<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210912.6	1	TGTTTTGCCTGCATGTATGCTTGTGTGCCATGTGAGTGCCTGATTCCTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109303	TGTTTTGCCTGCATGTATGCTTGTGTGCCATGTGAGTGCCTGATTCCTTC	109352

CU210912.6	51	AGAGGTAAGAAGAGGGAATTTGATCTTTTGGAACTAGAGTTATAGTTGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109353	AGAGGTAAGAAGAGGGAATTTGATCTTTTGGAACTAGAGTTATAGTTGAG	109402

CU210912.6	101	CTGTCCTGTGGGTGCTGGGTCTTGAACCCAGGTCTTCTAGAAGAGCAGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109403	CTGTCCTGTGGGTGCTGGGTCTTGAACCCAGGTCTTCTAGAAGAGCAGCC	109452

CU210912.6	151	AGTGTACCTAACCATTGTGCCATCTCTCCAGCCTCCTAGAGATGCTCTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109453	AGTGTACCTAACCATTGTGCCATCTCTCCAGCCTCCTAGAGATGCTCTTA	109502

CU210912.6	201	CATGGCTTCGCTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109503	CATGGCTTCGCTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAG	109552

CU210912.6	251	ATCCGTAGCCTGCATTGGCTTTGAACTTATGATTTGCCTCAGCCTCTCAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109553	ATCCGTAGCCTGCATTGGCTTTGAACTTATGATTTGCCTCAGCCTCTCAA	109602

CU210912.6	301	ATGCTGAGATGACCCCTGAGTGCCATCGCACCTGGTGGACCCTTGTCCAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109603	ATGCTGAGATGACCCCTGAGTGCCATCGCACCTGGTGGACCCTTGTCCAG	109652

CU210912.6	351	TGTCCCAGGGCTGACGTGACATGTTTTGACCTCCTGTTCTCTCTCAGCCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109653	TGTCCCAGGGCTGACGTGACATGTTTTGACCTCCTGTTCTCTCTCAGCCT	109702

CU210912.6	401	AGGGGATCCTAGGAGACATGCCTGGTCTGCCTTTGAGAGCTGCTGGTTGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109703	AGGGGATCCTAGGAGACATGCCTGGTCTGCCTTTGAGAGCTGCTGGTTGT	109752

CU210912.6	451	CGCAGTGGCTCCCTAGGCCTGGCATAGCCCTTGTCAGAGTCCACTTTCTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109753	CGCAGTGGCTCCCTAGGCCTGGCATAGCCCTTGTCAGAGTCCACTTTCTC	109802

CU210912.6	501	CAAGGGATCTCCAGGAAAGGACTGTGAGCTTTCGCAGGCCTGCTGGCTTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109803	CAAGGGATCTCCAGGAAAGGACTGTGAGCTTTCGCAGGCCTGCTGGCTTC	109852

CU210912.6	551	CCGTACAGAAACAGGCACCTGGTTGAGGGTGCTCCTGGAGAGCCTAAAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109853	CCGTACAGAAACAGGCACCTGGTTGAGGGTGCTCCTGGAGAGCCTAAAAT	109902

CU210912.6	601	AGTTTCCTTGGTCTCATGGATAAACTGACTTATTATCTGGCTTATTATAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109903	AGTTTCCTTGGTCTCATGGATAAACTGACTTATTATCTGGCTTATTATAT	109952

CU210912.6	651	TAACTTACTATGATAGCCGTATTCAGGGGAAAACATCAGGAACCAGGCAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	109953	TAACTTACTATGATAGCCGTATTCAGGGGAAAACATCAGGAACCAGGCAC	110002

CU210912.6	701	TTTGGAAGTGACCCAGTTCTGCAGTTGCTCCACTTGACCCTTGCGGTGCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110003	TTTGGAAGTGACCCAGTTCTGCAGTTGCTCCACTTGACCCTTGCGGTGCC	110052

CU210912.6	751	CTGGGACGGAGCTGGGTAGAGTGAGCGGCTCCATTTCCCACCAGTGTGTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110053	CTGGGACGGAGCTGGGTAGAGTGAGCGGCTCCATTTCCCACCAGTGTGTT	110102

CU210912.6	801	AAGTTCTGTGGAATCCCCTCCCCTAGCAGCATCCTGCCTCTGCTCGTTCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110103	AAGTTCTGTGGAATCCCCTCCCCTAGCAGCATCCTGCCTCTGCTCGTTCT	110152

CU210912.6	851	TGTCCTTCGTGTGCCCTCTCTCGCACCCTCCCAGAGTCAGCTGGTACCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110153	TGTCCTTCGTGTGCCCTCTCTCGCACCCTCCCAGAGTCAGCTGGTACCTG	110202

CU210912.6	901	ACTGGGACCTTCCAGAGCCCCATGCCAGTGTCTGCTCTCTGAATGTGTGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110203	ACTGGGACCTTCCAGAGCCCCATGCCAGTGTCTGCTCTCTGAATGTGTGG	110252

CU210912.6	951	TCACAGTGTCAGGAGGGAAAGGGTCTGCGGTTTGTTCACGGCCCACATCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110253	TCACAGTGTCAGGAGGGAAAGGGTCTGCGGTTTGTTCACGGCCCACATCC	110302

CU210912.6	1001	AGGCCCAGAGCTGTTCCTGCTTAGACCAAAGCCTCGTGGAGTGGCTTCCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110303	AGGCCCAGAGCTGTTCCTGCTTAGACCAAAGCCTCGTGGAGTGGCTTCCT	110352

CU210912.6	1051	GCGCAGCATCTCTCTCTGCCTCCCTTGTTGCGTAGGCCCTCCGCTGTGGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110353	GCGCAGCATCTCTCTCTGCCTCCCTTGTTGCGTAGGCCCTCCGCTGTGGT	110402

CU210912.6	1101	TTCTGGCTCTCCTCTCCCCATGCCTGGCTACTTAGAGGCTCCTTCTAGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110403	TTCTGGCTCTCCTCTCCCCATGCCTGGCTACTTAGAGGCTCCTTCTAGAG	110452

CU210912.6	1151	GGTGAAATCAGTCAGTGCTGAAATTAGAGTCGGCCCAGGGAGGATTCACT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110453	GGTGAAATCAGTCAGTGCTGAAATTAGAGTCGGCCCAGGGAGGATTCACT	110502

CU210912.6	1201	GTGGGACCTGAAGCTCAGACTCTTAACTTTAATCAACACTTCTGTGAGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110503	GTGGGACCTGAAGCTCAGACTCTTAACTTTAATCAACACTTCTGTGAGAA	110552

CU210912.6	1251	TTACCTGGAACCCAGTAACAAAGCTGAGCCAGAAGTCACGTGTGGTTCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110553	TTACCTGGAACCCAGTAACAAAGCTGAGCCAGAAGTCACGTGTGGTTCAG	110602

CU210912.6	1301	AAATCCATGGGGATCTGACTCCTAACTCCTGTCACTGAGAAGAAAAGGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110603	AAATCCATGGGGATCTGACTCCTAACTCCTGTCACTGAGAAGAAAAGGAA	110652

CU210912.6	1351	GAGTGACAAATGTGTGAGACGCCAGCCGGCTGCTCCCCCAGCATCCAGTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110653	GAGTGACAAATGTGTGAGACGCCAGCCGGCTGCTCCCCCAGCATCCAGTT	110702

CU210912.6	1401	CTGCACTCTTTAGCCCAGCATCCAGATGTGCACACTTTAGCCCAGCATGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110703	CTGCACTCTTTAGCCCAGCATCCAGATGTGCACACTTTAGCCCAGCATGG	110752

CU210912.6	1451	TGGGGTCTGTTCTTTAAAGGCCCCTGGCATGCTCAGACTGCCTAAGAGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110753	TGGGGTCTGTTCTTTAAAGGCCCCTGGCATGCTCAGACTGCCTAAGAGGT	110802

CU210912.6	1501	GGGTCTCGGTCCTGGCAGCGGGACAGTTCCAGTCACTTTAGCCCCTCCTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110803	GGGTCTCGGTCCTGGCAGCGGGACAGTTCCAGTCACTTTAGCCCCTCCTT	110852

CU210912.6	1551	ACTATAAACTCAGCATAGTGTCTGATGACAGCCAGGAAGGGCAGACTGTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110853	ACTATAAACTCAGCATAGTGTCTGATGACAGCCAGGAAGGGCAGACTGTA	110902

CU210912.6	1601	GGGTATCTGTACGAATGCAGAAGAGCTTTGATTGTGTAGATTTCTGCGTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110903	GGGTATCTGTACGAATGCAGAAGAGCTTTGATTGTGTAGATTTCTGCGTA	110952

CU210912.6	1651	GGACTGCCTGGGAGTGGGGCCCCCAGGAAGCTAGAATGCAGGCTACAGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	110953	GGACTGCCTGGGAGTGGGGCCCCCAGGAAGCTAGAATGCAGGCTACAGAC	111002

CU210912.6	1701	CTTTCCCCAGCCCCAGTGAGTCACAGCACCGGCCAGGAGAGCCCGGTAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	111003	CTTTCCCCAGCCCCAGTGAGTCACAGCACCGGCCAGGAGAGCCCGGTAAT	111052

CU210912.6	1751	CTGCATTTTAAGCAAAGCAGGGCATGGGGTTGCACACTTCTGTGATTCAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	111053	CTGCATTTTAAGCAAAGCAGGGCATGGGGTTGCACACTTCTGTGATTCAG	111102

CU210912.6	1801	CAGTGCTACACAGAGGGACACTGTAGAAGTACAGGCTCCTGTGCTCTTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	111103	CAGTGCTACACAGAGGGACACTGTAGAAGTACAGGCTCCTGTGCTCTTCC	111152

CU210912.6	1851	CTAGACTCCGAGACTCATAGTGACTGCCGTGTATACATATCTACATATCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	111153	CTAGACTCCGAGACTCATAGTGACTGCCGTGTATACATATCTACATATCT	111202

CU210912.6	1901	ACGATACGGCTTCGTTAGCAAAGCTAGCTGTGATGAAGTTGGTCTGCTGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	111203	ACGATACGGCTTCGTTAGCAAAGCTAGCTGTGATGAAGTTGGTCTGCTGT	111252

CU210912.6	1951	CTAACTACTGTGGAAGCTGAGGTAGTAGGGCCACCTGAGCTTAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU302290.9	111253	CTAACTACTGTGGAAGCTGAGGTAGTAGGGCCACCTGAGCTTAGGAATTC	111302

Overview

Query
CU210912.6 - 84672 bps
Hit
CU302290.9 - 111302 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link