCTGT	227164

CU369188.7	1401	AGCCGTACTTTCCTGGTTTGATTTCTGTAAAATCAACTTCCCAGTAGGTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227165	AGCCGTACTTTCCTGGTTTGATTTCTGTAAAATCAACTTCCCAGTAGGTC	227214

CU369188.7	1451	CCTGGTCTCTAACCTCACAGACATGATCCAGGATGTTTGGCAGTGTTGTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227215	CCTGGTCTCTAACCTCACAGACATGATCCAGGATGTTTGGCAGTGTTGTG	227264

CU369188.7	1501	GGTGTTGGTCAGTTGGCAAGCTTTGCAGCTTGATACTACATCTTTGATAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227265	GGTGTTGGTCAGTTGGCAAGCTTTGCAGCTTGATACTACATCTTTGATAG	227314

CU369188.7	1551	TATGCTGCATGTTTCTGAAAATCACTTTAGGTTGTCTCACTGCATCTGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227315	TATGCTGCATGTTTCTGAAAATCACTTTAGGTTGTCTCACTGCATCTGCC	227364

CU369188.7	1601	ATCTGTTTCACTCCCATGCGAGTGACTCTGGGGATTTTCTTGAGGATAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227365	ATCTGTTTCACTCCCATGCGAGTGACTCTGGGGATTTTCTTGAGGATAGA	227414

CU369188.7	1651	TCTTTCTAGGGAGGCTGGTAATATTAGCTAACCTTCAGTCATCTGCCACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227415	TCTTTCTAGGGAGGCTGGTAATATTAGCTAACCTTCAGTCATCTGCCACA	227464

CU369188.7	1701	AGCCTTCTGAACTCCAGCTCATGGGCTGACTCTTGGCCCATTTGTCCTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227465	AGCCTTCTGAACTCCAGCTCATGGGCTGACTCTTGGCCCATTTGTCCTCC	227514

CU369188.7	1751	TCCTCTGTGTAGGCTGGGCATTCCAGTAGGTTGGGGTTGGATGGTTCTGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227515	TCCTCTGTGTAGGCTGGGCATTCCAGTAGGTTGGGGTTGGATGGTTCTGG	227564

CU369188.7	1801	TAGAGTGGCAGCTAACACGGAAGCAGCTGTTTCCTCTAAGGCTTTGAACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227565	TAGAGTGGCAGCTAACACGGAAGCAGCTGTTTCCTCTAAGGCTTTGAACT	227614

CU369188.7	1851	TTAACTCTAAGAACTTTGGCAGTTCTGACAGTCAAGTTATTACCTCTGGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227615	TTAACTCTAAGAACTTTGGCAGTTCTGACAGTCAAGTTATTACCTCTGGC	227664

CU369188.7	1901	AACTGCCGTGGTTCTGTTTTGGTGGCCCGGACATTGTATGATTGCCACTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227665	AACTGCCGTGGTTCTGTTTTGGTGGCCCGGACATTGTATGATTGCCACTC	227714

CU369188.7	1951	TCTTTGGCATCCTGAGGGCTTCAAGTAACTGTAGGATCTCATCTTTGTTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU407123.9	227715	TCTTTGGCATCCTGAGGGCTTCAAGTAACTGTAGGATCTCATCTTTGTTT	227764

Overview

Query
CU369188.7 - 254931 bps
Hit
CU407123.9 - 227764 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link