<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU457375.18	1	AGGCTTCCAGGGTGAGCTGCTTTCTTATCATTCCTCTACAGCCCTTTGCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241243	AGGCTTCCAGGGTGAGCTGCTTTCTTATCATTCCTCTACAGCCCTTTGCC	241292

CU457375.18	51	TAGCCTTCCTTTAATCTTTCTTTGTCTATACTTCCCATTTTCTCACTGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241293	TAGCCTTCCTTTAATCTTTCTTTGTCTATACTTCCCATTTTCTCACTGCA	241342

CU457375.18	101	TGTACATTTGTGCATGTTTGTGAGGGTTTGTGTTTAGGGGCAGTGCATGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241343	TGTACATTTGTGCATGTTTGTGAGGGTTTGTGTTTAGGGGCAGTGCATGA	241392

CU457375.18	151	TGAAGGCAAGTGATAGTCTTGTGTGTTGTTCTTCAGGGACTACCCAGCTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241393	TGAAGGCAAGTGATAGTCTTGTGTGTTGTTCTTCAGGGACTACCCAGCTT	241442

CU457375.18	201	TTTAGAAGGGTGGTGGTGGTCAGGATCCTAAACTGGCTTAGAATATGCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241443	TTTAGAAGGGTGGTGGTGGTCAGGATCCTAAACTGGCTTAGAATATGCTG	241492

CU457375.18	251	AAGTAGACTAAGATTCTTGCCAGCAAGCTTCAGGAATTCTCCTATCTCTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241493	AAGTAGACTAAGATTCTTGCCAGCAAGCTTCAGGAATTCTCCTATCTCTA	241542

CU457375.18	301	CCTCTCTAGCATTGGGATTCAAAACATAGCCACTATACCTGTCCTTTTTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241543	CCTCTCTAGCATTGGGATTCAAAACATAGCCACTATACCTGTCCTTTTTA	241592

CU457375.18	351	CATGGGTTCTGGAGATTAAATTCAGGTCTTGGTGTTTGCTTTGCCTACTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241593	CATGGGTTCTGGAGATTAAATTCAGGTCTTGGTGTTTGCTTTGCCTACTG	241642

CU457375.18	401	ACCTGTCTCCCTGATCCCATGTTCCCAGTTTCCTTTTTGTTTTGTTTTGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241643	ACCTGTCTCCCTGATCCCATGTTCCCAGTTTCCTTTTTGTTTTGTTTTGT	241692

CU457375.18	451	TTTGTTTTGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGAATAGCCCTGGGTGTCCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241693	TTTGTTTTGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGAATAGCCCTGGGTGTCCT	241742

CU457375.18	501	GGAACTCACTTTGTGGACCAGAATGGCCTCAAACTCAGAAATCCGTTTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241743	GGAACTCACTTTGTGGACCAGAATGGCCTCAAACTCAGAAATCCGTTTGC	241792

CU457375.18	551	CTCTGCCTCCCGAATGCTGGGATTAAAGGAGTGTGCCACCATGCCCAGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241793	CTCTGCCTCCCGAATGCTGGGATTAAAGGAGTGTGCCACCATGCCCAGCT	241842

CU457375.18	601	CCCAGTTTTCTTGTTCGTCATTTATTAATTGGTTTCCATTCCTGTGTCCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241843	CCCAGTTTTCTTGTTCGTCATTTATTAATTGGTTTCCATTCCTGTGTCCT	241892

CU457375.18	651	GCCACCCATAGTTCCCTATATTGACCCAGAGATCTCTTTGTGTTTCATCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241893	GCCACCCATAGTTCCCTATATTGACCCAGAGATCTCTTTGTGTTTCATCC	241942

CU457375.18	701	CTCTTTTGCCCCAGCCATGTCTTAGTTGCCATACACACCTGTGCATATCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241943	CTCTTTTGCCCCAGCCATGTCTTAGTTGCCATACACACCTGTGCATATCA	241992

CU457375.18	751	CTGCACTGAAGTATTAGGGTTAGGAATCCCTTACGGTGTCCAAAAGATTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	241993	CTGCACTGAAGTATTAGGGTTAGGAATCCCTTACGGTGTCCAAAAGATTG	242042

CU457375.18	801	TTTCCTTCCCCAAGGAGTTCCCAGCCTAAAGAGAGGTCACAGAAAGAAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242043	TTTCCTTCCCCAAGGAGTTCCCAGCCTAAAGAGAGGTCACAGAAAGAAAG	242092

CU457375.18	851	GTGCCAGTGAGTGTCCTGTGACCATAAATAGAATCAAACCAAACATGCAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242093	GTGCCAGTGAGTGTCCTGTGACCATAAATAGAATCAAACCAAACATGCAA	242142

CU457375.18	901	ATAGGCCTTTGGTCCCAGCACTTGGAAATTAAGCTAGAAGAGTCAGTGGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242143	ATAGGCCTTTGGTCCCAGCACTTGGAAATTAAGCTAGAAGAGTCAGTGGA	242192

CU457375.18	951	GGACACTGAAGGCACATGAGCTATGACTTCATAGAAACACTAAAAAAAGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242193	GGACACTGAAGGCACATGAGCTATGACTTCATAGAAACACTAAAAAAAGT	242242

CU457375.18	1001	TAAAGATCCTTGTCCACCTCTTTCTTGGTGTCTTTTGTCAATTGCTTCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242243	TAAAGATCCTTGTCCACCTCTTTCTTGGTGTCTTTTGTCAATTGCTTCTC	242292

CU457375.18	1051	CTCCTTCTCAGGGTGATCCAGAGCCCCCAGACCACTGCCTGTTTTCTTCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242293	CTCCTTCTCAGGGTGATCCAGAGCCCCCAGACCACTGCCTGTTTTCTTCA	242342

CU457375.18	1101	GTGCCTGAAGCTTCAACTCAGAGTCTCCTCACCTCTCAGAGCCAAAAGCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242343	GTGCCTGAAGCTTCAACTCAGAGTCTCCTCACCTCTCAGAGCCAAAAGCA	242392

CU457375.18	1151	GTCTACACCTCAGCCTCTGTTTTCGACCTCTTCTTCTGAGATACCCCTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242393	GTCTACACCTCAGCCTCTGTTTTCGACCTCTTCTTCTGAGATACCCCTTC	242442

CU457375.18	1201	CTGAGAGTCTTCACACAAAGCCTAATGTCAGGCCACGGCGGTCCTCCAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242443	CTGAGAGTCTTCACACAAAGCCTAATGTCAGGCCACGGCGGTCCTCCAGG	242492

CU457375.18	1251	ATGACCCCCTCCCCGCATTCCTCTGCTGCCCTTAAGCCAAATACTACCTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242493	ATGACCCCCTCCCCGCATTCCTCTGCTGCCCTTAAGCCAAATACTACCTG	242542

CU457375.18	1301	CCCCACAAACCAGCCTGCTGCCTCTAGACCAACATCCCGACCCACTCGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242543	CCCCACAAACCAGCCTGCTGCCTCTAGACCAACATCCCGACCCACTCGGG	242592

CU457375.18	1351	GCAGGGCAAATAGGTCCTCTACCAGGACCCCAGAACTGATTGTCCCTGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242593	GCAGGGCAAATAGGTCCTCTACCAGGACCCCAGAACTGATTGTCCCTGTA	242642

CU457375.18	1401	GACCCTGAACTCCAGCCTTCCACCTCCACAGAACAGCCTGTCATCCCAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242643	GACCCTGAACTCCAGCCTTCCACCTCCACAGAACAGCCTGTCATCCCAAA	242692

CU457375.18	1451	ACTTACGTCCCAGGTCACTGAGGGCAGGGTACAGATGCCTGAACCACTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242693	ACTTACGTCCCAGGTCACTGAGGGCAGGGTACAGATGCCTGAACCACTTC	242742

CU457375.18	1501	TCACAGGTCCCGAGATCCAGTCTCCCACCTCCACAGAACAGTCTGTCACC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242743	TCACAGGTCCCGAGATCCAGTCTCCCACCTCCACAGAACAGTCTGTCACC	242792

CU457375.18	1551	CCAGACCGCAAACCTCGGGCCACTCGGGGCAGGCCAAGTAAATCTCCCAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242793	CCAGACCGCAAACCTCGGGCCACTCGGGGCAGGCCAAGTAAATCTCCCAA	242842

CU457375.18	1601	CAAGACCCCAGAACCACTTATTTCTACTGGCCCTGAACTCCAACCTCCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242843	CAAGACCCCAGAACCACTTATTTCTACTGGCCCTGAACTCCAACCTCCCA	242892

CU457375.18	1651	CCTCCATAGAACAACCTGTCATACCTAAACCCACTTCTCGGGTCACTCGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242893	CCTCCATAGAACAACCTGTCATACCTAAACCCACTTCTCGGGTCACTCGG	242942

CU457375.18	1701	GGCAGACCACGTAAGTCTTCTGTCAGGACCCCAGAATCAGTTGTCTCCAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242943	GGCAGACCACGTAAGTCTTCTGTCAGGACCCCAGAATCAGTTGTCTCCAC	242992

CU457375.18	1751	TGGCCCTGAACTTCAGCCTCTCACCTCTATAGAACAGCCTGTTATCCCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	242993	TGGCCCTGAACTTCAGCCTCTCACCTCTATAGAACAGCCTGTTATCCCTG	243042

CU457375.18	1801	AACCTAGGGCCACTCGAGGTAGACCAAGTAAGTCTTCTATCAAGACCCCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	243043	AACCTAGGGCCACTCGAGGTAGACCAAGTAAGTCTTCTATCAAGACCCCA	243092

CU457375.18	1851	GAATCAGTTGTCCCCACTGGTCCTGAGCTGCAGCCTCTTACCTCTGCAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	243093	GAATCAGTTGTCCCCACTGGTCCTGAGCTGCAGCCTCTTACCTCTGCAAA	243142

CU457375.18	1901	ACAGCCTGTCACCCCTAACCTCACATCTCGGGCCTCTCGGGGTAGATCAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	243143	ACAGCCTGTCACCCCTAACCTCACATCTCGGGCCTCTCGGGGTAGATCAA	243192

CU457375.18	1951	GTAAGTCTATCAGGACCCCGGAACCAGTTGTCCAAACTGGCCCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU367883.10	243193	GTAAGTCTATCAGGACCCCGGAACCAGTTGTCCAAACTGGCCCTGAATTC	243242

Overview

Query
CU457375.18 - 136147 bps
Hit
CU367883.10 - 243242 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link