<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207362.5	1	ACCACATAGCAGCTCACAACTGCAATTCCAGCCCCAGAGGACCTGACTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110450	ACCACATAGCAGCTCACAACTGCAATTCCAGCCCCAGAGGACCTGACTCC	110499

CU207362.5	51	CTCTTCTGGCTTCTGTGGACACATGGCACACAAATATAAATATAGGTAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110500	CTCTTCTGGCTTCTGTGGACACATGGCACACAAATATAAATATAGGTAAA	110549

CU207362.5	101	ATACCCATACATGTAAAACAAAAATAAGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110550	ATACCCATACATGTAAAACAAAAATAAGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGG	110599

CU207362.5	151	GTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCTGAAGGTTCAGAGTTCAAATCCCAGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110600	GTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCTGAAGGTTCAGAGTTCAAATCCCAGCA	110649

CU207362.5	201	ACCACATGGTGGCTCACAACCATCCGTAAAGAGATCTGACTCGGGGGCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110650	ACCACATGGTGGCTCACAACCATCCGTAAAGAGATCTGACTCGGGGGCTG	110699

CU207362.5	251	GTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCCGAAGGTCAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110700	GTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCCGAAGGTCAG	110749

CU207362.5	301	GAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGGTCACAACCATCCGTAATGAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110750	GAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGGTCACAACCATCCGTAATGAG	110799

CU207362.5	351	ATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110800	ATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTATA	110849

CU207362.5	401	TATAATAAAAATAAATAAATCTTAAACAAACAAACAAACAAAAAAACTAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110850	TATAATAAAAATAAATAAATCTTAAACAAACAAACAAACAAAAAAACTAT	110899

CU207362.5	451	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110900	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTC	110949

CU207362.5	501	TGAAGACAGCTACAATGTACTTACATATAATAAATAAATTTAAAAAAAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	110950	TGAAGACAGCTACAATGTACTTACATATAATAAATAAATTTAAAAAAAAA	110999

CU207362.5	551	TAAATAAAAAATAAAACTATCAAAAAAAGGAAAAAATTGACAAAGCTTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111000	TAAATAAAAAATAAAACTATCAAAAAAAGGAAAAAATTGACAAAGCTTTC	111049

CU207362.5	601	CTCAATTATGTAGAAAAAGAAATAAAACAGAACCCACAAAACTAAAATTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111050	CTCAATTATGTAGAAAAAGAAATAAAACAGAACCCACAAAACTAAAATTT	111099

CU207362.5	651	AGTTAATAACCTTGTCATTTTTTAAAAATGTTTAAGTAAAAATATACCTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111100	AGTTAATAACCTTGTCATTTTTTAAAAATGTTTAAGTAAAAATATACCTT	111149

CU207362.5	701	AAGTGTATAATAGAAGTCTTTTTTTTAACTTTATTGTAATTAAATCAATC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111150	AAGTGTATAATAGAAGTCTTTTTTTTAACTTTATTGTAATTAAATCAATC	111199

CU207362.5	751	TGATTCAACATATAAAGTAGCTTTTCTAGTACACGCTACTAAAATGCCCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111200	TGATTCAACATATAAAGTAGCTTTTCTAGTACACGCTACTAAAATGCCCA	111249

CU207362.5	801	TGTATAGATACTGCCATCTCCTGGCAACAAGAAAGTAAACTAAAAAGATG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111250	TGTATAGATACTGCCATCTCCTGGCAACAAGAAAGTAAACTAAAAAGATG	111299

CU207362.5	851	GCCTCAAACTGCAACCCTAACTAGTATTTGTCCCCAGTAGTACAAGAAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111300	GCCTCAAACTGCAACCCTAACTAGTATTTGTCCCCAGTAGTACAAGAAGA	111349

CU207362.5	901	GAGAAAACTAAATAATTATCTAAACAATTTTAGACTTTTCTTTGTTAAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111350	GAGAAAACTAAATAATTATCTAAACAATTTTAGACTTTTCTTTGTTAAAA	111399

CU207362.5	951	TTCTTACTTCCTATCAAGTATGTGATCAGGCCTCCTCATACATGGAAGTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111400	TTCTTACTTCCTATCAAGTATGTGATCAGGCCTCCTCATACATGGAAGTT	111449

CU207362.5	1001	TTGTGTTTATACAGTATTTTACTTGTATGTCTTTCAAATAACCTTTTGAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111450	TTGTGTTTATACAGTATTTTACTTGTATGTCTTTCAAATAACCTTTTGAG	111499

CU207362.5	1051	GCTGTAGAGAAGGCACTGTTATCTTCATTTTTCCTGACACCAGAACTCAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111500	GCTGTAGAGAAGGCACTGTTATCTTCATTTTTCCTGACACCAGAACTCAA	111549

CU207362.5	1101	GGGAGAGAATGATTTGCTTGAGATAACACAAACAGGTCAACTCAGACTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111550	GGGAGAGAATGATTTGCTTGAGATAACACAAACAGGTCAACTCAGACTTT	111599

CU207362.5	1151	CAAGTTTGCTTAGTCCTCCTGCAGGATTTCATACCCTACCCCAACATAGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111600	CAAGTTTGCTTAGTCCTCCTGCAGGATTTCATACCCTACCCCAACATAGT	111649

CU207362.5	1201	ACAGGGAAGGAAGGGAAGGACCAGACGGCTCCACAGGACATTACCTGGTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111650	ACAGGGAAGGAAGGGAAGGACCAGACGGCTCCACAGGACATTACCTGGTT	111699

CU207362.5	1251	CTGGTTTGTAGAACAGGAATGACTTTGCCTAGTCTTCTCTCACCTTTCGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111700	CTGGTTTGTAGAACAGGAATGACTTTGCCTAGTCTTCTCTCACCTTTCGC	111749

CU207362.5	1301	CTCCCCAGAATCCTTGTCAAAGGCATGCTGATTTGTTGTTGTTGTTGTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111750	CTCCCCAGAATCCTTGTCAAAGGCATGCTGATTTGTTGTTGTTGTTGTTG	111799

CU207362.5	1351	TGATTGTTGTTGTTGTTTTCCAGAGCAGAAGGCAGGAATAGGACAGAGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111800	TGATTGTTGTTGTTGTTTTCCAGAGCAGAAGGCAGGAATAGGACAGAGAA	111849

CU207362.5	1401	TTACTAGTTATATTTTTATAATTTACAGCTGTTATCATTCAACTATTAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111850	TTACTAGTTATATTTTTATAATTTACAGCTGTTATCATTCAACTATTAAA	111899

CU207362.5	1451	GCTCTCTATGAGAATATAAAATTTTGGGGGGTGGGGGGAGTTGAGACAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111900	GCTCTCTATGAGAATATAAAATTTTGGGGGGTGGGGGGAGTTGAGACAGG	111949

CU207362.5	1501	GTTTCTGTGTATAGCCTTGTCTATCCTAGAACTCGCTCTGTAGACCAGGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	111950	GTTTCTGTGTATAGCCTTGTCTATCCTAGAACTCGCTCTGTAGACCAGGC	111999

CU207362.5	1551	TGGCCTCAAATGCAAAGAGATCCCCCTGCCTCTACCTTCCAAATACTGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	112000	TGGCCTCAAATGCAAAGAGATCCCCCTGCCTCTACCTTCCAAATACTGGG	112049

CU207362.5	1601	ACTAGAAGGATGCGCCACACTGCCTAGGGAAAATATTCCTTTTTAATAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	112050	ACTAGAAGGATGCGCCACACTGCCTAGGGAAAATATTCCTTTTTAATAAA	112099

CU207362.5	1651	TGATTATCTTTAAATACTATGTATAACGCACTATAGTAGCATTTAAAATA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	112100	TGATTATCTTTAAATACTATGTATAACGCACTATAGTAGCATTTAAAATA	112149

CU207362.5	1701	ACAATTATAATCTTTAAACAAGGAAAAAATTTTTCTGAAGATGAGATTAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	112150	ACAATTATAATCTTTAAACAAGGAAAAAATTTTTCTGAAGATGAGATTAT	112199

CU207362.5	1751	TTTATACAATATTCATTTAGGAGATTGAGAATCAAAGTCAGAAGCTAAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	112200	TTTATACAATATTCATTTAGGAGATTGAGAATCAAAGTCAGAAGCTAAAT	112249

CU207362.5	1801	AGAGTCTAGAGATACAGCTCACTCCCCTAATGTGTGTGAGGCCCTGGTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	112250	AGAGTCTAGAGATACAGCTCACTCCCCTAATGTGTGTGAGGCCCTGGTTT	112299

CU207362.5	1851	GGATCTCTAGCATTTAAAAGAAACCAATTTAATAGAAAAATTTAAAAGCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	112300	GGATCTCTAGCATTTAAAAGAAACCAATTTAATAGAAAAATTTAAAAGCC	112349

CU207362.5	1901	TGAGCTAGATATGGTGAGTCGTGTTTGTAATCCCCGCACTGAGGAAGCAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	112350	TGAGCTAGATATGGTGAGTCGTGTTTGTAATCCCCGCACTGAGGAAGCAG	112399

CU207362.5	1951	AGGCATGACTGCTGAAAGATCTAGGCCAGTCAGACTTACAGACTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210925.4	112400	AGGCATGACTGCTGAAAGATCTAGGCCAGTCAGACTTACAGACTGAATTC	112449

Overview

Query
CU207362.5 - 121749 bps
Hit
CU210925.4 - 112449 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link