<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463184.5	1	GGAGACTGCAGCTATCAGAGACTGAACCACAGTCAGATTGTAGTGTAAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	252932	GGAGACTGCAGCTATCAGAGACTGAACCACAGTCAGATTGTAGTGTAAGG	252981

CU463184.5	51	CTCCAGGGAGCCCAAGCTTATTGGGGACCCCTGAGCCAGGATCGATGCAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	252982	CTCCAGGGAGCCCAAGCTTATTGGGGACCCCTGAGCCAGGATCGATGCAA	253031

CU463184.5	101	AATGCAAGAGGAATTTATTGTTCCAGTGCACTGGGGTCATCCCAGACCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253032	AATGCAAGAGGAATTTATTGTTCCAGTGCACTGGGGTCATCCCAGACCCA	253081

CU463184.5	151	AAGGAGAGATGGCGACCCCCAGCACCCGTTTGGTGAGTTTTTATACGGTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253082	AAGGAGAGATGGCGACCCCCAGCACCCGTTTGGTGAGTTTTTATACGGTT	253131

CU463184.5	201	TCCAGGGGCAGCATAGAACATCAGCAACTAGGCACAATATGATTGGTGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253132	TCCAGGGGCAGCATAGAACATCAGCAACTAGGCACAATATGATTGGTGGA	253181

CU463184.5	251	GCAGTGCACCCTTTAAACTGATTGGACTTTAGGGAATGAGGTGACAAGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253182	GCAGTGCACCCTTTAAACTGATTGGACTTTAGGGAATGAGGTGACAAGGA	253231

CU463184.5	301	CTTCCCTCGTCTGAAGGAGAGCAATGGTCCTGGTGGGGGGGGTGCTGGGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253232	CTTCCCTCGTCTGAAGGAGAGCAATGGTCCTGGTGGGGGGGGTGCTGGGG	253281

CU463184.5	351	GGGATGTGTCCCCACCCAAAGGTTGGTTCCTGACTGTGCTCGGAGGAATG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253282	GGGATGTGTCCCCACCCAAAGGTTGGTTCCTGACTGTGCTCGGAGGAATG	253331

CU463184.5	401	TTAATTAGCCTCTCCCTTCCGGAGGAGCAAGTGTTCCATGACCTTCCCAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253332	TTAATTAGCCTCTCCCTTCCGGAGGAGCAAGTGTTCCATGACCTTCCCAA	253381

CU463184.5	451	AGTTCCTGAGCTGACCTTTTCAGTAGTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253382	AGTTCCTGAGCTGACCTTTTCAGTAGTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAC	253431

CU463184.5	501	AGGGTTTCACTATGTAGTGGTGGTCGACCCGGAGACCAGGCTGACCTTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253432	AGGGTTTCACTATGTAGTGGTGGTCGACCCGGAGACCAGGCTGACCTTGA	253481

CU463184.5	551	TCCATCTGCAAAGATCCACCTGCTTCTGCTTCCCTAGGGCTAGGGTTAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253482	TCCATCTGCAAAGATCCACCTGCTTCTGCTTCCCTAGGGCTAGGGTTAGT	253531

CU463184.5	601	TAACCCGTGGGTGCTGTCTAGGAAAGGAACCATGCTTTCTCTTCAGAACC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253532	TAACCCGTGGGTGCTGTCTAGGAAAGGAACCATGCTTTCTCTTCAGAACC	253581

CU463184.5	651	CAATACCGCCACTCACCAGACACAGAGAATTTCCCTTTCAATGGGATATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253582	CAATACCGCCACTCACCAGACACAGAGAATTTCCCTTTCAATGGGATATC	253631

CU463184.5	701	TAAGGCATGTGCTGCCATGCCCTGACACTGCTTTCTTACACCCTTATGCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253632	TAAGGCATGTGCTGCCATGCCCTGACACTGCTTTCTTACACCCTTATGCT	253681

CU463184.5	751	ATTACAATAATGACATTGACTTCCAAAACAAAAATTAGAAATTTCTCTAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253682	ATTACAATAATGACATTGACTTCCAAAACAAAAATTAGAAATTTCTCTAA	253731

CU463184.5	801	GACTTGCTGATGAGAATCCAGAAACTGAAAGGGCACAATGAGGGCCTGAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253732	GACTTGCTGATGAGAATCCAGAAACTGAAAGGGCACAATGAGGGCCTGAT	253781

CU463184.5	851	GGATACAGGGGTGATCTTACCATAGGCATCTCACTTTTAACTTCCTCAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253782	GGATACAGGGGTGATCTTACCATAGGCATCTCACTTTTAACTTCCTCAAG	253831

CU463184.5	901	CCATGTACTCTATCAAAAGAATTCAGTTTAGGGGTCAGTGAGATGGCTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253832	CCATGTACTCTATCAAAAGAATTCAGTTTAGGGGTCAGTGAGATGGCTCA	253881

CU463184.5	951	GAAGGCAAAGGTGCTTGCTGCTAAACCTGACAAACTGAGTTAGATTCCCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253882	GAAGGCAAAGGTGCTTGCTGCTAAACCTGACAAACTGAGTTAGATTCCCC	253931

CU463184.5	1001	TCGGACCCACATGGTGGAAGGAAAAAACTGACTCTGGAAAGTTGTCTTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253932	TCGGACCCACATGGTGGAAGGAAAAAACTGACTCTGGAAAGTTGTCTTCT	253981

CU463184.5	1051	GATCTCCACACTCATGCCTTGGCATGTGTGTGTGCACACACATACACATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	253982	GATCTCCACACTCATGCCTTGGCATGTGTGTGTGCACACACATACACATA	254031

CU463184.5	1101	AAAATATTAAAATGTAAGTTAAGGGAGGTAGAGGCAGAGGCAGGCTGATC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254032	AAAATATTAAAATGTAAGTTAAGGGAGGTAGAGGCAGAGGCAGGCTGATC	254081

CU463184.5	1151	TCTGCGAGTTCCGGGCCAGCTGGACTACACAGAGTCCCTACAAAGGGACC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254082	TCTGCGAGTTCCGGGCCAGCTGGACTACACAGAGTCCCTACAAAGGGACC	254131

CU463184.5	1201	ATTGTGCTACTTTATATTTTAGACTTTATATACTTCTACAGTCTCTAAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254132	ATTGTGCTACTTTATATTTTAGACTTTATATACTTCTACAGTCTCTAAAG	254181

CU463184.5	1251	AAAGCAGCTCTTCCAGGAGGTCTTTTTCTTATCAAAGTGGTTGGCAGGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254182	AAAGCAGCTCTTCCAGGAGGTCTTTTTCTTATCAAAGTGGTTGGCAGGTT	254231

CU463184.5	1301	TGCAGCTCTACCCTCACAGGAGCTGGAAATGGCATGTCTTTGTCCTTTAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254232	TGCAGCTCTACCCTCACAGGAGCTGGAAATGGCATGTCTTTGTCCTTTAT	254281

CU463184.5	1351	CAAAAGTTCTCCTTCAATCCATCTTTATACAAGGATGATATTACTAAGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254282	CAAAAGTTCTCCTTCAATCCATCTTTATACAAGGATGATATTACTAAGTA	254331

CU463184.5	1401	TTAGGGCACAAATAGCTGGCAAGAGAACAGAATCTCTGGGCTGGATAGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254332	TTAGGGCACAAATAGCTGGCAAGAGAACAGAATCTCTGGGCTGGATAGAG	254381

CU463184.5	1451	ACCTACAGTTCCAGTAGGGCAAGATCATTTATTTACTTGACCTAGGGACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254382	ACCTACAGTTCCAGTAGGGCAAGATCATTTATTTACTTGACCTAGGGACA	254431

CU463184.5	1501	CACCTAGGAAGGCATGCTCACCTTAATCCACACAAAAGAAAGAGGCAGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254432	CACCTAGGAAGGCATGCTCACCTTAATCCACACAAAAGAAAGAGGCAGAA	254481

CU463184.5	1551	TAATTAATGCTCTAATGAGATACCATCGTTGTTCTCCCAGAATTCCTGGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254482	TAATTAATGCTCTAATGAGATACCATCGTTGTTCTCCCAGAATTCCTGGC	254531

CU463184.5	1601	CCTAGTGCAGTAGCTGCTGGCCACAGTCAGGGAGGTTTGTAAATCTGCCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254532	CCTAGTGCAGTAGCTGCTGGCCACAGTCAGGGAGGTTTGTAAATCTGCCC	254581

CU463184.5	1651	ACTTTCCTGAATTAGTCCTTTCCCTTTTCTTCTGTCTCTTTTCTAAGCAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254582	ACTTTCCTGAATTAGTCCTTTCCCTTTTCTTCTGTCTCTTTTCTAAGCAT	254631

CU463184.5	1701	AATTTCCTCAACACTCAGGGTCTTCTCTCCAACATTTTCAGCTCCACTAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254632	AATTTCCTCAACACTCAGGGTCTTCTCTCCAACATTTTCAGCTCCACTAC	254681

CU463184.5	1751	TCTTTCTTTAAAGCCTTCTTCCTTGTCACGTGGCTGCTTGTCTGCTACAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254682	TCTTTCTTTAAAGCCTTCTTCCTTGTCACGTGGCTGCTTGTCTGCTACAT	254731

CU463184.5	1801	GTCTTACCCCCATGCCAGTTTATAACGGCCCTCTCTCCTCCATTCTTCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254732	GTCTTACCCCCATGCCAGTTTATAACGGCCCTCTCTCCTCCATTCTTCTC	254781

CU463184.5	1851	TTCCCTGAAGCTGCTGAGACTTTACAGCCTGCTTGTCCTGAAAACGATCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254782	TTCCCTGAAGCTGCTGAGACTTTACAGCCTGCTTGTCCTGAAAACGATCT	254831

CU463184.5	1901	TGAGATTCTTTTTGAGTCTATCCTTAAATTACTTTATTAGTGAGCCCAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254832	TGAGATTCTTTTTGAGTCTATCCTTAAATTACTTTATTAGTGAGCCCAAC	254881

CU463184.5	1951	CCCCACCCGCAAATACCCATGAGAGGGGGAGGCAAAAACATAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU369188.7	254882	CCCCACCCGCAAATACCCATGAGAGGGGGAGGCAAAAACATAAGGAATTC	254931

Overview

Query
CU463184.5 - 124685 bps
Hit
CU369188.7 - 254931 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link