<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU207362.5 1 ACCACATAGCAGCTCACAACTGCAATTCCAGCCCCAGAGGACCTGACTCC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110450 ACCACATAGCAGCTCACAACTGCAATTCCAGCCCCAGAGGACCTGACTCC 110499 CU207362.5 51 CTCTTCTGGCTTCTGTGGACACATGGCACACAAATATAAATATAGGTAAA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110500 CTCTTCTGGCTTCTGTGGACACATGGCACACAAATATAAATATAGGTAAA 110549 CU207362.5 101 ATACCCATACATGTAAAACAAAAATAAGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110550 ATACCCATACATGTAAAACAAAAATAAGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGG 110599 CU207362.5 151 GTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCTGAAGGTTCAGAGTTCAAATCCCAGCA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110600 GTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCTGAAGGTTCAGAGTTCAAATCCCAGCA 110649 CU207362.5 201 ACCACATGGTGGCTCACAACCATCCGTAAAGAGATCTGACTCGGGGGCTG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110650 ACCACATGGTGGCTCACAACCATCCGTAAAGAGATCTGACTCGGGGGCTG 110699 CU207362.5 251 GTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCCGAAGGTCAG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110700 GTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCCGAAGGTCAG 110749 CU207362.5 301 GAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGGTCACAACCATCCGTAATGAG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110750 GAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGGTCACAACCATCCGTAATGAG 110799 CU207362.5 351 ATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTATA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110800 ATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTATA 110849 CU207362.5 401 TATAATAAAAATAAATAAATCTTAAACAAACAAACAAACAAAAAAACTAT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110850 TATAATAAAAATAAATAAATCTTAAACAAACAAACAAACAAAAAAACTAT 110899 CU207362.5 451 CTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTC 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110900 CTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTC 110949 CU207362.5 501 TGAAGACAGCTACAATGTACTTACATATAATAAATAAATTTAAAAAAAAA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 110950 TGAAGACAGCTACAATGTACTTACATATAATAAATAAATTTAAAAAAAAA 110999 CU207362.5 551 TAAATAAAAAATAAAACTATCAAAAAAAGGAAAAAATTGACAAAGCTTTC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111000 TAAATAAAAAATAAAACTATCAAAAAAAGGAAAAAATTGACAAAGCTTTC 111049 CU207362.5 601 CTCAATTATGTAGAAAAAGAAATAAAACAGAACCCACAAAACTAAAATTT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111050 CTCAATTATGTAGAAAAAGAAATAAAACAGAACCCACAAAACTAAAATTT 111099 CU207362.5 651 AGTTAATAACCTTGTCATTTTTTAAAAATGTTTAAGTAAAAATATACCTT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111100 AGTTAATAACCTTGTCATTTTTTAAAAATGTTTAAGTAAAAATATACCTT 111149 CU207362.5 701 AAGTGTATAATAGAAGTCTTTTTTTTAACTTTATTGTAATTAAATCAATC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111150 AAGTGTATAATAGAAGTCTTTTTTTTAACTTTATTGTAATTAAATCAATC 111199 CU207362.5 751 TGATTCAACATATAAAGTAGCTTTTCTAGTACACGCTACTAAAATGCCCA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111200 TGATTCAACATATAAAGTAGCTTTTCTAGTACACGCTACTAAAATGCCCA 111249 CU207362.5 801 TGTATAGATACTGCCATCTCCTGGCAACAAGAAAGTAAACTAAAAAGATG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111250 TGTATAGATACTGCCATCTCCTGGCAACAAGAAAGTAAACTAAAAAGATG 111299 CU207362.5 851 GCCTCAAACTGCAACCCTAACTAGTATTTGTCCCCAGTAGTACAAGAAGA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111300 GCCTCAAACTGCAACCCTAACTAGTATTTGTCCCCAGTAGTACAAGAAGA 111349 CU207362.5 901 GAGAAAACTAAATAATTATCTAAACAATTTTAGACTTTTCTTTGTTAAAA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111350 GAGAAAACTAAATAATTATCTAAACAATTTTAGACTTTTCTTTGTTAAAA 111399 CU207362.5 951 TTCTTACTTCCTATCAAGTATGTGATCAGGCCTCCTCATACATGGAAGTT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111400 TTCTTACTTCCTATCAAGTATGTGATCAGGCCTCCTCATACATGGAAGTT 111449 CU207362.5 1001 TTGTGTTTATACAGTATTTTACTTGTATGTCTTTCAAATAACCTTTTGAG 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111450 TTGTGTTTATACAGTATTTTACTTGTATGTCTTTCAAATAACCTTTTGAG 111499 CU207362.5 1051 GCTGTAGAGAAGGCACTGTTATCTTCATTTTTCCTGACACCAGAACTCAA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111500 GCTGTAGAGAAGGCACTGTTATCTTCATTTTTCCTGACACCAGAACTCAA 111549 CU207362.5 1101 GGGAGAGAATGATTTGCTTGAGATAACACAAACAGGTCAACTCAGACTTT 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111550 GGGAGAGAATGATTTGCTTGAGATAACACAAACAGGTCAACTCAGACTTT 111599 CU207362.5 1151 CAAGTTTGCTTAGTCCTCCTGCAGGATTTCATACCCTACCCCAACATAGT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111600 CAAGTTTGCTTAGTCCTCCTGCAGGATTTCATACCCTACCCCAACATAGT 111649 CU207362.5 1201 ACAGGGAAGGAAGGGAAGGACCAGACGGCTCCACAGGACATTACCTGGTT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111650 ACAGGGAAGGAAGGGAAGGACCAGACGGCTCCACAGGACATTACCTGGTT 111699 CU207362.5 1251 CTGGTTTGTAGAACAGGAATGACTTTGCCTAGTCTTCTCTCACCTTTCGC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111700 CTGGTTTGTAGAACAGGAATGACTTTGCCTAGTCTTCTCTCACCTTTCGC 111749 CU207362.5 1301 CTCCCCAGAATCCTTGTCAAAGGCATGCTGATTTGTTGTTGTTGTTGTTG 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111750 CTCCCCAGAATCCTTGTCAAAGGCATGCTGATTTGTTGTTGTTGTTGTTG 111799 CU207362.5 1351 TGATTGTTGTTGTTGTTTTCCAGAGCAGAAGGCAGGAATAGGACAGAGAA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111800 TGATTGTTGTTGTTGTTTTCCAGAGCAGAAGGCAGGAATAGGACAGAGAA 111849 CU207362.5 1401 TTACTAGTTATATTTTTATAATTTACAGCTGTTATCATTCAACTATTAAA 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111850 TTACTAGTTATATTTTTATAATTTACAGCTGTTATCATTCAACTATTAAA 111899 CU207362.5 1451 GCTCTCTATGAGAATATAAAATTTTGGGGGGTGGGGGGAGTTGAGACAGG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111900 GCTCTCTATGAGAATATAAAATTTTGGGGGGTGGGGGGAGTTGAGACAGG 111949 CU207362.5 1501 GTTTCTGTGTATAGCCTTGTCTATCCTAGAACTCGCTCTGTAGACCAGGC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 111950 GTTTCTGTGTATAGCCTTGTCTATCCTAGAACTCGCTCTGTAGACCAGGC 111999 CU207362.5 1551 TGGCCTCAAATGCAAAGAGATCCCCCTGCCTCTACCTTCCAAATACTGGG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 112000 TGGCCTCAAATGCAAAGAGATCCCCCTGCCTCTACCTTCCAAATACTGGG 112049 CU207362.5 1601 ACTAGAAGGATGCGCCACACTGCCTAGGGAAAATATTCCTTTTTAATAAA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 112050 ACTAGAAGGATGCGCCACACTGCCTAGGGAAAATATTCCTTTTTAATAAA 112099 CU207362.5 1651 TGATTATCTTTAAATACTATGTATAACGCACTATAGTAGCATTTAAAATA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 112100 TGATTATCTTTAAATACTATGTATAACGCACTATAGTAGCATTTAAAATA 112149 CU207362.5 1701 ACAATTATAATCTTTAAACAAGGAAAAAATTTTTCTGAAGATGAGATTAT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 112150 ACAATTATAATCTTTAAACAAGGAAAAAATTTTTCTGAAGATGAGATTAT 112199 CU207362.5 1751 TTTATACAATATTCATTTAGGAGATTGAGAATCAAAGTCAGAAGCTAAAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 112200 TTTATACAATATTCATTTAGGAGATTGAGAATCAAAGTCAGAAGCTAAAT 112249 CU207362.5 1801 AGAGTCTAGAGATACAGCTCACTCCCCTAATGTGTGTGAGGCCCTGGTTT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 112250 AGAGTCTAGAGATACAGCTCACTCCCCTAATGTGTGTGAGGCCCTGGTTT 112299 CU207362.5 1851 GGATCTCTAGCATTTAAAAGAAACCAATTTAATAGAAAAATTTAAAAGCC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 112300 GGATCTCTAGCATTTAAAAGAAACCAATTTAATAGAAAAATTTAAAAGCC 112349 CU207362.5 1901 TGAGCTAGATATGGTGAGTCGTGTTTGTAATCCCCGCACTGAGGAAGCAG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 112350 TGAGCTAGATATGGTGAGTCGTGTTTGTAATCCCCGCACTGAGGAAGCAG 112399 CU207362.5 1951 AGGCATGACTGCTGAAAGATCTAGGCCAGTCAGACTTACAGACTGAATTC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210925.4 112400 AGGCATGACTGCTGAAAGATCTAGGCCAGTCAGACTTACAGACTGAATTC 112449