<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  CU463837.8	2000	GAATTCTCAGCACACTGCAGACACCAGTGACTGCAGATGCTCAGTGACAG	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1	GAATTCTCAGCACACTGCAGACACCAGTGACTGCAGATGCTCAGTGACAG	50

C  CU463837.8	1950	CCTTTGATTTTTGTCTTGCATATAGCCATGAATTTGTGGTGGTCCAAATG	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	51	CCTTTGATTTTTGTCTTGCATATAGCCATGAATTTGTGGTGGTCCAAATG	100

C  CU463837.8	1900	AGAAAAAGTCCCCCAAAGGCTCGGGCATTTAAATGCTTGGTCCCCAGTAG	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	101	AGAAAAAGTCCCCCAAAGGCTCGGGCATTTAAATGCTTGGTCCCCAGTAG	150

C  CU463837.8	1850	GTGGCGCTGTTTGAGAAGGTTTAGAAGGCAAAGTCTTGCTGGAGGAAATG	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	151	GTGGCGCTGTTTGAGAAGGTTTAGAAGGCAAAGTCTTGCTGGAGGAAATG	200

C  CU463837.8	1800	TGGGTGGGGAGGGGGCACCTCACTTTTCCTCCAGCCCACCCTTACTGCTT	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	201	TGGGTGGGGAGGGGGCACCTCACTTTTCCTCCAGCCCACCCTTACTGCTT	250

C  CU463837.8	1750	TGTGCTGTTGTTAAAGATGTGATCTCTCAGCTTCCTGCTCCTGCTGCCAT	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	251	TGTGCTGTTGTTAAAGATGTGATCTCTCAGCTTCCTGCTCCTGCTGCCAT	300

C  CU463837.8	1700	GCCACGAAGAAGTTGCTCTGGGTCATGGTGTTTTATCACAGTGACGGAAC	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	301	GCCACGAAGAAGTTGCTCTGGGTCATGGTGTTTTATCACAGTGACGGAAC	350

C  CU463837.8	1650	AGTAACTAACATGGCCTCTGCGTGGGCCTTTCCTTAAGGAATGCACTTGC	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	351	AGTAACTAACATGGCCTCTGCGTGGGCCTTTCCTTAAGGAATGCACTTGC	400

C  CU463837.8	1600	CATTCCTAAGAGCCCCTGTACAGATCTATTCAGGTCCTGCAGGGACTCAC	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	401	CATTCCTAAGAGCCCCTGTACAGATCTATTCAGGTCCTGCAGGGACTCAC	450

C  CU463837.8	1550	TGGCATCATCTTAGTGAAACCAGGCTCTCATAACTAACTGTGACACGGCA	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	451	TGGCATCATCTTAGTGAAACCAGGCTCTCATAACTAACTGTGACACGGCA	500

C  CU463837.8	1500	CATGGGATGTTCTCCCTGTGCGCTCTCAGGATGACGTCACACAGTAAGTG	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	501	CATGGGATGTTCTCCCTGTGCGCTCTCAGGATGACGTCACACAGTAAGTG	550

C  CU463837.8	1450	ATGAGCTCAAGGAGAAAGAAGAGGGACTTGGAAGTAGACACACCTGCTTC	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	551	ATGAGCTCAAGGAGAAAGAAGAGGGACTTGGAAGTAGACACACCTGCTTC	600

C  CU463837.8	1400	AGATTCTGGTAGTTTTATTCGCCGGTCACATGATCTTGGGTGACTCTCTC	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	601	AGATTCTGGTAGTTTTATTCGCCGGTCACATGATCTTGGGTGACTCTCTC	650

C  CU463837.8	1350	AAACCACTCATTTCTCTACAGTGAAGACCTTACATGGTCATACCTGGTCA	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	651	AAACCACTCATTTCTCTACAGTGAAGACCTTACATGGTCATACCTGGTCA	700

C  CU463837.8	1300	CTATGAGCTTGTTTCAACATCTGTGACAAGTCTCCATGCATCGGGGCCCA	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	701	CTATGAGCTTGTTTCAACATCTGTGACAAGTCTCCATGCATCGGGGCCCA	750

C  CU463837.8	1250	TCTTCTCTGTGGCATTTCTTCTGCTGTGCTTGAATAGTCTCTGTCTGATG	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	751	TCTTCTCTGTGGCATTTCTTCTGCTGTGCTTGAATAGTCTCTGTCTGATG	800

C  CU463837.8	1200	TGCTCACATCTGGAGAGGGGTCTTCCTGGCTTGAAGCAGCAGCAGCAAGT	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	801	TGCTCACATCTGGAGAGGGGTCTTCCTGGCTTGAAGCAGCAGCAGCAAGT	850

C  CU463837.8	1150	GCAGTCTGGTGCATCGGACTGAACATGGTGGACTCTTCAAATGGCGACTC	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	851	GCAGTCTGGTGCATCGGACTGAACATGGTGGACTCTTCAAATGGCGACTC	900

C  CU463837.8	1100	TGCTACATCCTCGTGCCCCCAAGTTCAGGGCTCTTCCCTCTTTGGTCTTT	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	901	TGCTACATCCTCGTGCCCCCAAGTTCAGGGCTCTTCCCTCTTTGGTCTTT	950

C  CU463837.8	1050	TGTGCACTGGGTTCGATTCTCATCCCCCATATCACAAATGAATGAATGAA	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	951	TGTGCACTGGGTTCGATTCTCATCCCCCATATCACAAATGAATGAATGAA	1000

C  CU463837.8	1000	TGAATGAATGAATGAATTAGTGAACAAATGATTTTTAGATAACTGGTTTA	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1001	TGAATGAATGAATGAATTAGTGAACAAATGATTTTTAGATAACTGGTTTA	1050

C  CU463837.8	950	GTCTCTTATGTTTCCTTTGAATCAACATGTGTTTTATTAGCTTAAATTTA	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1051	GTCTCTTATGTTTCCTTTGAATCAACATGTGTTTTATTAGCTTAAATTTA	1100

C  CU463837.8	900	TACCTTTTGGGTGTGATGGGAATGAGCAGTTTTACAAAAAAGAAAACCAC	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1101	TACCTTTTGGGTGTGATGGGAATGAGCAGTTTTACAAAAAAGAAAACCAC	1150

C  CU463837.8	850	ATAGACACATGCACAGGTACACACACACACACACACACACACACACACAC	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1151	ATAGACACATGCACAGGTACACACACACACACACACACACACACACACAC	1200

C  CU463837.8	800	TTTTCCCGTTTGTTGCTGATATGGGCACCGTGACCACAGAGCACCTTTGG	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1201	TTTTCCCGTTTGTTGCTGATATGGGCACCGTGACCACAGAGCACCTTTGG	1250

C  CU463837.8	750	GCCCAGATTTTTTTGTAAGTGGTACTTTATTGCAGTGCCCAGCATTCTCC	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1251	GCCCAGATTTTTTTGTAAGTGGTACTTTATTGCAGTGCCCAGCATTCTCC	1300

C  CU463837.8	700	AGTAGAAACAGTGAGAGCAAAGTTATAACCCGTCTTTTATTAATATCTTT	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1301	AGTAGAAACAGTGAGAGCAAAGTTATAACCCGTCTTTTATTAATATCTTT	1350

C  CU463837.8	650	GAGACCTAGGGAACATTCTTGTCCTATTAGGACTCTGAAGAGCATCCAAA	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1351	GAGACCTAGGGAACATTCTTGTCCTATTAGGACTCTGAAGAGCATCCAAA	1400

C  CU463837.8	600	GAAAGCATATAGTGCCTGTTGGGCTGCCATGGTTACCCGTGTTCAGCTTC	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1401	GAAAGCATATAGTGCCTGTTGGGCTGCCATGGTTACCCGTGTTCAGCTTC	1450

C  CU463837.8	550	CCAAAATGAGAGGCAACACTAAACAGGACATGTTTCTCAGCCAAGTCTGG	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1451	CCAAAATGAGAGGCAACACTAAACAGGACATGTTTCTCAGCCAAGTCTGG	1500

C  CU463837.8	500	GAGGTACCAGGCTTTCCTCCTCTGCGGAGTGTCTGTCTGTAGACTATGAC	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1501	GAGGTACCAGGCTTTCCTCCTCTGCGGAGTGTCTGTCTGTAGACTATGAC	1550

C  CU463837.8	450	ACCATGGTCTGGGACAGAAATAGCCAAAGACTTATCTGTGTCAACTGAAT	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1551	ACCATGGTCTGGGACAGAAATAGCCAAAGACTTATCTGTGTCAACTGAAT	1600

C  CU463837.8	400	CTAGTGGAGCTCCTAAAGGTACTCATAGCTGAGCCTGGGGGGTAAAAGAG	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1601	CTAGTGGAGCTCCTAAAGGTACTCATAGCTGAGCCTGGGGGGTAAAAGAG	1650

C  CU463837.8	350	TCATAAGTTCAAAGCCAGTCTGGATAACACAATGAGACCCTGTCTCAAAA	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1651	TCATAAGTTCAAAGCCAGTCTGGATAACACAATGAGACCCTGTCTCAAAA	1700

C  CU463837.8	300	TAGAAATTAAAAGAGATATAGCTAGTGTTAGATAGAGATGAGACAGAGAT	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1701	TAGAAATTAAAAGAGATATAGCTAGTGTTAGATAGAGATGAGACAGAGAT	1750

C  CU463837.8	250	AGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAG	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1751	AGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAGAGATAG	1800

C  CU463837.8	200	AGATGATACAGAGACAGCCATAGAGACATAGCTCAAGGGCAGAGCACCTA	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1801	AGATGATACAGAGACAGCCATAGAGACATAGCTCAAGGGCAGAGCACCTA	1850

C  CU463837.8	150	CCTAACTTGCTCAAAGCCCCGGGTTTGAGTCCCCATACCACAAAAAGGAA	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1851	CCTAACTTGCTCAAAGCCCCGGGTTTGAGTCCCCATACCACAAAAAGGAA	1900

C  CU463837.8	100	GGAAGGAAGGAACAAATGATTTTTTTTTAGATTGTCATTTTCTTCTGAAG	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1901	GGAAGGAAGGAACAAATGATTTTTTTTTAGATTGTCATTTTCTTCTGAAG	1950

C  CU463837.8	50	TCCCTGCCCATGAACTCTGTACTGTCACCAAGCCCTTTGACGGAGGGTGA	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU207418.11	1951	TCCCTGCCCATGAACTCTGTACTGTCACCAAGCCCTTTGACGGAGGGTGA	2000

Overview

Query
CU463837.8 - 109654 bps
Hit
CU207418.11 - 197391 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link