<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU210937.2 1 GAATTCACTTATTTTTAAAATGCAGGTGAAAATACTGAACCCTGTTGGGC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 1995 GAATTCACTTATTTTTAAAATGCAGGTGAAAATACTGAACCCTGTTGGGC 2044 CU210937.2 51 ATGTCTGTAATCCTGGCGCTCAGGACCCAAATATAGGCAAGTCAGGAGTT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2045 ATGTCTGTAATCCTGGCGCTCAGGACCCAAATATAGGCAAGTCAGGAGTT 2094 CU210937.2 101 CAGGGGAGCCAGGCCACAAAGCAAGAGCAAACAAACGAAGCCTTCTTGGA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2095 CAGGGGAGCCAGGCCACAAAGCAAGAGCAAACAAACGAAGCCTTCTTGGA 2144 CU210937.2 151 CTGGAGGTGTCCCTAATGTCAAAACTGGTGGAGCGTTGGCTAAGCATACA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2145 CTGGAGGTGTCCCTAATGTCAAAACTGGTGGAGCGTTGGCTAAGCATACA 2194 CU210937.2 201 TAAGGCTTTATCCAAGGTTAAGGTTCTCCAACCTTAGCACAAAAATCTCT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2195 TAAGGCTTTATCCAAGGTTAAGGTTCTCCAACCTTAGCACAAAAATCTCT 2244 CU210937.2 251 ACCACTGGGGCTGGGGAGATGGTTCAGCGGTTAGGAGCACTGACTGTTCT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2245 ACCACTGGGGCTGGGGAGATGGTTCAGCGGTTAGGAGCACTGACTGTTCT 2294 CU210937.2 301 TCAAGAGGCCCTGAAGCCGGGTGTGGTGGTGCACGCCTTTAATCCCAGCA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2295 TCAAGAGGCCCTGAAGCCGGGTGTGGTGGTGCACGCCTTTAATCCCAGCA 2344 CU210937.2 351 CTTGGGAGGCAGAGGCAGATGGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCAGTTCA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2345 CTTGGGAGGCAGAGGCAGATGGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCAGTTCA 2394 CU210937.2 401 AGGTCTAGAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAAAGCTATACAGAGAAACCCT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2395 AGGTCTAGAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAAAGCTATACAGAGAAACCCT 2444 CU210937.2 451 GTCTTGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2445 GTCTTGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAG 2494 CU210937.2 501 AAAGAAAAGAAGAAAAAGAAAGAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGAGAA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2495 AAAGAAAAGAAGAAAAAGAAAGAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGAGAA 2544 CU210937.2 551 AAAAACTGATGGCCGTGTATAAAAGGGAGGTAACTCATTCACACTTACTG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2545 AAAAACTGATGGCCGTGTATAAAAGGGAGGTAACTCATTCACACTTACTG 2594 CU210937.2 601 TTTAGGTGAAGTGAAGTTGGATCAGAGGGGTAAAGAATGCTGGCCTGGGC 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2595 TTTAGGTGAAGTGAAGTTGGATCAGAGGGGTAAAGAATGCTGGCCTGGGC 2644 CU210937.2 651 ACTCGGGAGGCAGAAGCAGGTGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2645 ACTCGGGAGGCAGAAGCAGGTGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTC 2694 CU210937.2 701 TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2695 TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTC 2744 CU210937.2 751 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCTGGCCTGAGCCAGTGAAACAGGCT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2745 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCTGGCCTGAGCCAGTGAAACAGGCT 2794 CU210937.2 801 TCGTTGGTAAAGGTTCTTGTCTTAAATTTGAGGATACGAGTTTGCTGCTC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2795 TCGTTGGTAAAGGTTCTTGTCTTAAATTTGAGGATACGAGTTTGCTGCTC 2844 CU210937.2 851 AAGACCCACAAGGTAGAAAGACAGGACTGACTCTCTAACGTTGTCCTCTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2845 AAGACCCACAAGGTAGAAAGACAGGACTGACTCTCTAACGTTGTCCTCTG 2894 CU210937.2 901 ACTCTGGGGATATGCAGTTTTACACCAAGACTCCACCATGACATGCACGT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2895 ACTCTGGGGATATGCAGTTTTACACCAAGACTCCACCATGACATGCACGT 2944 CU210937.2 951 CTGAGCACGCGCACACACACAAACACACACACATATATACACACTTTTGT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2945 CTGAGCACGCGCACACACACAAACACACACACATATATACACACTTTTGT 2994 CU210937.2 1001 AAAAAGGTCAGACTTTCATTTATCCCGACTCTCACCCCAACTCAGGGTTT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 2995 AAAAAGGTCAGACTTTCATTTATCCCGACTCTCACCCCAACTCAGGGTTT 3044 CU210937.2 1051 CTCTCTTTATTTGTTTGTTTTTCGGGTGAAATGTCCTTTAGGAGTGCTGG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3045 CTCTCTTTATTTGTTTGTTTTTCGGGTGAAATGTCCTTTAGGAGTGCTGG 3094 CU210937.2 1101 GCCTTCCTAGCTCTGGGACATTAGGATAAGAGATCAGGCAGAAGTCAACA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3095 GCCTTCCTAGCTCTGGGACATTAGGATAAGAGATCAGGCAGAAGTCAACA 3144 CU210937.2 1151 GAACAAAGAACAGTCCTTGCACTTACTTTAAAGGTAAGAGATGTCTGGCT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3145 GAACAAAGAACAGTCCTTGCACTTACTTTAAAGGTAAGAGATGTCTGGCT 3194 CU210937.2 1201 TTAGATAGGAGGGGATCTCTGAGCTTGGGCCAGTAGCAGTGCTAGATTGG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3195 TTAGATAGGAGGGGATCTCTGAGCTTGGGCCAGTAGCAGTGCTAGATTGG 3244 CU210937.2 1251 CTATAAAGCCATAAGCTAGGAAATAAATCCTGTTGTACCATCGTACAATA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3245 CTATAAAGCCATAAGCTAGGAAATAAATCCTGTTGTACCATCGTACAATA 3294 CU210937.2 1301 TGCTAGGAGCATCTGAGAGAAAGTTCTAGATAGGACACAAGCTGTGACTC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3295 TGCTAGGAGCATCTGAGAGAAAGTTCTAGATAGGACACAAGCTGTGACTC 3344 CU210937.2 1351 ATCTGTTCTACAGGGCAGCAGCTGTGATCTAACCTTTTAGAGCATATATA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3345 ATCTGTTCTACAGGGCAGCAGCTGTGATCTAACCTTTTAGAGCATATATA 3394 CU210937.2 1401 TGATCTTCACACACACACACACTTTAGTAGTAGACATGGTAGTTTAGACT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3395 TGATCTTCACACACACACACACTTTAGTAGTAGACATGGTAGTTTAGACT 3444 CU210937.2 1451 GATGTCTCAGCTGTTAGGAGCACTTGCTGCTCGCACAGAAGACTGTTCCC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3445 GATGTCTCAGCTGTTAGGAGCACTTGCTGCTCGCACAGAAGACTGTTCCC 3494 CU210937.2 1501 AGCACCCCATGGTGGCACACAATTATCCCTAACTTCATTTCCAACATCTG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3495 AGCACCCCATGGTGGCACACAATTATCCCTAACTTCATTTCCAACATCTG 3544 CU210937.2 1551 CTTCCAAGGGCACTAGATACACACATGGTACTCACATACAGACTTGCAGG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3545 CTTCCAAGGGCACTAGATACACACATGGTACTCACATACAGACTTGCAGG 3594 CU210937.2 1601 CAAAACATTTACAGATATAAAAATAAATCTACAAAGAGAGTTGACCTTAT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3595 CAAAACATTTACAGATATAAAAATAAATCTACAAAGAGAGTTGACCTTAT 3644 CU210937.2 1651 CTCAAGTGCTGTCTTTGTGTGACCACACAAACCATTTCTTTTTTTTCTTT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3645 CTCAAGTGCTGTCTTTGTGTGACCACACAAACCATTTCTTTTTTTTCTTT 3694 CU210937.2 1701 TTTTTTTTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3695 TTTTTTTTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTA 3744 CU210937.2 1751 TCCTGGAACTTAATTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCTGT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3745 TCCTGGAACTTAATTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCTGT 3794 CU210937.2 1801 CTGCGTCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCACCACC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3795 CTGCGTCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCACCACC 3844 CU210937.2 1851 ACACCCTGCTCCACAAACCATTTTTCTGTATGTTTTTTTTTTCTCCCTTG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3845 ACACCCTGCTCCACAAACCATTTTTCTGTATGTTTTTTTTTTCTCCCTTG 3894 CU210937.2 1901 GTGTATGAGACAAGGTTTCTCTATGTAATCCCGGCTGTCCTAAAACTTAC 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3895 GTGTATGAGACAAGGTTTCTCTATGTAATCCCGGCTGTCCTAAAACTTAC 3944 CU210937.2 1951 CCTATATACCAGGATGGCCTCAAACTTAGAGATCCACCTGCCTCTGCCTC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372919.4 3945 CCTATATACCAGGATGGCCTCAAACTTAGAGATCCACCTGCCTCTGCCTC 3994
