<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210932.14	1	CACAAAACAAAATAGGGGTAGTAAGGAAGAAAAGAGGAAGAGGAGGAGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174144	CACAAAACAAAATAGGGGTAGTAAGGAAGAAAAGAGGAAGAGGAGGAGGA	174193

CU210932.14	51	GAGGGAGGAGGAGGAAAATTGGAAACATTGTGTAACTTAATTTCTATGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174194	GAGGGAGGAGGAGGAAAATTGGAAACATTGTGTAACTTAATTTCTATGGA	174243

CU210932.14	101	ATTCTAGAACAAAGAAAACAAAATAGAGGAGCCTTAAGGAATCCTGGTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174244	ATTCTAGAACAAAGAAAACAAAATAGAGGAGCCTTAAGGAATCCTGGTGG	174293

CU210932.14	151	GGTGGGGGATTGAGGGACTTTCTGGATGACGAAAGCAGATTTCCTGGAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174294	GGTGGGGGATTGAGGGACTTTCTGGATGACGAAAGCAGATTTCCTGGAGT	174343

CU210932.14	201	AGGGCGTGGTTCCTTGGCTACCAGCATTTCAAAATACATCAAGCTATGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174344	AGGGCGTGGTTCCTTGGCTACCAGCATTTCAAAATACATCAAGCTATGGG	174393

CU210932.14	251	CTTTCGGGTCTGTGCATTTCTTTGTGTATGTCTTGCATGTGAACTTAAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174394	CTTTCGGGTCTGTGCATTTCTTTGTGTATGTCTTGCATGTGAACTTAAAA	174443

CU210932.14	301	GGGATCTTAAAAGGGTGGCGGACTGCTCAGACTAGAGTGCTTGCTGTGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174444	GGGATCTTAAAAGGGTGGCGGACTGCTCAGACTAGAGTGCTTGCTGTGCC	174493

CU210932.14	351	TGGGTGAGGACCTAAGTCCTGAGCTCCAGAACCAGTGTACAAGCGGAAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174494	TGGGTGAGGACCTAAGTCCTGAGCTCCAGAACCAGTGTACAAGCGGAAGG	174543

CU210932.14	401	GGGCCGGGGCGGGGGGGGGGGGCGCAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174544	GGGCCGGGGCGGGGGGGGGGGGCGCAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGGTG	174593

CU210932.14	451	TGTGCACCTGTAACCATGGTGACAGGGAGGCAGAGACCGGTACATCCTGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174594	TGTGCACCTGTAACCATGGTGACAGGGAGGCAGAGACCGGTACATCCTGG	174643

CU210932.14	501	AGACTTGCTGCTGGCTATTCAGTGTATTGAAAATTATGAACTCCAGGTTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174644	AGACTTGCTGCTGGCTATTCAGTGTATTGAAAATTATGAACTCCAGGTTC	174693

CU210932.14	551	ACGGAGACACCATCTCTCAAAGAGGCCTTTACATGCACAGGGGAGCTCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174694	ACGGAGACACCATCTCTCAAAGAGGCCTTTACATGCACAGGGGAGCTCAC	174743

CU210932.14	601	TCTTTCGCATGCCTATGCGCACACACACACACACACACACACACACAAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174744	TCTTTCGCATGCCTATGCGCACACACACACACACACACACACACACAAGA	174793

CU210932.14	651	GCATTTGGGGAGAAATTATAAAGTTACCTTTATAAAACCAATGACATGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174794	GCATTTGGGGAGAAATTATAAAGTTACCTTTATAAAACCAATGACATGAT	174843

CU210932.14	701	GAACACAATTTTTTTTTGGGTAGGCCTGGATATCCTGGAACTCACTCTGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174844	GAACACAATTTTTTTTTGGGTAGGCCTGGATATCCTGGAACTCACTCTGT	174893

CU210932.14	751	AGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATTCGCCTGCCTCTGCCTCCCAAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174894	AGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATTCGCCTGCCTCTGCCTCCCAAG	174943

CU210932.14	801	TGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCCACTATGCCCAGCTCTGAACACTAAATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174944	TGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCCACTATGCCCAGCTCTGAACACTAAATT	174993

CU210932.14	851	TAATTGAGATCACAGTTGCCTCAAGCTGGGGAGGTGGCGGCAGAGGAAGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	174994	TAATTGAGATCACAGTTGCCTCAAGCTGGGGAGGTGGCGGCAGAGGAAGG	175043

CU210932.14	901	GACCCTATTTAAGGTGGCGGGGGGGGAGGGTCAGAGATGACTCTAACTCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175044	GACCCTATTTAAGGTGGCGGGGGGGGAGGGTCAGAGATGACTCTAACTCT	175093

CU210932.14	951	TGTTTCAAAGGTTGACTCCAAAGACAGTCCTTCATATCACTCTGTAATAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175094	TGTTTCAAAGGTTGACTCCAAAGACAGTCCTTCATATCACTCTGTAATAA	175143

CU210932.14	1001	CAAAATATATTCATATGATATGTGCACATATTTACATGTCATATTCATTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175144	CAAAATATATTCATATGATATGTGCACATATTTACATGTCATATTCATTA	175193

CU210932.14	1051	TATTGTAAGTATCCAATAATGTATACATTCTAATTTTTAAAAGAATTTTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175194	TATTGTAAGTATCCAATAATGTATACATTCTAATTTTTAAAAGAATTTTA	175243

CU210932.14	1101	TAGGGCTGGAGAGATATTCCACCACTTAAGAGCACTGGCCTCTCCTCCTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175244	TAGGGCTGGAGAGATATTCCACCACTTAAGAGCACTGGCCTCTCCTCCTC	175293

CU210932.14	1151	TCCTCTCCCCTCTCCTCTCTTCTCTTCTCTGATCTCAATTCCCAGCATCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175294	TCCTCTCCCCTCTCCTCTCTTCTCTTCTCTGATCTCAATTCCCAGCATCC	175343

CU210932.14	1201	ACATAGCAGCTCACAACTGTCTATAACTCCTGCTCCAGGGGATCCATCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175344	ACATAGCAGCTCACAACTGTCTATAACTCCTGCTCCAGGGGATCCATCTG	175393

CU210932.14	1251	ATCTCCTCTTCTGGCCTCCACAAAAGAGGCACCAGGCACACATGTGGCAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175394	ATCTCCTCTTCTGGCCTCCACAAAAGAGGCACCAGGCACACATGTGGCAC	175443

CU210932.14	1301	AGGGATGTGTGTAGGCAAAGCACCCGTACACACCAAATAAAAATAAATCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175444	AGGGATGTGTGTAGGCAAAGCACCCGTACACACCAAATAAAAATAAATCT	175493

CU210932.14	1351	TGAAAAAATTGTATGTATATGTGTCCGTGTGTGTGCACACATGATTGGGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175494	TGAAAAAATTGTATGTATATGTGTCCGTGTGTGTGCACACATGATTGGGT	175543

CU210932.14	1401	GTATATGTGTCTGTGTGTGTGCACACATGATTGGGTGTATATGTGTCTGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175544	GTATATGTGTCTGTGTGTGTGCACACATGATTGGGTGTATATGTGTCTGT	175593

CU210932.14	1451	GTGTGTGCACACATGATTGGGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCACACAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175594	GTGTGTGCACACATGATTGGGTGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCACACAT	175643

CU210932.14	1501	GATTGGGTGTATATGTGACTGTGTGTGTGCACACACGATTGGGTGTATAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175644	GATTGGGTGTATATGTGACTGTGTGTGTGCACACACGATTGGGTGTATAG	175693

CU210932.14	1551	GTATCTGTGTGTGCACACATGATTGGGTGTATATGTATTTGTGTGTGCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175694	GTATCTGTGTGTGCACACATGATTGGGTGTATATGTATTTGTGTGTGCAC	175743

CU210932.14	1601	ACATGATTGGGTGTACATGTGCTCCTGACTGCGGAGCATCTCTCCACACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175744	ACATGATTGGGTGTACATGTGCTCCTGACTGCGGAGCATCTCTCCACACC	175793

CU210932.14	1651	CAGTTGAAAGCAGGAGCTGGAGAGATGGCCAGCAGTTGAGAGCACTTACC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175794	CAGTTGAAAGCAGGAGCTGGAGAGATGGCCAGCAGTTGAGAGCACTTACC	175843

CU210932.14	1701	ATTCTTCCAGAGGACCTGGGTTCAGTTCCCAGCATGACTCAGCAGCTCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175844	ATTCTTCCAGAGGACCTGGGTTCAGTTCCCAGCATGACTCAGCAGCTCTT	175893

CU210932.14	1751	AAGCATCTGTAACTCCTGACCTCTTCTGGGCTCCAATGACCCTGCACATA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175894	AAGCATCTGTAACTCCTGACCTCTTCTGGGCTCCAATGACCCTGCACATA	175943

CU210932.14	1801	GGTGCTGTGCTTATGTGCAAGCAAAATACTCACACACATACACTACAAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175944	GGTGCTGTGCTTATGTGCAAGCAAAATACTCACACACATACACTACAAAT	175993

CU210932.14	1851	AAATCCTAAATCAGTGTTTAAAGCAACATGGGGTAGGAGGAGCCTGGGCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	175994	AAATCCTAAATCAGTGTTTAAAGCAACATGGGGTAGGAGGAGCCTGGGCT	176043

CU210932.14	1901	ACATAGGAAGACCTTTCAATGTGTCCCCTTAAGAGCAACTTCAGTTGACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	176044	ACATAGGAAGACCTTTCAATGTGTCCCCTTAAGAGCAACTTCAGTTGACA	176093

CU210932.14	1951	AAATGAATTGTCACCTGGAAAAGATTAATTGTGTCTCATCCAAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210933.11	176094	AAATGAATTGTCACCTGGAAAAGATTAATTGTGTCTCATCCAAAGAATTC	176143

Overview

Query
CU210932.14 - 79476 bps
Hit
CU210933.11 - 176143 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link