<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207371.8	1	TGGGGGTTTGGTTTGGTTTGGTTATTGTTGTTTTGCTTGTTTGTTTTCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77477	TGGGGGTTTGGTTTGGTTTGGTTATTGTTGTTTTGCTTGTTTGTTTTCTT	77526

CU207371.8	51	TTGTTTGGTTTTTGTAGCAATTGAGAAGTCTTGTTTGATAAGACCTAGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77527	TTGTTTGGTTTTTGTAGCAATTGAGAAGTCTTGTTTGATAAGACCTAGTG	77576

CU207371.8	101	GAAGTATCTGGTCTAAGACTTTTCTCGGCTACCCAATCCAGGCTACAACC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77577	GAAGTATCTGGTCTAAGACTTTTCTCGGCTACCCAATCCAGGCTACAACC	77626

CU207371.8	151	CTGGTTCTTAGCTAAGCAGCCAGGGAAAGGGGAAGAGAGGCCCCAGCCTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77627	CTGGTTCTTAGCTAAGCAGCCAGGGAAAGGGGAAGAGAGGCCCCAGCCTC	77676

CU207371.8	201	AGGATAACCTAACCGTAGTTATAGTCGTCACCCAGGAGGGAGTGGCCACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77677	AGGATAACCTAACCGTAGTTATAGTCGTCACCCAGGAGGGAGTGGCCACT	77726

CU207371.8	251	CTTGACCAGCATCATAGCTACAGAGATCCCTGTATGCTCTGGGACCGCAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77727	CTTGACCAGCATCATAGCTACAGAGATCCCTGTATGCTCTGGGACCGCAG	77776

CU207371.8	301	CAGAAGGCCTAACAAAGACCATGCACCAGAATCGCTGGGAGCCAACTCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77777	CAGAAGGCCTAACAAAGACCATGCACCAGAATCGCTGGGAGCCAACTCCT	77826

CU207371.8	351	CTGCAGAGCCACAAGCAAGGGACTCCTGACCAACCACTGTCTTGTCCTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77827	CTGCAGAGCCACAAGCAAGGGACTCCTGACCAACCACTGTCTTGTCCTCC	77876

CU207371.8	401	AGATGCCCAGTCTAGGAAGGCTCTGGGCTTGCCCGACCTCCCAGTTTGCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77877	AGATGCCCAGTCTAGGAAGGCTCTGGGCTTGCCCGACCTCCCAGTTTGCC	77926

CU207371.8	451	TCTCTTGCTTCTTCTCCAGCCTCACTGCCCTCTCCCCTCCCCACCACTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77927	TCTCTTGCTTCTTCTCCAGCCTCACTGCCCTCTCCCCTCCCCACCACTTC	77976

CU207371.8	501	TACCCCCCACCCCCCTACACACACACACATACTAAGTGCTCAGCTTTGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	77977	TACCCCCCACCCCCCTACACACACACACATACTAAGTGCTCAGCTTTGGC	78026

CU207371.8	551	CTTATAAGGCTGGACACAACATACAATGGCTAAGCAGCAAACATCATCGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78027	CTTATAAGGCTGGACACAACATACAATGGCTAAGCAGCAAACATCATCGG	78076

CU207371.8	601	AATGCATTTCTTTTGTTCTTAGAATCCCATCAGCTCAGTAAAACGTTCAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78077	AATGCATTTCTTTTGTTCTTAGAATCCCATCAGCTCAGTAAAACGTTCAG	78126

CU207371.8	651	AAGACACTCGAGGCACGGTCTTCCCCGATTATGCCAACAGCCACTTCCTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78127	AAGACACTCGAGGCACGGTCTTCCCCGATTATGCCAACAGCCACTTCCTC	78176

CU207371.8	701	GAGTTTCGCCATCGTCTCTTGTGTCAGGGTCGAAGTAAATGAGCTACTCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78177	GAGTTTCGCCATCGTCTCTTGTGTCAGGGTCGAAGTAAATGAGCTACTCA	78226

CU207371.8	751	ACCAAGAAAGAATTCTAGAAGCCTAAGAGCCTGAAACTACTCCCCTCTGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78227	ACCAAGAAAGAATTCTAGAAGCCTAAGAGCCTGAAACTACTCCCCTCTGT	78276

CU207371.8	801	GGCTCTGAAGAGCTGAGAAAAGCTTCACCTGACAGCACACAGTGCTGCTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78277	GGCTCTGAAGAGCTGAGAAAAGCTTCACCTGACAGCACACAGTGCTGCTG	78326

CU207371.8	851	AAAAACCTTGGATGGAGCAGAGACGGAGGGAGGGAGAAAGGAAGGGAGGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78327	AAAAACCTTGGATGGAGCAGAGACGGAGGGAGGGAGAAAGGAAGGGAGGG	78376

CU207371.8	901	AGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78377	AGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGAAG	78426

CU207371.8	951	GAAATGCTTTGACCAGAGCATGTGGAAGTTTTTTGTTGTTCTTGTTTTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78427	GAAATGCTTTGACCAGAGCATGTGGAAGTTTTTTGTTGTTCTTGTTTTGG	78476

CU207371.8	1001	TTTTTGGTTTTTCAAGACAGAGTTTCCTTGTAAAGCCCTGGCTGTTCTAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78477	TTTTTGGTTTTTCAAGACAGAGTTTCCTTGTAAAGCCCTGGCTGTTCTAG	78526

CU207371.8	1051	AGATCGCTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCATAGAGATCCCCCTGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78527	AGATCGCTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCATAGAGATCCCCCTGC	78576

CU207371.8	1101	CTCTGCCTCCTGAGTGCCAGGATTAGGGCTTGCACCACTATGCCTGGCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78577	CTCTGCCTCCTGAGTGCCAGGATTAGGGCTTGCACCACTATGCCTGGCTT	78626

CU207371.8	1151	GAGCATATGGTTTTAAGTAATTTTTCTTTAACTTTTTTTTAGTTTGCTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78627	GAGCATATGGTTTTAAGTAATTTTTCTTTAACTTTTTTTTAGTTTGCTGG	78676

CU207371.8	1201	CCTTTGGGGGGTTCGGGGGACTGTTCAGGGTCAGATCTGGGACTCTGAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78677	CCTTTGGGGGGTTCGGGGGACTGTTCAGGGTCAGATCTGGGACTCTGAGT	78726

CU207371.8	1251	ATGCTAAGCATGTCGTTACAGTAAGAAGAAGGTGGTGACAGTTTAGAGAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78727	ATGCTAAGCATGTCGTTACAGTAAGAAGAAGGTGGTGACAGTTTAGAGAC	78776

CU207371.8	1301	TAAAAACCTTGCAAGTAGGGTTAGGTGGGGTAGCATGAGGCAGGGGGTGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78777	TAAAAACCTTGCAAGTAGGGTTAGGTGGGGTAGCATGAGGCAGGGGGTGC	78826

CU207371.8	1351	TCGCCTTGAAAGGATGAGGGGATGAGTCCAACCCCAGCATCCACGAATAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78827	TCGCCTTGAAAGGATGAGGGGATGAGTCCAACCCCAGCATCCACGAATAA	78876

CU207371.8	1401	AACAAGGTGTGGTAGCCAATTGGATAGCTCCTGAGAGAGGAGACACTCCG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78877	AACAAGGTGTGGTAGCCAATTGGATAGCTCCTGAGAGAGGAGACACTCCG	78926

CU207371.8	1451	GTCTCCATGCACACACACGCACATAAGCACACACACGCACAGACATGTAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78927	GTCTCCATGCACACACACGCACATAAGCACACACACGCACAGACATGTAC	78976

CU207371.8	1501	ACGCACATGTTGTCTTTTCTTTTTTTAAGAAGCAGCTTAAAGCTGAAAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	78977	ACGCACATGTTGTCTTTTCTTTTTTTAAGAAGCAGCTTAAAGCTGAAAGA	79026

CU207371.8	1551	GGGGAAATGAGATTCTAATGATACCCCACGTACACCAGAACTGGCTGTCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	79027	GGGGAAATGAGATTCTAATGATACCCCACGTACACCAGAACTGGCTGTCT	79076

CU207371.8	1601	GTCTGTCCACCTCACTAGTCAGAAGTCTGCGTCAAAAAGTCAAAGCAGAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	79077	GTCTGTCCACCTCACTAGTCAGAAGTCTGCGTCAAAAAGTCAAAGCAGAC	79126

CU207371.8	1651	ATGACAAAGCACAGGCAGTAAAAACTCAGTGACTACCTAGGAAAAACTTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	79127	ATGACAAAGCACAGGCAGTAAAAACTCAGTGACTACCTAGGAAAAACTTC	79176

CU207371.8	1701	TAACAAAAACAAAACAAGTGGACTGCAAACCCGTAGTGATATAAAAGAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	79177	TAACAAAAACAAAACAAGTGGACTGCAAACCCGTAGTGATATAAAAGAGG	79226

CU207371.8	1751	CCTTGTGCATCTCTGACCGACTGGCTGGAGAGGCCGAGAACACTCCTTAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	79227	CCTTGTGCATCTCTGACCGACTGGCTGGAGAGGCCGAGAACACTCCTTAG	79276

CU207371.8	1801	GTCCTCTGTCGTCACTCACCGAGGAGCAGTGGTTTATGGGAGACTGGAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	79277	GTCCTCTGTCGTCACTCACCGAGGAGCAGTGGTTTATGGGAGACTGGAAA	79326

CU207371.8	1851	GTTTGCCCTGAACCTTAGTGAGCAGATACACAGCACAGCAAAGTAACCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	79327	GTTTGCCCTGAACCTTAGTGAGCAGATACACAGCACAGCAAAGTAACCTT	79376

CU207371.8	1901	TGACCTTTTTATCCCTGAAAAAGCTTAAGAAAAAAAATAGCTTTCTTAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	79377	TGACCTTTTTATCCCTGAAAAAGCTTAAGAAAAAAAATAGCTTTCTTAAA	79426

CU207371.8	1951	TGACCAGCCAGCACTGCCCAGGGACTGCTTCACCGGTTTTATGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210932.14	79427	TGACCAGCCAGCACTGCCCAGGGACTGCTTCACCGGTTTTATGTGAATTC	79476

Overview

Query
CU207371.8 - 100035 bps
Hit
CU210932.14 - 79476 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link