<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210848.9	1	CTTAGTTCCAATTGAGCTGTTGGCTATCTTGAGGATGTTACTGCTTTTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230273	CTTAGTTCCAATTGAGCTGTTGGCTATCTTGAGGATGTTACTGCTTTTGC	230322

CU210848.9	51	ACCCTTGGGTATATCTTGGTGTGGTGGTCCTTGTTGTTCTAGGCCTCACA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230323	ACCCTTGGGTATATCTTGGTGTGGTGGTCCTTGTTGTTCTAGGCCTCACA	230372

CU210848.9	101	GCTGGGTAGGACTATTGATAGATTCCCTCCCTTGGCAGTTTGCATAGCGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230373	GCTGGGTAGGACTATTGATAGATTCCCTCCCTTGGCAGTTTGCATAGCGA	230422

CU210848.9	151	CTTCAGATGAAAACTAGTCTTTAGAGAGGAGGAGTCCACGTTGGTCCCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230423	CTTCAGATGAAAACTAGTCTTTAGAGAGGAGGAGTCCACGTTGGTCCCAG	230472

CU210848.9	201	CTCAATTCCTCCAAGCCCTACGTCCAGAATATGTGCTATTCCCCAAGTCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230473	CTCAATTCCTCCAAGCCCTACGTCCAGAATATGTGCTATTCCCCAAGTCC	230522

CU210848.9	251	TTTTCTAATTACCCAAATCTACTACCACGTTTCCCTCTGGACACAAAAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230523	TTTTCTAATTACCCAAATCTACTACCACGTTTCCCTCTGGACACAAAAGA	230572

CU210848.9	301	GAGAGAACAGACATGTAAAACCATTGAAAATAAATGAGTACAGCAGCCTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230573	GAGAGAACAGACATGTAAAACCATTGAAAATAAATGAGTACAGCAGCCTT	230622

CU210848.9	351	GTTTTATCCACTCCGCCCCTTCTGAGTTATTTCCTCGGCGGTGAAAGCTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230623	GTTTTATCCACTCCGCCCCTTCTGAGTTATTTCCTCGGCGGTGAAAGCTA	230672

CU210848.9	401	ATTAACTAATTGTTTTTGTCTAGTTACTTTTAAGTGTTTATTTCACACAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230673	ATTAACTAATTGTTTTTGTCTAGTTACTTTTAAGTGTTTATTTCACACAG	230722

CU210848.9	451	GGTAGGTGAATATCAGCCTATTTGCAATAGATGAAGTTAAGTTTGAAGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230723	GGTAGGTGAATATCAGCCTATTTGCAATAGATGAAGTTAAGTTTGAAGGG	230772

CU210848.9	501	TTGAGTCACTTGTCTGAACTGTTCAGCTGGTGAGTATCAATCAGTTCAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230773	TTGAGTCACTTGTCTGAACTGTTCAGCTGGTGAGTATCAATCAGTTCAAG	230822

CU210848.9	551	CTTCAAAGTCCTGACCGAACGCCATATTCTCAGCTGGTCCACCATTCCGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230823	CTTCAAAGTCCTGACCGAACGCCATATTCTCAGCTGGTCCACCATTCCGC	230872

CU210848.9	601	TTTGAATGTTTCTCCTCTTCCTGGCACCGTAGCGGGTTGGGTTTTTCTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230873	TTTGAATGTTTCTCCTCTTCCTGGCACCGTAGCGGGTTGGGTTTTTCTTT	230922

CU210848.9	651	CCTTCCTTCCCACTCCCCATTTTTGCTCCTTCCTCTCCATCAGATAATTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230923	CCTTCCTTCCCACTCCCCATTTTTGCTCCTTCCTCTCCATCAGATAATTA	230972

CU210848.9	701	TAGAAACCAAAGGTAATGTTTCATTAAACTCTACCAGCTAAAAGGGTAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	230973	TAGAAACCAAAGGTAATGTTTCATTAAACTCTACCAGCTAAAAGGGTAAA	231022

CU210848.9	751	AACTAAGAATACCGACAGCACTAATGTCCTTTTCTCTCTCATGTGTTTGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231023	AACTAAGAATACCGACAGCACTAATGTCCTTTTCTCTCTCATGTGTTTGG	231072

CU210848.9	801	AAACGGACGTGTCAGTTTTACGATGGCCCAAGAGCTGAGCCAGCGTTCTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231073	AAACGGACGTGTCAGTTTTACGATGGCCCAAGAGCTGAGCCAGCGTTCTC	231122

CU210848.9	851	CCTTAGGCATTTTGCACAAGGCCTCCTCCAGGTTTAAATGGTGACAATAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231123	CCTTAGGCATTTTGCACAAGGCCTCCTCCAGGTTTAAATGGTGACAATAT	231172

CU210848.9	901	TTCTTGGACATCCTCAAAGATTCCAGGCATGGCAGAGAGCTTGCATTTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231173	TTCTTGGACATCCTCAAAGATTCCAGGCATGGCAGAGAGCTTGCATTTTA	231222

CU210848.9	951	TTAGAGAGCGGGTTCCTAATGGCTCGCCGCCTGCCAACAACAGCACCATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231223	TTAGAGAGCGGGTTCCTAATGGCTCGCCGCCTGCCAACAACAGCACCATC	231272

CU210848.9	1001	GGTGGTCCTCGGCAGCTGCAGCGGCAGGGCTTCCCGTTGCTGCCCCTCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231273	GGTGGTCCTCGGCAGCTGCAGCGGCAGGGCTTCCCGTTGCTGCCCCTCCC	231322

CU210848.9	1051	CCAATGACAGAGAGCAAGTGTCCAGAGGTGTCCACGATCAAGACTGTTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231323	CCAATGACAGAGAGCAAGTGTCCAGAGGTGTCCACGATCAAGACTGTTGT	231372

CU210848.9	1101	GCAAACAGGAATGAACACCGGGGCGTTTGTCGAAGTAGATGGGACAGATC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231373	GCAAACAGGAATGAACACCGGGGCGTTTGTCGAAGTAGATGGGACAGATC	231422

CU210848.9	1151	TAATATCCCCGAAAGGAAGGGGGCAAAGTGTCCTGTGTGCCGTAAATCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231423	TAATATCCCCGAAAGGAAGGGGGCAAAGTGTCCTGTGTGCCGTAAATCAT	231472

CU210848.9	1201	GTCCTCGGTGCTGTGGAGCATTGCTTCCGTGGACGGAGCTGGAGGGCTTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231473	GTCCTCGGTGCTGTGGAGCATTGCTTCCGTGGACGGAGCTGGAGGGCTTC	231522

CU210848.9	1251	AGCTGGTTCTCCTGGGTCAGGGTGGTCTGTGAGAGAGAAGGGCCTCCAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231523	AGCTGGTTCTCCTGGGTCAGGGTGGTCTGTGAGAGAGAAGGGCCTCCAAG	231572

CU210848.9	1301	TTTCAAAGCTACACGGGTGTGTGAAGCGCATGGCTCTGGTTGAGGGACCG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231573	TTTCAAAGCTACACGGGTGTGTGAAGCGCATGGCTCTGGTTGAGGGACCG	231622

CU210848.9	1351	GGCAAAAGCAACACAAATTTACAACGCGCTAATCCCACCTACAGACTTTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231623	GGCAAAAGCAACACAAATTTACAACGCGCTAATCCCACCTACAGACTTTT	231672

CU210848.9	1401	CCCTGATGCCAGGCCTGTATTAAATTAGGGTGGAAAATTCTGACCTGTTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231673	CCCTGATGCCAGGCCTGTATTAAATTAGGGTGGAAAATTCTGACCTGTTC	231722

CU210848.9	1451	AGTTCACTGCAACTCTTCTGTGTGGGGGCATTTACAGTACATGCCTGGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231723	AGTTCACTGCAACTCTTCTGTGTGGGGGCATTTACAGTACATGCCTGGCA	231772

CU210848.9	1501	GATGTGTTAGGGCTGTTTCTAGGGGTTTTCTTGAATATATAATCTCTATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231773	GATGTGTTAGGGCTGTTTCTAGGGGTTTTCTTGAATATATAATCTCTATC	231822

CU210848.9	1551	TAAAATACTAATATTTAATCTTTCCCCAGCAATACACTGGAAGAGTACCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231823	TAAAATACTAATATTTAATCTTTCCCCAGCAATACACTGGAAGAGTACCA	231872

CU210848.9	1601	TTCACCAAGCAAGAGCCGAGCCCAGTCTTGTACCCTGAAGCAGCTCCTTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231873	TTCACCAAGCAAGAGCCGAGCCCAGTCTTGTACCCTGAAGCAGCTCCTTC	231922

CU210848.9	1651	TCTACGGGCGTGGGTAGAGGCCCCTGTACCCGGCAGCCTCCAGACTCCAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231923	TCTACGGGCGTGGGTAGAGGCCCCTGTACCCGGCAGCCTCCAGACTCCAC	231972

CU210848.9	1701	CTCAGGTGTCAGCTCTTTCCTGTTGCCAACCTCTGGTTTGGATTCTCGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	231973	CTCAGGTGTCAGCTCTTTCCTGTTGCCAACCTCTGGTTTGGATTCTCGCA	232022

CU210848.9	1751	TTGGTTTCCACGTTGGGGCAACTGTGTAGGGTTTAGTGCTGCTGCTGGAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	232023	TTGGTTTCCACGTTGGGGCAACTGTGTAGGGTTTAGTGCTGCTGCTGGAC	232072

CU210848.9	1801	CCCTTTAAAGCGGTCATTGTGAGCGTGGAGGTAGCTCAGTGGTAGGAAGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	232073	CCCTTTAAAGCGGTCATTGTGAGCGTGGAGGTAGCTCAGTGGTAGGAAGT	232122

CU210848.9	1851	ATAAGGCCCTGGCTTTGATTCATAATGCAAAATAAATTAGGAAATAAACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	232123	ATAAGGCCCTGGCTTTGATTCATAATGCAAAATAAATTAGGAAATAAACA	232172

CU210848.9	1901	TAAATGATACATACATAAATACATTCTGGTTGTTGTTTTCTGTGTGCCCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	232173	TAAATGATACATACATAAATACATTCTGGTTGTTGTTTTCTGTGTGCCCC	232222

CU210848.9	1951	ACAGTTGGACTTAACCCTGCCTTTTTAACCAAGACCAGCTCCGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207396.16	232223	ACAGTTGGACTTAACCCTGCCTTTTTAACCAAGACCAGCTCCGGGAATTC	232272

Overview

Query
CU210848.9 - 157408 bps
Hit
CU207396.16 - 232272 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link