<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207387.6	1	GTGGGACAGGAGGTAAAACGTAGGCCTAAGGAGACACCTTGAGCCCCACT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189453	GTGGGACAGGAGGTAAAACGTAGGCCTAAGGAGACACCTTGAGCCCCACT	189502

CU207387.6	51	TTGTCTACTGACTGGGCCACAGGCCAGTGACTGAGGTTCCCTGGCCTAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189503	TTGTCTACTGACTGGGCCACAGGCCAGTGACTGAGGTTCCCTGGCCTAGA	189552

CU207387.6	101	GGGTGACTGGGCTGGTGTCTGGGGTTCAGGTGTGTTTTGCCCTCCTTAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189553	GGGTGACTGGGCTGGTGTCTGGGGTTCAGGTGTGTTTTGCCCTCCTTAGA	189602

CU207387.6	151	AAAGGATCTTGTAAGCGAAGCCAGCAAAAGATGATGCTTTTAGATTTAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189603	AAAGGATCTTGTAAGCGAAGCCAGCAAAAGATGATGCTTTTAGATTTAGG	189652

CU207387.6	201	GTGTATTGGCTTAGAATATGTGTCCTTAGTAGGTTAGCATCCCCTCCATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189653	GTGTATTGGCTTAGAATATGTGTCCTTAGTAGGTTAGCATCCCCTCCATT	189702

CU207387.6	251	GACTGGGAAGCAACTACTTCCCAAGGCACTCCCAAGTGACTTGAGTTTAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189703	GACTGGGAAGCAACTACTTCCCAAGGCACTCCCAAGTGACTTGAGTTTAG	189752

CU207387.6	301	GCAGCCCTTTTTTTGGTTTTGTTTTGTTTTGGTCATTGTCTGTTTTTGTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189753	GCAGCCCTTTTTTTGGTTTTGTTTTGTTTTGGTCATTGTCTGTTTTTGTT	189802

CU207387.6	351	ATAGATCAGCAACCGCTGGAAGCTGGCCAGCCAGGTCCAGGTCCAGAAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189803	ATAGATCAGCAACCGCTGGAAGCTGGCCAGCCAGGTCCAGGTCCAGAAAG	189852

CU207387.6	401	AACCTAAAGAAGCAACCAAGAAGAAGGTAGCTGAGCAAACAGGTAGCGTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189853	AACCTAAAGAAGCAACCAAGAAGAAGGTAGCTGAGCAAACAGGTAGCGTT	189902

CU207387.6	451	CGCAATCTTGTAAATGCAGGGTCTCTGAAGGGACAGCCCCAGCACATTAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189903	CGCAATCTTGTAAATGCAGGGTCTCTGAAGGGACAGCCCCAGCACATTAG	189952

CU207387.6	501	TCAGATGGAGGATGTTGAATGACGGTTGTCTAGTAGGGAGCCCCGCCCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	189953	TCAGATGGAGGATGTTGAATGACGGTTGTCTAGTAGGGAGCCCCGCCCTC	190002

CU207387.6	551	GCTGACGGACAGGGCAACGAGCAAAACGGGCCTAGCCCCAACCTGGCAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190003	GCTGACGGACAGGGCAACGAGCAAAACGGGCCTAGCCCCAACCTGGCAGA	190052

CU207387.6	601	TTTGAACTTGTCCTGGGCATGGTGCACACTCACTGCCTGTGTGCTCTGCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190053	TTTGAACTTGTCCTGGGCATGGTGCACACTCACTGCCTGTGTGCTCTGCC	190102

CU207387.6	651	CCTGTAACACAGCACTTCTGCATGTGGAGAAAGAAGAGCTCTGGACGAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190103	CCTGTAACACAGCACTTCTGCATGTGGAGAAAGAAGAGCTCTGGACGAGA	190152

CU207387.6	701	GAAAAGGCAGGCTAGGTCACCTGAACTGAAGAGGCTGGGACAGATCCAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190153	GAAAAGGCAGGCTAGGTCACCTGAACTGAAGAGGCTGGGACAGATCCAGG	190202

CU207387.6	751	GGGAGAGTGGACTGAAGCAGTCTAGGGTCCCAAGTGGTGACTGGCTGGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190203	GGGAGAGTGGACTGAAGCAGTCTAGGGTCCCAAGTGGTGACTGGCTGGCA	190252

CU207387.6	801	TGCCCAAAGAAGGGCAAGGCAGGATTGTCCAGAGTACCTGGGGAAGAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190253	TGCCCAAAGAAGGGCAAGGCAGGATTGTCCAGAGTACCTGGGGAAGAGAG	190302

CU207387.6	851	GCAGACAAGCAAAAGGGGCCTCTCTGAGGACTGGCTGGTCTTTAGAGTAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190303	GCAGACAAGCAAAAGGGGCCTCTCTGAGGACTGGCTGGTCTTTAGAGTAA	190352

CU207387.6	901	CTTGGCAGGGCTCTGAGCAGAGGGAATCCAAGTGACAAAGTCAAAATAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190353	CTTGGCAGGGCTCTGAGCAGAGGGAATCCAAGTGACAAAGTCAAAATAGG	190402

CU207387.6	951	ACAGAGAGCCTGAGCCCAGCAGCTCAGCTGACATGACTGGTCTGCTGTCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190403	ACAGAGAGCCTGAGCCCAGCAGCTCAGCTGACATGACTGGTCTGCTGTCA	190452

CU207387.6	1001	TGTCAGACCCTAGACTCACCCTGTCTCAGAGCCAGTACTTGGTGCTAAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190453	TGTCAGACCCTAGACTCACCCTGTCTCAGAGCCAGTACTTGGTGCTAAGT	190502

CU207387.6	1051	CGCATGAAGCATGGGAAAGGAAGGTGTGGGGCGGCAGAGGGTCTGTCCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190503	CGCATGAAGCATGGGAAAGGAAGGTGTGGGGCGGCAGAGGGTCTGTCCTG	190552

CU207387.6	1101	AACATCTAGGAAGATGGGGTTGCTGGCTGTGAGAGAAACTCCATCTTTAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190553	AACATCTAGGAAGATGGGGTTGCTGGCTGTGAGAGAAACTCCATCTTTAA	190602

CU207387.6	1151	AAGAAGGCCTGACTCCTGGACGTCGACAGTGGGAGTTTCAGAGAAGCCAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190603	AAGAAGGCCTGACTCCTGGACGTCGACAGTGGGAGTTTCAGAGAAGCCAC	190652

CU207387.6	1201	TGGCCGTTTGGCCTGGCCTCCTGAGAGGCACAGGCAGGCAAGGCTATTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190653	TGGCCGTTTGGCCTGGCCTCCTGAGAGGCACAGGCAGGCAAGGCTATTGG	190702

CU207387.6	1251	TTAGAATCTGTAGGGGACAGGTGGGGAAGGGGCAGCAGTGCCGGCCCTCG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190703	TTAGAATCTGTAGGGGACAGGTGGGGAAGGGGCAGCAGTGCCGGCCCTCG	190752

CU207387.6	1301	TGCCCAGGTAGGGTGGACAGTGGCAGGAGTCTACAAATGGTTCTCTCTCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190753	TGCCCAGGTAGGGTGGACAGTGGCAGGAGTCTACAAATGGTTCTCTCTCA	190802

CU207387.6	1351	CAGCTGCCCGGGAGGAGGCGAAGGAGGAGGCTGCAGCCGGTGTGCTGGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190803	CAGCTGCCCGGGAGGAGGCGAAGGAGGAGGCTGCAGCCGGTGTGCTGGAA	190852

CU207387.6	1401	CAGGCTATCCCTGTGCGGCAGCAGGCCGCGGTACGTGCTCCCCTTCCCCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190853	CAGGCTATCCCTGTGCGGCAGCAGGCCGCGGTACGTGCTCCCCTTCCCCT	190902

CU207387.6	1451	TTCTAGAAACACACTCCTAGTCATGTACAGGGTTTCCCTGGACCACTGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190903	TTCTAGAAACACACTCCTAGTCATGTACAGGGTTTCCCTGGACCACTGTC	190952

CU207387.6	1501	AGGAGGCTCACTTTGCACCTCAGCTGATCTGGGTTTGTCAGTCGGCACCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	190953	AGGAGGCTCACTTTGCACCTCAGCTGATCTGGGTTTGTCAGTCGGCACCC	191002

CU207387.6	1551	ACCTCTCTTCTCCTCTAACTAGGTGATGTTAGAGTTCTCTTAGGATCTGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	191003	ACCTCTCTTCTCCTCTAACTAGGTGATGTTAGAGTTCTCTTAGGATCTGT	191052

CU207387.6	1601	GTCTGGTAAACCCTCTTAGCACTGGGCCGTGGTCTGTCAGAGGACAAAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	191053	GTCTGGTAAACCCTCTTAGCACTGGGCCGTGGTCTGTCAGAGGACAAAGC	191102

CU207387.6	1651	ACAGGGACGCTGCTGTGTCCCAGTCTGCCCTAGAGAAGTCTTTGTTCTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	191103	ACAGGGACGCTGCTGTGTCCCAGTCTGCCCTAGAGAAGTCTTTGTTCTGT	191152

CU207387.6	1701	TTTGATGGTGGTGGAGGAGGCAGTGCTTTTGTTTTCTGAGACAGGATTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	191153	TTTGATGGTGGTGGAGGAGGCAGTGCTTTTGTTTTCTGAGACAGGATTTT	191202

CU207387.6	1751	CTGTGTAGTTCTGGCTGTACTGGAATTCATTTGTAGGCCAGGCTGGCCTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	191203	CTGTGTAGTTCTGGCTGTACTGGAATTCATTTGTAGGCCAGGCTGGCCTC	191252

CU207387.6	1801	AAACTCAGAGATGCACCTGTCTCTGCCTCCCTTCTGCTAAAATTAAAGGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	191253	AAACTCAGAGATGCACCTGTCTCTGCCTCCCTTCTGCTAAAATTAAAGGT	191302

CU207387.6	1851	GTGTAACACCAAAGCCCTGCCCCTGCCCACCCTGATCCCTTTGTTCTTAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	191303	GTGTAACACCAAAGCCCTGCCCCTGCCCACCCTGATCCCTTTGTTCTTAC	191352

CU207387.6	1901	TACACTCAGTGCATTCCAAAACTCCCTTCTTAATCTTTGCCTTAAGTGGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	191353	TACACTCAGTGCATTCCAAAACTCCCTTCTTAATCTTTGCCTTAAGTGGC	191402

CU207387.6	1951	CTGAGAATATTATCATTAAGGAATCTTCTCCTGTGATTGCCCCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210865.6	191403	CTGAGAATATTATCATTAAGGAATCTTCTCCTGTGATTGCCCCTGAATTC	191452

Overview

Query
CU207387.6 - 40574 bps
Hit
CU210865.6 - 191452 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link