<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210867.6	1	GTAGTTTAGGTTAGCCTGGGCTACGAGACCCTGTCTCAAAATATGTACAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	191878	GTAGTTTAGGTTAGCCTGGGCTACGAGACCCTGTCTCAAAATATGTACAG	191927

CU210867.6	51	TCCGTTAAACAGAGCATTCAGGAGGTAGGAACAGGCAGATCTCTGTGAGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	191928	TCCGTTAAACAGAGCATTCAGGAGGTAGGAACAGGCAGATCTCTGTGAGT	191977

CU210867.6	101	TCAAGATCAGCCTGGTCTACAAAATGAGTTCCAAGCCACCTAAGGACTAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	191978	TCAAGATCAGCCTGGTCTACAAAATGAGTTCCAAGCCACCTAAGGACTAC	192027

CU210867.6	151	ACAATAAAACCCTGTCTCAAACAAGCAACAACAAAATAAGTGGATGCTGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192028	ACAATAAAACCCTGTCTCAAACAAGCAACAACAAAATAAGTGGATGCTGA	192077

CU210867.6	201	AAGAGGGTGTCAGATCCCCTGGAACTGGAGTTATAAGTAATTGTGAGCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192078	AAGAGGGTGTCAGATCCCCTGGAACTGGAGTTATAAGTAATTGTGAGCCA	192127

CU210867.6	251	CCATGTGGGCACGGGAACCAAACCTAGGTCCTCTAGAAGAGCAACCAGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192128	CCATGTGGGCACGGGAACCAAACCTAGGTCCTCTAGAAGAGCAACCAGTG	192177

CU210867.6	301	CTCTAAAGCACCTCAGCCATCTTCCAGCACTGGGGATTATTTTTATTGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192178	CTCTAAAGCACCTCAGCCATCTTCCAGCACTGGGGATTATTTTTATTGTG	192227

CU210867.6	351	TTAGTTGAGAAGACCCACTGTGGGTGGCCCCGATCCATGGATGGGGTTCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192228	TTAGTTGAGAAGACCCACTGTGGGTGGCCCCGATCCATGGATGGGGTTCT	192277

CU210867.6	401	GGACTATATAAATGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192278	GGACTATATAAATGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	192327

CU210867.6	451	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAATTTACTGCTCTCTGCTTCCTGATTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192328	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAATTTACTGCTCTCTGCTTCCTGATTGT	192377

CU210867.6	501	GGGTGTTACATTACCAATGGCTTCAAGCTCCTGCCACACACAAGCCAGAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192378	GGGTGTTACATTACCAATGGCTTCAAGCTCCTGCCACACACAAGCCAGAT	192427

CU210867.6	551	GACAGGAATGGTGATAGAGATGTGGATAGTGGCTATCTCAGAGGAGAGAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192428	GACAGGAATGGTGATAGAGATGTGGATAGTGGCTATCTCAGAGGAGAGAT	192477

CU210867.6	601	AAGCTCTATCAGGAACTTGGCTGGGGGTCCTTTGTATGACCTGTTAGCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192478	AAGCTCTATCAGGAACTTGGCTGGGGGTCCTTTGTATGACCTGTTAGCCA	192527

CU210867.6	651	AGAATCTGGCTTTATTCTGCCTGTGTCCTGAGAATTTACTGAAACTGGAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192528	AGAATCTGGCTTTATTCTGCCTGTGTCCTGAGAATTTACTGAAACTGGAC	192577

CU210867.6	701	GTGGGGGTGGTAGGCTAATTGGTTTCTCAGAGGGAAATTGTGTGAGAAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192578	GTGGGGGTGGTAGGCTAATTGGTTTCTCAGAGGGAAATTGTGTGAGAAGG	192627

CU210867.6	751	ATTAGGATTAGGAGACAAATTCATGTGCAAGGAGAAGGGTTGAGCTAAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192628	ATTAGGATTAGGAGACAAATTCATGTGCAAGGAGAAGGGTTGAGCTAAGA	192677

CU210867.6	801	GTGGAGATGGAGGCATTCTCTGCCTCTCCTAAACAATTGCTTAGAAGAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192678	GTGGAGATGGAGGCATTCTCTGCCTCTCCTAAACAATTGCTTAGAAGAGA	192727

CU210867.6	851	GTGTGTGTTTCCCTTGGGTCAGAACACAGAATCTCATGCAAACATGGGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192728	GTGTGTGTTTCCCTTGGGTCAGAACACAGAATCTCATGCAAACATGGGTC	192777

CU210867.6	901	CGAGAGGCCCAGAAGCTTGCAGAAGAACCTAACAGCTTTCTCCAAATGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192778	CGAGAGGCCCAGAAGCTTGCAGAAGAACCTAACAGCTTTCTCCAAATGTG	192827

CU210867.6	951	ACTGGTTCTGGACTCATGATCTTCTAACTATCCCCTTTCTCCATCTCTGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192828	ACTGGTTCTGGACTCATGATCTTCTAACTATCCCCTTTCTCCATCTCTGC	192877

CU210867.6	1001	CTTAACCCACTGCCACTCCTGGTCATTGTCCTTGACCAATCTGACAGTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192878	CTTAACCCACTGCCACTCCTGGTCATTGTCCTTGACCAATCTGACAGTTG	192927

CU210867.6	1051	TTAGCACAGATTCTGCAGAAGGGATAGAGACATTGGGCGCACACCTGGGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192928	TTAGCACAGATTCTGCAGAAGGGATAGAGACATTGGGCGCACACCTGGGT	192977

CU210867.6	1101	GTATATGCCTCAGCTTCACTTCCTCAGAGTCTCAATTCTCATCTGAGTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	192978	GTATATGCCTCAGCTTCACTTCCTCAGAGTCTCAATTCTCATCTGAGTGG	193027

CU210867.6	1151	GAGGCTGGGTGCGTTGTGTGAGGGAGACGTCACTGTTGGCCGATCAGCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193028	GAGGCTGGGTGCGTTGTGTGAGGGAGACGTCACTGTTGGCCGATCAGCTA	193077

CU210867.6	1201	AGAGAGAGCTGGGGAGAGGCCTTTCCCACACGTCTGGAGTCTAGGCACAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193078	AGAGAGAGCTGGGGAGAGGCCTTTCCCACACGTCTGGAGTCTAGGCACAC	193127

CU210867.6	1251	TTTCTCTTCCACTCATGGTGGGGGAGGAGACTTTGGCACCCAGAGATGAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193128	TTTCTCTTCCACTCATGGTGGGGGAGGAGACTTTGGCACCCAGAGATGAT	193177

CU210867.6	1301	GCCCCAGATGGCATGGCTACGTGACCTCATCTTTGGGTCAGACTCAAAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193178	GCCCCAGATGGCATGGCTACGTGACCTCATCTTTGGGTCAGACTCAAAAT	193227

CU210867.6	1351	TCTATCCTAATCAGCTCTTCTTGTTAAGGGTCAGAAAGGAGGGTTGGAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193228	TCTATCCTAATCAGCTCTTCTTGTTAAGGGTCAGAAAGGAGGGTTGGAAT	193277

CU210867.6	1401	TCCAGAAGTTCCTTGTCATATCCCAGCTTTTAATCAGTTGACACTGGAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193278	TCCAGAAGTTCCTTGTCATATCCCAGCTTTTAATCAGTTGACACTGGAGA	193327

CU210867.6	1451	GTGAGCATCCTCAAGCTGAAATCTTCACAAGTTTTTGAGGGGGGTTGTTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193328	GTGAGCATCCTCAAGCTGAAATCTTCACAAGTTTTTGAGGGGGGTTGTTG	193377

CU210867.6	1501	GAAGGTGGGTATCAAAACCATTGTGTGGGCCACATAGCTCCTTCTGGCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193378	GAAGGTGGGTATCAAAACCATTGTGTGGGCCACATAGCTCCTTCTGGCCT	193427

CU210867.6	1551	GGAAATCGGTTGAGGAGAGAGCTTGAAAGTTGGTGTGAAGTACACGTGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193428	GGAAATCGGTTGAGGAGAGAGCTTGAAAGTTGGTGTGAAGTACACGTGTG	193477

CU210867.6	1601	GCGATCAGAACCACGGACAGCTACCAGAGTACCCGGAAGTAGTGCAGTCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193478	GCGATCAGAACCACGGACAGCTACCAGAGTACCCGGAAGTAGTGCAGTCC	193527

CU210867.6	1651	AGCTAGGTGCTGGGAAGCCAGGCCGGGCCTGGATTACAGGTTTGGAGGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193528	AGCTAGGTGCTGGGAAGCCAGGCCGGGCCTGGATTACAGGTTTGGAGGAC	193577

CU210867.6	1701	ACTCTCCCCGGGAGGCTGGTGATGGTGGGTGTTGTTTGGGAATGTTTTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193578	ACTCTCCCCGGGAGGCTGGTGATGGTGGGTGTTGTTTGGGAATGTTTTCC	193627

CU210867.6	1751	ATGAGTCACGCCATAAGCCCCACACTCGCCACAGGCTGGGAAAGCTGGGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193628	ATGAGTCACGCCATAAGCCCCACACTCGCCACAGGCTGGGAAAGCTGGGG	193677

CU210867.6	1801	CTCTCCCCGCCATTTCCAATAGGGGTGGGGCAGGGTGTCATAGGCCCTCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193678	CTCTCCCCGCCATTTCCAATAGGGGTGGGGCAGGGTGTCATAGGCCCTCA	193727

CU210867.6	1851	GCCTCTGCATGAAAGAAGGGAGCAGGAAGCAAGGACTGTTAGTGTGTTCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193728	GCCTCTGCATGAAAGAAGGGAGCAGGAAGCAAGGACTGTTAGTGTGTTCC	193777

CU210867.6	1901	GCACACCCCCACCCTAGCCCAGCCCATTTCTATACAAGGCCTGCTCTCCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193778	GCACACCCCCACCCTAGCCCAGCCCATTTCTATACAAGGCCTGCTCTCCA	193827

CU210867.6	1951	CAGCCTCCACCCACAATGAATACTCCACACAGGCACAGAGGGGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207406.7	193828	CAGCCTCCACCCACAATGAATACTCCACACAGGCACAGAGGGGTGAATTC	193877

Overview

Query
CU210867.6 - 54376 bps
Hit
CU207406.7 - 193877 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link