<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207376.7	1	CAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAAACAAAAACAAACAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52377	CAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAAACAAAAACAAACAA	52426

CU207376.7	51	ACAAACAAAAAAACCCAACAGATTTTATTTTTATATGCACAAGTGTTTTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52427	ACAAACAAAAAAACCCAACAGATTTTATTTTTATATGCACAAGTGTTTTG	52476

CU207376.7	101	CCTGCATGCATATATGTGTACCACATGCATAACTATTTCCCACAAAGGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52477	CCTGCATGCATATATGTGTACCACATGCATAACTATTTCCCACAAAGGCC	52526

CU207376.7	151	AGAAAGGGACACTGAATATCCCGGAATCGAATACAGATAGAATTGAACCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52527	AGAAAGGGACACTGAATATCCCGGAATCGAATACAGATAGAATTGAACCC	52576

CU207376.7	201	AGGACCCCGGGAAAAGCAATCAGTGCTTTTAACAACTGAGCCATCTTTCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52577	AGGACCCCGGGAAAAGCAATCAGTGCTTTTAACAACTGAGCCATCTTTCC	52626

CU207376.7	251	AGCCCCTAACAATAAGTTTTAAAATTAAAAAAGAAAAATGTCGCCGGGCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52627	AGCCCCTAACAATAAGTTTTAAAATTAAAAAAGAAAAATGTCGCCGGGCA	52676

CU207376.7	301	GTGGTGGCGCATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52677	GTGGTGGCGCATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGG	52726

CU207376.7	351	ATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52727	ATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGC	52776

CU207376.7	401	CAGGGCTACAGAGAAACTCTGTCTCGAAAAACCAAAACCAAACCAAAACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52777	CAGGGCTACAGAGAAACTCTGTCTCGAAAAACCAAAACCAAACCAAAACA	52826

CU207376.7	451	AAACAAAAAATGTCATTCCCCCCCCCCCCCAATCCCAAATAAATACAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52827	AAACAAAAAATGTCATTCCCCCCCCCCCCCAATCCCAAATAAATACAAAA	52876

CU207376.7	501	AGCTGCTCAGAGGGCTGGTCCTTAGATGTTCGCTGAGCAGACTTCCCTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52877	AGCTGCTCAGAGGGCTGGTCCTTAGATGTTCGCTGAGCAGACTTCCCTGA	52926

CU207376.7	551	TTAAGTGTCTGAATGAATTTGCTCTTATGAACATAAAACAGCTGGGGTGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52927	TTAAGTGTCTGAATGAATTTGCTCTTATGAACATAAAACAGCTGGGGTGT	52976

CU207376.7	601	GGTAGCACACACCTTTAATCCTAGCTCTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGGAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	52977	GGTAGCACACACCTTTAATCCTAGCTCTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGGAT	53026

CU207376.7	651	TTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAATTCCAGGACAGCCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53027	TTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAATTCCAGGACAGCCA	53076

CU207376.7	701	GGGATACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAAATAAATAAACAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53077	GGGATACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAAAATAAATAAACAA	53126

CU207376.7	751	AACAACATAAAACAAACAGCTTCCCACAAACTTGTATGTGGAGATGGCTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53127	AACAACATAAAACAAACAGCTTCCCACAAACTTGTATGTGGAGATGGCTA	53176

CU207376.7	801	AATGGGAAACATTAAAGATTTGAGTGAAAAATCACTAATCCATAAAAAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53177	AATGGGAAACATTAAAGATTTGAGTGAAAAATCACTAATCCATAAAAAAA	53226

CU207376.7	851	TTCACATGAGGGACTGGCGAGATGGCTCAGTAGTTAAGAGCGCCGACTGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53227	TTCACATGAGGGACTGGCGAGATGGCTCAGTAGTTAAGAGCGCCGACTGC	53276

CU207376.7	901	TCTTCTGAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53277	TCTTCTGAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACA	53326

CU207376.7	951	ACCATCTGTAACGAAATCTGATGCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAGATAGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53327	ACCATCTGTAACGAAATCTGATGCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAGATAGC	53376

CU207376.7	1001	TACAGTGTACTTACATATAATAAATAAATAAATCTAAAAAGAAAAAAAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53377	TACAGTGTACTTACATATAATAAATAAATAAATCTAAAAAGAAAAAAAAT	53426

CU207376.7	1051	TCACATGAACATTCTATCAGCCTAAGGCAAGCGAGCTACAAATGGGTGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53427	TCACATGAACATTCTATCAGCCTAAGGCAAGCGAGCTACAAATGGGTGTG	53476

CU207376.7	1101	ACAGAGTTACTCAAAAGGTTGGATAGGGAAACAAAAATGTTGGATAGGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53477	ACAGAGTTACTCAAAAGGTTGGATAGGGAAACAAAAATGTTGGATAGGGA	53526

CU207376.7	1151	GGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTGCAGAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53527	GGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTGCAGAGG	53576

CU207376.7	1201	TCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCCCATGGTGGCTTATGACCATCTGTAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53577	TCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCCCATGGTGGCTTATGACCATCTGTAA	53626

CU207376.7	1251	TAGGAACCCGTGTCCGAAGACAGCTACAGTATACTCATATACATTAATTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53627	TAGGAACCCGTGTCCGAAGACAGCTACAGTATACTCATATACATTAATTA	53676

CU207376.7	1301	AATAAATAAATCTTTTTCAAAAAATAAGAGGTTGGGATAGGATTGATGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53677	AATAAATAAATCTTTTTCAAAAAATAAGAGGTTGGGATAGGATTGATGGA	53726

CU207376.7	1351	GCAGCCTTTGTGAGTCTCCAGAAGAGCTCTTCCCTTCTCAGCCTCCCAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53727	GCAGCCTTTGTGAGTCTCCAGAAGAGCTCTTCCCTTCTCAGCCTCCCAAG	53776

CU207376.7	1401	TCCAGTGGCGAACTAAAGGGGAACCACAACATGTGGCCCCACACTCTTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53777	TCCAGTGGCGAACTAAAGGGGAACCACAACATGTGGCCCCACACTCTTCA	53826

CU207376.7	1451	AAGTCTCATATCTGAAACTGGAAACTATAATCCAGAATAGGGCAGAAGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53827	AAGTCTCATATCTGAAACTGGAAACTATAATCCAGAATAGGGCAGAAGAG	53876

CU207376.7	1501	AGAGAGGCAAGGTCTCCTCACAGCTCACGAGAGAGACTGTTTTGAGCACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53877	AGAGAGGCAAGGTCTCCTCACAGCTCACGAGAGAGACTGTTTTGAGCACT	53926

CU207376.7	1551	CACAGGGAAGAGCTTCGACCCTGGGTCTCTGGAAGGTTTAATGGCAAACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53927	CACAGGGAAGAGCTTCGACCCTGGGTCTCTGGAAGGTTTAATGGCAAACA	53976

CU207376.7	1601	CGCTCTATATCCAGGCAGAACTGGAATGCATCACCACCAGACTGTGGGAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	53977	CGCTCTATATCCAGGCAGAACTGGAATGCATCACCACCAGACTGTGGGAC	54026

CU207376.7	1651	CAGGTTAAGGACTTGCTAGGCAGTTATCTCCCCCATTCCCTGAGGCAGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	54027	CAGGTTAAGGACTTGCTAGGCAGTTATCTCCCCCATTCCCTGAGGCAGAG	54076

CU207376.7	1701	GGTCAAAGAGCATCTCTCGTTGGAGGCCTGAAGCACTCAGTCCTCTTACT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	54077	GGTCAAAGAGCATCTCTCGTTGGAGGCCTGAAGCACTCAGTCCTCTTACT	54126

CU207376.7	1751	ACACCAGTTACCCAGGACAGCATCCGGAACACCTCACCTCATAGTCTTTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	54127	ACACCAGTTACCCAGGACAGCATCCGGAACACCTCACCTCATAGTCTTTC	54176

CU207376.7	1801	CTTGGAAGAATCTCATCCTCTTCTTCCTGTGTCTCCCCAAGGATGGTCTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	54177	CTTGGAAGAATCTCATCCTCTTCTTCCTGTGTCTCCCCAAGGATGGTCTA	54226

CU207376.7	1851	GAAAAACAGATTCACAGAATGGAGATCATTTAATGGGTTAAGGGTACAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	54227	GAAAAACAGATTCACAGAATGGAGATCATTTAATGGGTTAAGGGTACAAG	54276

CU207376.7	1901	GAGGGTAGTATTATTAAAATCGAAATTAGCTAGAGCCATCTTCAAAGAGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	54277	GAGGGTAGTATTATTAAAATCGAAATTAGCTAGAGCCATCTTCAAAGAGG	54326

CU207376.7	1951	AACAATATTTCAAAACCATGAGCTCTACATTTCTATTGATCGGCGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210867.6	54327	AACAATATTTCAAAACCATGAGCTCTACATTTCTATTGATCGGCGAATTC	54376

Overview

Query
CU207376.7 - 113283 bps
Hit
CU210867.6 - 54376 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link