<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU467499.7	1	TCAGGGAGGGTCAGGTCCAAGATGGAGCCAGGGAAAGTCACCCCACAGTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	180821	TCAGGGAGGGTCAGGTCCAAGATGGAGCCAGGGAAAGTCACCCCACAGTG	180870

CU467499.7	51	CCTCCCTTCCCTGCCCATCTCAGAACTAAGTTAGGGAGACGGGGCAGGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	180871	CCTCCCTTCCCTGCCCATCTCAGAACTAAGTTAGGGAGACGGGGCAGGAT	180920

CU467499.7	101	GCATGCCCAGGTGGTGCCTAGAACTCACAGGTGAGCAGACAGATTCTAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	180921	GCATGCCCAGGTGGTGCCTAGAACTCACAGGTGAGCAGACAGATTCTAGC	180970

CU467499.7	151	TGCTCCACAGAGACAAGCTGGCTCCCAGGACAGTCCTCTCAGCTTGCCCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	180971	TGCTCCACAGAGACAAGCTGGCTCCCAGGACAGTCCTCTCAGCTTGCCCC	181020

CU467499.7	201	GTTCTATTTCATGTAGAACATACCTGACCTGGCACTGTCTGCCCCTAAGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181021	GTTCTATTTCATGTAGAACATACCTGACCTGGCACTGTCTGCCCCTAAGG	181070

CU467499.7	251	GGTCCTTAGGTCTGGGAACAGCAGACTAGGAAGCAACCACGTAACCGTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181071	GGTCCTTAGGTCTGGGAACAGCAGACTAGGAAGCAACCACGTAACCGTGG	181120

CU467499.7	301	TGGGCTCCAACCGACAAGTCCCCGCCCGTGTCGCCCGTCCGTGCCGCCCG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181121	TGGGCTCCAACCGACAAGTCCCCGCCCGTGTCGCCCGTCCGTGCCGCCCG	181170

CU467499.7	351	TGCCGCCCAGGCTGAAGAGAAGCTGGTTTTCTCTTTTACCCGTGACGACA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181171	TGCCGCCCAGGCTGAAGAGAAGCTGGTTTTCTCTTTTACCCGTGACGACA	181220

CU467499.7	401	CCATCCTGAAGACAGCGTAGTCCCTCCCTGCCTTGCTGTTAAGGCCAGAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181221	CCATCCTGAAGACAGCGTAGTCCCTCCCTGCCTTGCTGTTAAGGCCAGAG	181270

CU467499.7	451	CATCACACCGGGGGCTGCTCTGATCTTGTTCCCTAGTTTTTCTTCCTGAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181271	CATCACACCGGGGGCTGCTCTGATCTTGTTCCCTAGTTTTTCTTCCTGAC	181320

CU467499.7	501	TCCGAGCTTGTCGCTGCGGGTACTCTTCCCCTTCCCAGGCAATGCCTCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181321	TCCGAGCTTGTCGCTGCGGGTACTCTTCCCCTTCCCAGGCAATGCCTCAG	181370

CU467499.7	551	ACAGCATATGACTGGACTTCCATGTCCCCAGCCAACTGGCAGCCACACTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181371	ACAGCATATGACTGGACTTCCATGTCCCCAGCCAACTGGCAGCCACACTC	181420

CU467499.7	601	CACTTTACTCTATGTCCCCACTGGGGTCCTGATGCCCATCTGCTGCCCTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181421	CACTTTACTCTATGTCCCCACTGGGGTCCTGATGCCCATCTGCTGCCCTC	181470

CU467499.7	651	TGAGAGCAGAATGTACACAGAGGGAGTGATCCAGGAGGCCCCAGCACTGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181471	TGAGAGCAGAATGTACACAGAGGGAGTGATCCAGGAGGCCCCAGCACTGA	181520

CU467499.7	701	GATGAAGGAGGCCCCCTGCCCCGACACCAGCTTATCCACATGCACGCAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181521	GATGAAGGAGGCCCCCTGCCCCGACACCAGCTTATCCACATGCACGCAGA	181570

CU467499.7	751	GACAGAGCCACACAGAGGTCAAGGTGCCAGCCAGTGCTGCCTCTTTACCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181571	GACAGAGCCACACAGAGGTCAAGGTGCCAGCCAGTGCTGCCTCTTTACCT	181620

CU467499.7	801	GCACCCCTCCAGATGAGACGCAGTCACCGTAGCTCCAGGCCATCTCCTTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181621	GCACCCCTCCAGATGAGACGCAGTCACCGTAGCTCCAGGCCATCTCCTTC	181670

CU467499.7	851	CTCTGCTGTTGCTGCTTCCAGACTCCCCTCCCCACCCCCGCTGAATCAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181671	CTCTGCTGTTGCTGCTTCCAGACTCCCCTCCCCACCCCCGCTGAATCAGA	181720

CU467499.7	901	GCTTGACTAGAAAGTGACCACTGTGCAAACCGATTTAATCCTTTTTGAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181721	GCTTGACTAGAAAGTGACCACTGTGCAAACCGATTTAATCCTTTTTGAAA	181770

CU467499.7	951	GATAATCTTATTCCGATCTAGCCCTGGGGAACAGAGCTATCTTAGACCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181771	GATAATCTTATTCCGATCTAGCCCTGGGGAACAGAGCTATCTTAGACCTG	181820

CU467499.7	1001	GAAGATCAGCCTATGACAGCTGCCCAAGGTTCCTCCTCACAGGACTGAGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181821	GAAGATCAGCCTATGACAGCTGCCCAAGGTTCCTCCTCACAGGACTGAGG	181870

CU467499.7	1051	AGACAGTGCCAGATTCTGAGGCAACAGAGTCCCTCAGGACAAGGGTCCCG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181871	AGACAGTGCCAGATTCTGAGGCAACAGAGTCCCTCAGGACAAGGGTCCCG	181920

CU467499.7	1101	CTTGCTTAGCCATCCCCTGGCTAAACTGCTCTCCCCTGTGGCTCAGCCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181921	CTTGCTTAGCCATCCCCTGGCTAAACTGCTCTCCCCTGTGGCTCAGCCTA	181970

CU467499.7	1151	CACTGGGCAGGTAAAAGGTGCCTCGTTCCCTGTGATTCCAGACCCAGCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	181971	CACTGGGCAGGTAAAAGGTGCCTCGTTCCCTGTGATTCCAGACCCAGCTA	182020

CU467499.7	1201	GGTAACTTGGTACAGGTAGCTAGGAGCCTAGGCCCTCTGTTCCTTTGTCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182021	GGTAACTTGGTACAGGTAGCTAGGAGCCTAGGCCCTCTGTTCCTTTGTCC	182070

CU467499.7	1251	CCTCAGCTCATCTTCACGCCCACGGCCACCGTCGCTACTGTTCAGCCTGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182071	CCTCAGCTCATCTTCACGCCCACGGCCACCGTCGCTACTGTTCAGCCTGA	182120

CU467499.7	1301	GCTCTGCACTGGTTCCCCTGCTCGGCCCCCTACCCCTGCCCAGGTGAGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182121	GCTCTGCACTGGTTCCCCTGCTCGGCCCCCTACCCCTGCCCAGGTGAGGA	182170

CU467499.7	1351	CCCCGGGCTCGTGGGTGGGCAGGGGGGTGGGCAGCTCATAGAGGGGCAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182171	CCCCGGGCTCGTGGGTGGGCAGGGGGGTGGGCAGCTCATAGAGGGGCAGG	182220

CU467499.7	1401	GGTGCTGGCAGTGGTAGGACTCGTCTATGAAGCAATAAGAAAATGGACTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182221	GGTGCTGGCAGTGGTAGGACTCGTCTATGAAGCAATAAGAAAATGGACTC	182270

CU467499.7	1451	GCTCGTTACCATCCAGCTGGCCTCAGCACCTCTTGGCTCCTCTGAATATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182271	GCTCGTTACCATCCAGCTGGCCTCAGCACCTCTTGGCTCCTCTGAATATA	182320

CU467499.7	1501	GGTAGGCAGCAGAGAGCACCGTGAGCCAGCACTGAGGGGAGGGGATCAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182321	GGTAGGCAGCAGAGAGCACCGTGAGCCAGCACTGAGGGGAGGGGATCAGA	182370

CU467499.7	1551	GGCAGGGGCATACGGAGAGAGGGAACGGCATGGGTGCTGGCCTCCGGCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182371	GGCAGGGGCATACGGAGAGAGGGAACGGCATGGGTGCTGGCCTCCGGCCT	182420

CU467499.7	1601	TCTGCTACAGCACAGAGGAGCTATTCTGTGTGAGAAGTCTGTGGGAACCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182421	TCTGCTACAGCACAGAGGAGCTATTCTGTGTGAGAAGTCTGTGGGAACCT	182470

CU467499.7	1651	GAGAACGGACCTCTTACTCAGTCTGTCTTCCTACGCCATCTCCAGAAGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182471	GAGAACGGACCTCTTACTCAGTCTGTCTTCCTACGCCATCTCCAGAAGGG	182520

CU467499.7	1701	GGACCCAAGCTCGAGGATGGAGAAGCTAGGTTATGAGTCCGGCACTGCCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182521	GGACCCAAGCTCGAGGATGGAGAAGCTAGGTTATGAGTCCGGCACTGCCC	182570

CU467499.7	1751	CCCATTGTCCAGCAGAGGGCAGCAGGGACCAGGCTGAGTAAGCATGCGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182571	CCCATTGTCCAGCAGAGGGCAGCAGGGACCAGGCTGAGTAAGCATGCGGC	182620

CU467499.7	1801	TGTCTTGGAAACGACCTGGCGTTAACCTGATTGTGAGGACAAGCTGAGCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182621	TGTCTTGGAAACGACCTGGCGTTAACCTGATTGTGAGGACAAGCTGAGCC	182670

CU467499.7	1851	TCTGCTTTGCCTGTCAGTCTTGTCCTGTTTTTTTCCATACCATGCTTTGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182671	TCTGCTTTGCCTGTCAGTCTTGTCCTGTTTTTTTCCATACCATGCTTTGC	182720

CU467499.7	1901	CGCAGTAGGATGCAACGAATCCCGATAGTGTCAGGGGTGGGGAACGAAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182721	CGCAGTAGGATGCAACGAATCCCGATAGTGTCAGGGGTGGGGAACGAAAG	182770

CU467499.7	1951	GCGCTGGCTTCCCTGCCCCTGTCTGCCCCAGCCGGGCAGCCCCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU210837.8	182771	GCGCTGGCTTCCCTGCCCCTGTCTGCCCCAGCCGGGCAGCCCCAGAATTC	182820

Overview

Query
CU467499.7 - 133907 bps
Hit
CU210837.8 - 182820 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link