<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207374.15	1	GAATCCTCACACAGGCCATCCCAGTCAACAGCAACAGGCTGTATTCTCCG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194016	GAATCCTCACACAGGCCATCCCAGTCAACAGCAACAGGCTGTATTCTCCG	194065

CU207374.15	51	CAGAGCTCAGCAAGGTCTACTAAATGCCAGACACTTGACTGTATGGCCAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194066	CAGAGCTCAGCAAGGTCTACTAAATGCCAGACACTTGACTGTATGGCCAG	194115

CU207374.15	101	AAAGTACCAGATTCTATACAGGATGAGAAGGCAGGGCAGATCCCAGGAAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194116	AAAGTACCAGATTCTATACAGGATGAGAAGGCAGGGCAGATCCCAGGAAC	194165

CU207374.15	151	TTCCATTAGCCACTGGAAGCCTTTGTTAGAGGAGAGATTAACCCGAGAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194166	TTCCATTAGCCACTGGAAGCCTTTGTTAGAGGAGAGATTAACCCGAGAGT	194215

CU207374.15	201	TCAAAAGTCAAATTTTGTTAAACAGTCAAAATGTGGAATACAGTCTGCCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194216	TCAAAAGTCAAATTTTGTTAAACAGTCAAAATGTGGAATACAGTCTGCCC	194265

CU207374.15	251	AGACAGCTCATTCTCCATACCCTGTCATTTCCAAGTGTAACTGAGCACAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194266	AGACAGCTCATTCTCCATACCCTGTCATTTCCAAGTGTAACTGAGCACAG	194315

CU207374.15	301	CAGACAGTACCTAGCAAATGGCAGGAGCTCAGTGAATGTGATACGCTGAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194316	CAGACAGTACCTAGCAAATGGCAGGAGCTCAGTGAATGTGATACGCTGAT	194365

CU207374.15	351	GAATGTGGGAGGACTCCCAGAGCATCCCAGAATGCTCAGCTCACTGGCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194366	GAATGTGGGAGGACTCCCAGAGCATCCCAGAATGCTCAGCTCACTGGCTC	194415

CU207374.15	401	GGGTGAAGCCCAACCACTTTCTTAAATTTTTTTTTTTTAATTTTAAAGGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194416	GGGTGAAGCCCAACCACTTTCTTAAATTTTTTTTTTTTAATTTTAAAGGC	194465

CU207374.15	451	TTGTTTGTTTATTTATTTGAGTACGCTGTCATCGGACACACCAAAAGAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194466	TTGTTTGTTTATTTATTTGAGTACGCTGTCATCGGACACACCAAAAGAGA	194515

CU207374.15	501	GCATCAGATCCCATTACAGGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194516	GCATCAGATCCCATTACAGGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAA	194565

CU207374.15	551	CTCAGGACCTTTGGAAGAACAGTCAGTGCTCTTAACCGTTGAGCCATCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194566	CTCAGGACCTTTGGAAGAACAGTCAGTGCTCTTAACCGTTGAGCCATCTC	194615

CU207374.15	601	TCCAGCCCCGCCCAGTCACTTTCTGTTGTTGCCTTTTTCTTCTTTTCAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194616	TCCAGCCCCGCCCAGTCACTTTCTGTTGTTGCCTTTTTCTTCTTTTCAGA	194665

CU207374.15	651	AGCTTAAGGTAGCCTCAAACTTGCTGTGGCAGTCAAGGATGACCTAGAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194666	AGCTTAAGGTAGCCTCAAACTTGCTGTGGCAGTCAAGGATGACCTAGAAT	194715

CU207374.15	701	GCATATATCAAACTCTCTCCTGTTCCATCTCTTTGAAAAGGCAGCCACAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194716	GCATATATCAAACTCTCTCCTGTTCCATCTCTTTGAAAAGGCAGCCACAG	194765

CU207374.15	751	GATGGTGTTATATATCAGATACTGTAAACTCAACAGCAAATGAACCAGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194766	GATGGTGTTATATATCAGATACTGTAAACTCAACAGCAAATGAACCAGGT	194815

CU207374.15	801	TAACAACTCAGATGAAAACATCAGCTTGGACTAACAACAACGAACAGTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194816	TAACAACTCAGATGAAAACATCAGCTTGGACTAACAACAACGAACAGTGT	194865

CU207374.15	851	AAATCAACGGAAGGCCGCACACGCAGTGGCCAGTGCGAGCTCTCAGAGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194866	AAATCAACGGAAGGCCGCACACGCAGTGGCCAGTGCGAGCTCTCAGAGGC	194915

CU207374.15	901	CGGGAGAGAAGGCATGCGACAGCCTGTGCTCTGAGCTGGGGCTAGGAAGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194916	CGGGAGAGAAGGCATGCGACAGCCTGTGCTCTGAGCTGGGGCTAGGAAGT	194965

CU207374.15	951	GATTTACATAAGCAGATGTTAAAGCCTTGATGGCAGGATTATTTATTTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	194966	GATTTACATAAGCAGATGTTAAAGCCTTGATGGCAGGATTATTTATTTAT	195015

CU207374.15	1001	CTATTTGTGAATCTAGGTCACAGATTTAGATTTCAGTTCGCTCTGAAACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195016	CTATTTGTGAATCTAGGTCACAGATTTAGATTTCAGTTCGCTCTGAAACA	195065

CU207374.15	1051	ACCTTGGGTCAAGTACATTACCACATACCCCAGGGCCCACTCTGAAACCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195066	ACCTTGGGTCAAGTACATTACCACATACCCCAGGGCCCACTCTGAAACCC	195115

CU207374.15	1101	ACCTGTATAGAACTTCATGAGGGACGGCACCAGCAGTTTGGTAGAGAGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195116	ACCTGTATAGAACTTCATGAGGGACGGCACCAGCAGTTTGGTAGAGAGAG	195165

CU207374.15	1151	GATGGTTCTCAATCATCTCAAAGAACTTCTGAGTTCTCGGCTGGACAGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195166	GATGGTTCTCAATCATCTCAAAGAACTTCTGAGTTCTCGGCTGGACAGAA	195215

CU207374.15	1201	GGGTTGGTCATAAACATGACCTCCACCAGCTTGGCCACTAGGTAAGGGTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195216	GGGTTGGTCATAAACATGACCTCCACCAGCTTGGCCACTAGGTAAGGGTT	195265

CU207374.15	1251	TCGGATGTAGTTCTGGTTGCACAGCATCACAACGAGGAACATGACAATGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195266	TCGGATGTAGTTCTGGTTGCACAGCATCACAACGAGGAACATGACAATGT	195315

CU207374.15	1301	CCTGAGTGCAGGGCTCATAAAGCACCTGAGGAGAGTATCTGTAAAGAGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195316	CCTGAGTGCAGGGCTCATAAAGCACCTGAGGAGAGTATCTGTAAAGAGGA	195365

CU207374.15	1351	GAAAACACATGGTGAGTCTCGGAGAGCTCGCTAGGCCGGGAAGGAGACAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195366	GAAAACACATGGTGAGTCTCGGAGAGCTCGCTAGGCCGGGAAGGAGACAG	195415

CU207374.15	1401	GGTCCAGCAGAGGGGGGTACTGGAATACATACACAGCAGAGGGGGGTACT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195416	GGTCCAGCAGAGGGGGGTACTGGAATACATACACAGCAGAGGGGGGTACT	195465

CU207374.15	1451	GGGGTACATACACAGCAGAGGGGGTACTGGGGTACACAGCAGAGGGGGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195466	GGGGTACATACACAGCAGAGGGGGTACTGGGGTACACAGCAGAGGGGGGT	195515

CU207374.15	1501	ACTGGAGTACATACACAGCAGAGGGGGTACTGGGGTACACAGCAGAGGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195516	ACTGGAGTACATACACAGCAGAGGGGGTACTGGGGTACACAGCAGAGGGG	195565

CU207374.15	1551	GTACTGGAGCGCACAGCAGAGGGGGGTACTGGGGCACACAGCAGAGGGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195566	GTACTGGAGCGCACAGCAGAGGGGGGTACTGGGGCACACAGCAGAGGGGG	195615

CU207374.15	1601	GTTCTGGAGTACATACACAGCAGAGGGGGGTACTGGAGTACATACACAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195616	GTTCTGGAGTACATACACAGCAGAGGGGGGTACTGGAGTACATACACAGC	195665

CU207374.15	1651	AGAGGGGGATACTGGGGCACACAGCAGAGGGGGAGTACTGGAGTGCCTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195666	AGAGGGGGATACTGGGGCACACAGCAGAGGGGGAGTACTGGAGTGCCTCT	195715

CU207374.15	1701	ACATGGTTCAACAATGTGCACACTGGAGCCACAAAGATTCAAAGCAAACC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195716	ACATGGTTCAACAATGTGCACACTGGAGCCACAAAGATTCAAAGCAAACC	195765

CU207374.15	1751	TGAGTGTTGGCTGCAATGTGTTTTAGAAAGTAAGCAAAAGCCATAACTGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195766	TGAGTGTTGGCTGCAATGTGTTTTAGAAAGTAAGCAAAAGCCATAACTGA	195815

CU207374.15	1801	AACTTCACAAAAAGATCTTCACTGTCCAAAAGTGGGGGTTTTATTTATTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195816	AACTTCACAAAAAGATCTTCACTGTCCAAAAGTGGGGGTTTTATTTATTT	195865

CU207374.15	1851	TAAAAGACAGGATCTTTTAAATAGCTTCAACTGTCCTCAAATTCACTATA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195866	TAAAAGACAGGATCTTTTAAATAGCTTCAACTGTCCTCAAATTCACTATA	195915

CU207374.15	1901	TGCTGGCTTTGAACGTGTTATCATTTGCCTCTACTTCCCAAATACTTATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195916	TGCTGGCTTTGAACGTGTTATCATTTGCCTCTACTTCCCAAATACTTATA	195965

CU207374.15	1951	TTATGGGAATGCATGACCATGCCCAGCTTCAGAATGGACAACCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207415.5	195966	TTATGGGAATGCATGACCATGCCCAGCTTCAGAATGGACAACCTGAATTC	196015

Overview

Query
CU207374.15 - 93138 bps
Hit
CU207415.5 - 196015 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link