<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210837.8	1	GAATTCAGAAGTTGTACCACATCTTGGTCTATCCTCATGGCTGTAGCTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124361	GAATTCAGAAGTTGTACCACATCTTGGTCTATCCTCATGGCTGTAGCTCC	124410

CU210837.8	51	TTTGTTCAGTTGATGAGGAAAAAAATTAAACAACAGAACTGGAATGAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124411	TTTGTTCAGTTGATGAGGAAAAAAATTAAACAACAGAACTGGAATGAAAA	124460

CU210837.8	101	ACAGATGCTAAAGAGTCTAAGAATTGAGATCAAGAAGCCAGGGTGAAAGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124461	ACAGATGCTAAAGAGTCTAAGAATTGAGATCAAGAAGCCAGGGTGAAAGT	124510

CU210837.8	151	TAAGAGATGCAGAGAGGAAATCAGACTCCCAGAAGGAGCCATGTAAACTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124511	TAAGAGATGCAGAGAGGAAATCAGACTCCCAGAAGGAGCCATGTAAACTA	124560

CU210837.8	201	TTCCAGATAAACTTCTGGAGCCTTGAAGGGCTTTTTACAACAGTACAGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124561	TTCCAGATAAACTTCTGGAGCCTTGAAGGGCTTTTTACAACAGTACAGCA	124610

CU210837.8	251	GTGAAGACTCAGAGAACCTCATCAAAGGTCACACAAGTACCTCTGGGCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124611	GTGAAGACTCAGAGAACCTCATCAAAGGTCACACAAGTACCTCTGGGCTG	124660

CU210837.8	301	GGGAGGCAGCCCGGCCATTAAAGCACCTGCCTAAGGGGCATGAGGTCCTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124661	GGGAGGCAGCCCGGCCATTAAAGCACCTGCCTAAGGGGCATGAGGTCCTG	124710

CU210837.8	351	AGCCGAGCTCCAGAGCCTACTACAAAAGCCAGGCATCAGGGATCGGTGCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124711	AGCCGAGCTCCAGAGCCTACTACAAAAGCCAGGCATCAGGGATCGGTGCT	124760

CU210837.8	401	TGAACGTGGGATGGACCTCAAGTTGGGCTGGTTATTGGTTGGCCATTCCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124761	TGAACGTGGGATGGACCTCAAGTTGGGCTGGTTATTGGTTGGCCATTCCC	124810

CU210837.8	451	CCAGTCTCTGATCCATCCCCAACCCCTGCATTTCTTGTAGATAGGATAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124811	CCAGTCTCTGATCCATCCCCAACCCCTGCATTTCTTGTAGATAGGATAAA	124860

CU210837.8	501	TTTTGGGTCTTCATGTGGGTCCCTAACAACTGGAGCAGGGGCTATCCCAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124861	TTTTGGGTCTTCATGTGGGTCCCTAACAACTGGAGCAGGGGCTATCCCAA	124910

CU210837.8	551	AAGCTGTTGCCTGTGTAGCCGGGAGAGAAAGCACCTAGCCTGGCACTTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124911	AAGCTGTTGCCTGTGTAGCCGGGAGAGAAAGCACCTAGCCTGGCACTTGA	124960

CU210837.8	601	AGTACCAGGGTAGGGAAATACCCAGGGGAGAAGGGGAGGGGAGGTGGGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	124961	AGTACCAGGGTAGGGAAATACCCAGGGGAGAAGGGGAGGGGAGGTGGGGG	125010

CU210837.8	651	AAGGGTTGTGGAGGGTGACTGGAAGACGGGCAGTGAGCAGGATGTAAAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125011	AAGGGTTGTGGAGGGTGACTGGAAGACGGGCAGTGAGCAGGATGTAAAAT	125060

CU210837.8	701	GAATAAGTAATAAAGTTAATTAATTATTATTTTTTAAAAAGCCAGGTGTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125061	GAATAAGTAATAAAGTTAATTAATTATTATTTTTTAAAAAGCCAGGTGTG	125110

CU210837.8	751	GTAGCATGCTTGTAGTCTCAGCACTAGGAAGGCAGAGACAGGCAGTTAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125111	GTAGCATGCTTGTAGTCTCAGCACTAGGAAGGCAGAGACAGGCAGTTAGT	125160

CU210837.8	801	TCCTAGGGGCTTGCCTCGCCTAATCGCTGAGCTCCAGCCAGTGAGAGGCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125161	TCCTAGGGGCTTGCCTCGCCTAATCGCTGAGCTCCAGCCAGTGAGAGGCC	125210

CU210837.8	851	CTATCTCAGAGGAACTGGGAAAAGTTCCTGAAGAAGTCATGCAAAGTTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125211	CTATCTCAGAGGAACTGGGAAAAGTTCCTGAAGAAGTCATGCAAAGTTAT	125260

CU210837.8	901	CCTGTGTCCACATGCACATAGAAACATATATGTGCACAAACATACACACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125261	CCTGTGTCCACATGCACATAGAAACATATATGTGCACAAACATACACACA	125310

CU210837.8	951	CACACACCTTGTATAATAAAGTGAATATCTATATCACTTCACTTCTCCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125311	CACACACCTTGTATAATAAAGTGAATATCTATATCACTTCACTTCTCCTG	125360

CU210837.8	1001	ACTCGCTTTTCCTGACTGTCTTACTCTATGAGGATGAGACTCAGGTCATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125361	ACTCGCTTTTCCTGACTGTCTTACTCTATGAGGATGAGACTCAGGTCATA	125410

CU210837.8	1051	AGGTGCATCTGAAAGTATTTGAAAGGCAAAGCACATAGTACGGGTTATGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125411	AGGTGCATCTGAAAGTATTTGAAAGGCAAAGCACATAGTACGGGTTATGG	125460

CU210837.8	1101	TGAATATTGCCATTATTCTAAACACGCCGAATATGAGTGAAGCATCTTTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125461	TGAATATTGCCATTATTCTAAACACGCCGAATATGAGTGAAGCATCTTTG	125510

CU210837.8	1151	GAAACCCTTGCTCATTGGAAGGCCAGCTGAGTCCCCCAGGAGACGAATGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125511	GAAACCCTTGCTCATTGGAAGGCCAGCTGAGTCCCCCAGGAGACGAATGC	125560

CU210837.8	1201	TTACTTGAAACAGTCATAAAAAGAACTAAACCAGTTTCAGAACGAGGTCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125561	TTACTTGAAACAGTCATAAAAAGAACTAAACCAGTTTCAGAACGAGGTCA	125610

CU210837.8	1251	AGTGCTATTCAAACCAGGTTAGATGTGTCTGTCTTACAACAGATGAGCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125611	AGTGCTATTCAAACCAGGTTAGATGTGTCTGTCTTACAACAGATGAGCTT	125660

CU210837.8	1301	TGGGAAGGAGCCACACTAGGGGTCAGATACACAGAGGCAAGAGAGCCATG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125661	TGGGAAGGAGCCACACTAGGGGTCAGATACACAGAGGCAAGAGAGCCATG	125710

CU210837.8	1351	CTCTCAGGGTGTATATGGATGGAGACAACTCACCTTAGGCCAGCAGCCAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125711	CTCTCAGGGTGTATATGGATGGAGACAACTCACCTTAGGCCAGCAGCCAC	125760

CU210837.8	1401	ACTGGGAACACTGAGAGAGAAAGACTGAGTGGTCTAGGAGGAGGGGCAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125761	ACTGGGAACACTGAGAGAGAAAGACTGAGTGGTCTAGGAGGAGGGGCAGG	125810

CU210837.8	1451	CTCCTTAGGAGAGGTGACAGTAACCTGGACATGGAAGATAAATCCATGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125811	CTCCTTAGGAGAGGTGACAGTAACCTGGACATGGAAGATAAATCCATGAC	125860

CU210837.8	1501	CAGGTGACCAAGGCAGAGAAGAGGGGCCGTGGCCTTAGGACCAGGCCAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125861	CAGGTGACCAAGGCAGAGAAGAGGGGCCGTGGCCTTAGGACCAGGCCAGC	125910

CU210837.8	1551	CTCCCGTGCAGGGTCTACTTTGTCATCAAGCTTTGCCCTAGAGTCTGGGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125911	CTCCCGTGCAGGGTCTACTTTGTCATCAAGCTTTGCCCTAGAGTCTGGGC	125960

CU210837.8	1601	TGGACTGAGAAGCGTCTGTCTAGACTTCTGAATTCTCATTCAAGCTTGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	125961	TGGACTGAGAAGCGTCTGTCTAGACTTCTGAATTCTCATTCAAGCTTGAG	126010

CU210837.8	1651	AAAATCCTTCATATGCAAATCTCAGTGTCTCACTGTCACTTTCCATGACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	126011	AAAATCCTTCATATGCAAATCTCAGTGTCTCACTGTCACTTTCCATGACA	126060

CU210837.8	1701	GTCATCAACTGTACGGATCCCGGGCACCAGGAGAACAGTGTCCGGCAAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	126061	GTCATCAACTGTACGGATCCCGGGCACCAGGAGAACAGTGTCCGGCAAGT	126110

CU210837.8	1751	CCACGCCAGCGGGCCCCACAGATTCAGCTTCGGCACCACCGTTTCCTACC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	126111	CCACGCCAGCGGGCCCCACAGATTCAGCTTCGGCACCACCGTTTCCTACC	126160

CU210837.8	1801	AGTGCAACCACGGCTTCTACCTCCTGGGCACTCCTGCCCTCAGCTGCCAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	126161	AGTGCAACCACGGCTTCTACCTCCTGGGCACTCCTGCCCTCAGCTGCCAG	126210

CU210837.8	1851	GGAGACGGCACCTGGGACCGGCCCCGCCCACAGTGTCTCTGTAAGTAGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	126211	GGAGACGGCACCTGGGACCGGCCCCGCCCACAGTGTCTCTGTAAGTAGAT	126260

CU210837.8	1901	CTGTTAACTATCGAAGGGACATATCTCAGAGCACACACACACATATGTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	126261	CTGTTAACTATCGAAGGGACATATCTCAGAGCACACACACACATATGTTC	126310

CU210837.8	1951	ATGTGTGTGCACATGCCTGTTGTGCCACTACAGCACTCTGACTGTCCCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU372907.16	126311	ATGTGTGTGCACATGCCTGTTGTGCCACTACAGCACTCTGACTGTCCCTT	126360

Overview

Query
CU210837.8 - 182820 bps
Hit
CU372907.16 - 126360 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link