<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
C CU463837.8 2000 GAATTCTCAGCACACTGCAGACACCAGTGACTGCAGATGCTCAGTGACAG 1951 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1 GAATTCTCAGCACACTGCAGACACCAGTGACTGCAGATGCTCAGTGACAG 50 C CU463837.8 1950 CCTTTGATTTTTGTCTTGCATATAGCCATGAATTTGTGGTGGTCCAAATG 1901 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 51 CCTTTGATTTTTGTCTTGCATATAGCCATGAATTTGTGGTGGTCCAAATG 100 C CU463837.8 1900 AGAAAAAGTCCCCCAAAGGCTCGGGCATTTAAATGCTTGGTCCCCAGTAG 1851 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 101 AGAAAAAGTCCCCCAAAGGCTCGGGCATTTAAATGCTTGGTCCCCAGTAG 150 C CU463837.8 1850 GTGGCGCTGTTTGAGAAGGTTTAGAAGGCAAAGTCTTGCTGGAGGAAATG 1801 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 151 GTGGCGCTGTTTGAGAAGGTTTAGAAGGCAAAGTCTTGCTGGAGGAAATG 200 C CU463837.8 1800 TGGGTGGGGAGGGGGCACCTCACTTTTCCTCCAGCCCACCCTTACTGCTT 1751 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 201 TGGGTGGGGAGGGGGCACCTCACTTTTCCTCCAGCCCACCCTTACTGCTT 250 C CU463837.8 1750 TGTGCTGTTGTTAAAGATGTGATCTCTCAGCTTCCTGCTCCTGCTGCCAT 1701 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 251 TGTGCTGTTGTTAAAGATGTGATCTCTCAGCTTCCTGCTCCTGCTGCCAT 300 C CU463837.8 1700 GCCACGAAGAAGTTGCTCTGGGTCATGGTGTTTTATCACAGTGACGGAAC 1651 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 301 GCCACGAAGAAGTTGCTCTGGGTCATGGTGTTTTATCACAGTGACGGAAC 350 C CU463837.8 1650 AGTAACTAACATGGCCTCTGCGTGGGCCTTTCCTTAAGGAATGCACTTGC 1601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 351 AGTAACTAACATGGCCTCTGCGTGGGCCTTTCCTTAAGGAATGCACTTGC 400 C CU463837.8 1600 CATTCCTAAGAGCCCCTGTACAGATCTATTCAGGTCCTGCAGGGACTCAC 1551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 401 CATTCCTAAGAGCCCCTGTACAGATCTATTCAGGTCCTGCAGGGACTCAC 450 C CU463837.8 1550 TGGCATCATCTTAGTGAAACCAGGCTCTCATAACTAACTGTGACACGGCA 1501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 451 TGGCATCATCTTAGTGAAACCAGGCTCTCATAACTAACTGTGACACGGCA 500 C CU463837.8 1500 CATGGGATGTTCTCCCTGTGCGCTCTCAGGATGACGTCACACAGTAAGTG 1451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 501 CATGGGATGTTCTCCCTGTGCGCTCTCAGGATGACGTCACACAGTAAGTG 550 C CU463837.8 1450 ATGAGCTCAAGGAGAAAGAAGAGGGACTTGGAAGTAGACACACCTGCTTC 1401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 551 ATGAGCTCAAGGAGAAAGAAGAGGGACTTGGAAGTAGACACACCTGCTTC 600 C CU463837.8 1400 AGATTCTGGTAGTTTTATTCGCCGGTCACATGATCTTGGGTGACTCTCTC 1351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 601 AGATTCTGGTAGTTTTATTCGCCGGTCACATGATCTTGGGTGACTCTCTC 650 C CU463837.8 1350 AAACCACTCATTTCTCTACAGTGAAGACCTTACATGGTCATACCTGGTCA 1301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 651 AAACCACTCATTTCTCTACAGTGAAGACCTTACATGGTCATACCTGGTCA 700 C CU463837.8 1300 CTATGAGCTTGTTTCAACATCTGTGACAAGTCTCCATGCATCGGGGCCCA 1251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 701 CTATGAGCTTGTTTCAACATCTGTGACAAGTCTCCATGCATCGGGGCCCA 750 C CU463837.8 1250 TCTTCTCTGTGGCATTTCTTCTGCTGTGCTTGAATAGTCTCTGTCTGATG 1201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 751 TCTTCTCTGTGGCATTTCTTCTGCTGTGCTTGAATAGTCTCTGTCTGATG 800 C CU463837.8 1200 TGCTCACATCTGGAGAGGGGTCTTCCTGGCTTGAAGCAGCAGCAGCAAGT 1151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 801 TGCTCACATCTGGAGAGGGGTCTTCCTGGCTTGAAGCAGCAGCAGCAAGT 850 C CU463837.8 1150 GCAGTCTGGTGCATCGGACTGAACATGGTGGACTCTTCAAATGGCGACTC 1101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 851 GCAGTCTGGTGCATCGGACTGAACATGGTGGACTCTTCAAATGGCGACTC 900 C CU463837.8 1100 TGCTACATCCTCGTGCCCCCAAGTTCAGGGCTCTTCCCTCTTTGGTCTTT 1051 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 901 TGCTACATCCTCGTGCCCCCAAGTTCAGGGCTCTTCCCTCTTTGGTCTTT 950 C CU463837.8 1050 TGTGCACTGGGTTCGATTCTCATCCCCCATATCACAAATGAATGAATGAA 1001 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 951 TGTGCACTGGGTTCGATTCTCATCCCCCATATCACAAATGAATGAATGAA 1000 C CU463837.8 1000 TGAATGAATGAATGAATTAGTGAACAAATGATTTTTAGATAACTGGTTTA 951 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1001 TGAATGAATGAATGAATTAGTGAACAAATGATTTTTAGATAACTGGTTTA 1050 C CU463837.8 950 GTCTCTTATGTTTCCTTTGAATCAACATGTGTTTTATTAGCTTAAATTTA 901 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1051 GTCTCTTATGTTTCCTTTGAATCAACATGTGTTTTATTAGCTTAAATTTA 1100 C CU463837.8 900 TACCTTTTGGGTGTGATGGGAATGAGCAGTTTTACAAAAAAGAAAACCAC 851 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1101 TACCTTTTGGGTGTGATGGGAATGAGCAGTTTTACAAAAAAGAAAACCAC 1150 C CU463837.8 850 ATAGACACATGCACAGGTACACACACACACACACACACACACACACACAC 801 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1151 ATAGACACATGCACAGGTACACACACACACACACACACACACACACACAC 1200 C CU463837.8 800 TTTTCCCGTTTGTTGCTGATATGGGCACCGTGACCACAGAGCACCTTTGG 751 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1201 TTTTCCCGTTTGTTGCTGATATGGGCACCGTGACCACAGAGCACCTTTGG 1250 C CU463837.8 750 GCCCAGATTTTTTTGTAAGTGGTACTTTATTGCAGTGCCCAGCATTCTCC 701 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1251 GCCCAGATTTTTTTGTAAGTGGTACTTTATTGCAGTGCCCAGCATTCTCC 1300 C CU463837.8 700 AGTAGAAACAGTGAGAGCAAAGTTATAACCCGTCTTTTATTAATATCTTT 651 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1301 AGTAGAAACAGTGAGAGCAAAGTTATAACCCGTCTTTTATTAATATCTTT 1350 C CU463837.8 650 GAGACCTAGGGAACATTCTTGTCCTATTAGGACTCTGAAGAGCATCCAAA 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1351 GAGACCTAGGGAACATTCTTGTCCTATTAGGACTCTGAAGAGCATCCAAA 1400 C CU463837.8 600 GAAAGCATATAGTGCCTGTTGGGCTGCCATGGTTACCCGTGTTCAGCTTC 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1401 GAAAGCATATAGTGCCTGTTGGGCTGCCATGGTTACCCGTGTTCAGCTTC 1450 C CU463837.8 550 CCAAAATGAGAGGCAACACTAAACAGGACATGTTTCTCAGCCAAGTCTGG 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1451 CCAAAATGAGAGGCAACACTAAACAGGACATGTTTCTCAGCCAAGTCTGG 1500 C CU463837.8 500 GAGGTACCAGGCTTTCCTCCTCTGCGGAGTGTCTGTCTGTAGACTATGAC 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1501 GAGGTACCAGGCTTTCCTCCTCTGCGGAGTGTCTGTCTGTAGACTATGAC 1550 C CU463837.8 450 ACCATGGTCTGGGACAGAAATAGCCAAAGACTTATCTGTGTCAACTGAAT 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1551 ACCATGGTCTGGGACAGAAATAGCCAAAGACTTATCTGTGTCAACTGAAT 1600 C CU463837.8 400 CTAGTGGAGCTCCTAAAGGTACTCATAGCTGAGCCTGGGGGGTAAAAGAG 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1601 CTAGTGGAGCTCCTAAAGGTACTCATAGCTGAGCCTGGGGGGTAAAAGAG 1650 C CU463837.8 350 TCATAAGTTCAAAGCCAGTCTGGATAACACAATGAGACCCTGTCTCAAAA 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1651 TCATAAGTTCAAAGCCAGTCTGGATAACACAATGAGACCCTGTCTCAAAA 1700 C CU463837.8 300 TAGAAATTAAAAGAGATATAGCTAGTGTTAGATAGAGATGAGACAGAGAT 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1701 TAGAAATTAAAAGAGATATAGCTAGTGTTAGATAGAGATGAGACAGAGAT 1750 C CU463837.8 250 AGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAG 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1751 AGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAG 1800 C CU463837.8 200 AGATGATACAGAGACAGCCATAGAGACATAGCTCAAGGGCAGAGCACCTA 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1801 AGATGATACAGAGACAGCCATAGAGACATAGCTCAAGGGCAGAGCACCTA 1850 C CU463837.8 150 CCTAACTTGCTCAAAGCCCCGGGTTTGAGTCCCCATACCACAAAAAGGAA 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1851 CCTAACTTGCTCAAAGCCCCGGGTTTGAGTCCCCATACCACAAAAAGGAA 1900 C CU463837.8 100 GGAAGGAAGGAACAAATGATTTTTTTTTAGATTGTCATTTTCTTCTGAAG 51 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1901 GGAAGGAAGGAACAAATGATTTTTTTTTAGATTGTCATTTTCTTCTGAAG 1950 C CU463837.8 50 TCCCTGCCCATGAACTCTGTACTGTCACCAAGCCCTTTGACGGAGGGTGA 1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU207418.11 1951 TCCCTGCCCATGAACTCTGTACTGTCACCAAGCCCTTTGACGGAGGGTGA 2000