<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207332.5	1	GAATTCTCAACTGAGGAATACTGAGTGTCTGAGAAGCACCTAAAGAAATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	166972	GAATTCTCAACTGAGGAATACTGAGTGTCTGAGAAGCACCTAAAGAAATG	167021

CU207332.5	51	TTCAACACCCTTAATCATCAGGGAAATACAAATCAAAACAATTGTGAGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167022	TTCAACACCCTTAATCATCAGGGAAATACAAATCAAAACAATTGTGAGAT	167071

CU207332.5	101	TCCACTTTATACCAGTCAGAATGGCTAAGATAAAAAACTCAGGAGACTGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167072	TCCACTTTATACCAGTCAGAATGGCTAAGATAAAAAACTCAGGAGACTGC	167121

CU207332.5	151	AGATGCTCGTGAGGATGTTCCCAAAGAGAAACATTCCTCCAATGGTGGTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167122	AGATGCTCGTGAGGATGTTCCCAAAGAGAAACATTCCTCCAATGGTGGTG	167171

CU207332.5	201	GGATTGCAAGCTGGTGCAACCACTCTGGAAATCAGTTTGATTGTTCCTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167172	GGATTGCAAGCTGGTGCAACCACTCTGGAAATCAGTTTGATTGTTCCTCA	167221

CU207332.5	251	GAAAATCGGACATAGTAATCCATGGTCTTAAAGTGGAGTTATAGCAATAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167222	GAAAATCGGACATAGTAATCCATGGTCTTAAAGTGGAGTTATAGCAATAG	167271

CU207332.5	301	CATATGGGCTTAAATATGGGAGAAAAGAAGAAAAGTATAGCCCTTCATAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167272	CATATGGGCTTAAATATGGGAGAAAAGAAGAAAAGTATAGCCCTTCATAA	167321

CU207332.5	351	GAAGTCTATAGAAATTTTCATAATGATTGCAATATGAGTAAATAAAATCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167322	GAAGTCTATAGAAATTTTCATAATGATTGCAATATGAGTAAATAAAATCT	167371

CU207332.5	401	AGGTATATAAACTGAATTAAACCATCACTTAGAGCTACCTACCCAATATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167372	AGGTATATAAACTGAATTAAACCATCACTTAGAGCTACCTACCCAATATG	167421

CU207332.5	451	GTAGCTTCTTGTCAAACATTTTTCCCCCACTGGGTACATGTGATGTGTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167422	GTAGCTTCTTGTCAAACATTTTTCCCCCACTGGGTACATGTGATGTGTTT	167471

CU207332.5	501	GGTCTGGATTTAGAGATGCAATATATGTATAATGCAAACTAAACTTGAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167472	GGTCTGGATTTAGAGATGCAATATATGTATAATGCAAACTAAACTTGAAG	167521

CU207332.5	551	ATTTGATTAAAAAAACCATGCAAATGATTTCAACACTCTTTTCAGTGATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167522	ATTTGATTAAAAAAACCATGCAAATGATTTCAACACTCTTTTCAGTGATT	167571

CU207332.5	601	GTATCTTGAACTAATAATATTTTAGTATTTGGAATAAATAATGTACAGTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167572	GTATCTTGAACTAATAATATTTTAGTATTTGGAATAAATAATGTACAGTA	167621

CU207332.5	651	TTAATTTTTTTACATAAAGTAAGGGAACTTTTGAAAAGAAATGAGACAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167622	TTAATTTTTTTACATAAAGTAAGGGAACTTTTGAAAAGAAATGAGACAAT	167671

CU207332.5	701	TATACCCCACTGTCAAACTCCTCTATATCATGATATAGTCTTTAATGTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167672	TATACCCCACTGTCAAACTCCTCTATATCATGATATAGTCTTTAATGTGG	167721

CU207332.5	751	TAGCACCAACAATTTCACAGATAGTGGCCAACACCTAGCAAGAGTGGTAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167722	TAGCACCAACAATTTCACAGATAGTGGCCAACACCTAGCAAGAGTGGTAT	167771

CU207332.5	801	GCTTCCTATAAACAAAATATCAACTTATCCTGAGTCGGTTTTGGCATCTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167772	GCTTCCTATAAACAAAATATCAACTTATCCTGAGTCGGTTTTGGCATCTA	167821

CU207332.5	851	TCTAATAGCAATGGTATTCATTATGTAGTTTTATTTTTAACCTACAGCCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167822	TCTAATAGCAATGGTATTCATTATGTAGTTTTATTTTTAACCTACAGCCT	167871

CU207332.5	901	CCTGTGAGTCACAACTTATCAGATAACAACTCTCTGAGAGCTTGCAAACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167872	CCTGTGAGTCACAACTTATCAGATAACAACTCTCTGAGAGCTTGCAAACC	167921

CU207332.5	951	TTTTCCTGTAATTGACACATTCTCCTGAGCAGGGGTTCCTCCTTGTCTGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167922	TTTTCCTGTAATTGACACATTCTCCTGAGCAGGGGTTCCTCCTTGTCTGC	167971

CU207332.5	1001	TGGGCATATTTCTGCAAGGATTCTATTATCCACTCTGTTCTTTTCACAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	167972	TGGGCATATTTCTGCAAGGATTCTATTATCCACTCTGTTCTTTTCACAAT	168021

CU207332.5	1051	GCCAAGATGCCACTAAATGAAAGTACTCTATAGAAATTCCATTCCTTCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168022	GCCAAGATGCCACTAAATGAAAGTACTCTATAGAAATTCCATTCCTTCAT	168071

CU207332.5	1101	GAAAGGCAGGGTGGCTCTGTCTGAAACAGGGGTTCTCAACCTGTGGGTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168072	GAAAGGCAGGGTGGCTCTGTCTGAAACAGGGGTTCTCAACCTGTGGGTCA	168121

CU207332.5	1151	TGACCTCCTTAGGGGTCAAAAATTGGTTATCCTCCATATTGGATATTTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168122	TGACCTCCTTAGGGGTCAAAAATTGGTTATCCTCCATATTGGATATTTAT	168171

CU207332.5	1201	ATTGATATTTATAACAGTAAAATTATGGTAATGAAGTAGCAATGAAATAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168172	ATTGATATTTATAACAGTAAAATTATGGTAATGAAGTAGCAATGAAATAA	168221

CU207332.5	1251	TTTTATGTTTGGGAGTTACCATAACATGAGGAACTGTATTAAATAGTAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168222	TTTTATGTTTGGGAGTTACCATAACATGAGGAACTGTATTAAATAGTAGC	168271

CU207332.5	1301	AGCATTAGGAACATTGAGAAATACTGGCCTAAAGACGATGTTGGTACTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168272	AGCATTAGGAACATTGAGAAATACTGGCCTAAAGACGATGTTGGTACTTG	168321

CU207332.5	1351	GACCCCATTTGTCATAGGAGGAAACTGAGTATTTTAATTAATGCTACCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168322	GACCCCATTTGTCATAGGAGGAAACTGAGTATTTTAATTAATGCTACCAT	168371

CU207332.5	1401	ACCTGCTGACATTCAAAGAGTTACTCCTTCCATTCCTCCTCCCCTTCACC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168372	ACCTGCTGACATTCAAAGAGTTACTCCTTCCATTCCTCCTCCCCTTCACC	168421

CU207332.5	1451	TCCGAGAAGATGTTCCCCCTGGATATTCCCCTATCCTAGTACATCAGGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168422	TCCGAGAAGATGTTCCCCCTGGATATTCCCCTATCCTAGTACATCAGGTC	168471

CU207332.5	1501	TCTGCAGGATGAGGCACATCATCTCCAACTGTGGCCAAACAAGGCAGACG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168472	TCTGCAGGATGAGGCACATCATCTCCAACTGTGGCCAAACAAGGCAGACG	168521

CU207332.5	1551	ACTGCTACATATGTGTAGTGGGAAGAGCCTCAGACCAGCCAATGTATGCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168522	ACTGCTACATATGTGTAGTGGGAAGAGCCTCAGACCAGCCAATGTATGCT	168571

CU207332.5	1601	CTTCGGTTGGTAACTCAGTCTCTGGGGGCTCCCAGAGGTCCAGGCTAATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168572	CTTCGGTTGGTAACTCAGTCTCTGGGGGCTCCCAGAGGTCCAGGCTAATT	168621

CU207332.5	1651	CACACTTTTGGTCTTCTTGTGGTCTTGATATCCCTTTCAGGGTTTTCAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168622	CACACTTTTGGTCTTCTTGTGGTCTTGATATCCCTTTCAGGGTTTTCAAT	168671

CU207332.5	1701	CCTCCCCCTAACTCCTCCATTAAGGTCCCCAGTCTCTGTCCAATGTTTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168672	CCTCCCCCTAACTCCTCCATTAAGGTCCCCAGTCTCTGTCCAATGTTTGG	168721

CU207332.5	1751	CTGTGGGTATCTATATCTGTCTCAATCAGCTGCTAAGTAGAGCCTCTCAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168722	CTGTGGGTATCTATATCTGTCTCAATCAGCTGCTAAGTAGAGCCTCTCAG	168771

CU207332.5	1801	AGGACAGCTATGAAGGCCTAACAGAAAGAAATTGAAGAATACCTTAGAAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168772	AGGACAGCTATGAAGGCCTAACAGAAAGAAATTGAAGAATACCTTAGAAG	168821

CU207332.5	1851	ATGGAAAGATGCTCATGGATTGGTAGAATTAACATAGTGAAAATGATCAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168822	ATGGAAAGATGCTCATGGATTGGTAGAATTAACATAGTGAAAATGATCAT	168871

CU207332.5	1901	CTTACTAAAAGCAATCTACATATTCAATGCAATTCCCATTGAAATTCCAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168872	CTTACTAAAAGCAATCTACATATTCAATGCAATTCCCATTGAAATTCCAC	168921

CU207332.5	1951	CACACATTTTTACATACCTTGAAAAAGCAATTCTCAACTTTATATAGAGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210875.9	168922	CACACATTTTTACATACCTTGAAAAAGCAATTCTCAACTTTATATAGAGT	168971

Overview

Query
CU207332.5 - 227402 bps
Hit
CU210875.9 - 168971 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link