<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207386.8	1	GAATTCATCTTTGCATTTCATTGGGAAATTTAGACCTGTCTTTAGAAGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	52855	GAATTCATCTTTGCATTTCATTGGGAAATTTAGACCTGTCTTTAGAAGCA	52904

CU207386.8	51	CAACAAAATCCTAGTAACGAAAAGCCATGATTCTAGAGACCTCTGAATCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	52905	CAACAAAATCCTAGTAACGAAAAGCCATGATTCTAGAGACCTCTGAATCA	52954

CU207386.8	101	GCTGGGAAGGGAGAATGGTTCCTAGACCACTTAGCACCACCAACTTGTCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	52955	GCTGGGAAGGGAGAATGGTTCCTAGACCACTTAGCACCACCAACTTGTCT	53004

CU207386.8	151	GGGTATGAGAAAATTCACCTACTGAAAGGGCCTTGTTTCTCAGCCCCCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53005	GGGTATGAGAAAATTCACCTACTGAAAGGGCCTTGTTTCTCAGCCCCCCT	53054

CU207386.8	201	CCCCTACCCTACCCTTGTTCACAAATTTATGAACTTAACATGACTCTCAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53055	CCCCTACCCTACCCTTGTTCACAAATTTATGAACTTAACATGACTCTCAA	53104

CU207386.8	251	ACCTCCCTCTTACGTTACTCATATTGGAGGTTGGGGTCCGAAATATAGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53105	ACCTCCCTCTTACGTTACTCATATTGGAGGTTGGGGTCCGAAATATAGGA	53154

CU207386.8	301	CCAGATAGAAGCTCTAAAGAGCCTACTGTGTGCCAAGAACTTGTATAAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53155	CCAGATAGAAGCTCTAAAGAGCCTACTGTGTGCCAAGAACTTGTATAAAC	53204

CU207386.8	351	CCTTTGGTCCTCATAGTTTTACTTCCAGCCTCACTTCCCCCTGTTCTCCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53205	CCTTTGGTCCTCATAGTTTTACTTCCAGCCTCACTTCCCCCTGTTCTCCC	53254

CU207386.8	401	TCCAGATCTCTGTTCCAGACACATCGAGCCTTACTCCATCCTGACTCATA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53255	TCCAGATCTCTGTTCCAGACACATCGAGCCTTACTCCATCCTGACTCATA	53304

CU207386.8	451	GCCATTGTTTACCTCCAGCCTTTAGTATGCACTGCCCCCTCTGCCCAGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53305	GCCATTGTTTACCTCCAGCCTTTAGTATGCACTGCCCCCTCTGCCCAGAG	53354

CU207386.8	501	TTTTCTGCCTCCCATCCTCTTCTGCCCCAATCTCCACATGACTGGAATCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53355	TTTTCTGCCTCCCATCCTCTTCTGCCCCAATCTCCACATGACTGGAATCT	53404

CU207386.8	551	TTCCATTATTCAACATAAGCTCCAGAGTTACATCTTTGGAGGTTCTCTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53405	TTCCATTATTCAACATAAGCTCCAGAGTTACATCTTTGGAGGTTCTCTCT	53454

CU207386.8	601	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53455	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCC	53504

CU207386.8	651	CCCCTGTCATTCACCCACTGAGTTCCAGCATGTATCTTCTGCTACCTTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53505	CCCCTGTCATTCACCCACTGAGTTCCAGCATGTATCTTCTGCTACCTTCA	53554

CU207386.8	701	CAGCTCTCACTGCAATCTGTCTGTCTATTCATTGACAAACTGCTCACTTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53555	CAGCTCTCACTGCAATCTGTCTGTCTATTCATTGACAAACTGCTCACTTC	53604

CU207386.8	751	TTGCCTCTGCCTCCAGAGTGTGAGCTTCTTGGGGATAGTTTTTTTTGTGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53605	TTGCCTCTGCCTCCAGAGTGTGAGCTTCTTGGGGATAGTTTTTTTTGTGT	53654

CU207386.8	801	GTGTCTTTTTAAAATTGTGCTTCTAGTGGCCCCCAAATAGTGATTGTGAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53655	GTGTCTTTTTAAAATTGTGCTTCTAGTGGCCCCCAAATAGTGATTGTGAC	53704

CU207386.8	851	AGAGCAGGGACTAAAGATGGATGGATGAATGGATAATGGATAGATGGATG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53705	AGAGCAGGGACTAAAGATGGATGGATGAATGGATAATGGATAGATGGATG	53754

CU207386.8	901	ATGGATGGATAGATGGATGGATGATGGATGGATGGATGATGGATGGATGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53755	ATGGATGGATAGATGGATGGATGATGGATGGATGGATGATGGATGGATGG	53804

CU207386.8	951	ATGGATGGATAGATGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGATAATGGATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53805	ATGGATGGATAGATGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGATAATGGATG	53854

CU207386.8	1001	ATGGATGGATTGACGATGGGTGGATGATGAATGATGGATGGATGGATGGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53855	ATGGATGGATTGACGATGGGTGGATGATGAATGATGGATGGATGGATGGA	53904

CU207386.8	1051	TGACAGATGGATGGATGGATGGATGATGAATGATGGATGGACGGACGATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53905	TGACAGATGGATGGATGGATGGATGATGAATGATGGATGGACGGACGATG	53954

CU207386.8	1101	GATAGAAGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	53955	GATAGAAGGATGGATGGATAGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGA	54004

CU207386.8	1151	TGGATGGATGTTGGATGGCTGATGGATGGATGTTGAATGATAGATGGATG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54005	TGGATGGATGTTGGATGGCTGATGGATGGATGTTGAATGATAGATGGATG	54054

CU207386.8	1201	ATGAATGATGGATAGATGATGGATGGATGGATGATGGATAGATTGATAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54055	ATGAATGATGGATAGATGATGGATGGATGGATGATGGATAGATTGATAAT	54104

CU207386.8	1251	TGGTGGATGCATGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGATGGAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54105	TGGTGGATGCATGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGATGGAT	54154

CU207386.8	1301	AGATGGATGGATGATGGATGGTGGATGGATGAAAGGCCGAGTGAATGTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54155	AGATGGATGGATGATGGATGGTGGATGGATGAAAGGCCGAGTGAATGTTT	54204

CU207386.8	1351	CCCCCAAACCCTGGCCTTGTCTGTGGTAGTTTCAGTAAATTAGCAAATGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54205	CCCCCAAACCCTGGCCTTGTCTGTGGTAGTTTCAGTAAATTAGCAAATGG	54254

CU207386.8	1401	ATGTAGCACAGAGGACTCAAAAAAGCTTGGCAGGTTTATCTTTAGCCATC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54255	ATGTAGCACAGAGGACTCAAAAAAGCTTGGCAGGTTTATCTTTAGCCATC	54304

CU207386.8	1451	CTCAGTTGTCCTAAGTTGTTTGAAAGGTTGCCCAAGGCCTGCAGATCTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54305	CTCAGTTGTCCTAAGTTGTTTGAAAGGTTGCCCAAGGCCTGCAGATCTAT	54354

CU207386.8	1501	TTAAAGGGATGTTTTGTTTCCTGGACATTTCTAGAAGACAATGAATTCAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54355	TTAAAGGGATGTTTTGTTTCCTGGACATTTCTAGAAGACAATGAATTCAT	54404

CU207386.8	1551	TTAACAGATGAAAACCTGACACTTGGAAAGAGGGACAAGGACTCTGCAAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54405	TTAACAGATGAAAACCTGACACTTGGAAAGAGGGACAAGGACTCTGCAAG	54454

CU207386.8	1601	ATCACAGGAAGTGTCAGGAGACTCAAGATGAGAAGCCAGCTGGCTTGATC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54455	ATCACAGGAAGTGTCAGGAGACTCAAGATGAGAAGCCAGCTGGCTTGATC	54504

CU207386.8	1651	TGGCTAGCTTGTGTCTGACGCTCTTGGCAGGTGCACACAGAGCCGGCTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54505	TGGCTAGCTTGTGTCTGACGCTCTTGGCAGGTGCACACAGAGCCGGCTGT	54554

CU207386.8	1701	CCATCAGAAAAGCGGCGCCATTTTTCTGGTCATGCTGGAACAATAATAGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54555	CCATCAGAAAAGCGGCGCCATTTTTCTGGTCATGCTGGAACAATAATAGC	54604

CU207386.8	1751	AAAATAAGGGTCCTGGAGGCCAGCCTGCTGTTAAGGTTTAATCTGAACCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54605	AAAATAAGGGTCCTGGAGGCCAGCCTGCTGTTAAGGTTTAATCTGAACCA	54654

CU207386.8	1801	CGCCAAGGGCTTATGCTCTGAACGCTGAATCCCCAGCCTGCAGCTTGATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54655	CGCCAAGGGCTTATGCTCTGAACGCTGAATCCCCAGCCTGCAGCTTGATC	54704

CU207386.8	1851	CTGAAAGCTGTGGAAACTCTGAAGGGGATCCTAGTTTGCAGAAATAAGCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54705	CTGAAAGCTGTGGAAACTCTGAAGGGGATCCTAGTTTGCAGAAATAAGCA	54754

CU207386.8	1901	ACTAGGGACAGGCTCATTACGGTCACTTTCCAGATGAGGAGACTGAATAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54755	ACTAGGGACAGGCTCATTACGGTCACTTTCCAGATGAGGAGACTGAATAC	54804

CU207386.8	1951	ACCTATGTGTATATGTCATGCATTTACTACTGGTCACAGGGTGGATAAAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210874.8	54805	ACCTATGTGTATATGTCATGCATTTACTACTGGTCACAGGGTGGATAAAG	54854

Overview

Query
CU207386.8 - 153575 bps
Hit
CU210874.8 - 54854 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link