<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210838.16	1	ACGCCTAGAGTCTTGGTTCTACATTTGAGCTTTTCTTTGTCACTTACAAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155036	ACGCCTAGAGTCTTGGTTCTACATTTGAGCTTTTCTTTGTCACTTACAAC	155085

CU210838.16	51	TGACAGGGTCTGATTAAATAAACTTGAAACCCAGTGTCCTGGGAGAGGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155086	TGACAGGGTCTGATTAAATAAACTTGAAACCCAGTGTCCTGGGAGAGGTG	155135

CU210838.16	101	AACAAAACCCAGGTCACTCCAGATAGGGTGCCAACAACAGACCAGAGAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155136	AACAAAACCCAGGTCACTCCAGATAGGGTGCCAACAACAGACCAGAGAAA	155185

CU210838.16	151	GAATCCCACCCAAGCCTAGATTGGAGACCCAGTGAGTTTATTGGGTTTGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155186	GAATCCCACCCAAGCCTAGATTGGAGACCCAGTGAGTTTATTGGGTTTGC	155235

CU210838.16	201	TTACGGGAACTTATAATATTGTTAGTGATTCCAGATCAGCCACATCTCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155236	TTACGGGAACTTATAATATTGTTAGTGATTCCAGATCAGCCACATCTCCA	155285

CU210838.16	251	AAGTGTCTCACCCCAGCATGGATGGCAGTCTCTCCATAGCTGCATAGATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155286	AAGTGTCTCACCCCAGCATGGATGGCAGTCTCTCCATAGCTGCATAGATA	155335

CU210838.16	301	GGGCGCCTCCATCTCGATGAGGGTCTCCTGCAGGGAGTCTCAGCTGCTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155336	GGGCGCCTCCATCTCGATGAGGGTCTCCTGCAGGGAGTCTCAGCTGCTCA	155385

CU210838.16	351	GAGTAAGATGGTAGTGTCTGCCATGCCTGGGGGACTGTAGTCCACAATGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155386	GAGTAAGATGGTAGTGTCTGCCATGCCTGGGGGACTGTAGTCCACAATGA	155435

CU210838.16	401	TATCATCATAAAAATTTGAACAACCAGAGCCAAGCCAGAGTGCTTAGAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155436	TATCATCATAAAAATTTGAACAACCAGAGCCAAGCCAGAGTGCTTAGAAT	155485

CU210838.16	451	CATAAATTTGTTGTGTTCCAGAGATAAAGGCCAGAGCGATTAAACCTATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155486	CATAAATTTGTTGTGTTCCAGAGATAAAGGCCAGAGCGATTAAACCTATT	155535

CU210838.16	501	TGGGGGGGAACCTGGGAAGAGCTTTAGCTGTGCATGTGGAGAGCCAAACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155536	TGGGGGGGAACCTGGGAAGAGCTTTAGCTGTGCATGTGGAGAGCCAAACT	155585

CU210838.16	551	TGCCCTACTGCTGTTATTGCCGGGGCAGACTATCATCCCCTTGCACACAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155586	TGCCCTACTGCTGTTATTGCCGGGGCAGACTATCATCCCCTTGCACACAG	155635

CU210838.16	601	TTGGTGCTCAGTAAGTGCATGGATTGACTGACATGCCCTATAGGCAGCTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155636	TTGGTGCTCAGTAAGTGCATGGATTGACTGACATGCCCTATAGGCAGCTT	155685

CU210838.16	651	GGGCAGGAAGAATCCTAGGCAGAGTGACAGTGGGATTTGGGGGAAGAGCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155686	GGGCAGGAAGAATCCTAGGCAGAGTGACAGTGGGATTTGGGGGAAGAGCC	155735

CU210838.16	701	GGCAGAAAGCGAGATGTCGATTATCAGCCTAAGGGCTGGCTTTCCATGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155736	GGCAGAAAGCGAGATGTCGATTATCAGCCTAAGGGCTGGCTTTCCATGCA	155785

CU210838.16	751	ATGAATCCAAAAACCCAGAATGGAGATGAAGGCAGAATGGAGTGGCTGGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155786	ATGAATCCAAAAACCCAGAATGGAGATGAAGGCAGAATGGAGTGGCTGGC	155835

CU210838.16	801	AAGCTAGGCTCCTGCCTGCAAAGGCAGCTGAGGCCCTTGGGGACTATGTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155836	AAGCTAGGCTCCTGCCTGCAAAGGCAGCTGAGGCCCTTGGGGACTATGTT	155885

CU210838.16	851	TGGGTGGTGTGCTCCGGAGGGGTCCCTGCATTTCCTGCTCAGGGCTCAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155886	TGGGTGGTGTGCTCCGGAGGGGTCCCTGCATTTCCTGCTCAGGGCTCAGA	155935

CU210838.16	901	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTGTGTGTGTGCCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155936	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTGTGTGTGTGCCA	155985

CU210838.16	951	GGGATTCTGGGAATTCCATCTGGGGAGGTCTTGCAAATACTGACATTGAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	155986	GGGATTCTGGGAATTCCATCTGGGGAGGTCTTGCAAATACTGACATTGAC	156035

CU210838.16	1001	ATAGAACTCTCTATGTGCAGTATCTTTAAAATATGTCAGCCTGGGGCTTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156036	ATAGAACTCTCTATGTGCAGTATCTTTAAAATATGTCAGCCTGGGGCTTA	156085

CU210838.16	1051	CACAGAAGTCTCGTTCTCTCCTCTGGACCTTGTTTCTCAAAGTGCATCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156086	CACAGAAGTCTCGTTCTCTCCTCTGGACCTTGTTTCTCAAAGTGCATCCC	156135

CU210838.16	1101	ATGGACCAGCAACACCAGCAACCTGTAGGCATTTGTTAAAGTTCAAGGGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156136	ATGGACCAGCAACACCAGCAACCTGTAGGCATTTGTTAAAGTTCAAGGGC	156185

CU210838.16	1151	TGGGAAGATGGCTCAGTTGGTAAAGTGCTTGACACTTAAGCGTAAGGACG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156186	TGGGAAGATGGCTCAGTTGGTAAAGTGCTTGACACTTAAGCGTAAGGACG	156235

CU210838.16	1201	AGAGTTCCATCCCTGGTAGCTACATAAAAATTCTGGCGGTGCTCACTTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156236	AGAGTTCCATCCCTGGTAGCTACATAAAAATTCTGGCGGTGCTCACTTGG	156285

CU210838.16	1251	AATTTAAGTACAGGGAAGGAAGAGATAGGTGGATCCCTAAGGCTTGCTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156286	AATTTAAGTACAGGGAAGGAAGAGATAGGTGGATCCCTAAGGCTTGCTGG	156335

CU210838.16	1301	CCAGCCAACCTAGCCTAATTGATGAGCCCCAGGCCCAGTAAGAGACCCCG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156336	CCAGCCAACCTAGCCTAATTGATGAGCCCCAGGCCCAGTAAGAGACCCCG	156385

CU210838.16	1351	TCTCAAAAACCAAGGTGATTAGCTCCTAAGAACACATCCAAGGTTGTCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156386	TCTCAAAAACCAAGGTGATTAGCTCCTAAGAACACATCCAAGGTTGTCTT	156435

CU210838.16	1401	CTGGCCTCCCTATAGAACAGAGAACATGCTTTACACATACACACACGCAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156436	CTGGCCTCCCTATAGAACAGAGAACATGCTTTACACATACACACACGCAC	156485

CU210838.16	1451	ACGCACACGCGCACACGTACACACACGCACGCACACACACACACGCACGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156486	ACGCACACGCGCACACGTACACACACGCACGCACACACACACACGCACGC	156535

CU210838.16	1501	ACACGCACACACACGCACACACATACACACACACACACACACACGCATGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156536	ACACGCACACACACGCACACACATACACACACACACACACACACGCATGC	156585

CU210838.16	1551	ATGCATGCACAGATTTTAGACTTCTGGCCCCATTCATGTCAGCTGATCGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156586	ATGCATGCACAGATTTTAGACTTCTGGCCCCATTCATGTCAGCTGATCGT	156635

CU210838.16	1601	GGTTGTATTTTAGACTAGATTCTCCCACTCACTCTCAAGCTGGTTAGAGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156636	GGTTGTATTTTAGACTAGATTCTCCCACTCACTCTCAAGCTGGTTAGAGT	156685

CU210838.16	1651	CACTCTGGCCGATGTAGAAAACATTGTTGGCTGGATTCCCCGACCCTTAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156686	CACTCTGGCCGATGTAGAAAACATTGTTGGCTGGATTCCCCGACCCTTAA	156735

CU210838.16	1701	GGTTCTGACTCAGCTGCTCTGGGTGACAACCTGACATTAGGACCTCTGAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156736	GGTTCTGACTCAGCTGCTCTGGGTGACAACCTGACATTAGGACCTCTGAA	156785

CU210838.16	1751	ATTCTAGCAGGTGCTTCTCGTGTGCTTAAGTTAAAGACCATAGCTTGAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156786	ATTCTAGCAGGTGCTTCTCGTGTGCTTAAGTTAAAGACCATAGCTTGAAC	156835

CU210838.16	1801	TTCTTTGGGGTGTGCTCCCAAACATGGATGAATGGGGGTGACTCAGCCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156836	TTCTTTGGGGTGTGCTCCCAAACATGGATGAATGGGGGTGACTCAGCCTC	156885

CU210838.16	1851	CCTTGCTGCAGCCCTGAGAGCCCAGGAGGGTGTGACTAGCTCCAGAGAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156886	CCTTGCTGCAGCCCTGAGAGCCCAGGAGGGTGTGACTAGCTCCAGAGAAA	156935

CU210838.16	1901	TACAGCCAGGTTCTCTCTGGGTGAGTATTGGGTAGCAGTTCCAAGGTGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156936	TACAGCCAGGTTCTCTCTGGGTGAGTATTGGGTAGCAGTTCCAAGGTGAG	156985

CU210838.16	1951	AGTCCCACGCTAGCCGTGCAGCTACCATGTAGCTCACTGGAGATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207417.13	156986	AGTCCCACGCTAGCCGTGCAGCTACCATGTAGCTCACTGGAGATGAATTC	157035

Overview

Query
CU210838.16 - 139002 bps
Hit
CU207417.13 - 157035 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link