<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU207394.18 1 GAATTCCCAGTAACCACATGGTGCTCACAACCATCTGTAATGGTATTGGA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114113 GAATTCCCAGTAACCACATGGTGCTCACAACCATCTGTAATGGTATTGGA 114162 CU207394.18 51 TGCCCTCTTCTGGTGTTCATGACGAGAGCTGTATGTACTCACATACATAA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114163 TGCCCTCTTCTGGTGTTCATGACGAGAGCTGTATGTACTCACATACATAA 114212 CU207394.18 101 AATATTAAAAAAAAAAAGACCTTTCATTTAGTGGTATCAGAGAACAAATC 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114213 AATATTAAAAAAAAAAAGACCTTTCATTTAGTGGTATCAGAGAACAAATC 114262 CU207394.18 151 CAGATTTCTGTCCCTAAGGGTCTGTCTCTCCTATTTTAATTGTACCAAGA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114263 CAGATTTCTGTCCCTAAGGGTCTGTCTCTCCTATTTTAATTGTACCAAGA 114312 CU207394.18 201 TTACTAGTAAGATAGGTTCAAAGGAATATAGCCATGAAAATGAGACCTAC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114313 TTACTAGTAAGATAGGTTCAAAGGAATATAGCCATGAAAATGAGACCTAC 114362 CU207394.18 251 AGGTATTACAGTAATGAATGGTTTGGTCAGAGAATTGGCACACTCACAAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114363 AGGTATTACAGTAATGAATGGTTTGGTCAGAGAATTGGCACACTCACAAA 114412 CU207394.18 301 ACTCAAAAAGAGCTGGGGAGGAGGGTAAAGGATCAAAAGGAAAAAGACAA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114413 ACTCAAAAAGAGCTGGGGAGGAGGGTAAAGGATCAAAAGGAAAAAGACAA 114462 CU207394.18 351 GCAATGCCATCCTAAAGATGTGTACAGGCATTTAAAAGATTGTGAGAAAT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114463 GCAATGCCATCCTAAAGATGTGTACAGGCATTTAAAAGATTGTGAGAAAT 114512 CU207394.18 401 GTGGCATTAAACAGAACATAAAGGAAAACTTGGGGAAGAGTCTTGTGAAA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114513 GTGGCATTAAACAGAACATAAAGGAAAACTTGGGGAAGAGTCTTGTGAAA 114562 CU207394.18 451 ACTGCCGCTGCTTAGACTTTGCTGCCGAAGTAGAAACTGCTACCTTATCA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114563 ACTGCCGCTGCTTAGACTTTGCTGCCGAAGTAGAAACTGCTACCTTATCA 114612 CU207394.18 501 TTGGCATGGAGCCAAGTCTCTGATGCTGTCTTAGGGTTTCTATTCCTGCA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114613 TTGGCATGGAGCCAAGTCTCTGATGCTGTCTTAGGGTTTCTATTCCTGCA 114662 CU207394.18 551 CAAACATGAACAAGAAGCAAGTTGGAGAGAAAAGGGTTTATTCAGCTTAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114663 CAAACATGAACAAGAAGCAAGTTGGAGAGAAAAGGGTTTATTCAGCTTAC 114712 CU207394.18 601 ACATCTACATTGCTGTTCATCACCAAAAGAAGTCAGGACTGGAACTCAGC 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114713 ACATCTACATTGCTGTTCATCACCAAAAGAAGTCAGGACTGGAACTCAGC 114762 CU207394.18 651 AGGTCAGGAAACAGGAGCTGATGCTGAAGCCATGGAGAGATGTTACTGGC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114763 AGGTCAGGAAACAGGAGCTGATGCTGAAGCCATGGAGAGATGTTACTGGC 114812 CU207394.18 701 TTGCTTCCCCTGGGTTGCTCAGCTTGCTTTCTTATAGAACCCAGGACCAC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114813 TTGCTTCCCCTGGGTTGCTCAGCTTGCTTTCTTATAGAACCCAGGACCAC 114862 CU207394.18 751 CAGCCCAGGATGGCACCATCTACCATGGACCCTCCCACCCTTGATCACTA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114863 CAGCCCAGGATGGCACCATCTACCATGGACCCTCCCACCCTTGATCACTA 114912 CU207394.18 801 ACTGAGAAAATGCCTTACAGCTGGATCTCATGGAGGCATTTCCTCAAGGG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114913 ACTGAGAAAATGCCTTACAGCTGGATCTCATGGAGGCATTTCCTCAAGGG 114962 CU207394.18 851 AGACTCCTTTCTCTGTGATAACTCCAGCTTGTGTCAAGTTGACACACAAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 114963 AGACTCCTTTCTCTGTGATAACTCCAGCTTGTGTCAAGTTGACACACAAA 115012 CU207394.18 901 ACCAGCCAGTACACTGTCTGCTCACTGAATAACTTGTGCTTCAACAATTG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115013 ACCAGCCAGTACACTGTCTGCTCACTGAATAACTTGTGCTTCAACAATTG 115062 CU207394.18 951 GAACCTATAACATCTTGCAGCACTTGGCCACTGCCTTGTCACAGAATTCC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115063 GAACCTATAACATCTTGCAGCACTTGGCCACTGCCTTGTCACAGAATTCC 115112 CU207394.18 1001 TTTCATCAGCCAACTCTAACCACAGTAACATTTAATATATGTAATACTAT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115113 TTTCATCAGCCAACTCTAACCACAGTAACATTTAATATATGTAATACTAT 115162 CU207394.18 1051 GCAGGGCTTGGTGACCCACCCCCCATCTTTAATCCCAGCACTTAGCAAGC 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115163 GCAGGGCTTGGTGACCCACCCCCCATCTTTAATCCCAGCACTTAGCAAGC 115212 CU207394.18 1101 AGAGACAAGCAATCTCTAAGTTTGAGGCAAGCCTGGTCTACAAAGTGAGT 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115213 AGAGACAAGCAATCTCTAAGTTTGAGGCAAGCCTGGTCTACAAAGTGAGT 115262 CU207394.18 1151 TCCAGGGCAGCCAGAGCTATACAGAAACCATGCCTTAAAAAAAGAAAAAG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115263 TCCAGGGCAGCCAGAGCTATACAGAAACCATGCCTTAAAAAAAGAAAAAG 115312 CU207394.18 1201 AAAAAGAAAGAAGTATGTGTATGCAGTATGTAATACCAGAAAAAAAAATG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115313 AAAAAGAAAGAAGTATGTGTATGCAGTATGTAATACCAGAAAAAAAAATG 115362 CU207394.18 1251 TCAGCATGGACACTTCATGAAATTAGAGGTTATTATTTGTATTTTTGGTG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115363 TCAGCATGGACACTTCATGAAATTAGAGGTTATTATTTGTATTTTTGGTG 115412 CU207394.18 1301 GTGGTGGTGTGTGACTAAAAATTGAATCCAGAGCCTTGTGCTTCCCAAAG 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115413 GTGGTGGTGTGTGACTAAAAATTGAATCCAGAGCCTTGTGCTTCCCAAAG 115462 CU207394.18 1351 ACTCTACCTCTGACTTATAGCCACAGAACTTTTTTGACTGTTAATTTTGA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115463 ACTCTACCTCTGACTTATAGCCACAGAACTTTTTTGACTGTTAATTTTGA 115512 CU207394.18 1401 GATCATGTCTCACCAAGTTGCCCTAATCTCACTGAGCCCAAGCAGGCCTT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115513 GATCATGTCTCACCAAGTTGCCCTAATCTCACTGAGCCCAAGCAGGCCTT 115562 CU207394.18 1451 GAATTTGCCATTTTATGTATCTCTTGAGTAGCTAGGAATACAGGTCTATA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115563 GAATTTGCCATTTTATGTATCTCTTGAGTAGCTAGGAATACAGGTCTATA 115612 CU207394.18 1501 CTGGTAGGGCCAGCTGAAGTTACTGATTTCTTACTCAAGTTTTTTGTTTG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115613 CTGGTAGGGCCAGCTGAAGTTACTGATTTCTTACTCAAGTTTTTTGTTTG 115662 CU207394.18 1551 TTTTTGTTTTGTTGTATGTTTTGAGATAGGGTTTCTCTACATAGTCTTGG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115663 TTTTTGTTTTGTTGTATGTTTTGAGATAGGGTTTCTCTACATAGTCTTGG 115712 CU207394.18 1601 TTATCCTGAAACTATGTGAGTTCTCTTGCAATAGTAGTCAGCGCTCCCAA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115713 TTATCCTGAAACTATGTGAGTTCTCTTGCAATAGTAGTCAGCGCTCCCAA 115762 CU207394.18 1651 ATATTGAGCCATCTCTCCAGTCTCAATGATTTTTGCTTTTAAAAGCCTTT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115763 ATATTGAGCCATCTCTCCAGTCTCAATGATTTTTGCTTTTAAAAGCCTTT 115812 CU207394.18 1701 GAAGTGAGCAGCCTCTAGATCCTTCCAGAGAATATAGGACTGCCTGTCCA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115813 GAAGTGAGCAGCCTCTAGATCCTTCCAGAGAATATAGGACTGCCTGTCCA 115862 CU207394.18 1751 TCAATATATATATTTTACAGATCACAGAATGGAAGCCTTAGGACTTGAGA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115863 TCAATATATATATTTTACAGATCACAGAATGGAAGCCTTAGGACTTGAGA 115912 CU207394.18 1801 GTGTGATATGATTCTCTGTTGGAAAATAAGTGGCAGCTGTCCCTTACACT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115913 GTGTGATATGATTCTCTGTTGGAAAATAAGTGGCAGCTGTCCCTTACACT 115962 CU207394.18 1851 AAATCTAATCCCAGGACTGGGAGGCACAATCAGGAGGATTGCCATGAGTT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 115963 AAATCTAATCCCAGGACTGGGAGGCACAATCAGGAGGATTGCCATGAGTT 116012 CU207394.18 1901 AAAGGCCGGCCTAGTCTACATAGTTTCAGGACAGCCAAGGCTAACTAGGG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 116013 AAAGGCCGGCCTAGTCTACATAGTTTCAGGACAGCCAAGGCTAACTAGGG 116062 CU207394.18 1951 ATATTAGCCATCTCAAAAGAAACAAGCAAAAATACCCCACCCCTCAAAAA 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU210876.20 116063 ATATTAGCCATCTCAAAAGAAACAAGCAAAAATACCCCACCCCTCAAAAA 116112
