<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU407307.5	1	GGAAACAGCCATGCACTCCCATAATCCCCAGCACTCAAGAGCCTGAGAGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	132911	GGAAACAGCCATGCACTCCCATAATCCCCAGCACTCAAGAGCCTGAGAGC	132960

CU407307.5	51	TGAGAAAGGACCATTAGCTGAGCTAAATAATGCGTCTGAAGCCAGCCCGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	132961	TGAGAAAGGACCATTAGCTGAGCTAAATAATGCGTCTGAAGCCAGCCCGC	133010

CU407307.5	101	TCACCCCTCTCACCACCCCAAAAAAGTTTCCTATGACCAAGGTCTGTAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133011	TCACCCCTCTCACCACCCCAAAAAAGTTTCCTATGACCAAGGTCTGTAAG	133060

CU407307.5	151	TCAGCCTAGGAAACTGTGCCACCAGAGGCCGGTCTTTGGCAAGACACACC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133061	TCAGCCTAGGAAACTGTGCCACCAGAGGCCGGTCTTTGGCAAGACACACC	133110

CU407307.5	201	ATTGCCCAGCCCAAGGCTCCCAGATGAGAGTGCTGTTTAATCTCTAACCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133111	ATTGCCCAGCCCAAGGCTCCCAGATGAGAGTGCTGTTTAATCTCTAACCT	133160

CU407307.5	251	CCACAGTCAAGCAAACAACCCCTGCACTACTGGAGCAAACCCCTCCCACC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133161	CCACAGTCAAGCAAACAACCCCTGCACTACTGGAGCAAACCCCTCCCACC	133210

CU407307.5	301	TTGGGTGCCTGGTTCCATTAGGCCCCACCTCTGGCCTGGTACACTTTCTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133211	TTGGGTGCCTGGTTCCATTAGGCCCCACCTCTGGCCTGGTACACTTTCTC	133260

CU407307.5	351	TTTGTGACTTGGAACAGATATGCTACCAGGTTACAGTGAGATTCAGTTTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133261	TTTGTGACTTGGAACAGATATGCTACCAGGTTACAGTGAGATTCAGTTTC	133310

CU407307.5	401	CGCTCACTCTGGTCCGTAGAGCTCAAACCCCAGATCCTTCTCCAGGGGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133311	CGCTCACTCTGGTCCGTAGAGCTCAAACCCCAGATCCTTCTCCAGGGGCT	133360

CU407307.5	451	CCTGTACCCGAAACCTCAGCGTGTCTGGGGACTTATGCACACCCAGAGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133361	CCTGTACCCGAAACCTCAGCGTGTCTGGGGACTTATGCACACCCAGAGGG	133410

CU407307.5	501	CCCAGGTTAAGAGAGACACGGGCCCACCAAGTACTTCCCAGCACAGAGGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133411	CCCAGGTTAAGAGAGACACGGGCCCACCAAGTACTTCCCAGCACAGAGGT	133460

CU407307.5	551	CCACCCCATTTGATCTGCACTCCCCACCCTGGCTCTGTCTCGACCAGTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133461	CCACCCCATTTGATCTGCACTCCCCACCCTGGCTCTGTCTCGACCAGTTC	133510

CU407307.5	601	CCACTCGAACTGCTTCCTACAGACACACTGGCCTCTGAACAGGAGGGAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133511	CCACTCGAACTGCTTCCTACAGACACACTGGCCTCTGAACAGGAGGGAGA	133560

CU407307.5	651	GACACACACGAGCTCACAGGAACACCGGAAGTACACTATGGAGCTGTACC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133561	GACACACACGAGCTCACAGGAACACCGGAAGTACACTATGGAGCTGTACC	133610

CU407307.5	701	TGGCACGAAATAGCAGCAGGAGACTGACCACCAGGTGCCTGCCACACACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133611	TGGCACGAAATAGCAGCAGGAGACTGACCACCAGGTGCCTGCCACACACA	133660

CU407307.5	751	TCATGGTATCCCACAAGTGGGCTGCTCTACTATGGGGGCAGGTAGGGGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133661	TCATGGTATCCCACAAGTGGGCTGCTCTACTATGGGGGCAGGTAGGGGTG	133710

CU407307.5	801	TGTGTGTGTGTGCTGTAGCACATTAGATTATCATCTGTTCCCTACAAGTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133711	TGTGTGTGTGTGCTGTAGCACATTAGATTATCATCTGTTCCCTACAAGTG	133760

CU407307.5	851	TTTTTAGGGACAACTAGGAGGGAACGTGAACGGTTTAGGCATACCCATAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133761	TTTTTAGGGACAACTAGGAGGGAACGTGAACGGTTTAGGCATACCCATAC	133810

CU407307.5	901	CCAGCTGGCTCCAGAGCTGTGTGGCTTCTCAGGGCCTTCGAAGGGTCAGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133811	CCAGCTGGCTCCAGAGCTGTGTGGCTTCTCAGGGCCTTCGAAGGGTCAGT	133860

CU407307.5	951	TCTCCCCTGCCACCAGTGTGCAGGCACCAGAGGCGGGGCAGCCACTTTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133861	TCTCCCCTGCCACCAGTGTGCAGGCACCAGAGGCGGGGCAGCCACTTTCT	133910

CU407307.5	1001	GGGGCTCACTGCAGAGAGTTCCCTAGGGCCGGTCAGATTCCAAGAAGTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133911	GGGGCTCACTGCAGAGAGTTCCCTAGGGCCGGTCAGATTCCAAGAAGTCT	133960

CU407307.5	1051	TCTTGCTGCAGGGCCTAGTGATACATTTTATCTTGGTACTCAAGAGGCAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	133961	TCTTGCTGCAGGGCCTAGTGATACATTTTATCTTGGTACTCAAGAGGCAG	134010

CU407307.5	1101	ACCTCTGTGAGTAGAGTCAGCCTGGTCTACATATCAAGATCCAAACCAGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134011	ACCTCTGTGAGTAGAGTCAGCCTGGTCTACATATCAAGATCCAAACCAGC	134060

CU407307.5	1151	CAGGGCTACATAGAGAGATCATAACTAAAAAGGAAAGGAAAATGGCGGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134061	CAGGGCTACATAGAGAGATCATAACTAAAAAGGAAAGGAAAATGGCGGAT	134110

CU407307.5	1201	GGCAGGAAGATGGAAGATTGGGAGTTCAAGGCCATCGTCAGCTATGTGGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134111	GGCAGGAAGATGGAAGATTGGGAGTTCAAGGCCATCGTCAGCTATGTGGT	134160

CU407307.5	1251	AAAGTTTGAAGCCAACCTGATCAACTGGACACTGTCTCAACAAATTGAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134161	AAAGTTTGAAGCCAACCTGATCAACTGGACACTGTCTCAACAAATTGAGT	134210

CU407307.5	1301	TGTTTCTGCGGTGCTGGAGCCTGAGCTAGGGCTTGTGCCAAGACAGCACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134211	TGTTTCTGCGGTGCTGGAGCCTGAGCTAGGGCTTGTGCCAAGACAGCACT	134260

CU407307.5	1351	TAACTACTGGGCGGTGTCTTCAGACATTAATTTTTTTTTAACTTTGAAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134261	TAACTACTGGGCGGTGTCTTCAGACATTAATTTTTTTTTAACTTTGAAAT	134310

CU407307.5	1401	AAGATCGCCCCAAATCACCCAGGCTAGCCTTGACCTTACTCACACCCTGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134311	AAGATCGCCCCAAATCACCCAGGCTAGCCTTGACCTTACTCACACCCTGA	134360

CU407307.5	1451	ATGTGGCTAAAACCTTTATTGTTTTTATGTTTGTGAAATATAATATAAAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134361	ATGTGGCTAAAACCTTTATTGTTTTTATGTTTGTGAAATATAATATAAAC	134410

CU407307.5	1501	TCTTGTAGAGAACTGAGTAGGCAGAAGAGATAACTGGGCAAGGGAGAGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134411	TCTTGTAGAGAACTGAGTAGGCAGAAGAGATAACTGGGCAAGGGAGAGGG	134460

CU407307.5	1551	GATGGTTTTAAGTTGTATTTAAAACAAAATGGCTTTCACTCCTAGCTATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134461	GATGGTTTTAAGTTGTATTTAAAACAAAATGGCTTTCACTCCTAGCTATA	134510

CU407307.5	1601	TATCTGAAAGAACTGAAAACCACTCTCAAACCAGTTCTCTCTCTCTCTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134511	TATCTGAAAGAACTGAAAACCACTCTCAAACCAGTTCTCTCTCTCTCTCT	134560

CU407307.5	1651	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTCTCTTCTCTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134561	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTCTCTTCTCTCT	134610

CU407307.5	1701	TCTCTCTCTCTCACACACACACCCATCCTTGGGTGGGTGATCAGATGAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134611	TCTCTCTCTCTCACACACACACCCATCCTTGGGTGGGTGATCAGATGAAG	134660

CU407307.5	1751	TCTGGTCTAGATATCCACTAGAATGTCAACATAGCTCTTAAAAGGGAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134661	TCTGGTCTAGATATCCACTAGAATGTCAACATAGCTCTTAAAAGGGAAAA	134710

CU407307.5	1801	GCTAAGCGCGGCAGTGCATGCCTGTAAACCTAAGCAATTGAAAGGCAGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134711	GCTAAGCGCGGCAGTGCATGCCTGTAAACCTAAGCAATTGAAAGGCAGAG	134760

CU407307.5	1851	ACCGTCCAGGGCCAGCCTGGGCCACACGGTGAGATGTGTCACAAATAAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134761	ACCGTCCAGGGCCAGCCTGGGCCACACGGTGAGATGTGTCACAAATAAAT	134810

CU407307.5	1901	AAATAAATTCCAACACATGCTACAGCCTGCAGGACACAGTTCCGGTTGAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134811	AAATAAATTCCAACACATGCTACAGCCTGCAGGACACAGTTCCGGTTGAC	134860

CU407307.5	1951	ATAATCCAAGCACAAAGGACACGCATGGTATAAGGAACCCAGCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210846.9	134861	ATAATCCAAGCACAAAGGACACGCATGGTATAAGGAACCCAGCTGAATTC	134910

Overview

Query
CU407307.5 - 70955 bps
Hit
CU210846.9 - 134910 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link