<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU302421.25	1	GCTAGGAGTTCAGCATGGTGAGAACAGCCCGAACCGGGGTGGGACCCACG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128015	GCTAGGAGTTCAGCATGGTGAGAACAGCCCGAACCGGGGTGGGACCCACG	128064

CU302421.25	51	GGAGGGAGAACGCCATCTCCTCAGAGTCTGGGGTCCTGTGAGGGTGAGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128065	GGAGGGAGAACGCCATCTCCTCAGAGTCTGGGGTCCTGTGAGGGTGAGCA	128114

CU302421.25	101	AGCGAAGCGGCTGGGAGCCCGCTTCTCCTCTCCCAGGTCCCCGGCAGGGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128115	AGCGAAGCGGCTGGGAGCCCGCTTCTCCTCTCCCAGGTCCCCGGCAGGGG	128164

CU302421.25	151	GTGGGGTGGGATGGGGGTGTTAGGTCTCAGAGCCTGGCATCTCCTCATGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128165	GTGGGGTGGGATGGGGGTGTTAGGTCTCAGAGCCTGGCATCTCCTCATGG	128214

CU302421.25	201	CCCAAACTCTCTCAAGAGGGAGATGCACCTTGGGGTGCAGAACCTGCCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128215	CCCAAACTCTCTCAAGAGGGAGATGCACCTTGGGGTGCAGAACCTGCCTG	128264

CU302421.25	251	GAGTCCCAGCCCAACAGCACCTGACAAAAGAGGCACAAGAGTTCCAGCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128265	GAGTCCCAGCCCAACAGCACCTGACAAAAGAGGCACAAGAGTTCCAGCCT	128314

CU302421.25	301	TAGCCTCGTCCGATTCCAGTCTCGAGAGTGCCGAGATGGGTTTTTGGAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128315	TAGCCTCGTCCGATTCCAGTCTCGAGAGTGCCGAGATGGGTTTTTGGAAA	128364

CU302421.25	351	GGGAACTTTTGTGTTTTCTGATGCCAGTGCCCTTGACTGAGAAAACAATC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128365	GGGAACTTTTGTGTTTTCTGATGCCAGTGCCCTTGACTGAGAAAACAATC	128414

CU302421.25	401	AATCGCCTGGGTTCCAGAAGATTCTAGAAGCTACCAAGCTTTCTGGCCTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128415	AATCGCCTGGGTTCCAGAAGATTCTAGAAGCTACCAAGCTTTCTGGCCTA	128464

CU302421.25	451	ATGCTCACCATAGGAAAGTGAAAGTGAAAGTGACCGAGCCCAGACAGCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128465	ATGCTCACCATAGGAAAGTGAAAGTGAAAGTGACCGAGCCCAGACAGCTT	128514

CU302421.25	501	CAGTTTGGAAATTTAAGAGTCTCTCACGGCCTTTGCTGGTCCCTAGCTTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128515	CAGTTTGGAAATTTAAGAGTCTCTCACGGCCTTTGCTGGTCCCTAGCTTA	128564

CU302421.25	551	CTGTGCAGGGGGAAATCCTCCAGACTCTGATAGTCCTGCCCTCTGCCTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128565	CTGTGCAGGGGGAAATCCTCCAGACTCTGATAGTCCTGCCCTCTGCCTTC	128614

CU302421.25	601	TCTGTCAGAATCACAGATGTTGGCCACCAAACTTCCCAAAGAAGTTTTTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128615	TCTGTCAGAATCACAGATGTTGGCCACCAAACTTCCCAAAGAAGTTTTTG	128664

CU302421.25	651	TATTTTGTGCCTGCAGCTCCTTGTCATGTTAGGTGGTTTATAAGTGGAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128665	TATTTTGTGCCTGCAGCTCCTTGTCATGTTAGGTGGTTTATAAGTGGAAT	128714

CU302421.25	701	CATTTGTGCCCTTTAGAAGGTATATGAGCTATGGTGTGGCATGCCACAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128715	CATTTGTGCCCTTTAGAAGGTATATGAGCTATGGTGTGGCATGCCACAGT	128764

CU302421.25	751	CCCAAACACTATGCAGGCAGAGGTAGGGAACTTGGATGCCCAAGACTAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128765	CCCAAACACTATGCAGGCAGAGGTAGGGAACTTGGATGCCCAAGACTAAT	128814

CU302421.25	801	CTGAGGTAGTGAATTTGAGACCAGCACAGGCTACAAGACCTTAAGGGGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128815	CTGAGGTAGTGAATTTGAGACCAGCACAGGCTACAAGACCTTAAGGGGGA	128864

CU302421.25	851	AAACATAAAACTGAGAACCTTTCTTAAGTTTTTGGTTTGTTTTAAAATGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128865	AAACATAAAACTGAGAACCTTTCTTAAGTTTTTGGTTTGTTTTAAAATGT	128914

CU302421.25	901	GTAGGTGTGTCTTTGGGAAGTGTGTGTTCATGACTGCCATTTCCCAGAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128915	GTAGGTGTGTCTTTGGGAAGTGTGTGTTCATGACTGCCATTTCCCAGAGA	128964

CU302421.25	951	AGCCAGAGAGGGCAGTGACTATCCAGAGGCTGCAGTCATGGGCAGTCCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	128965	AGCCAGAGAGGGCAGTGACTATCCAGAGGCTGCAGTCATGGGCAGTCCCT	129014

CU302421.25	1001	GAAAGAGGAGAACTTAACAAACAAACCATCTCTCCTGCCCTAGGCAGGGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129015	GAAAGAGGAGAACTTAACAAACAAACCATCTCTCCTGCCCTAGGCAGGGA	129064

CU302421.25	1051	ACTTTTTAAAATATCTATATTCACTCAAAAGGAACACATGCTAACAAATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129065	ACTTTTTAAAATATCTATATTCACTCAAAAGGAACACATGCTAACAAATA	129114

CU302421.25	1101	CCAAATGAGATCTAGGTCTAAACAGCCGGAATGTGTTTGTTTTTTTTGAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129115	CCAAATGAGATCTAGGTCTAAACAGCCGGAATGTGTTTGTTTTTTTTGAC	129164

CU302421.25	1151	AGGGTCTCATGGTAAACTCAAACTTGTCTCCCTGCCTTAGCCTCATAATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129165	AGGGTCTCATGGTAAACTCAAACTTGTCTCCCTGCCTTAGCCTCATAATT	129214

CU302421.25	1201	GAGCTAGTTCCTGTCTTGTATCACCACACCTGGCTTGATCATTATTTTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129215	GAGCTAGTTCCTGTCTTGTATCACCACACCTGGCTTGATCATTATTTTTT	129264

CU302421.25	1251	CATTAAGAAATGTATTGAGAAGGCACTTCAGCCCCCATCCTTTTGTTCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129265	CATTAAGAAATGTATTGAGAAGGCACTTCAGCCCCCATCCTTTTGTTCTT	129314

CU302421.25	1301	ATGGTGAAATCCTTGCCGTGCATGGAATTTGGCAACATATTCTAACTTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129315	ATGGTGAAATCCTTGCCGTGCATGGAATTTGGCAACATATTCTAACTTGA	129364

CU302421.25	1351	TTTCTGTTGCTGGGATAAAAACACCAGAGCGACTTTTAGGAGGAAGGGGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129365	TTTCTGTTGCTGGGATAAAAACACCAGAGCGACTTTTAGGAGGAAGGGGT	129414

CU302421.25	1401	TTATTTGACTTCCAGGCTATGTAGTCTGCCAGTGGAAACCCATGCAGGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129415	TTATTTGACTTCCAGGCTATGTAGTCTGCCAGTGGAAACCCATGCAGGAA	129464

CU302421.25	1451	TGAAGGCAAATTATCTCTGTGAGTTCAAGTCAGCCAGGGAAACATAGTGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129465	TGAAGGCAAATTATCTCTGTGAGTTCAAGTCAGCCAGGGAAACATAGTGA	129514

CU302421.25	1501	GACCTTATCTTAAAACAAAAAAGAGAAAGAAAAGTGGCAGGAAACTAGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129515	GACCTTATCTTAAAACAAAAAAGAGAAAGAAAAGTGGCAGGAAACTAGAA	129564

CU302421.25	1551	CGCAAGATTTTCTAGATGGGCAGATAAAAAACACAGTGACTACCCAGGCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129565	CGCAAGATTTTCTAGATGGGCAGATAAAAAACACAGTGACTACCCAGGCT	129614

CU302421.25	1601	AGGGCTGGGTACCCTGGGACCTATTCTGTCTTTTTTATTAGAGTATATCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129615	AGGGCTGGGTACCCTGGGACCTATTCTGTCTTTTTTATTAGAGTATATCT	129664

CU302421.25	1651	TATCCTTTAGACAGGCCACTATTAAAACCACATAGATTATTTTCCAGAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129665	TATCCTTTAGACAGGCCACTATTAAAACCACATAGATTATTTTCCAGAGA	129714

CU302421.25	1701	ATTACTGTGACTGTCCATGATGAGCTAATTGTCGACATTGTATGGTGTGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129715	ATTACTGTGACTGTCCATGATGAGCTAATTGTCGACATTGTATGGTGTGC	129764

CU302421.25	1751	AAGTCTTAAACTTTAATATTTTGAAAAGTGGCAAACATTTATACTCTGGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129765	AAGTCTTAAACTTTAATATTTTGAAAAGTGGCAAACATTTATACTCTGGG	129814

CU302421.25	1801	GTGAACTCCTACTGAAGAGTATGGTTAGCCTCATGTGATGGCTTACATTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129815	GTGAACTCCTACTGAAGAGTATGGTTAGCCTCATGTGATGGCTTACATTT	129864

CU302421.25	1851	CTAATTCTAGAACTTGAGAGGCTGGGGCAAGAGGATTATCACTAGAGAGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129865	CTAATTCTAGAACTTGAGAGGCTGGGGCAAGAGGATTATCACTAGAGAGT	129914

CU302421.25	1901	TCAGAGCGGAACAAGCTGCTCTCTCTCTCGTGTGTGTGTATGTGTTGAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129915	TCAGAGCGGAACAAGCTGCTCTCTCTCTCGTGTGTGTGTATGTGTTGAGA	129964

CU302421.25	1951	TATGGTTGGACTTGAATGTACTTACTCTTTCCTTCTGAGAACTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207395.25	129965	TATGGTTGGACTTGAATGTACTTACTCTTTCCTTCTGAGAACTGGAATTC	130014

Overview

Query
CU302421.25 - 195940 bps
Hit
CU207395.25 - 130014 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link