<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207324.10	1	GAATTCTTCCCTAACCCTACTCCTATAGAGGGTTATTATCCAAAATATAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	61636	GAATTCTTCCCTAACCCTACTCCTATAGAGGGTTATTATCCAAAATATAT	61685

CU207324.10	51	AAAAAACTCAAGAAGCTAACCACCAAAAACACCAAACAACCCAATCAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	61686	AAAAAACTCAAGAAGCTAACCACCAAAAACACCAAACAACCCAATCAAAA	61735

CU207324.10	101	AATGAGGTAAAGAACTATACTGAGAATTCACAGCAGAGGAATCTGAAATT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	61736	AATGAGGTAAAGAACTATACTGAGAATTCACAGCAGAGGAATCTGAAATT	61785

CU207324.10	151	GTTGAGAAGCACCTATGGAAATGTTCAAAGCCCTTAGTGATCAGAGAAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	61786	GTTGAGAAGCACCTATGGAAATGTTCAAAGCCCTTAGTGATCAGAGAAAT	61835

CU207324.10	201	GCTAGTCAAAACAACCATGAGAGTCTACCTTACACTAATCAGAATGGCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	61836	GCTAGTCAAAACAACCATGAGAGTCTACCTTACACTAATCAGAATGGCTG	61885

CU207324.10	251	TGGGGAATTGCAGGCTGGTATCCAGTCAAGCTGAGGTCTGAACCCCGATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	61886	TGGGGAATTGCAGGCTGGTATCCAGTCAAGCTGAGGTCTGAACCCCGATG	61935

CU207324.10	301	GTTATACTTCACCTACATGACATGGTAGGCATTCTGTCATGCTCTTAGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	61936	GTTATACTTCACCTACATGACATGGTAGGCATTCTGTCATGCTCTTAGAA	61985

CU207324.10	351	CTCTGGCCTCTACTAAGTTACCACCCCCAACAACCCCCATAAGAGAAGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	61986	CTCTGGCCTCTACTAAGTTACCACCCCCAACAACCCCCATAAGAGAAGAA	62035

CU207324.10	401	TGGTCAGTAGTCACGTAAACAATGCCCAAACTTCTGACCTTCAGGCTAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62036	TGGTCAGTAGTCACGTAAACAATGCCCAAACTTCTGACCTTCAGGCTAAA	62085

CU207324.10	451	CTCTTCCCCAGTTACCTAGCAATAGTGAAGACCATAAAAAGGGCTGTTCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62086	CTCTTCCCCAGTTACCTAGCAATAGTGAAGACCATAAAAAGGGCTGTTCA	62135

CU207324.10	501	GCCCCCACCTCACTCTCTTACTCTTATGCTCTTACTTCTTACACTTCACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62136	GCCCCCACCTCACTCTCTTACTCTTATGCTCTTACTTCTTACACTTCACT	62185

CU207324.10	551	CTCACCCTCTCTCTCCCCTCTCTTTGTCTTCTCCCCCTCTCTCTTTTCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62186	CTCACCCTCTCTCTCCCCTCTCTTTGTCTTCTCCCCCTCTCTCTTTTCTC	62235

CU207324.10	601	CTTTTCCTCTCTTTCCTCTCTCCCTCTTACACTCTTTCTCTCTAGCCTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62236	CTTTTCCTCTCTTTCCTCTCTCCCTCTTACACTCTTTCTCTCTAGCCTTT	62285

CU207324.10	651	CCCCCCTCCTCTTTGTACCTTCTCTCTTTCTCCCTGCATTTTTTTTTTGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62286	CCCCCCTCCTCTTTGTACCTTCTCTCTTTCTCCCTGCATTTTTTTTTTGC	62335

CU207324.10	701	CCGTAGGCAAATGGCAATTTATTTATTCATTTATTTTTATTTTTATTTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62336	CCGTAGGCAAATGGCAATTTATTTATTCATTTATTTTTATTTTTATTTTA	62385

CU207324.10	751	GAATTATTTTTTTATTGGGCATTTTCCTCATTTACATTTCCAATGCTATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62386	GAATTATTTTTTTATTGGGCATTTTCCTCATTTACATTTCCAATGCTATC	62435

CU207324.10	801	CAAAAAGTCCCCAATACACTCCCCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62436	CAAAAAGTCCCCAATACACTCCCCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCAA	62485

CU207324.10	851	CTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGGCATATACAGTTTGCAAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62486	CTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGGCATATACAGTTTGCAAGT	62535

CU207324.10	901	CCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATTGCCGACTAGGCCATCTTTTGATAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62536	CCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATTGCCGACTAGGCCATCTTTTGATAC	62585

CU207324.10	951	ATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCTGGGGTACTGGTTAGTTCATATTGTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62586	ATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCTGGGGTACTGGTTAGTTCATATTGTT	62635

CU207324.10	1001	GTTCCACTTATAGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62636	GTTCCACTTATAGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCT	62685

CU207324.10	1051	AGCTCCTCCACTGGGGGCCCTGTGATCCATCCAATAGCTGACTGTGAGCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62686	AGCTCCTCCACTGGGGGCCCTGTGATCCATCCAATAGCTGACTGTGAGCA	62735

CU207324.10	1101	TCCACTTCTGTGTTTGCTAGGTCCCGGCATTGTCTCACGAGAGACAGCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62736	TCCACTTCTGTGTTTGCTAGGTCCCGGCATTGTCTCACGAGAGACAGCTA	62785

CU207324.10	1151	TATCTGGGTCCTTTCAGCAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62786	TATCTGGGTCCTTTCAGCAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGC	62835

CU207324.10	1201	GTTTGGACGCTGATTATGGGATGGATCCCTGGATATGGCAGTCTTTAGAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62836	GTTTGGACGCTGATTATGGGATGGATCCCTGGATATGGCAGTCTTTAGAT	62885

CU207324.10	1251	GGTGCATCCTTTCTTCACAGCTCCAAACTTTATCTTTGTAACTCTTTCCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62886	GGTGCATCCTTTCTTCACAGCTCCAAACTTTATCTTTGTAACTCTTTCCA	62935

CU207324.10	1301	TGGGTGTTTTGTTCCCAATTCTAAAAAGGGGCACAGCGTCCACACTTTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62936	TGGGTGTTTTGTTCCCAATTCTAAAAAGGGGCACAGCGTCCACACTTTGG	62985

CU207324.10	1351	TCTTCGTTCTTCTTGAGTTTCATGCGTTTAACAAATTGTATCTTATATCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	62986	TCTTCGTTCTTCTTGAGTTTCATGCGTTTAACAAATTGTATCTTATATCT	63035

CU207324.10	1401	TGGGTATCCTAAGTTTTGGGGCTAATATCAACTTATCAGTGAGTACATAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63036	TGGGTATCCTAAGTTTTGGGGCTAATATCAACTTATCAGTGAGTACATAT	63085

CU207324.10	1451	TGTGTGAGTTCCTTTATGATTGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63086	TGTGTGAGTTCCTTTATGATTGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCC	63135

CU207324.10	1501	AGGTCCATCCATTTGCCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63136	AGGTCCATCCATTTGCCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGC	63185

CU207324.10	1551	TGAGTAGTACTCCATTGTGTAAATGTAGCACATTTTCTGTATCCATTCCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63186	TGAGTAGTACTCCATTGTGTAAATGTAGCACATTTTCTGTATCCATTCCA	63235

CU207324.10	1601	GCAGATCCTGGTGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63236	GCAGATCCTGGTGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGG	63285

CU207324.10	1651	TGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63286	TGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTTTT	63335

CU207324.10	1701	CAGACAATTGGACATACTACTACCGGAGGATCCCGAAATACCTCTTTGGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63336	CAGACAATTGGACATACTACTACCGGAGGATCCCGAAATACCTCTTTGGG	63385

CU207324.10	1751	CATATATCCAGAAGATGTTCCAACCGGTAAGAAGGACTCATGTTCCACTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63386	CATATATCCAGAAGATGTTCCAACCGGTAAGAAGGACTCATGTTCCACTA	63435

CU207324.10	1801	TGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAATCTGGAAAGAACCCAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63436	TGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAATCTGGAAAGAACCCAGA	63485

CU207324.10	1851	TGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAAAAAAATGTGGTATATTTACACAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63486	TGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAAAAAAATGTGGTATATTTACACAA	63535

CU207324.10	1901	TGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAGGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63536	TGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAGGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGC	63585

CU207324.10	1951	AAATGGTTGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210950.8	63586	AAATGGTTGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACA	63635

Overview

Query
CU207324.10 - 168632 bps
Hit
CU210950.8 - 63635 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link