<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207323.5	1	GAATTCACTCTAGGCCTTGTTCTATCTCTCCTCAGTTGCACCCTCATTTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	84869	GAATTCACTCTAGGCCTTGTTCTATCTCTCCTCAGTTGCACCCTCATTTA	84918

CU207323.5	51	TGCTCTACCTTCCAATACAGGTTCGTATGATTGACAGGTGAGGAAACCCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	84919	TGCTCTACCTTCCAATACAGGTTCGTATGATTGACAGGTGAGGAAACCCA	84968

CU207323.5	101	GGCTTGGGACAAATGACTTGCCAAAGATCACAGAGGCAGGAAGTGGCGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	84969	GGCTTGGGACAAATGACTTGCCAAAGATCACAGAGGCAGGAAGTGGCGAG	85018

CU207323.5	151	GTTGTCACACACAAATACCCATGATACATGTTATCTGTTGGGAAACATTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85019	GTTGTCACACACAAATACCCATGATACATGTTATCTGTTGGGAAACATTG	85068

CU207323.5	201	GACTTCCTCTGTTTCTGAGGGATTTGGTCCCAAGAACTATTTTTGAAAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85069	GACTTCCTCTGTTTCTGAGGGATTTGGTCCCAAGAACTATTTTTGAAAGA	85118

CU207323.5	251	TGGAGGTCAAGTCTTACAGCTGGCCACCAGGATAGCCTTTGGTTGTAGTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85119	TGGAGGTCAAGTCTTACAGCTGGCCACCAGGATAGCCTTTGGTTGTAGTC	85168

CU207323.5	301	TTGATTACGTATGTAGCTTCTATACTTCCATCTTGTCTCTCCATGACAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85169	TTGATTACGTATGTAGCTTCTATACTTCCATCTTGTCTCTCCATGACAGC	85218

CU207323.5	351	CTTGATCAGTAAGTTCCCTGTAATGGGTCCCATTTCCCAAGTGAGGAGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85219	CTTGATCAGTAAGTTCCCTGTAATGGGTCCCATTTCCCAAGTGAGGAGAC	85268

CU207323.5	401	TGATGCTATTAATACCCTCTGAGGATCAAATGTATGAGGGAAGGGCTGGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85269	TGATGCTATTAATACCCTCTGAGGATCAAATGTATGAGGGAAGGGCTGGG	85318

CU207323.5	451	ACTATAGCTTTGTGCCACAACAAGCACCTTTCCTGCCTTTTCTCCTATGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85319	ACTATAGCTTTGTGCCACAACAAGCACCTTTCCTGCCTTTTCTCCTATGG	85368

CU207323.5	501	GGTGAGGCTGTTCTGTGGGTGTGGAGGTGACTCACGCAGGACACGTGGGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85369	GGTGAGGCTGTTCTGTGGGTGTGGAGGTGACTCACGCAGGACACGTGGGT	85418

CU207323.5	551	GGTGGGTGTGGCCTGCCTGATGCCGAGGGCAGGTGGCCCAGCCAGTTTTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85419	GGTGGGTGTGGCCTGCCTGATGCCGAGGGCAGGTGGCCCAGCCAGTTTTG	85468

CU207323.5	601	CCTCTGATGCCTCATTCCAGCTGTCAGCTATCTCTGTGCCTACGATGAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85469	CCTCTGATGCCTCATTCCAGCTGTCAGCTATCTCTGTGCCTACGATGAGA	85518

CU207323.5	651	GCCTCTGGCCACCTCAGCCACCTTCCCGACGGTGGGTTTTGGGCCCCAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85519	GCCTCTGGCCACCTCAGCCACCTTCCCGACGGTGGGTTTTGGGCCCCAGA	85568

CU207323.5	701	CATGCGGTGATCTCAAGGCAAGGACTGCCACCACCATCTGGAACCTGCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85569	CATGCGGTGATCTCAAGGCAAGGACTGCCACCACCATCTGGAACCTGCCA	85618

CU207323.5	751	GGTAAATCCTTGTCACCCAGAGAAAGCTAGTGTTCCCCAGAAAGACTAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85619	GGTAAATCCTTGTCACCCAGAGAAAGCTAGTGTTCCCCAGAAAGACTAGA	85668

CU207323.5	801	GTGCGGGCCTGGAATCCTCTGGACCATGTCTGCCCTTTGCCCATGGGTCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85669	GTGCGGGCCTGGAATCCTCTGGACCATGTCTGCCCTTTGCCCATGGGTCC	85718

CU207323.5	851	TAGGAAGGTGTGGGGAGAGCTGGGGTTCCTTTTAACAACAGGCAGAGGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85719	TAGGAAGGTGTGGGGAGAGCTGGGGTTCCTTTTAACAACAGGCAGAGGAG	85768

CU207323.5	901	ATAATGCAGGTTCTGACAGGCCCAGGAACTTTCTGGGAATCTCAGGAAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85769	ATAATGCAGGTTCTGACAGGCCCAGGAACTTTCTGGGAATCTCAGGAAGA	85818

CU207323.5	951	GAAAGCTCCCGTCTCTTTCAGCTAGCTTAGGGGTGGATGTGAATCTCCAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85819	GAAAGCTCCCGTCTCTTTCAGCTAGCTTAGGGGTGGATGTGAATCTCCAT	85868

CU207323.5	1001	GGCTGGAGTGTGATGGGTGTTTAAGACGGGAGCAGCTATCCCAGCGCTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85869	GGCTGGAGTGTGATGGGTGTTTAAGACGGGAGCAGCTATCCCAGCGCTGA	85918

CU207323.5	1051	AGAGTGACCACGCCCAGGCACTCACGGGTTATTGAGATAGCAGCTATGGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85919	AGAGTGACCACGCCCAGGCACTCACGGGTTATTGAGATAGCAGCTATGGA	85968

CU207323.5	1101	GGTCTCCTTCTGGCCCCTGCCTGGTCTGCGTCCCTAGGACAGGCCGCTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	85969	GGTCTCCTTCTGGCCCCTGCCTGGTCTGCGTCCCTAGGACAGGCCGCTTC	86018

CU207323.5	1151	AATCAGTGTCAGAGCCTTGGCAGGTGTGACATGGTATTTCTCGGGTGAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86019	AATCAGTGTCAGAGCCTTGGCAGGTGTGACATGGTATTTCTCGGGTGAAG	86068

CU207323.5	1201	GAGCTGGATCGCAGGGCAGGGAGAGAGTCCAGCAGGTGAGGATGCAAAGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86069	GAGCTGGATCGCAGGGCAGGGAGAGAGTCCAGCAGGTGAGGATGCAAAGC	86118

CU207323.5	1251	AAAGCATATAGGGTGACTCAGGAGTTAATTATAGCTGCTGGAGCCTGAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86119	AAAGCATATAGGGTGACTCAGGAGTTAATTATAGCTGCTGGAGCCTGAGT	86168

CU207323.5	1301	CCAGACTGCTCTGACCCCCGCTCACCCGAGCTGTTCAGAGTAGCCCACAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86169	CCAGACTGCTCTGACCCCCGCTCACCCGAGCTGTTCAGAGTAGCCCACAC	86218

CU207323.5	1351	TCATGGCCCTAGCACAAGAAAGATGGAGCAACTGGTGTCAGGGGACCGAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86219	TCATGGCCCTAGCACAAGAAAGATGGAGCAACTGGTGTCAGGGGACCGAC	86268

CU207323.5	1401	CACTCAAGCTATTTCTCAGGAGAGAAACCAGAGGATGAGGGAGGATGAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86269	CACTCAAGCTATTTCTCAGGAGAGAAACCAGAGGATGAGGGAGGATGAGG	86318

CU207323.5	1451	AACACCTCTGTCTACTTCTGCTCTTGACTCAGCAAAGTCTTTTTAGCCCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86319	AACACCTCTGTCTACTTCTGCTCTTGACTCAGCAAAGTCTTTTTAGCCCC	86368

CU207323.5	1501	ACAGGTCCACTGATTGCTTTGGGTAGAGGCAACATAAATACCTATCTGGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86369	ACAGGTCCACTGATTGCTTTGGGTAGAGGCAACATAAATACCTATCTGGC	86418

CU207323.5	1551	TTTGGCTGCGATAGATGTAGGCAGGGGCTGAAAAGTTACTTCTATAGCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86419	TTTGGCTGCGATAGATGTAGGCAGGGGCTGAAAAGTTACTTCTATAGCTA	86468

CU207323.5	1601	AGTAAGCTATCTGAGGTGGCTTGCATTAAGGTTGGTCCCCTGACTTCAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86469	AGTAAGCTATCTGAGGTGGCTTGCATTAAGGTTGGTCCCCTGACTTCAGA	86518

CU207323.5	1651	ATTACCTCTTCTTGTCCACACTGCCTTTCTATGTCTATCCTTCAAGGTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86519	ATTACCTCTTCTTGTCCACACTGCCTTTCTATGTCTATCCTTCAAGGTTA	86568

CU207323.5	1701	GCAGCCTCTTCCCCCTCACCATGCTCTTCATAACAGCTTCCCCCAGGTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86569	GCAGCCTCTTCCCCCTCACCATGCTCTTCATAACAGCTTCCCCCAGGTCA	86618

CU207323.5	1751	CCGGTCTCTCTTGTCCCCATGGCCTGTTCTCCTTCAGGCTCTGTTGCCTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86619	CCGGTCTCTCTTGTCCCCATGGCCTGTTCTCCTTCAGGCTCTGTTGCCTA	86668

CU207323.5	1801	TGTAACCCAGAACCTTTCCCTGCTCCCTGCTTCCCTGACATCAGTCTCAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86669	TGTAACCCAGAACCTTTCCCTGCTCCCTGCTTCCCTGACATCAGTCTCAG	86718

CU207323.5	1851	CTTCCAAGTTCTGCTCGAGGGCTTCACAGTGTGGCTCAGCCTGCTGCCAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86719	CTTCCAAGTTCTGCTCGAGGGCTTCACAGTGTGGCTCAGCCTGCTGCCAA	86768

CU207323.5	1901	GCCCTTCGCTGCCAGGGCTCTCCATGAACGCATACAGGGTCTCCAGCTCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86769	GCCCTTCGCTGCCAGGGCTCTCCATGAACGCATACAGGGTCTCCAGCTCC	86818

CU207323.5	1951	ACCCGCTTTACCCTCATTGAATTGCTTTGAGCCCTGGTCATTGTGCAGGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210936.9	86819	ACCCGCTTTACCCTCATTGAATTGCTTTGAGCCCTGGTCATTGTGCAGGC	86868

Overview

Query
CU207323.5 - 185364 bps
Hit
CU210936.9 - 86868 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link