<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207347.9	1	GAATTCATGCTCCACAGTACCTGGCCAGCCTGGCTTGACTATATTCTGTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	118611	GAATTCATGCTCCACAGTACCTGGCCAGCCTGGCTTGACTATATTCTGTT	118660

CU207347.9	51	TTGCATTTCTGACGAGATGTGTTCTTTAAAGTCGTTTCTGTTTCTGGGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	118661	TTGCATTTCTGACGAGATGTGTTCTTTAAAGTCGTTTCTGTTTCTGGGGG	118710

CU207347.9	101	TAAACAGTGATCAAGTGGGATTAATGAGTATAGAGAATATTTTTATTGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	118711	TAAACAGTGATCAAGTGGGATTAATGAGTATAGAGAATATTTTTATTGTG	118760

CU207347.9	151	GAGTTTGTCTGTTTTAGAGGAGAAGGAACCACAGTCTGAAGGTATTACAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	118761	GAGTTTGTCTGTTTTAGAGGAGAAGGAACCACAGTCTGAAGGTATTACAA	118810

CU207347.9	201	CATTCTTAAGACCACTACTCCACTTTGGAATTTCTGAGAATCTTTAGTGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	118811	CATTCTTAAGACCACTACTCCACTTTGGAATTTCTGAGAATCTTTAGTGT	118860

CU207347.9	251	GGTTTGAACTGGCCTGAAATTATCCATATGGTCAACGCTGTCTTCAGTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	118861	GGTTTGAACTGGCCTGAAATTATCCATATGGTCAACGCTGTCTTCAGTGT	118910

CU207347.9	301	TAGTCTGGTTAATCAGGGCTAATCTTTCTCAAGTCTCATTATCTTGTCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	118911	TAGTCTGGTTAATCAGGGCTAATCTTTCTCAAGTCTCATTATCTTGTCCT	118960

CU207347.9	351	TTATGATTTCTCCTGAGTTCTTTCAGTTCCTGCCCGTTTCATGCTTTTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	118961	TTATGATTTCTCCTGAGTTCTTTCAGTTCCTGCCCGTTTCATGCTTTTCC	119010

CU207347.9	401	TTAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACATGCTCACTTGTATGTGTCACTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119011	TTAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACATGCTCACTTGTATGTGTCACTC	119060

CU207347.9	451	AGCACAGTTTAGTAGGAGTTGCTTCTCAGTTGAGCTCTGGAGCCCATCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119061	AGCACAGTTTAGTAGGAGTTGCTTCTCAGTTGAGCTCTGGAGCCCATCTT	119110

CU207347.9	501	TATGCTTGGCACCTTTACTTGCTGAGCCATTTTGCTGGCTCTTTTGAAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119111	TATGCTTGGCACCTTTACTTGCTGAGCCATTTTGCTGGCTCTTTTGAAGT	119160

CU207347.9	551	CTTGATCCTCTTCCCTTCTTTTCACACTTTCTCTAACATATCTAGTGTTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119161	CTTGATCCTCTTCCCTTCTTTTCACACTTTCTCTAACATATCTAGTGTTA	119210

CU207347.9	601	ACGTGAAAGCTTAATTCCTGTCAAGTATTTTCACCCGTATTGATTTTGTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119211	ACGTGAAAGCTTAATTCCTGTCAAGTATTTTCACCCGTATTGATTTTGTA	119260

CU207347.9	651	GGAGCTTGATCCTTAGTGGGTGTGTGTGAATGGTGTGCTGCATTTTAGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119261	GGAGCTTGATCCTTAGTGGGTGTGTGTGAATGGTGTGCTGCATTTTAGTA	119310

CU207347.9	701	CCATTTAGAGGTGAATGGGGTATTACAAATGAAGGAAGCATTTGGAAGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119311	CCATTTAGAGGTGAATGGGGTATTACAAATGAAGGAAGCATTTGGAAGAA	119360

CU207347.9	751	GAGGACAAGGGAAAATTTGATTTTATGTTTGTAAATCAGAGCGCATGTCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119361	GAGGACAAGGGAAAATTTGATTTTATGTTTGTAAATCAGAGCGCATGTCA	119410

CU207347.9	801	CACAAGGTTAGTGGCAACAGAAGACTCTTGAAATGACATTAGTGATCTCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119411	CACAAGGTTAGTGGCAACAGAAGACTCTTGAAATGACATTAGTGATCTCA	119460

CU207347.9	851	CCGGCTTATTTTACATTCACACATACACACCTTTCATTTTCATTGTGAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119461	CCGGCTTATTTTACATTCACACATACACACCTTTCATTTTCATTGTGAGT	119510

CU207347.9	901	CATATCTTTAAATTGGGAATATTTCTTGGTTTAGTGAAAAAAGCATCATA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119511	CATATCTTTAAATTGGGAATATTTCTTGGTTTAGTGAAAAAAGCATCATA	119560

CU207347.9	951	CCAGTATTGGACAATTGGTGATTAGATAATATGAGACCTACAGACACAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119561	CCAGTATTGGACAATTGGTGATTAGATAATATGAGACCTACAGACACAGG	119610

CU207347.9	1001	TGAATGAAACATGACTCATAAAAAACAGCATAGAGGAAGTGAAGTCAGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119611	TGAATGAAACATGACTCATAAAAAACAGCATAGAGGAAGTGAAGTCAGAA	119660

CU207347.9	1051	CTAGTTTTCTTTGAAACATAGACAAAAATGTCCTAACAGCAGAATGTTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119661	CTAGTTTTCTTTGAAACATAGACAAAAATGTCCTAACAGCAGAATGTTTT	119710

CU207347.9	1101	ATGGGGACTTTTATGCTGACAAGATGGGTTTTGGAATGTCTTATTTGTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119711	ATGGGGACTTTTATGCTGACAAGATGGGTTTTGGAATGTCTTATTTGTTA	119760

CU207347.9	1151	TCCTAAACAAAGAGACCTCCCCCCACTCCCCTTAGGTGGATATTGGACAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119761	TCCTAAACAAAGAGACCTCCCCCCACTCCCCTTAGGTGGATATTGGACAA	119810

CU207347.9	1201	ATTGTAGTTTTGTCAATGTACTTGACAAACTGAGAAAGGAAAGTGTTAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119811	ATTGTAGTTTTGTCAATGTACTTGACAAACTGAGAAAGGAAAGTGTTAAG	119860

CU207347.9	1251	TTGACCTATGCATAGCCTGGAAGTTTGAAAGCGCTGTATTATCTAGATGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119861	TTGACCTATGCATAGCCTGGAAGTTTGAAAGCGCTGTATTATCTAGATGC	119910

CU207347.9	1301	TAAAACGGGCCTTCTGTGTTGCTTTGCATGCTGCTTCTGGGCTGTGGGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119911	TAAAACGGGCCTTCTGTGTTGCTTTGCATGCTGCTTCTGGGCTGTGGGTT	119960

CU207347.9	1351	ATTTTGAAAGGTGATTCAAATAACCTTTTCCAATGTCTATTTTGCAACCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	119961	ATTTTGAAAGGTGATTCAAATAACCTTTTCCAATGTCTATTTTGCAACCT	120010

CU207347.9	1401	CAGGGAACTTGCAGCTGCTACAGTCATTCCAGCTGTCCCGATGCAGGATA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120011	CAGGGAACTTGCAGCTGCTACAGTCATTCCAGCTGTCCCGATGCAGGATA	120060

CU207347.9	1451	GGAAGCATTTCAGAATGGTGTTGACAGGCAGAAGCCAGGTGGCCTTTGGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120061	GGAAGCATTTCAGAATGGTGTTGACAGGCAGAAGCCAGGTGGCCTTTGGG	120110

CU207347.9	1501	GTTTTGCTTCTGAATTTGCTTTATTGAAACTATTAAAGTTGAAGTTTTGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120111	GTTTTGCTTCTGAATTTGCTTTATTGAAACTATTAAAGTTGAAGTTTTGG	120160

CU207347.9	1551	TGGATTGTTTGGTTTGGTTTAGTTTTTTTGGATCTGGGGACTGAACCTAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120161	TGGATTGTTTGGTTTGGTTTAGTTTTTTTGGATCTGGGGACTGAACCTAA	120210

CU207347.9	1601	GGCCTTGAGCACACTTTACTACAAACACTCTACCACAGAATAATAACCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120211	GGCCTTGAGCACACTTTACTACAAACACTCTACCACAGAATAATAACCCT	120260

CU207347.9	1651	AAGTCCTCAAGTGTATCCCTTGATGAAATAATCAATTCATTAAGCAGGTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120261	AAGTCCTCAAGTGTATCCCTTGATGAAATAATCAATTCATTAAGCAGGTT	120310

CU207347.9	1701	TTGAATTAATATGTGGTGAAGTTCAAAAGTGAATTAAAATGATTTAAGAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120311	TTGAATTAATATGTGGTGAAGTTCAAAAGTGAATTAAAATGATTTAAGAT	120360

CU207347.9	1751	TTAAATTGTTTTCCAGGAAAACTACTTAGTCTGGTGAGATTTTAAAAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120361	TTAAATTGTTTTCCAGGAAAACTACTTAGTCTGGTGAGATTTTAAAAAAA	120410

CU207347.9	1801	GATAGAAAAATTAAGAAAAACATTTGACTTAATTTTCAGGCAAAGCACAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120411	GATAGAAAAATTAAGAAAAACATTTGACTTAATTTTCAGGCAAAGCACAA	120460

CU207347.9	1851	ATTGGAGGTAGTTCTTACTCTGCATAAGAAGGTTCCCACAGTTGTTTAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120461	ATTGGAGGTAGTTCTTACTCTGCATAAGAAGGTTCCCACAGTTGTTTAGA	120510

CU207347.9	1901	AAAAGAACAAGCTTAACTTTATTATTTATTTATTTGTTTATTTATTTTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120511	AAAAGAACAAGCTTAACTTTATTATTTATTTATTTGTTTATTTATTTTGG	120560

CU207347.9	1951	TTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210913.6	120561	TTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTC	120610

Overview

Query
CU207347.9 - 171464 bps
Hit
CU210913.6 - 120610 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link