<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207375.12	1	GAATTCACTTTGTAGGCCAGCCTCGAACTGAGAAATCTGCCTGCCTCTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19128	GAATTCACTTTGTAGGCCAGCCTCGAACTGAGAAATCTGCCTGCCTCTGC	19177

CU207375.12	51	CTCCTGAGTGCTGAGATTAAAGGCATGTGCCACCATGCATGGCACACTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19178	CTCCTGAGTGCTGAGATTAAAGGCATGTGCCACCATGCATGGCACACTTT	19227

CU207375.12	101	TCTTTTTTTTAAGATTTATTTATTATATGTAAGTACATGGTAGCTATCTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19228	TCTTTTTTTTAAGATTTATTTATTATATGTAAGTACATGGTAGCTATCTT	19277

CU207375.12	151	CAGACATCCCAGAAAAGGGCATCAGATCTCATTACGGATGGTTGTGAGCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19278	CAGACATCCCAGAAAAGGGCATCAGATCTCATTACGGATGGTTGTGAGCC	19327

CU207375.12	201	ACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCACGACCTTCAGAAGAGCAGTCGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19328	ACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCACGACCTTCAGAAGAGCAGTCGA	19377

CU207375.12	251	CGATCTTAACCACTGAGCCATCTCCCCAGCCCTGGGATGAACTCTTATCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19378	CGATCTTAACCACTGAGCCATCTCCCCAGCCCTGGGATGAACTCTTATCT	19427

CU207375.12	301	CTCTGGAACCAGAAGTTCAAATAAAGTCTTCCTTTGACAATTTGCCTTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19428	CTCTGGAACCAGAAGTTCAAATAAAGTCTTCCTTTGACAATTTGCCTTGG	19477

CU207375.12	351	TTGTGGTGTTTTATTTATTTATTGTTTATTTATTTTATGTATTTATTTGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19478	TTGTGGTGTTTTATTTATTTATTGTTTATTTATTTTATGTATTTATTTGT	19527

CU207375.12	401	TTTTTTTTTTTGAGACAGGGTTTTTCTGTATAGCCTTGGTTGTCCTGGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19528	TTTTTTTTTTTGAGACAGGGTTTTTCTGTATAGCCTTGGTTGTCCTGGAA	19577

CU207375.12	451	TTCACTTAGAAGACCAGACTTGCCTCACACTCACAGCGACCTGCCTGCCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19578	TTCACTTAGAAGACCAGACTTGCCTCACACTCACAGCGACCTGCCTGCCT	19627

CU207375.12	501	CTGCCTCTTCAGTGTTGTAATTAATAAAGGCCTGCACTGCCACCGCCCGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19628	CTGCCTCTTCAGTGTTGTAATTAATAAAGGCCTGCACTGCCACCGCCCGC	19677

CU207375.12	551	CCAGTGGTCCTGGTATTTTATCACAAAATCAACAACATGACTAACATAGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19678	CCAGTGGTCCTGGTATTTTATCACAAAATCAACAACATGACTAACATAGG	19727

CU207375.12	601	CCTACAATTGACTTGTTTCCTTAACATTTCTACTGGGGTCATTATTTAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19728	CCTACAATTGACTTGTTTCCTTAACATTTCTACTGGGGTCATTATTTAGA	19777

CU207375.12	651	AACTGACAAATTCTTATTTGAAATATTGATTGGTCTGTTTGCTTGTTTAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19778	AACTGACAAATTCTTATTTGAAATATTGATTGGTCTGTTTGCTTGTTTAT	19827

CU207375.12	701	TTGAGACAGGGTCCCACTAGGTAGCCTTACCTAGCTTGTTAGTCACTATA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19828	TTGAGACAGGGTCCCACTAGGTAGCCTTACCTAGCTTGTTAGTCACTATA	19877

CU207375.12	751	TAGACCAAGCTGCCATCAAACTCATAGATTCCAGCTTCTGCCTCTTGAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19878	TAGACCAAGCTGCCATCAAACTCATAGATTCCAGCTTCTGCCTCTTGAAT	19927

CU207375.12	801	GTTGGGACTAAGGGTGTGTGCTGCCATGCCTGGCTTAATTTAATGATTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19928	GTTGGGACTAAGGGTGTGTGCTGCCATGCCTGGCTTAATTTAATGATTTT	19977

CU207375.12	851	TATTTGTCTTTTATTTTTTAGTCTTCTATGCAACTCTGTAAAAAAAAAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	19978	TATTTGTCTTTTATTTTTTAGTCTTCTATGCAACTCTGTAAAAAAAAAAA	20027

CU207375.12	901	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCCAACAGGATCCCCTTTGCTGTGGTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20028	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCCAACAGGATCCCCTTTGCTGTGGTC	20077

CU207375.12	951	TCACTGTATCTCCTGAAACTTTTGTTGAACTGGTCTTTGTCAGTGGTTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20078	TCACTGTATCTCCTGAAACTTTTGTTGAACTGGTCTTTGTCAGTGGTTTT	20127

CU207375.12	1001	AGGCCCAGAATTCAGGAGACAGAGGCAGGTGGATCTATGTAGGTTTAAGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20128	AGGCCCAGAATTCAGGAGACAGAGGCAGGTGGATCTATGTAGGTTTAAGG	20177

CU207375.12	1051	CCAGCCTGGTCTACATACTGAGTTCCAAGCCAGTAGAGTCGTACAGTAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20178	CCAGCCTGGTCTACATACTGAGTTCCAAGCCAGTAGAGTCGTACAGTAAG	20227

CU207375.12	1101	AACCTGTCTCAAAAGAAGGAAAAAAAAAGTGCCTGTGTGTCTGGCTGTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20228	AACCTGTCTCAAAAGAAGGAAAAAAAAAGTGCCTGTGTGTCTGGCTGTTT	20277

CU207375.12	1151	TGCCCGTGTGCAGGTTGCCTGTTTGTGTCTGTTGCTCTCAGAGGCCTGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20278	TGCCCGTGTGCAGGTTGCCTGTTTGTGTCTGTTGCTCTCAGAGGCCTGAA	20327

CU207375.12	1201	GAACTAACTGGGGTCACTTCTGGGTGTGTGCCACCATGTGGGTGCTAGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20328	GAACTAACTGGGGTCACTTCTGGGTGTGTGCCACCATGTGGGTGCTAGGA	20377

CU207375.12	1251	ATTGAGCCGGTTCCTCTGAAAGAGCAGCCAAGGCTCTGAACTGCGGAATC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20378	ATTGAGCCGGTTCCTCTGAAAGAGCAGCCAAGGCTCTGAACTGCGGAATC	20427

CU207375.12	1301	AGTCTGTTTAATGTTTTAAAAGAACTTAGCTTTCTCTGAGTCTGGAATCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20428	AGTCTGTTTAATGTTTTAAAAGAACTTAGCTTTCTCTGAGTCTGGAATCT	20477

CU207375.12	1351	GGAGTAAACACACACAGCTGCCCTCCTTACTAAAGTGGCTACTGTTGCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20478	GGAGTAAACACACACAGCTGCCCTCCTTACTAAAGTGGCTACTGTTGCTG	20527

CU207375.12	1401	GTTGAGGGCTTGCTCTTGATGTCCCTTCCCAAAGAAATTCTAATCAAAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20528	GTTGAGGGCTTGCTCTTGATGTCCCTTCCCAAAGAAATTCTAATCAAAAA	20577

CU207375.12	1451	CCAAAGCAGGTTCAGAAAGTAAGAAACCAAACTAAAGGATAGACTGTGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20578	CCAAAGCAGGTTCAGAAAGTAAGAAACCAAACTAAAGGATAGACTGTGAC	20627

CU207375.12	1501	AGAGGCAGATGAATGTGTGTCTCTGGGGACCCATAGGCTCTGGGGGCCTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20628	AGAGGCAGATGAATGTGTGTCTCTGGGGACCCATAGGCTCTGGGGGCCTG	20677

CU207375.12	1551	CAGGACTAGAAATGAATAAATTAACAAAAATTAAAAGGTAATTAATCCTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20678	CAGGACTAGAAATGAATAAATTAACAAAAATTAAAAGGTAATTAATCCTT	20727

CU207375.12	1601	TAATCCCAGCACTCCGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTAAGTCCGAGGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20728	TAATCCCAGCACTCCGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTAAGTCCGAGGC	20777

CU207375.12	1651	CAGCCTGGTCTACAAAGTTAAGTTCCAGGACAGTCAGGGCTATGGAGGGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20778	CAGCCTGGTCTACAAAGTTAAGTTCCAGGACAGTCAGGGCTATGGAGGGC	20827

CU207375.12	1701	TATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAAACAAAAAACAAAACAAAACAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20828	TATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAAACAAAAAACAAAACAAAACAAA	20877

CU207375.12	1751	AGTTAATTAATTTAAAATTAAAATTAATTTAAAATTTAATATAATTTAGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20878	AGTTAATTAATTTAAAATTAAAATTAATTTAAAATTTAATATAATTTAGC	20927

CU207375.12	1801	AAATTATATAATCATTTATTTAATATAATAATACTTTTAAATTAATTAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20928	AAATTATATAATCATTTATTTAATATAATAATACTTTTAAATTAATTAAA	20977

CU207375.12	1851	ATGTTATTTTATTTTATTTTGCTTTTTTAAGGCAGGGTTTCTCTGTGTAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	20978	ATGTTATTTTATTTTATTTTGCTTTTTTAAGGCAGGGTTTCTCTGTGTAT	21027

CU207375.12	1901	CCCTGGCTATCCTAGAGCAAGCTGGCCTACAAACTTATAAAGATCTGCCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	21028	CCCTGGCTATCCTAGAGCAAGCTGGCCTACAAACTTATAAAGATCTGCCT	21077

CU207375.12	1951	ACCCCTGCCTTTGCCTTTGGAGTGGTAGGATTAAAGGTGTGTACCACCAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302433.11	21078	ACCCCTGCCTTTGCCTTTGGAGTGGTAGGATTAAAGGTGTGTACCACCAC	21127

Overview

Query
CU207375.12 - 191037 bps
Hit
CU302433.11 - 21127 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link