<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210937.2	1	GAATTCACTTATTTTTAAAATGCAGGTGAAAATACTGAACCCTGTTGGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	1995	GAATTCACTTATTTTTAAAATGCAGGTGAAAATACTGAACCCTGTTGGGC	2044

CU210937.2	51	ATGTCTGTAATCCTGGCGCTCAGGACCCAAATATAGGCAAGTCAGGAGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2045	ATGTCTGTAATCCTGGCGCTCAGGACCCAAATATAGGCAAGTCAGGAGTT	2094

CU210937.2	101	CAGGGGAGCCAGGCCACAAAGCAAGAGCAAACAAACGAAGCCTTCTTGGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2095	CAGGGGAGCCAGGCCACAAAGCAAGAGCAAACAAACGAAGCCTTCTTGGA	2144

CU210937.2	151	CTGGAGGTGTCCCTAATGTCAAAACTGGTGGAGCGTTGGCTAAGCATACA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2145	CTGGAGGTGTCCCTAATGTCAAAACTGGTGGAGCGTTGGCTAAGCATACA	2194

CU210937.2	201	TAAGGCTTTATCCAAGGTTAAGGTTCTCCAACCTTAGCACAAAAATCTCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2195	TAAGGCTTTATCCAAGGTTAAGGTTCTCCAACCTTAGCACAAAAATCTCT	2244

CU210937.2	251	ACCACTGGGGCTGGGGAGATGGTTCAGCGGTTAGGAGCACTGACTGTTCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2245	ACCACTGGGGCTGGGGAGATGGTTCAGCGGTTAGGAGCACTGACTGTTCT	2294

CU210937.2	301	TCAAGAGGCCCTGAAGCCGGGTGTGGTGGTGCACGCCTTTAATCCCAGCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2295	TCAAGAGGCCCTGAAGCCGGGTGTGGTGGTGCACGCCTTTAATCCCAGCA	2344

CU210937.2	351	CTTGGGAGGCAGAGGCAGATGGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCAGTTCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2345	CTTGGGAGGCAGAGGCAGATGGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCAGTTCA	2394

CU210937.2	401	AGGTCTAGAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAAAGCTATACAGAGAAACCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2395	AGGTCTAGAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAAAGCTATACAGAGAAACCCT	2444

CU210937.2	451	GTCTTGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2445	GTCTTGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAG	2494

CU210937.2	501	AAAGAAAAGAAGAAAAAGAAAGAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGAGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2495	AAAGAAAAGAAGAAAAAGAAAGAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGAGAA	2544

CU210937.2	551	AAAAACTGATGGCCGTGTATAAAAGGGAGGTAACTCATTCACACTTACTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2545	AAAAACTGATGGCCGTGTATAAAAGGGAGGTAACTCATTCACACTTACTG	2594

CU210937.2	601	TTTAGGTGAAGTGAAGTTGGATCAGAGGGGTAAAGAATGCTGGCCTGGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2595	TTTAGGTGAAGTGAAGTTGGATCAGAGGGGTAAAGAATGCTGGCCTGGGC	2644

CU210937.2	651	ACTCGGGAGGCAGAAGCAGGTGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2645	ACTCGGGAGGCAGAAGCAGGTGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTC	2694

CU210937.2	701	TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2695	TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTC	2744

CU210937.2	751	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCTGGCCTGAGCCAGTGAAACAGGCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2745	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCTGGCCTGAGCCAGTGAAACAGGCT	2794

CU210937.2	801	TCGTTGGTAAAGGTTCTTGTCTTAAATTTGAGGATACGAGTTTGCTGCTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2795	TCGTTGGTAAAGGTTCTTGTCTTAAATTTGAGGATACGAGTTTGCTGCTC	2844

CU210937.2	851	AAGACCCACAAGGTAGAAAGACAGGACTGACTCTCTAACGTTGTCCTCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2845	AAGACCCACAAGGTAGAAAGACAGGACTGACTCTCTAACGTTGTCCTCTG	2894

CU210937.2	901	ACTCTGGGGATATGCAGTTTTACACCAAGACTCCACCATGACATGCACGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2895	ACTCTGGGGATATGCAGTTTTACACCAAGACTCCACCATGACATGCACGT	2944

CU210937.2	951	CTGAGCACGCGCACACACACAAACACACACACATATATACACACTTTTGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2945	CTGAGCACGCGCACACACACAAACACACACACATATATACACACTTTTGT	2994

CU210937.2	1001	AAAAAGGTCAGACTTTCATTTATCCCGACTCTCACCCCAACTCAGGGTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	2995	AAAAAGGTCAGACTTTCATTTATCCCGACTCTCACCCCAACTCAGGGTTT	3044

CU210937.2	1051	CTCTCTTTATTTGTTTGTTTTTCGGGTGAAATGTCCTTTAGGAGTGCTGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3045	CTCTCTTTATTTGTTTGTTTTTCGGGTGAAATGTCCTTTAGGAGTGCTGG	3094

CU210937.2	1101	GCCTTCCTAGCTCTGGGACATTAGGATAAGAGATCAGGCAGAAGTCAACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3095	GCCTTCCTAGCTCTGGGACATTAGGATAAGAGATCAGGCAGAAGTCAACA	3144

CU210937.2	1151	GAACAAAGAACAGTCCTTGCACTTACTTTAAAGGTAAGAGATGTCTGGCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3145	GAACAAAGAACAGTCCTTGCACTTACTTTAAAGGTAAGAGATGTCTGGCT	3194

CU210937.2	1201	TTAGATAGGAGGGGATCTCTGAGCTTGGGCCAGTAGCAGTGCTAGATTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3195	TTAGATAGGAGGGGATCTCTGAGCTTGGGCCAGTAGCAGTGCTAGATTGG	3244

CU210937.2	1251	CTATAAAGCCATAAGCTAGGAAATAAATCCTGTTGTACCATCGTACAATA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3245	CTATAAAGCCATAAGCTAGGAAATAAATCCTGTTGTACCATCGTACAATA	3294

CU210937.2	1301	TGCTAGGAGCATCTGAGAGAAAGTTCTAGATAGGACACAAGCTGTGACTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3295	TGCTAGGAGCATCTGAGAGAAAGTTCTAGATAGGACACAAGCTGTGACTC	3344

CU210937.2	1351	ATCTGTTCTACAGGGCAGCAGCTGTGATCTAACCTTTTAGAGCATATATA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3345	ATCTGTTCTACAGGGCAGCAGCTGTGATCTAACCTTTTAGAGCATATATA	3394

CU210937.2	1401	TGATCTTCACACACACACACACTTTAGTAGTAGACATGGTAGTTTAGACT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3395	TGATCTTCACACACACACACACTTTAGTAGTAGACATGGTAGTTTAGACT	3444

CU210937.2	1451	GATGTCTCAGCTGTTAGGAGCACTTGCTGCTCGCACAGAAGACTGTTCCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3445	GATGTCTCAGCTGTTAGGAGCACTTGCTGCTCGCACAGAAGACTGTTCCC	3494

CU210937.2	1501	AGCACCCCATGGTGGCACACAATTATCCCTAACTTCATTTCCAACATCTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3495	AGCACCCCATGGTGGCACACAATTATCCCTAACTTCATTTCCAACATCTG	3544

CU210937.2	1551	CTTCCAAGGGCACTAGATACACACATGGTACTCACATACAGACTTGCAGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3545	CTTCCAAGGGCACTAGATACACACATGGTACTCACATACAGACTTGCAGG	3594

CU210937.2	1601	CAAAACATTTACAGATATAAAAATAAATCTACAAAGAGAGTTGACCTTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3595	CAAAACATTTACAGATATAAAAATAAATCTACAAAGAGAGTTGACCTTAT	3644

CU210937.2	1651	CTCAAGTGCTGTCTTTGTGTGACCACACAAACCATTTCTTTTTTTTCTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3645	CTCAAGTGCTGTCTTTGTGTGACCACACAAACCATTTCTTTTTTTTCTTT	3694

CU210937.2	1701	TTTTTTTTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3695	TTTTTTTTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTA	3744

CU210937.2	1751	TCCTGGAACTTAATTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3745	TCCTGGAACTTAATTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCTGT	3794

CU210937.2	1801	CTGCGTCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCACCACC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3795	CTGCGTCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCACCACC	3844

CU210937.2	1851	ACACCCTGCTCCACAAACCATTTTTCTGTATGTTTTTTTTTTCTCCCTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3845	ACACCCTGCTCCACAAACCATTTTTCTGTATGTTTTTTTTTTCTCCCTTG	3894

CU210937.2	1901	GTGTATGAGACAAGGTTTCTCTATGTAATCCCGGCTGTCCTAAAACTTAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3895	GTGTATGAGACAAGGTTTCTCTATGTAATCCCGGCTGTCCTAAAACTTAC	3944

CU210937.2	1951	CCTATATACCAGGATGGCCTCAAACTTAGAGATCCACCTGCCTCTGCCTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372919.4	3945	CCTATATACCAGGATGGCCTCAAACTTAGAGATCCACCTGCCTCTGCCTC	3994

Overview

Query
CU210937.2 - 165559 bps
Hit
CU372919.4 - 3994 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link