<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU074422.1	1	GAATTCCACTAAGTACCATTTCCACTGTAATGCTTTCCCTTCCTCTGTAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55141	GAATTCCACTAAGTACCATTTCCACTGTAATGCTTTCCCTTCCTCTGTAG	55190

CU074422.1	51	ACCAGCCCATGCTTCCTCTGGTGCCTTGATCCAACCTAGGGCCAGGATGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55191	ACCAGCCCATGCTTCCTCTGGTGCCTTGATCCAACCTAGGGCCAGGATGT	55240

CU074422.1	101	TGGTTCTGAATATTACTTGCTTGTTCTGCAGCATGCTGTGACAAGTTTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55241	TGGTTCTGAATATTACTTGCTTGTTCTGCAGCATGCTGTGACAAGTTTTT	55290

CU074422.1	151	AAGGCCTTATATCCTATACAAATTGTTTTCTCAAATAGAGAGAATTTGTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55291	AAGGCCTTATATCCTATACAAATTGTTTTCTCAAATAGAGAGAATTTGTT	55340

CU074422.1	201	TCCTAACTATGGGAAGCATTTACAACATTCTCTAGCATTTCTTTTGGCAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55341	TCCTAACTATGGGAAGCATTTACAACATTCTCTAGCATTTCTTTTGGCAA	55390

CU074422.1	251	CGATATTCCAGTTTCTTGTATGTCTAAATATACTGTATCATCTGCTCGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55391	CGATATTCCAGTTTCTTGTATGTCTAAATATACTGTATCATCTGCTCGGA	55440

CU074422.1	301	TGTTGTATAGCTTAGAATATTCCTTTATATACTTTAGCACTGTTTTCACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55441	TGTTGTATAGCTTAGAATATTCCTTTATATACTTTAGCACTGTTTTCACA	55490

CU074422.1	351	GCTTGTTCTTGGGCCTTATCCAAAATGAAATCATTTGCATTCCTTGTAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55491	GCTTGTTCTTGGGCCTTATCCAAAATGAAATCATTTGCATTCCTTGTAAT	55540

CU074422.1	401	ATTATACAAGGGTTTCAGAATGACTTGTAAATATGGTATGTGTTGTCTTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55541	ATTATACAAGGGTTTCAGAATGACTTGTAAATATGGTATGTGTTGTCTTC	55590

CU074422.1	451	AATACACAAACAATCCTATAAGAAATTGTACCTCTTTTTTATTGGTTGGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55591	AATACACAAACAATCCTATAAGAAATTGTACCTCTTTTTTATTGGTTGGT	55640

CU074422.1	501	ATTTTAAGCTGTTCTAACTTACTTATGACTTCTGGAAATATTTCCAGTCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55641	ATTTTAAGCTGTTCTAACTTACTTATGACTTCTGGAAATATTTCCAGTCC	55690

CU074422.1	551	TGTAGTGGACCACATTACACCCAAGAACTTGACCTTCATATATGGTCCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55691	TGTAGTGGACCACATTACACCCAAGAACTTGACCTTCATATATGGTCCTG	55740

CU074422.1	601	ATGCCTTATCATTATTGATGGTCCAACCATCACCTTAATGCTTGTATGGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55741	ATGCCTTATCATTATTGATGGTCCAACCATCACCTTAATGCTTGTATGGT	55790

CU074422.1	651	TTGGTCTACTGTTTTCAGTATGTTTTCCTTTCCTTGTCCTATTAGGAACT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55791	TTGGTCTACTGTTTTCAGTATGTTTTCCTTTCCTTGTCCTATTAGGAACT	55840

CU074422.1	701	GTTCATCAACATAGGAATATATGACAGAATTAGGTGCTGACATGGCCTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55841	GTTCATCAACATAGGAATATATGACAGAATTAGGTGCTGACATGGCCTTA	55890

CU074422.1	751	TCCAGTGAGCATTGAGGAATGTTGTCAGCAATTATTGGACTGTTTATGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55891	TCCAGTGAGCATTGAGGAATGTTGTCAGCAATTATTGGACTGTTTATGTG	55940

CU074422.1	801	TTGTGTCTGGCCAGTAGATCACAACCTGGGTTCTAGCCTGGAAAGGCATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55941	TTGTGTCTGGCCAGTAGATCACAACCTGGGTTCTAGCCTGGAAAGGCATT	55990

CU074422.1	851	TTGGAAACCTGGAAGAGAAGAGGGGCTGGGCTGCTCGAGATAAGGAAGGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	55991	TTGGAAACCTGGAAGAGAAGAGGGGCTGGGCTGCTCGAGATAAGGAAGGA	56040

CU074422.1	901	ACCAAGACAAAGCTCTCTGCTCAAGGTTCAATTTTTACTATTTCGGCACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56041	ACCAAGACAAAGCTCTCTGCTCAAGGTTCAATTTTTACTATTTCGGCACT	56090

CU074422.1	951	CAGTTATAAAGGAAGGGGGAGGAGCCCAATTCCCGCCAAATAATCTTGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56091	CAGTTATAAAGGAAGGGGGAGGAGCCCAATTCCCGCCAAATAATCTTGGG	56140

CU074422.1	1001	ATCCAGTAGCAGGGTGATCACTTGTGTGGCTCCAAACAGCAAAGCGGCAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56141	ATCCAGTAGCAGGGTGATCACTTGTGTGGCTCCAAACAGCAAAGCGGCAC	56190

CU074422.1	1051	GTTCCAGCAGTGGGCAAGGCAGAATGATTGAGCGGGAAGCTCCACCCCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56191	GTTCCAGCAGTGGGCAAGGCAGAATGATTGAGCGGGAAGCTCCACCCCTG	56240

CU074422.1	1101	AGCAAGCAGGTTTCAGACTGGGGGAGGGGAGACTACATTTATGTATACTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56241	AGCAAGCAGGTTTCAGACTGGGGGAGGGGAGACTACATTTATGTATACTT	56290

CU074422.1	1151	CTGGTTGTTTTAAAACTTCGTATTGTCTTCCTTGCCAAGCCAATGTGGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56291	CTGGTTGTTTTAAAACTTCGTATTGTCTTCCTTGCCAAGCCAATGTGGTG	56340

CU074422.1	1201	TTTTCTCTGCTTTATGGGTGTAGTGGCATGCCAAAGAACAGGTCTGACAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56341	TTTTCTCTGCTTTATGGGTGTAGTGGCATGCCAAAGAACAGGTCTGACAA	56390

CU074422.1	1251	ATCTATAGTCATTTTTATGTTGCTTTCTTAATCCTCATAAAAATATCTTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56391	ATCTATAGTCATTTTTATGTTGCTTTCTTAATCCTCATAAAAATATCTTC	56440

CU074422.1	1301	AACATCTGGTAGTTCTTCTGGCAGTTTAGGAGGCAATTCATTAATTCTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56441	AACATCTGGTAGTTCTTCTGGCAGTTTAGGAGGCAATTCATTAATTCTCC	56490

CU074422.1	1351	TATGATCTACTGTCATTGGTCACTTACCATTTAGTTTTAAAACTGGCCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56491	TATGATCTACTGTCATTGGTCACTTACCATTTAGTTTTAAAACTGGCCAA	56540

CU074422.1	1401	AGTGGACTGTTGAAATGAAAGCTTTGAGTTAGTTCAATTACTCCTTCCTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56541	AGTGGACTGTTGAAATGAAAGCTTTGAGTTAGTTCAATTACTCCTTCCTT	56590

CU074422.1	1451	AGGAGGGTTTAATGGTTTCAGATATCTTCTCACTTCCTCCTCTAATTGGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56591	AGGAGGGTTTAATGGTTTCAGATATCTTCTCACTTCCTCCTCTAATTGGG	56640

CU074422.1	1501	TGTTGTGGCATGAATGAGGGTTTACTTGTTGGGAGTCTTACAGGTTCTAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56641	TGTTGTGGCATGAATGAGGGTTTACTTGTTGGGAGTCTTACAGGTTCTAC	56690

CU074422.1	1551	TTTTACTTCTGCTAAAATGCATTCTACTTTAGCAAACATTTTAAAACTTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56691	TTTTACTTCTGCTAAAATGCATTCTACTTTAGCAAACATTTTAAAACTTA	56740

CU074422.1	1601	GGCAATCAGGAAAACATTTTCAGATCATTGGAAAGCCTAAAATATTTTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56741	GGCAATCAGGAAAACATTTTCAGATCATTGGAAAGCCTAAAATATTTTCT	56790

CU074422.1	1651	GGTGCTCTCCAACATGCAAAATCCAAGGGAATTATTGTATCACATACCAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56791	GGTGCTCTCCAACATGCAAAATCCAAGGGAATTATTGTATCACATACCAT	56840

CU074422.1	1701	TAATTCTAATTTACATACAGGTAGTATGGATTCTCCTGCCACTCCATATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56841	TAATTCTAATTTACATACAGGTAGTATGGATTCTCCTGCCACTCCATATA	56890

CU074422.1	1751	TAATTATTTTTTCTCACTTGGTATAGTGTCTGGTTGTCCTGTGTATATAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56891	TAATTATTTTTTCTCACTTGGTATAGTGTCTGGTTGTCCTGTGTATATAT	56940

CU074422.1	1801	TAACATCACTGCCTGTGTCAAATAGCCATCTAACTTTTATCTTCTTATTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56941	TAACATCACTGCCTGTGTCAAATAGCCATCTAACTTTTATCTTCTTATTC	56990

CU074422.1	1851	TTAGATTTTAGGGGCAACATAATACATGGTGGTATTGGCACCTAACATGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	56991	TTAGATTTTAGGGGCAACATAATACATGGTGGTATTGGCACCTAACATGA	57040

CU074422.1	1901	TTCCTATTGAAAGGTGTATGTTTTGGACACTGATTGTCCCTTTGTACTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	57041	TTCCTATTGAAAGGTGTATGTTTTGGACACTGATTGTCCCTTTGTACTGG	57090

CU074422.1	1951	TAGCCACCTTTGTAGTGGCCTTCTGTTCTCTTTTAAAAAGGCTTAGGTTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU329702.1	57091	TAGCCACCTTTGTAGTGGCCTTCTGTTCTCTTTTAAAAAGGCTTAGGTTT	57140

Overview

Query
CU074422.1 - 195668 bps
Hit
CU329702.1 - 57140 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link