<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU329702.1	1	GAATTCCAGGCTGGGCCTCCTCCTCCCCCCTCCCCTTGCACTTGACTCCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71126	GAATTCCAGGCTGGGCCTCCTCCTCCCCCCTCCCCTTGCACTTGACTCCC	71175

CU329702.1	51	TCAGCCTGCTCACATTTCACTGGCACCAGTGGTGCATGGTCACAAGCGCG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71176	TCAGCCTGCTCACATTTCACTGGCACCAGTGGTGCATGGTCACAAGCGCG	71225

CU329702.1	101	TTGCTAGGATATGAAACACGCTACGTTGGACCCTTACTTTTCCCCCCACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71226	TTGCTAGGATATGAAACACGCTACGTTGGACCCTTACTTTTCCCCCCACT	71275

CU329702.1	151	CACAACAGGCCATGACTTACGGCTGCTGGTAGGAAGTCCCACCCTCCAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71276	CACAACAGGCCATGACTTACGGCTGCTGGTAGGAAGTCCCACCCTCCAGT	71325

CU329702.1	201	GGCACAGACCTGAGAGCCTGACCTGTGGCACCCTCAGACCCACTGGCTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71326	GGCACAGACCTGAGAGCCTGACCTGTGGCACCCTCAGACCCACTGGCTGC	71375

CU329702.1	251	CCACTCCTGCGTGCAAGAGAGCTCCCACAGAAGCTGCTGCCACCCAGCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71376	CCACTCCTGCGTGCAAGAGAGCTCCCACAGAAGCTGCTGCCACCCAGCCT	71425

CU329702.1	301	CTGCCACGTGGGTTACACGGTCAGATGGGCCCAAACCAACCACTCAGTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71426	CTGCCACGTGGGTTACACGGTCAGATGGGCCCAAACCAACCACTCAGTTC	71475

CU329702.1	351	CACATCTTCTGCTACCAGACTGCAGAAGCTCACTAACACACACTGGCATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71476	CACATCTTCTGCTACCAGACTGCAGAAGCTCACTAACACACACTGGCATA	71525

CU329702.1	401	TTGATAGGTGAGGAGTTTCTCCAGTTCGTGGGAGGGACCCTATATGCCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71526	TTGATAGGTGAGGAGTTTCTCCAGTTCGTGGGAGGGACCCTATATGCCCA	71575

CU329702.1	451	GATAGCTCTTTGGGGCTAATGGGTTGACATTTCAATGCCCTGGTCCTTAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71576	GATAGCTCTTTGGGGCTAATGGGTTGACATTTCAATGCCCTGGTCCTTAT	71625

CU329702.1	501	GACCGGCCTCCTGGCTAACCTACAAGTTAAGACTTAGACCATTGGGTGAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71626	GACCGGCCTCCTGGCTAACCTACAAGTTAAGACTTAGACCATTGGGTGAC	71675

CU329702.1	551	CTCCCTTCTCGAAAGCAGTTCATAAATTCCCAGAACTCTTGCAACTGGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71676	CTCCCTTCTCGAAAGCAGTTCATAAATTCCCAGAACTCTTGCAACTGGCC	71725

CU329702.1	601	AAAAATTCCTGGTACCAGGTTGAATTGCTTTCTGGCAGTTTCCAGGAAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71726	AAAAATTCCTGGTACCAGGTTGAATTGCTTTCTGGCAGTTTCCAGGAAAT	71775

CU329702.1	651	TGCCGCTGTAGCATCTAGTTCTTCATATGACGACCTGAATTTCTAGTTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71776	TGCCGCTGTAGCATCTAGTTCTTCATATGACGACCTGAATTTCTAGTTTG	71825

CU329702.1	701	GCTGTACACTGACTGTCCCTGAGCTCTCTTCAGGGCGCCGGTACCAAAAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71826	GCTGTACACTGACTGTCCCTGAGCTCTCTTCAGGGCGCCGGTACCAAAAG	71875

CU329702.1	751	TTCAGTAACATCCCCATCACCCAATGGATGCTAACGTGTCTTCAAACACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71876	TTCAGTAACATCCCCATCACCCAATGGATGCTAACGTGTCTTCAAACACA	71925

CU329702.1	801	TATTTTAAGGTATCTTCACACATACTGCCAGTAGCCTGATAAATGGAAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71926	TATTTTAAGGTATCTTCACACATACTGCCAGTAGCCTGATAAATGGAAAA	71975

CU329702.1	851	AGTCCCCTAGGCCTAAGTGCTCACCTATCCATGCTCCCACATCCCTGGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	71976	AGTCCCCTAGGCCTAAGTGCTCACCTATCCATGCTCCCACATCCCTGGCC	72025

CU329702.1	901	TGTTCTCATGGCCTGCGTGCTCAGTTTGGGTTACAGGCTTAAATCTTATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72026	TGTTCTCATGGCCTGCGTGCTCAGTTTGGGTTACAGGCTTAAATCTTATG	72075

CU329702.1	951	TCACTGCTGCCAGCTTTCTTATTCTGGTCCTAGCCAAATATTTCTTTGCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72076	TCACTGCTGCCAGCTTTCTTATTCTGGTCCTAGCCAAATATTTCTTTGCT	72125

CU329702.1	1001	ATACAGTATATACCTTTCTCTACCTACACAACCTGTCAAAGTTACCTAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72126	ATACAGTATATACCTTTCTCTACCTACACAACCTGTCAAAGTTACCTAAG	72175

CU329702.1	1051	ATTTTCTTTCCTAACCTGTCTTGATGACTGTCATTTAATTCTATTCAGTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72176	ATTTTCTTTCCTAACCTGTCTTGATGACTGTCATTTAATTCTATTCAGTT	72225

CU329702.1	1101	ATAACCAATCTATAACGCTCAATCCTGTCAGAAGTTTAACTGTTAAGTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72226	ATAACCAATCTATAACGCTCAATCCTGTCAGAAGTTTAACTGTTAAGTTT	72275

CU329702.1	1151	ATGACAGACAGAATCCTCAAAAGCCTCTAACAGTTTCTCCCATGAAGTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72276	ATGACAGACAGAATCCTCAAAAGCCTCTAACAGTTTCTCCCATGAAGTCT	72325

CU329702.1	1201	CAGAAGATGTGGACACTGCTAGAGGATGCTGTTTGGATTGTGATATGATA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72326	CAGAAGATGTGGACACTGCTAGAGGATGCTGTTTGGATTGTGATATGATA	72375

CU329702.1	1251	ATCACTGAAATACGCAGTGGACAAAACTGGATACCCTGAGTCATATGATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72376	ATCACTGAAATACGCAGTGGACAAAACTGGATACCCTGAGTCATATGATT	72425

CU329702.1	1301	AGCTAAAATAAAGGTAAGCCATCCCTCATATCACGCGTATCCATTCCACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72426	AGCTAAAATAAAGGTAAGCCATCCCTCATATCACGCGTATCCATTCCACA	72475

CU329702.1	1351	GAGAAAAACCCCTGTGTCTTCTGTACCTGAAAGCCAGACTGACTCTGCCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72476	GAGAAAAACCCCTGTGTCTTCTGTACCTGAAAGCCAGACTGACTCTGCCC	72525

CU329702.1	1401	TATTTGCCATTGAGACCATGGAGACCATAGAGAACTGTTGACTAGTGGAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72526	TATTTGCCATTGAGACCATGGAGACCATAGAGAACTGTTGACTAGTGGAC	72575

CU329702.1	1451	TCTGTCATTTTTAAAATAATATATAACTGGTATGTATATAACTGCTAGAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72576	TCTGTCATTTTTAAAATAATATATAACTGGTATGTATATAACTGCTAGAT	72625

CU329702.1	1501	TTTTGGTTCTTCCCCAGACTTGTGACTACATTGACAGCTAAGACAGCAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72626	TTTTGGTTCTTCCCCAGACTTGTGACTACATTGACAGCTAAGACAGCAGC	72675

CU329702.1	1551	TAGAAAAAACTTTCACAGATGTAATCTGTTATCTCCTTACCTAAACTCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72676	TAGAAAAAACTTTCACAGATGTAATCTGTTATCTCCTTACCTAAACTCTG	72725

CU329702.1	1601	TTTCCATTAATCAAATGTTTCATGTTTCCTCCTCTTGCTATGCCACTGTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72726	TTTCCATTAATCAAATGTTTCATGTTTCCTCCTCTTGCTATGCCACTGTC	72775

CU329702.1	1651	CTAATATTATCTGAGTTCCTATAAATTTGCCTAACTCTAATAAAACATTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72776	CTAATATTATCTGAGTTCCTATAAATTTGCCTAACTCTAATAAAACATTT	72825

CU329702.1	1701	TAATCCTGTTCTTTCTGCTCCATAAAGGGCTCATCGTAAGACTGTTCATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72826	TAATCCTGTTCTTTCTGCTCCATAAAGGGCTCATCGTAAGACTGTTCATG	72875

CU329702.1	1751	TTGCTAACTCATGTTTTCTCTTTTATAAACTTATAAACTATAGAAAATCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72876	TTGCTAACTCATGTTTTCTCTTTTATAAACTTATAAACTATAGAAAATCC	72925

CU329702.1	1801	ACTCAGATCTACCTCTCATAGACCAAATAGATTCCATCCAGATAAATACA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72926	ACTCAGATCTACCTCTCATAGACCAAATAGATTCCATCCAGATAAATACA	72975

CU329702.1	1851	TCTGCCCAAAGTTCCCACTTGCTACCTATTCCAAAGGGTGGGATTCCTCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	72976	TCTGCCCAAAGTTCCCACTTGCTACCTATTCCAAAGGGTGGGATTCCTCT	73025

CU329702.1	1901	GGGTTTCAAATGTACATCTTAAGAAATAATTTTCTTTCTCCCAAATGTAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	73026	GGGTTTCAAATGTACATCTTAAGAAATAATTTTCTTTCTCCCAAATGTAC	73075

CU329702.1	1951	TTAATCTTATTTTCTACTTACAATAATGTGTTCCAACATCTTGTCAAATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302375.2	73076	TTAATCTTATTTTCTACTTACAATAATGTGTTCCAACATCTTGTCAAATC	73125

Overview

Query
CU329702.1 - 57140 bps
Hit
CU302375.2 - 73125 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link