<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU207323.5 1 GAATTCACTCTAGGCCTTGTTCTATCTCTCCTCAGTTGCACCCTCATTTA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 84869 GAATTCACTCTAGGCCTTGTTCTATCTCTCCTCAGTTGCACCCTCATTTA 84918 CU207323.5 51 TGCTCTACCTTCCAATACAGGTTCGTATGATTGACAGGTGAGGAAACCCA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 84919 TGCTCTACCTTCCAATACAGGTTCGTATGATTGACAGGTGAGGAAACCCA 84968 CU207323.5 101 GGCTTGGGACAAATGACTTGCCAAAGATCACAGAGGCAGGAAGTGGCGAG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 84969 GGCTTGGGACAAATGACTTGCCAAAGATCACAGAGGCAGGAAGTGGCGAG 85018 CU207323.5 151 GTTGTCACACACAAATACCCATGATACATGTTATCTGTTGGGAAACATTG 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85019 GTTGTCACACACAAATACCCATGATACATGTTATCTGTTGGGAAACATTG 85068 CU207323.5 201 GACTTCCTCTGTTTCTGAGGGATTTGGTCCCAAGAACTATTTTTGAAAGA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85069 GACTTCCTCTGTTTCTGAGGGATTTGGTCCCAAGAACTATTTTTGAAAGA 85118 CU207323.5 251 TGGAGGTCAAGTCTTACAGCTGGCCACCAGGATAGCCTTTGGTTGTAGTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85119 TGGAGGTCAAGTCTTACAGCTGGCCACCAGGATAGCCTTTGGTTGTAGTC 85168 CU207323.5 301 TTGATTACGTATGTAGCTTCTATACTTCCATCTTGTCTCTCCATGACAGC 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85169 TTGATTACGTATGTAGCTTCTATACTTCCATCTTGTCTCTCCATGACAGC 85218 CU207323.5 351 CTTGATCAGTAAGTTCCCTGTAATGGGTCCCATTTCCCAAGTGAGGAGAC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85219 CTTGATCAGTAAGTTCCCTGTAATGGGTCCCATTTCCCAAGTGAGGAGAC 85268 CU207323.5 401 TGATGCTATTAATACCCTCTGAGGATCAAATGTATGAGGGAAGGGCTGGG 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85269 TGATGCTATTAATACCCTCTGAGGATCAAATGTATGAGGGAAGGGCTGGG 85318 CU207323.5 451 ACTATAGCTTTGTGCCACAACAAGCACCTTTCCTGCCTTTTCTCCTATGG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85319 ACTATAGCTTTGTGCCACAACAAGCACCTTTCCTGCCTTTTCTCCTATGG 85368 CU207323.5 501 GGTGAGGCTGTTCTGTGGGTGTGGAGGTGACTCACGCAGGACACGTGGGT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85369 GGTGAGGCTGTTCTGTGGGTGTGGAGGTGACTCACGCAGGACACGTGGGT 85418 CU207323.5 551 GGTGGGTGTGGCCTGCCTGATGCCGAGGGCAGGTGGCCCAGCCAGTTTTG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85419 GGTGGGTGTGGCCTGCCTGATGCCGAGGGCAGGTGGCCCAGCCAGTTTTG 85468 CU207323.5 601 CCTCTGATGCCTCATTCCAGCTGTCAGCTATCTCTGTGCCTACGATGAGA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85469 CCTCTGATGCCTCATTCCAGCTGTCAGCTATCTCTGTGCCTACGATGAGA 85518 CU207323.5 651 GCCTCTGGCCACCTCAGCCACCTTCCCGACGGTGGGTTTTGGGCCCCAGA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85519 GCCTCTGGCCACCTCAGCCACCTTCCCGACGGTGGGTTTTGGGCCCCAGA 85568 CU207323.5 701 CATGCGGTGATCTCAAGGCAAGGACTGCCACCACCATCTGGAACCTGCCA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85569 CATGCGGTGATCTCAAGGCAAGGACTGCCACCACCATCTGGAACCTGCCA 85618 CU207323.5 751 GGTAAATCCTTGTCACCCAGAGAAAGCTAGTGTTCCCCAGAAAGACTAGA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85619 GGTAAATCCTTGTCACCCAGAGAAAGCTAGTGTTCCCCAGAAAGACTAGA 85668 CU207323.5 801 GTGCGGGCCTGGAATCCTCTGGACCATGTCTGCCCTTTGCCCATGGGTCC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85669 GTGCGGGCCTGGAATCCTCTGGACCATGTCTGCCCTTTGCCCATGGGTCC 85718 CU207323.5 851 TAGGAAGGTGTGGGGAGAGCTGGGGTTCCTTTTAACAACAGGCAGAGGAG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85719 TAGGAAGGTGTGGGGAGAGCTGGGGTTCCTTTTAACAACAGGCAGAGGAG 85768 CU207323.5 901 ATAATGCAGGTTCTGACAGGCCCAGGAACTTTCTGGGAATCTCAGGAAGA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85769 ATAATGCAGGTTCTGACAGGCCCAGGAACTTTCTGGGAATCTCAGGAAGA 85818 CU207323.5 951 GAAAGCTCCCGTCTCTTTCAGCTAGCTTAGGGGTGGATGTGAATCTCCAT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85819 GAAAGCTCCCGTCTCTTTCAGCTAGCTTAGGGGTGGATGTGAATCTCCAT 85868 CU207323.5 1001 GGCTGGAGTGTGATGGGTGTTTAAGACGGGAGCAGCTATCCCAGCGCTGA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85869 GGCTGGAGTGTGATGGGTGTTTAAGACGGGAGCAGCTATCCCAGCGCTGA 85918 CU207323.5 1051 AGAGTGACCACGCCCAGGCACTCACGGGTTATTGAGATAGCAGCTATGGA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85919 AGAGTGACCACGCCCAGGCACTCACGGGTTATTGAGATAGCAGCTATGGA 85968 CU207323.5 1101 GGTCTCCTTCTGGCCCCTGCCTGGTCTGCGTCCCTAGGACAGGCCGCTTC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 85969 GGTCTCCTTCTGGCCCCTGCCTGGTCTGCGTCCCTAGGACAGGCCGCTTC 86018 CU207323.5 1151 AATCAGTGTCAGAGCCTTGGCAGGTGTGACATGGTATTTCTCGGGTGAAG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86019 AATCAGTGTCAGAGCCTTGGCAGGTGTGACATGGTATTTCTCGGGTGAAG 86068 CU207323.5 1201 GAGCTGGATCGCAGGGCAGGGAGAGAGTCCAGCAGGTGAGGATGCAAAGC 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86069 GAGCTGGATCGCAGGGCAGGGAGAGAGTCCAGCAGGTGAGGATGCAAAGC 86118 CU207323.5 1251 AAAGCATATAGGGTGACTCAGGAGTTAATTATAGCTGCTGGAGCCTGAGT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86119 AAAGCATATAGGGTGACTCAGGAGTTAATTATAGCTGCTGGAGCCTGAGT 86168 CU207323.5 1301 CCAGACTGCTCTGACCCCCGCTCACCCGAGCTGTTCAGAGTAGCCCACAC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86169 CCAGACTGCTCTGACCCCCGCTCACCCGAGCTGTTCAGAGTAGCCCACAC 86218 CU207323.5 1351 TCATGGCCCTAGCACAAGAAAGATGGAGCAACTGGTGTCAGGGGACCGAC 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86219 TCATGGCCCTAGCACAAGAAAGATGGAGCAACTGGTGTCAGGGGACCGAC 86268 CU207323.5 1401 CACTCAAGCTATTTCTCAGGAGAGAAACCAGAGGATGAGGGAGGATGAGG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86269 CACTCAAGCTATTTCTCAGGAGAGAAACCAGAGGATGAGGGAGGATGAGG 86318 CU207323.5 1451 AACACCTCTGTCTACTTCTGCTCTTGACTCAGCAAAGTCTTTTTAGCCCC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86319 AACACCTCTGTCTACTTCTGCTCTTGACTCAGCAAAGTCTTTTTAGCCCC 86368 CU207323.5 1501 ACAGGTCCACTGATTGCTTTGGGTAGAGGCAACATAAATACCTATCTGGC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86369 ACAGGTCCACTGATTGCTTTGGGTAGAGGCAACATAAATACCTATCTGGC 86418 CU207323.5 1551 TTTGGCTGCGATAGATGTAGGCAGGGGCTGAAAAGTTACTTCTATAGCTA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86419 TTTGGCTGCGATAGATGTAGGCAGGGGCTGAAAAGTTACTTCTATAGCTA 86468 CU207323.5 1601 AGTAAGCTATCTGAGGTGGCTTGCATTAAGGTTGGTCCCCTGACTTCAGA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86469 AGTAAGCTATCTGAGGTGGCTTGCATTAAGGTTGGTCCCCTGACTTCAGA 86518 CU207323.5 1651 ATTACCTCTTCTTGTCCACACTGCCTTTCTATGTCTATCCTTCAAGGTTA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86519 ATTACCTCTTCTTGTCCACACTGCCTTTCTATGTCTATCCTTCAAGGTTA 86568 CU207323.5 1701 GCAGCCTCTTCCCCCTCACCATGCTCTTCATAACAGCTTCCCCCAGGTCA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86569 GCAGCCTCTTCCCCCTCACCATGCTCTTCATAACAGCTTCCCCCAGGTCA 86618 CU207323.5 1751 CCGGTCTCTCTTGTCCCCATGGCCTGTTCTCCTTCAGGCTCTGTTGCCTA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86619 CCGGTCTCTCTTGTCCCCATGGCCTGTTCTCCTTCAGGCTCTGTTGCCTA 86668 CU207323.5 1801 TGTAACCCAGAACCTTTCCCTGCTCCCTGCTTCCCTGACATCAGTCTCAG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86669 TGTAACCCAGAACCTTTCCCTGCTCCCTGCTTCCCTGACATCAGTCTCAG 86718 CU207323.5 1851 CTTCCAAGTTCTGCTCGAGGGCTTCACAGTGTGGCTCAGCCTGCTGCCAA 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86719 CTTCCAAGTTCTGCTCGAGGGCTTCACAGTGTGGCTCAGCCTGCTGCCAA 86768 CU207323.5 1901 GCCCTTCGCTGCCAGGGCTCTCCATGAACGCATACAGGGTCTCCAGCTCC 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86769 GCCCTTCGCTGCCAGGGCTCTCCATGAACGCATACAGGGTCTCCAGCTCC 86818 CU207323.5 1951 ACCCGCTTTACCCTCATTGAATTGCTTTGAGCCCTGGTCATTGTGCAGGC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210936.9 86819 ACCCGCTTTACCCTCATTGAATTGCTTTGAGCCCTGGTCATTGTGCAGGC 86868
