<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1842 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU406960.9	1	TGTTTACAGTCTAACACCCTGACCCATCGTGGGAGCCCAGGTAAAGGGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214320	TGTTTACAGTCTAACACCCTGACCCATCGTGGGAGCCCAGGTAAAGGGAG	214369

CU406960.9	51	GAAGAGTTAATATGCTGAGAGTCAGAAAACTTATAAAGAAATAAAAATTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214370	GAAGAGTTAATATGCTGAGAGTCAGAAAACTTATAAAGAAATAAAAATTG	214419

CU406960.9	101	CCCCCAAACTCAAAAGCCTTTCTCTCCTTTCTACCTGGGTTCTTGAATTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214420	CCCCCAAACTCAAAAGCCTTTCTCTCCTTTCTACCTGGGTTCTTGAATTA	214469

CU406960.9	151	GGGTCAAAGCCAGCAGCTGCGGGATCGTCACACCCTTACCCTTTAATCCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214470	GGGTCAAAGCCAGCAGCTGCGGGATCGTCACACCCTTACCCTTTAATCCC	214519

CU406960.9	201	AGCGATGCTGAGCCGGCTTCCATCCCCTCGCTGAGCTAGCCAGCTGTCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214520	AGCGATGCTGAGCCGGCTTCCATCCCCTCGCTGAGCTAGCCAGCTGTCTG	214569

CU406960.9	251	ACTGCTTGAAAATGGCGGAAGAGGAAGAGGGCGGCGTGGAGGAGGGGGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214570	ACTGCTTGAAAATGGCGGAAGAGGAAGAGGGCGGCGTGGAGGAGGGGGAC	214619

CU406960.9	301	GTGTTCCTAGCATTTGCCCAGGGTCCCATTCCTCCTCGGGGGCCCGTGCG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214620	GTGTTCCTAGCATTTGCCCAGGGTCCCATTCCTCCTCGGGGGCCCGTGCG	214669

CU406960.9	351	GCGGGCTTTGGACAAGATCTTCCTCGCCTTCTTGGTCCTCTTCCTGACTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214670	GCGGGCTTTGGACAAGATCTTCCTCGCCTTCTTGGTCCTCTTCCTGACTC	214719

CU406960.9	401	TGCTGATGCTGGAGGCTGCTTACAAACTGCTGTGGCCCCTGCCATGGGCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214720	TGCTGATGCTGGAGGCTGCTTACAAACTGCTGTGGCCCCTGCCATGGGCC	214769

CU406960.9	451	AAGTTTCAGGACTGGCTCCTGAGGACCCCTGAGGAGGAGGCAGCTCTGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214770	AAGTTTCAGGACTGGCTCCTGAGGACCCCTGAGGAGGAGGCAGCTCTGGA	214819

CU406960.9	501	ACTCTGAGCGTCTTCATAGACCACCTGTCCTTGCTACTGAGGTGAGAAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214820	ACTCTGAGCGTCTTCATAGACCACCTGTCCTTGCTACTGAGGTGAGAAAG	214869

CU406960.9	551	GAGATGTTAGAGAGGTCAGGGTGGAAGACATAGTTAAGGCCAACACTCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214870	GAGATGTTAGAGAGGTCAGGGTGGAAGACATAGTTAAGGCCAACACTCTG	214919

CU406960.9	601	AGATTATCTTTGTTTATCTGCGTTTCTGTTTGTGGGTATGTGCATGAGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214920	AGATTATCTTTGTTTATCTGCGTTTCTGTTTGTGGGTATGTGCATGAGTT	214969

CU406960.9	651	CAGGTGCCCGCGGAAGCTAGAGGTTGTCGGATCCCTAGGGGCTGGGGTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	214970	CAGGTGCCCGCGGAAGCTAGAGGTTGTCGGATCCCTAGGGGCTGGGGTTA	215019

CU406960.9	701	TAGAAGGTGTTAGTCACCTGAAGTGGGTACTGGGAACCAGACTCAGGTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215020	TAGAAGGTGTTAGTCACCTGAAGTGGGTACTGGGAACCAGACTCAGGTCT	215069

CU406960.9	751	GCAACACACACACACACACCTTTATATACATACTGTATATAAATGTAATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215070	GCAACACACACACACACACCTTTATATACATACTGTATATAAATGTAATT	215119

CU406960.9	801	TCAGAACCCACATGAGAGCATACAAAGAATAATTTTTCCTTTTGAATAGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215120	TCAGAACCCACATGAGAGCATACAAAGAATAATTTTTCCTTTTGAATAGC	215169

CU406960.9	851	TTATTTTGCTTAAGAATGTACTTTTTTCTTTTATTTTTTAAGATTTAAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215170	TTATTTTGCTTAAGAATGTACTTTTTTCTTTTATTTTTTAAGATTTAAAG	215219

CU406960.9	901	TGCACTGTAGCTATCTTAGACATTTTTTTCTTCTCTCTCCAGCCCAGCTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215220	TGCACTGTAGCTATCTTAGACATTTTTTTCTTCTCTCTCCAGCCCAGCTC	215269

CU406960.9	951	ACTCAAAGATTTATTATATGTACGTACACTGTCGCTGTCTTCAGACACCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215270	ACTCAAAGATTTATTATATGTACGTACACTGTCGCTGTCTTCAGACACCC	215319

CU406960.9	1001	CAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTAAGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215320	CAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTAAGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGG	215369

CU406960.9	1051	TTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGAACAGCAGTCAGTGCTCTTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215370	TTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGAACAGCAGTCAGTGCTCTTAA	215419

CU406960.9	1101	CCGCTGAGCCATTTCTCCAACCCTTAAGAGTGTATTTTATTTCCTTTTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215420	CCGCTGAGCCATTTCTCCAACCCTTAAGAGTGTATTTTATTTCCTTTTGA	215469

CU406960.9	1151	TTTCCTGCAAGTATCATGGTTTCAGTTTTCTTTCTGGCTGTAAGACTCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215470	TTTCCTGCAAGTATCATGGTTTCAGTTTTCTTTCTGGCTGTAAGACTCCA	215519

CU406960.9	1201	TTGTATGTCCGAACCACATTTTATCTGTTTTACGGGCCAGTTGGCTGCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215520	TTGTATGTCCGAACCACATTTTATCTGTTTTACGGGCCAGTTGGCTGCTT	215569

CU406960.9	1251	CTGTTCTTTTGCCTATTGCAATCGCTACAGCAATAAACATGGATGTGTAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215570	CTGTTCTTTTGCCTATTGCAATCGCTACAGCAATAAACATGGATGTGTAC	215619

CU406960.9	1301	GTGGTGTTCTGACTTAAATTTCTTCAAGTATCTATCCAGGAGCAATACAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215620	GTGGTGTTCTGACTTAAATTTCTTCAAGTATCTATCCAGGAGCAATACAT	215669

CU406960.9	1351	CTAGGACATGTTAGGTCTTAGGCCGTGCATAGGTCCAGAGATGGGTCCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215670	CTAGGACATGTTAGGTCTTAGGCCGTGCATAGGTCCAGAGATGGGTCCTG	215719

CU406960.9	1401	GCCCACCTCAAGCTGGACTCTAGAAGAGTCCCTGGCAGTTAGACAAAGGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215720	GCCCACCTCAAGCTGGACTCTAGAAGAGTCCCTGGCAGTTAGACAAAGGC	215769

CU406960.9	1451	CAGAATTCCCCCAGGACCTTGTGAAACAGGCTCCTGTCTGCAGAAAGGAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215770	CAGAATTCCCCCAGGACCTTGTGAAACAGGCTCCTGTCTGCAGAAAGGAT	215819

CU406960.9	1501	GTTTCCCTTGCCTCTGGAAAAAGGACACAAGGCTCAGCAGTGTGCCTGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215820	GTTTCCCTTGCCTCTGGAAAAAGGACACAAGGCTCAGCAGTGTGCCTGGG	215869

CU406960.9	1551	GTGCCTCTGTGCGTGTTCCCACACTAGCATCCTCCTTCCTGAGACTCCCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215870	GTGCCTCTGTGCGTGTTCCCACACTAGCATCCTCCTTCCTGAGACTCCCA	215919

CU406960.9	1601	GCCCTGCTCCAGGTCAGGGCCTCCCTAACCCTAGCTCCCTCCATATACAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215920	GCCCTGCTCCAGGTCAGGGCCTCCCTAACCCTAGCTCCCTCCATATACAT	215969

CU406960.9	1651	CTCATACGCAGCGGCTGTCTACCATTTCTCATCATGGCTGCTCACAGCTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	215970	CTCATACGCAGCGGCTGTCTACCATTTCTCATCATGGCTGCTCACAGCTC	216019

CU406960.9	1701	CAGTCCCTGGGATCAGTCCACCCTCTTTTGATCTTCATGTCCATAAAAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	216020	CAGTCCCTGGGATCAGTCCACCCTCTTTTGATCTTCATGTCCATAAAAAG	216069

CU406960.9	1751	TACTTTGAGCATTTGTGATTATTGCAGGAACAGAATGGATCAGACAATGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	216070	TACTTTGAGCATTTGTGATTATTGCAGGAACAGAATGGATCAGACAATGT	216119

CU406960.9	1801	AAAAACCTATGCTTACTTTTATTCATTATATATAAGGAATTC	1842
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU405655.14	216120	AAAAACCTATGCTTACTTTTATTCATTATATATAAGGAATTC	216161

Overview

Query
CU406960.9 - 184215 bps
Hit
CU405655.14 - 216161 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1842 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link