<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU234134.7 1 GCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 157512 GCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTC 157561 CU234134.7 51 AGGGCCTTGAGTAGATAGAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGCC 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 157562 AGGGCCTTGAGTAGATAGAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGCC 157611 CU234134.7 101 GCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 157612 GCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAA 157661 CU234134.7 151 TACTGCCTCACCAGATGCCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 157662 TACTGCCTCACCAGATGCCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGA 157711 CU234134.7 201 GTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 157712 GTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACC 157761 CU234134.7 251 GATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 157762 GATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACC 157811 CU234134.7 301 AGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 157812 AGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCA 157861 CU234134.7 351 TTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGG 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 157862 TTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGG 157911 CU234134.7 401 GCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTTTCTGA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 157912 GCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTTTCTGA 157961 CU234134.7 451 GGTAAACTATGATACTTGGGTCTATCAGTTAATAGGAATAGGGAACACTG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 157962 GGTAAACTATGATACTTGGGTCTATCAGTTAATAGGAATAGGGAACACTG 158011 CU234134.7 501 GGCTTTTTAAACTTTACGAGTTTATGATGGGGTTACATTAAGGTTCCTCT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158012 GGCTTTTTAAACTTTACGAGTTTATGATGGGGTTACATTAAGGTTCCTCT 158061 CU234134.7 551 TGTCCCTCACACTCCATTTTAGACAAGCAGGAAGACAGTTCAGATGACGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158062 TGTCCCTCACACTCCATTTTAGACAAGCAGGAAGACAGTTCAGATGACGA 158111 CU234134.7 601 CGAGACTGAAGAAGGAGAAGTGGAAGATGAGAATTCAAGTGATGTAGAGG 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158112 CGAGACTGAAGAAGGAGAAGTGGAAGATGAGAATTCAAGTGATGTAGAGG 158161 CU234134.7 651 TTAGTAATAGGGCAAAGATATCTAAGGTTTTATTGGAAAAAAATAATGCT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158162 TTAGTAATAGGGCAAAGATATCTAAGGTTTTATTGGAAAAAAATAATGCT 158211 CU234134.7 701 TACTGTCTTTTTAAATGTCAGATGTAAAGACTTAGTAAGCTATGTTCATG 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158212 TACTGTCTTTTTAAATGTCAGATGTAAAGACTTAGTAAGCTATGTTCATG 158261 CU234134.7 751 TAGCCTTTTAGTTTGTGTGGATGTAACAGTTCATTTTGGAGTCTTAGAAT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158262 TAGCCTTTTAGTTTGTGTGGATGTAACAGTTCATTTTGGAGTCTTAGAAT 158311 CU234134.7 801 AGTGTTCATATTTGTGTAGAAGAGAAAATGGGTTTAATAAGAAACACTTT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158312 AGTGTTCATATTTGTGTAGAAGAGAAAATGGGTTTAATAAGAAACACTTT 158361 CU234134.7 851 GAAGTGTTATCTAAAAAACAAGTAGTGTTTGTCAGAAATGTTGGAGAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158362 GAAGTGTTATCTAAAAAACAAGTAGTGTTTGTCAGAAATGTTGGAGAGTG 158411 CU234134.7 901 TTCATTTGAAATATTTGGGTTAGAGGTGGGGGGCTTGCACATGTTAGGCA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158412 TTCATTTGAAATATTTGGGTTAGAGGTGGGGGGCTTGCACATGTTAGGCA 158461 CU234134.7 951 AGTGCTGTGCTTCTGATCTGTGCCCTCAGCTAAGTATATTCATTTCATGT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158462 AGTGCTGTGCTTCTGATCTGTGCCCTCAGCTAAGTATATTCATTTCATGT 158511 CU234134.7 1001 TGAATTATTTAAATGGTAAGTGTTTACTATATACCAAATTCTGGGAACAA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158512 TGAATTATTTAAATGGTAAGTGTTTACTATATACCAAATTCTGGGAACAA 158561 CU234134.7 1051 ACTATCAGGGTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGCCCTTGCCTCACTGGAGGCT 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158562 ACTATCAGGGTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGCCCTTGCCTCACTGGAGGCT 158611 CU234134.7 1101 GCATTTTAGAGGGGAGGACAGATACACAGTTGCTGCTAGGAGACACAGTG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158612 GCATTTTAGAGGGGAGGACAGATACACAGTTGCTGCTAGGAGACACAGTG 158661 CU234134.7 1151 AGCACTCTGAAGACTGTAAAGGGTGAAGGGAGAGAGATTAAGGGCTGCAG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158662 AGCACTCTGAAGACTGTAAAGGGTGAAGGGAGAGAGATTAAGGGCTGCAG 158711 CU234134.7 1201 GGATAGTACATGTTGTGCTTGCAGGGGACCTGAGTTACACTTCCAGCATC 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158712 GGATAGTACATGTTGTGCTTGCAGGGGACCTGAGTTACACTTCCAGCATC 158761 CU234134.7 1251 CATGTGGGATGGCTTACGACTGCTTGTCATACTCACTACAGGGTAGCCAA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158762 CATGTGGGATGGCTTACGACTGCTTGTCATACTCACTACAGGGTAGCCAA 158811 CU234134.7 1301 CTTTGTTCTGTCCTCTGTAGACAGAACTCATGTGCACATAACTCCACACA 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158812 CTTTGTTCTGTCCTCTGTAGACAGAACTCATGTGCACATAACTCCACACA 158861 CU234134.7 1351 GACACTTTCCTGTGCACATAATTTTTAAAAAGTGTTCATAATAAAGGAGA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158862 GACACTTTCCTGTGCACATAATTTTTAAAAAGTGTTCATAATAAAGGAGA 158911 CU234134.7 1401 TAGAAAATGATGGGGACTATTTTTTAGGCGAGTTAGTCAAGGAAACCCTG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158912 TAGAAAATGATGGGGACTATTTTTTAGGCGAGTTAGTCAAGGAAACCCTG 158961 CU234134.7 1451 ACTTCAGAGTCGCCGTAGGAATAGATGCTGTGACACTGATGGGCAGAAGG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 158962 ACTTCAGAGTCGCCGTAGGAATAGATGCTGTGACACTGATGGGCAGAAGG 159011 CU234134.7 1501 CTTCTTAATGGGAACTGCACAGAAAAAGTATGAAAAATGCTGGAGTTTTA 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 159012 CTTCTTAATGGGAACTGCACAGAAAAAGTATGAAAAATGCTGGAGTTTTA 159061 CU234134.7 1551 TGTTGAAAGTGTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTAAGTTGGACAC 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 159062 TGTTGAAAGTGTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTAAGTTGGACAC 159111 CU234134.7 1601 GTTGTCTCAGGTAGAAGAAGAGTCTCTGTTACGAAATGATCTTCGTCCAG 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 159112 GTTGTCTCAGGTAGAAGAAGAGTCTCTGTTACGAAATGATCTTCGTCCAG 159161 CU234134.7 1651 CTAACAAACTTGCTAAAGGAAATAGACTATTCATGAGATTTGCTACAAAA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 159162 CTAACAAACTTGCTAAAGGAAATAGACTATTCATGAGATTTGCTACAAAA 159211 CU234134.7 1701 GGTAAACTTGATCTTTGGTATTGATTTTTGGTCAGAATGATGAAATTACT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 159212 GGTAAACTTGATCTTTGGTATTGATTTTTGGTCAGAATGATGAAATTACT 159261 CU234134.7 1751 GAGTAAAACTTAGCTGTTGACTAGAAGCGAGTTCAAATAATGCCAAAGCT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 159262 GAGTAAAACTTAGCTGTTGACTAGAAGCGAGTTCAAATAATGCCAAAGCT 159311 CU234134.7 1801 CCTTTTAAACAAATAATTTATGAAAAAGCAGCTTACTGACTGAGGGGGAA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 159312 CCTTTTAAACAAATAATTTATGAAAAAGCAGCTTACTGACTGAGGGGGAA 159361 CU234134.7 1851 TTTCATTTACATTTGTGTTTGTTAGTGTGTCTTTATTTCACTGTTAGCCT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 159362 TTTCATTTACATTTGTGTTTGTTAGTGTGTCTTTATTTCACTGTTAGCCT 159411 CU234134.7 1901 GCATGCCTGTGATGCACTTGGGTCCCATTTAATCCTCCTCTTGTTCACAC 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 159412 GCATGCCTGTGATGCACTTGGGTCCCATTTAATCCTCCTCTTGTTCACAC 159461 CU234134.7 1951 ATCCCCTTCCTTCCCCTTTTGACCTCCCCTTTTACTTAACTCTGGAATTC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210938.6 159462 ATCCCCTTCCTTCCCCTTTTGACCTCCCCTTTTACTTAACTCTGGAATTC 159511
