<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1864 bps / non-identical: 150 bps

Full alignment

CU207392.14	1	GAATTCTTCTTTTTTTTTCTTTCTTTCCTTTCATGACTTGACCATAAAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152133	GAATTCTTCTTTTTTTTTCTTTCTTTCCTTTCATGACTTGACCATAAAGA	152182

CU207392.14	51	TAAAACTGGGGTGCTTTAATTACCATCCAGAGCCAGAGCCTTGCCCTTTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152183	TAAAACTGGGGTGCTTTAATTACCATCCAGAGCCAGAGCCTTGCCCTTTG	152232

CU207392.14	101	ATATGGAAATCCCACTTGTGCCCCCACCTCTTCTCTGCCCCTTCCTCCAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152233	ATATGGAAATCCCACTTGTGCCCCCACCTCTTCTCTGCCCCTTCCTCCAC	152282

CU207392.14	151	TTTCCCAGCAGGAATTTTAAGTAGCTTTGTCCAACCAGCTTATAGTGACA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152283	TTTCCCAGCAGGAATTTTAAGTAGCTTTGTCCAACCAGCTTATAGTGACA	152332

CU207392.14	201	ACAAGAGAGCCAAGCATAGCTCCTGGTAAGGTCTGAGTCCTCCTGGCAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152333	ACAAGAGAGCCAAGCATAGCTCCTGGTAAGGTCTGAGTCCTCCTGGCAGA	152382

CU207392.14	251	ACTGAGGGCAGGACAGAATGGAGAGGAGATAAACAGGAAGGACAGGACAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152383	ACTGAGGGCAGGACAGAATGGAGAGGAGATAAACAGGAAGGACAGGACAG	152432

CU207392.14	301	GATAGAATAGGGTAGGGTAGGGTAGGGTAGGGTAGGGTAGGGCAGGGTAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152433	GATAGAATAGGGTAGGGTAGGGTAGGGTAGGGTAGGGTAGGGCAGGGTAG	152482

CU207392.14	351	GGTAGGGTGGGGCAGGGTAGGGTAAGAGAGGAGAGGGTAGGAGAGTGGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152483	GGTAGGGTGGGGCAGGGTAGGGTAAGAGAGGAGAGGGTAGGAGAGTGGAG	152532

CU207392.14	401	AGGAGAGGAGGGGAGGGGAGAAGAGGAGGGAGGGAGAGCTTATTAGAATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152533	AGGAGAGGAGGGGAGGGGAGAAGAGGAGGGAGGGAGAGCTTATTAGAATG	152582

CU207392.14	451	GCTGGATTTGTTTCTGCCCCATCAGCATGAAGTGTGGCCAGGCAACACAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152583	GCTGGATTTGTTTCTGCCCCATCAGCATGAAGTGTGGCCAGGCAACACAA	152632

CU207392.14	501	AGCCTCTCACTTTAAACTCACACAGAGAGCACCAGCCAGGCATGCAGGCG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152633	AGCCTCTCACTTTAAACTCACACAGAGAGCACCAGCCAGGCATGCAGGCG	152682

CU207392.14	551	GGCATGCACAGCCACCCAGGTATTGTCATCTGCCTTCTGCATGACTCCCG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152683	GGCATGCACAGCCACCCAGGTATTGTCATCTGCCTTCTGCATGACTCCCG	152732

CU207392.14	601	GCTTAGCTATAATTATTAATTGCACTTGTCAACTGTCATTAATTCCTCTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152733	GCTTAGCTATAATTATTAATTGCACTTGTCAACTGTCATTAATTCCTCTT	152782

CU207392.14	651	TAACATCCCTGTCTTTGAGTAATTAGACAGAACAGCCTCACGGAGCCCAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152783	TAACATCCCTGTCTTTGAGTAATTAGACAGAACAGCCTCACGGAGCCCAT	152832

CU207392.14	701	TGTTTAGAGTCTCCTGAAAGAGCCCACTGGGCTTTCAGGAGGATAATAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152833	TGTTTAGAGTCTCCTGAAAGAGCCCACTGGGCTTTCAGGAGGATAATAGA	152882

CU207392.14	751	GGGCTTCTCGGTTAACCCTTGGTGAGCACTTGTGGAGCAGGAGGGAAGGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152883	GGGCTTCTCGGTTAACCCTTGGTGAGCACTTGTGGAGCAGGAGGGAAGGG	152932

CU207392.14	801	GGCAGGCTTGGGCCTCCTGCGTTGCCTTGGTCAGACACAGAGACACATCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152933	GGCAGGCTTGGGCCTCCTGCGTTGCCTTGGTCAGACACAGAGACACATCC	152982

CU207392.14	851	ACTGTTTAAGTGGGGCTAGCTTTTCAATATTTCTTTCCTAGGGACAAAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	152983	ACTGTTTAAGTGGGGCTAGCTTTTCAATATTTCTTTCCTAGGGACAAAGA	153032

CU207392.14	901	GTATTTAAAGTTGACTTAGGAGCAGAGAAAGGGCCAAGAAAAACAGGATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153033	GTATTTAAAGTTGACTTAGGAGCAGAGAAAGGGCCAAGAAAAACAGGATT	153082

CU207392.14	951	CACTAATCTGCAACAGGGGATATGCCATTTTTTCATATGTATTCTTATGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153083	CACTAATCTGCAACAGGGGATATGCCATTTTTTCATATGTATTCTTATGC	153132

CU207392.14	1001	TTTGTATTTGAGAAAAGCCACATCTTTGAAGATATCTTCTTACATTCATT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153133	TTTGTATTTGAGAAAAGCCACATCTTTGAAGATATCTTCTTACATTCATT	153182

CU207392.14	1051	ACATTATACACAAGATGTGTAATGTTTACATGAAGAGAAAGGCGCTTTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153183	ACATTATACACAAGATGTGTAATGTTTACATGAAGAGAAAGGCGCTTTAA	153232

CU207392.14	1101	GATGATTTCTAAATTCTCTGAAGTACAAACACTTTTAGCACGCTAGTATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153233	GATGATTTCTAAATTCTCTGAAGTACAAACACTTTTAGCACGCTAGTATT	153282

CU207392.14	1151	AAGGAGTAAGTTTTGCTCAGACGTCTCTCAGCTTTCTATAGATGGAAATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153283	AAGGAGTAAGTTTTGCTCAGACGTCTCTCAGCTTTCTATAGATGGAAATT	153332

CU207392.14	1201	ACTGACAATAATTTTTATATTTTATCATATATTTAGTGTGTGTGTGCGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153333	ACTGACAATAATTTTTATATTTTATCATATATTTAGTGTGTGTGTGCGTG	153382

CU207392.14	1251	CCTGCGTGTGTGTGCACACATGTGCATATCTGCTGGTGCCACAGATGCTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153383	CCTGCGTGTGTGTGCACACATGTGCATATCTGCTGGTGCCACAGATGCTA	153432

CU207392.14	1301	GAAGAGGGAATGGGGACCCCTGGAGTTGGGGTTGCTAGCAGTTCTGAGCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153433	GAAGAGGGAATGGGGACCCCTGGAGTTGGGGTTGCTAGCAGTTCTGAGCT	153482

CU207392.14	1351	GATCGACACAAGTACTGGTGTCTGAACTTGAATCCTTAAAAGCTTTCAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153483	GATCGACACAAGTACTGGTGTCTGAACTTGAATCCTTAAAAGCTTTCAAC	153532

CU207392.14	1401	CCCAGATCTATCTCCAGCCCCCACCGACAGACAGCAGTTTTAGTTCTGCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153533	CCCAGATCTATCTCCAGCCCCCACCGACAGACAGCAGTTTTAGTTCTGCT	153582

CU207392.14	1451	ATTGGAGGCTCAGGAGACTTTCTTTCTTTCTTCCTTTCTTCCTTCCTTCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153583	ATTGGAGGCTCAGGAGACTTTCTTTCTTTCTTCCTTTCTTCCTTCCTTCC	153632

CU207392.14	1501	TTTCTTTCTT----------------------------------------	1510
			||||||||||                                        
CU210899.12	153633	TTTCTTTCTTCCTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTCTT	153682

CU207392.14	1511	--------------------------------------------------	1510
			                                                  
CU210899.12	153683	CCTTTCTTCCTTTCTTCCTTTCTTCCTTTCTTCCTTTCTTCCTTTCTTCC	153732

CU207392.14	1511	----------------------------------------------TCTT	1514
			                                              ||||
CU210899.12	153733	TTTCTTCCTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTTCTTTCTT	153782

CU207392.14	1515	TCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTAGTT	1564
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153783	TCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTAGTT	153832

CU207392.14	1565	TGTTCTTTAATTAGTTTTATAGGCAGGCTCTCATATAGCTCAGGCTAGCC	1614
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153833	TGTTCTTTAATTAGTTTTATAGGCAGGCTCTCATATAGCTCAGGCTAGCC	153882

CU207392.14	1615	TTGCATGCACTATGTAGCTGGGGATAAGCTTGAATTCCTCACCTTTTTAC	1664
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153883	TTGCATGCACTATGTAGCTGGGGATAAGCTTGAATTCCTCACCTTTTTAC	153932

CU207392.14	1665	TTCCACCTCTAAAGTGCTAAGATTCTCTTTATGCACCACCTTGCCCAGCT	1714
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153933	TTCCACCTCTAAAGTGCTAAGATTCTCTTTATGCACCACCTTGCCCAGCT	153982

CU207392.14	1715	TTATTTGACATTACTTTAAAACTTATTCTGAAAGATATACTCAGCATGCC	1764
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	153983	TTATTTGACATTACTTTAAAACTTATTCTGAAAGATATACTCAGCATGCC	154032

CU207392.14	1765	CATGGCCTCTCGAGCTCCCCTAAATGTAGGTAGTGTCCCCCAGTGAAAGG	1814
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	154033	CATGGCCTCTCGAGCTCCCCTAAATGTAGGTAGTGTCCCCCAGTGAAAGG	154082

CU207392.14	1815	CAAGATGTGACATATGGCTTATTTCACATATCTTGCCAAGTGACAGATAT	1864
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210899.12	154083	CAAGATGTGACATATGGCTTATTTCACATATCTTGCCAAGTGACAGATAT	154132

Compact alignment

skip 1500 bps 100% identity alignment

CU207392.14	1501	TTTCTTTCTT----------------------------------------	1510
			||||||||||                                        
CU210899.12	153633	TTTCTTTCTTCCTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTCTT	153682

CU207392.14	1511	--------------------------------------------------	1510
			                                                  
CU210899.12	153683	CCTTTCTTCCTTTCTTCCTTTCTTCCTTTCTTCCTTTCTTCCTTTCTTCC	153732

CU207392.14	1511	----------------------------------------------TCTT	1514
			                                              ||||
CU210899.12	153733	TTTCTTCCTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTTCTTTCTT	153782

skip 350 bps 100% identity alignment

Overview

Query
CU207392.14 - 264250 bps
Hit
CU210899.12 - 154132 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1864 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link