<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU234134.7	1	GCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	157512	GCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTC	157561

CU234134.7	51	AGGGCCTTGAGTAGATAGAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	157562	AGGGCCTTGAGTAGATAGAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGCC	157611

CU234134.7	101	GCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	157612	GCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAA	157661

CU234134.7	151	TACTGCCTCACCAGATGCCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	157662	TACTGCCTCACCAGATGCCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGA	157711

CU234134.7	201	GTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	157712	GTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACC	157761

CU234134.7	251	GATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	157762	GATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACC	157811

CU234134.7	301	AGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	157812	AGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGGGCCTTGAGTAGATAGAGCA	157861

CU234134.7	351	TTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	157862	TTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTCGCCCTGTGCACCGATCTGTTCAGG	157911

CU234134.7	401	GCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTTTCTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	157912	GCCTTGAGTAGATAGAGCATTGTGAATACTGCCTCACCAGATGTTTCTGA	157961

CU234134.7	451	GGTAAACTATGATACTTGGGTCTATCAGTTAATAGGAATAGGGAACACTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	157962	GGTAAACTATGATACTTGGGTCTATCAGTTAATAGGAATAGGGAACACTG	158011

CU234134.7	501	GGCTTTTTAAACTTTACGAGTTTATGATGGGGTTACATTAAGGTTCCTCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158012	GGCTTTTTAAACTTTACGAGTTTATGATGGGGTTACATTAAGGTTCCTCT	158061

CU234134.7	551	TGTCCCTCACACTCCATTTTAGACAAGCAGGAAGACAGTTCAGATGACGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158062	TGTCCCTCACACTCCATTTTAGACAAGCAGGAAGACAGTTCAGATGACGA	158111

CU234134.7	601	CGAGACTGAAGAAGGAGAAGTGGAAGATGAGAATTCAAGTGATGTAGAGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158112	CGAGACTGAAGAAGGAGAAGTGGAAGATGAGAATTCAAGTGATGTAGAGG	158161

CU234134.7	651	TTAGTAATAGGGCAAAGATATCTAAGGTTTTATTGGAAAAAAATAATGCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158162	TTAGTAATAGGGCAAAGATATCTAAGGTTTTATTGGAAAAAAATAATGCT	158211

CU234134.7	701	TACTGTCTTTTTAAATGTCAGATGTAAAGACTTAGTAAGCTATGTTCATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158212	TACTGTCTTTTTAAATGTCAGATGTAAAGACTTAGTAAGCTATGTTCATG	158261

CU234134.7	751	TAGCCTTTTAGTTTGTGTGGATGTAACAGTTCATTTTGGAGTCTTAGAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158262	TAGCCTTTTAGTTTGTGTGGATGTAACAGTTCATTTTGGAGTCTTAGAAT	158311

CU234134.7	801	AGTGTTCATATTTGTGTAGAAGAGAAAATGGGTTTAATAAGAAACACTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158312	AGTGTTCATATTTGTGTAGAAGAGAAAATGGGTTTAATAAGAAACACTTT	158361

CU234134.7	851	GAAGTGTTATCTAAAAAACAAGTAGTGTTTGTCAGAAATGTTGGAGAGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158362	GAAGTGTTATCTAAAAAACAAGTAGTGTTTGTCAGAAATGTTGGAGAGTG	158411

CU234134.7	901	TTCATTTGAAATATTTGGGTTAGAGGTGGGGGGCTTGCACATGTTAGGCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158412	TTCATTTGAAATATTTGGGTTAGAGGTGGGGGGCTTGCACATGTTAGGCA	158461

CU234134.7	951	AGTGCTGTGCTTCTGATCTGTGCCCTCAGCTAAGTATATTCATTTCATGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158462	AGTGCTGTGCTTCTGATCTGTGCCCTCAGCTAAGTATATTCATTTCATGT	158511

CU234134.7	1001	TGAATTATTTAAATGGTAAGTGTTTACTATATACCAAATTCTGGGAACAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158512	TGAATTATTTAAATGGTAAGTGTTTACTATATACCAAATTCTGGGAACAA	158561

CU234134.7	1051	ACTATCAGGGTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGCCCTTGCCTCACTGGAGGCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158562	ACTATCAGGGTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGCCCTTGCCTCACTGGAGGCT	158611

CU234134.7	1101	GCATTTTAGAGGGGAGGACAGATACACAGTTGCTGCTAGGAGACACAGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158612	GCATTTTAGAGGGGAGGACAGATACACAGTTGCTGCTAGGAGACACAGTG	158661

CU234134.7	1151	AGCACTCTGAAGACTGTAAAGGGTGAAGGGAGAGAGATTAAGGGCTGCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158662	AGCACTCTGAAGACTGTAAAGGGTGAAGGGAGAGAGATTAAGGGCTGCAG	158711

CU234134.7	1201	GGATAGTACATGTTGTGCTTGCAGGGGACCTGAGTTACACTTCCAGCATC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158712	GGATAGTACATGTTGTGCTTGCAGGGGACCTGAGTTACACTTCCAGCATC	158761

CU234134.7	1251	CATGTGGGATGGCTTACGACTGCTTGTCATACTCACTACAGGGTAGCCAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158762	CATGTGGGATGGCTTACGACTGCTTGTCATACTCACTACAGGGTAGCCAA	158811

CU234134.7	1301	CTTTGTTCTGTCCTCTGTAGACAGAACTCATGTGCACATAACTCCACACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158812	CTTTGTTCTGTCCTCTGTAGACAGAACTCATGTGCACATAACTCCACACA	158861

CU234134.7	1351	GACACTTTCCTGTGCACATAATTTTTAAAAAGTGTTCATAATAAAGGAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158862	GACACTTTCCTGTGCACATAATTTTTAAAAAGTGTTCATAATAAAGGAGA	158911

CU234134.7	1401	TAGAAAATGATGGGGACTATTTTTTAGGCGAGTTAGTCAAGGAAACCCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158912	TAGAAAATGATGGGGACTATTTTTTAGGCGAGTTAGTCAAGGAAACCCTG	158961

CU234134.7	1451	ACTTCAGAGTCGCCGTAGGAATAGATGCTGTGACACTGATGGGCAGAAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	158962	ACTTCAGAGTCGCCGTAGGAATAGATGCTGTGACACTGATGGGCAGAAGG	159011

CU234134.7	1501	CTTCTTAATGGGAACTGCACAGAAAAAGTATGAAAAATGCTGGAGTTTTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	159012	CTTCTTAATGGGAACTGCACAGAAAAAGTATGAAAAATGCTGGAGTTTTA	159061

CU234134.7	1551	TGTTGAAAGTGTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTAAGTTGGACAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	159062	TGTTGAAAGTGTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTAAGTTGGACAC	159111

CU234134.7	1601	GTTGTCTCAGGTAGAAGAAGAGTCTCTGTTACGAAATGATCTTCGTCCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	159112	GTTGTCTCAGGTAGAAGAAGAGTCTCTGTTACGAAATGATCTTCGTCCAG	159161

CU234134.7	1651	CTAACAAACTTGCTAAAGGAAATAGACTATTCATGAGATTTGCTACAAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	159162	CTAACAAACTTGCTAAAGGAAATAGACTATTCATGAGATTTGCTACAAAA	159211

CU234134.7	1701	GGTAAACTTGATCTTTGGTATTGATTTTTGGTCAGAATGATGAAATTACT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	159212	GGTAAACTTGATCTTTGGTATTGATTTTTGGTCAGAATGATGAAATTACT	159261

CU234134.7	1751	GAGTAAAACTTAGCTGTTGACTAGAAGCGAGTTCAAATAATGCCAAAGCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	159262	GAGTAAAACTTAGCTGTTGACTAGAAGCGAGTTCAAATAATGCCAAAGCT	159311

CU234134.7	1801	CCTTTTAAACAAATAATTTATGAAAAAGCAGCTTACTGACTGAGGGGGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	159312	CCTTTTAAACAAATAATTTATGAAAAAGCAGCTTACTGACTGAGGGGGAA	159361

CU234134.7	1851	TTTCATTTACATTTGTGTTTGTTAGTGTGTCTTTATTTCACTGTTAGCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	159362	TTTCATTTACATTTGTGTTTGTTAGTGTGTCTTTATTTCACTGTTAGCCT	159411

CU234134.7	1901	GCATGCCTGTGATGCACTTGGGTCCCATTTAATCCTCCTCTTGTTCACAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	159412	GCATGCCTGTGATGCACTTGGGTCCCATTTAATCCTCCTCTTGTTCACAC	159461

CU234134.7	1951	ATCCCCTTCCTTCCCCTTTTGACCTCCCCTTTTACTTAACTCTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210938.6	159462	ATCCCCTTCCTTCCCCTTTTGACCTCCCCTTTTACTTAACTCTGGAATTC	159511

Overview

Query
CU234134.7 - 118423 bps
Hit
CU210938.6 - 159511 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link