<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU210837.8 1 GAATTCAGAAGTTGTACCACATCTTGGTCTATCCTCATGGCTGTAGCTCC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124361 GAATTCAGAAGTTGTACCACATCTTGGTCTATCCTCATGGCTGTAGCTCC 124410 CU210837.8 51 TTTGTTCAGTTGATGAGGAAAAAAATTAAACAACAGAACTGGAATGAAAA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124411 TTTGTTCAGTTGATGAGGAAAAAAATTAAACAACAGAACTGGAATGAAAA 124460 CU210837.8 101 ACAGATGCTAAAGAGTCTAAGAATTGAGATCAAGAAGCCAGGGTGAAAGT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124461 ACAGATGCTAAAGAGTCTAAGAATTGAGATCAAGAAGCCAGGGTGAAAGT 124510 CU210837.8 151 TAAGAGATGCAGAGAGGAAATCAGACTCCCAGAAGGAGCCATGTAAACTA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124511 TAAGAGATGCAGAGAGGAAATCAGACTCCCAGAAGGAGCCATGTAAACTA 124560 CU210837.8 201 TTCCAGATAAACTTCTGGAGCCTTGAAGGGCTTTTTACAACAGTACAGCA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124561 TTCCAGATAAACTTCTGGAGCCTTGAAGGGCTTTTTACAACAGTACAGCA 124610 CU210837.8 251 GTGAAGACTCAGAGAACCTCATCAAAGGTCACACAAGTACCTCTGGGCTG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124611 GTGAAGACTCAGAGAACCTCATCAAAGGTCACACAAGTACCTCTGGGCTG 124660 CU210837.8 301 GGGAGGCAGCCCGGCCATTAAAGCACCTGCCTAAGGGGCATGAGGTCCTG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124661 GGGAGGCAGCCCGGCCATTAAAGCACCTGCCTAAGGGGCATGAGGTCCTG 124710 CU210837.8 351 AGCCGAGCTCCAGAGCCTACTACAAAAGCCAGGCATCAGGGATCGGTGCT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124711 AGCCGAGCTCCAGAGCCTACTACAAAAGCCAGGCATCAGGGATCGGTGCT 124760 CU210837.8 401 TGAACGTGGGATGGACCTCAAGTTGGGCTGGTTATTGGTTGGCCATTCCC 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124761 TGAACGTGGGATGGACCTCAAGTTGGGCTGGTTATTGGTTGGCCATTCCC 124810 CU210837.8 451 CCAGTCTCTGATCCATCCCCAACCCCTGCATTTCTTGTAGATAGGATAAA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124811 CCAGTCTCTGATCCATCCCCAACCCCTGCATTTCTTGTAGATAGGATAAA 124860 CU210837.8 501 TTTTGGGTCTTCATGTGGGTCCCTAACAACTGGAGCAGGGGCTATCCCAA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124861 TTTTGGGTCTTCATGTGGGTCCCTAACAACTGGAGCAGGGGCTATCCCAA 124910 CU210837.8 551 AAGCTGTTGCCTGTGTAGCCGGGAGAGAAAGCACCTAGCCTGGCACTTGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124911 AAGCTGTTGCCTGTGTAGCCGGGAGAGAAAGCACCTAGCCTGGCACTTGA 124960 CU210837.8 601 AGTACCAGGGTAGGGAAATACCCAGGGGAGAAGGGGAGGGGAGGTGGGGG 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 124961 AGTACCAGGGTAGGGAAATACCCAGGGGAGAAGGGGAGGGGAGGTGGGGG 125010 CU210837.8 651 AAGGGTTGTGGAGGGTGACTGGAAGACGGGCAGTGAGCAGGATGTAAAAT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125011 AAGGGTTGTGGAGGGTGACTGGAAGACGGGCAGTGAGCAGGATGTAAAAT 125060 CU210837.8 701 GAATAAGTAATAAAGTTAATTAATTATTATTTTTTAAAAAGCCAGGTGTG 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125061 GAATAAGTAATAAAGTTAATTAATTATTATTTTTTAAAAAGCCAGGTGTG 125110 CU210837.8 751 GTAGCATGCTTGTAGTCTCAGCACTAGGAAGGCAGAGACAGGCAGTTAGT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125111 GTAGCATGCTTGTAGTCTCAGCACTAGGAAGGCAGAGACAGGCAGTTAGT 125160 CU210837.8 801 TCCTAGGGGCTTGCCTCGCCTAATCGCTGAGCTCCAGCCAGTGAGAGGCC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125161 TCCTAGGGGCTTGCCTCGCCTAATCGCTGAGCTCCAGCCAGTGAGAGGCC 125210 CU210837.8 851 CTATCTCAGAGGAACTGGGAAAAGTTCCTGAAGAAGTCATGCAAAGTTAT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125211 CTATCTCAGAGGAACTGGGAAAAGTTCCTGAAGAAGTCATGCAAAGTTAT 125260 CU210837.8 901 CCTGTGTCCACATGCACATAGAAACATATATGTGCACAAACATACACACA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125261 CCTGTGTCCACATGCACATAGAAACATATATGTGCACAAACATACACACA 125310 CU210837.8 951 CACACACCTTGTATAATAAAGTGAATATCTATATCACTTCACTTCTCCTG 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125311 CACACACCTTGTATAATAAAGTGAATATCTATATCACTTCACTTCTCCTG 125360 CU210837.8 1001 ACTCGCTTTTCCTGACTGTCTTACTCTATGAGGATGAGACTCAGGTCATA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125361 ACTCGCTTTTCCTGACTGTCTTACTCTATGAGGATGAGACTCAGGTCATA 125410 CU210837.8 1051 AGGTGCATCTGAAAGTATTTGAAAGGCAAAGCACATAGTACGGGTTATGG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125411 AGGTGCATCTGAAAGTATTTGAAAGGCAAAGCACATAGTACGGGTTATGG 125460 CU210837.8 1101 TGAATATTGCCATTATTCTAAACACGCCGAATATGAGTGAAGCATCTTTG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125461 TGAATATTGCCATTATTCTAAACACGCCGAATATGAGTGAAGCATCTTTG 125510 CU210837.8 1151 GAAACCCTTGCTCATTGGAAGGCCAGCTGAGTCCCCCAGGAGACGAATGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125511 GAAACCCTTGCTCATTGGAAGGCCAGCTGAGTCCCCCAGGAGACGAATGC 125560 CU210837.8 1201 TTACTTGAAACAGTCATAAAAAGAACTAAACCAGTTTCAGAACGAGGTCA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125561 TTACTTGAAACAGTCATAAAAAGAACTAAACCAGTTTCAGAACGAGGTCA 125610 CU210837.8 1251 AGTGCTATTCAAACCAGGTTAGATGTGTCTGTCTTACAACAGATGAGCTT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125611 AGTGCTATTCAAACCAGGTTAGATGTGTCTGTCTTACAACAGATGAGCTT 125660 CU210837.8 1301 TGGGAAGGAGCCACACTAGGGGTCAGATACACAGAGGCAAGAGAGCCATG 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125661 TGGGAAGGAGCCACACTAGGGGTCAGATACACAGAGGCAAGAGAGCCATG 125710 CU210837.8 1351 CTCTCAGGGTGTATATGGATGGAGACAACTCACCTTAGGCCAGCAGCCAC 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125711 CTCTCAGGGTGTATATGGATGGAGACAACTCACCTTAGGCCAGCAGCCAC 125760 CU210837.8 1401 ACTGGGAACACTGAGAGAGAAAGACTGAGTGGTCTAGGAGGAGGGGCAGG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125761 ACTGGGAACACTGAGAGAGAAAGACTGAGTGGTCTAGGAGGAGGGGCAGG 125810 CU210837.8 1451 CTCCTTAGGAGAGGTGACAGTAACCTGGACATGGAAGATAAATCCATGAC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125811 CTCCTTAGGAGAGGTGACAGTAACCTGGACATGGAAGATAAATCCATGAC 125860 CU210837.8 1501 CAGGTGACCAAGGCAGAGAAGAGGGGCCGTGGCCTTAGGACCAGGCCAGC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125861 CAGGTGACCAAGGCAGAGAAGAGGGGCCGTGGCCTTAGGACCAGGCCAGC 125910 CU210837.8 1551 CTCCCGTGCAGGGTCTACTTTGTCATCAAGCTTTGCCCTAGAGTCTGGGC 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125911 CTCCCGTGCAGGGTCTACTTTGTCATCAAGCTTTGCCCTAGAGTCTGGGC 125960 CU210837.8 1601 TGGACTGAGAAGCGTCTGTCTAGACTTCTGAATTCTCATTCAAGCTTGAG 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 125961 TGGACTGAGAAGCGTCTGTCTAGACTTCTGAATTCTCATTCAAGCTTGAG 126010 CU210837.8 1651 AAAATCCTTCATATGCAAATCTCAGTGTCTCACTGTCACTTTCCATGACA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 126011 AAAATCCTTCATATGCAAATCTCAGTGTCTCACTGTCACTTTCCATGACA 126060 CU210837.8 1701 GTCATCAACTGTACGGATCCCGGGCACCAGGAGAACAGTGTCCGGCAAGT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 126061 GTCATCAACTGTACGGATCCCGGGCACCAGGAGAACAGTGTCCGGCAAGT 126110 CU210837.8 1751 CCACGCCAGCGGGCCCCACAGATTCAGCTTCGGCACCACCGTTTCCTACC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 126111 CCACGCCAGCGGGCCCCACAGATTCAGCTTCGGCACCACCGTTTCCTACC 126160 CU210837.8 1801 AGTGCAACCACGGCTTCTACCTCCTGGGCACTCCTGCCCTCAGCTGCCAG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 126161 AGTGCAACCACGGCTTCTACCTCCTGGGCACTCCTGCCCTCAGCTGCCAG 126210 CU210837.8 1851 GGAGACGGCACCTGGGACCGGCCCCGCCCACAGTGTCTCTGTAAGTAGAT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 126211 GGAGACGGCACCTGGGACCGGCCCCGCCCACAGTGTCTCTGTAAGTAGAT 126260 CU210837.8 1901 CTGTTAACTATCGAAGGGACATATCTCAGAGCACACACACACATATGTTC 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 126261 CTGTTAACTATCGAAGGGACATATCTCAGAGCACACACACACATATGTTC 126310 CU210837.8 1951 ATGTGTGTGCACATGCCTGTTGTGCCACTACAGCACTCTGACTGTCCCTT 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU372907.16 126311 ATGTGTGTGCACATGCCTGTTGTGCCACTACAGCACTCTGACTGTCCCTT 126360