<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU326367.19	1	ATAAGAATGGGTGGGTCTCAGAGTCGGGGGCAGGGGATGTGATGTTAATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262251	ATAAGAATGGGTGGGTCTCAGAGTCGGGGGCAGGGGATGTGATGTTAATG	262300

CU326367.19	51	TAAACACTGACTAACACCCTCCTTGTTTCTTGGTCTTTCTCAGGACTTCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262301	TAAACACTGACTAACACCCTCCTTGTTTCTTGGTCTTTCTCAGGACTTCT	262350

CU326367.19	101	CTTACACATGTGGCATAGTCGGCTGTGCTGGTTTCAGCTGCACTTCCCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262351	CTTACACATGTGGCATAGTCGGCTGTGCTGGTTTCAGCTGCACTTCCCCT	262400

CU326367.19	151	TTTATGGAAAATATCAACAGGGATTTTTTTTTCATGGCTGGAGGTCTTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262401	TTTATGGAAAATATCAACAGGGATTTTTTTTTCATGGCTGGAGGTCTTTT	262450

CU326367.19	201	CCTCATCTAAATATTAAAGCCTAACAAGTCTTTCAGACTTAGTGGTGCAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262451	CCTCATCTAAATATTAAAGCCTAACAAGTCTTTCAGACTTAGTGGTGCAT	262500

CU326367.19	251	AATCATACTTGTTAATTAGGAGCCGAGTGATGGCTATTAAAAGTTGAAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262501	AATCATACTTGTTAATTAGGAGCCGAGTGATGGCTATTAAAAGTTGAAAG	262550

CU326367.19	301	AGTTTCCTGGTGACGGCTACATGTTTCAACATGATCCCAAGCTCTGTCAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262551	AGTTTCCTGGTGACGGCTACATGTTTCAACATGATCCCAAGCTCTGTCAA	262600

CU326367.19	351	TAACCACAAGGGGAAAAAGAGAGCAAGAGGAAAATGCCTCTCCAGAGCCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262601	TAACCACAAGGGGAAAAAGAGAGCAAGAGGAAAATGCCTCTCCAGAGCCT	262650

CU326367.19	401	TCCATCTGAGAGAAAAGCTAGCGTGTCAGAGCACAGGCTCCACACCACAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262651	TCCATCTGAGAGAAAAGCTAGCGTGTCAGAGCACAGGCTCCACACCACAG	262700

CU326367.19	451	CACCAAGGGAGCCCAGATGGGCAGCTCGGGGCTAGGCTTTACTCAGAGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262701	CACCAAGGGAGCCCAGATGGGCAGCTCGGGGCTAGGCTTTACTCAGAGAG	262750

CU326367.19	501	GGGACAGCAGGACCCGGGGAAGAGCCAGCAGAGTACTAGAATCATTTCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262751	GGGACAGCAGGACCCGGGGAAGAGCCAGCAGAGTACTAGAATCATTTCTC	262800

CU326367.19	551	CTATCAGCTGTGTGAGCTCAAACCTACCACGCAGTCCCTGCCTCAGTTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262801	CTATCAGCTGTGTGAGCTCAAACCTACCACGCAGTCCCTGCCTCAGTTTC	262850

CU326367.19	601	CTCCATAGCTTTACAAGAAGCTCACGGGCTACAGAATAGTGTCTCAATTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262851	CTCCATAGCTTTACAAGAAGCTCACGGGCTACAGAATAGTGTCTCAATTC	262900

CU326367.19	651	CAAGTTCTGCATCTACCAGACAACTGAAAAGTCAATTTTCCAAATATGTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262901	CAAGTTCTGCATCTACCAGACAACTGAAAAGTCAATTTTCCAAATATGTC	262950

CU326367.19	701	AAAAAGCCTAGACGATACACTTTGCCTCTTTCAGAAGCCAAGTGTTCTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	262951	AAAAAGCCTAGACGATACACTTTGCCTCTTTCAGAAGCCAAGTGTTCTGG	263000

CU326367.19	751	ATTATAGCAGCTGGCAACGATAAGCCATGTTTCCGTTGTAGGGAATCCGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263001	ATTATAGCAGCTGGCAACGATAAGCCATGTTTCCGTTGTAGGGAATCCGG	263050

CU326367.19	801	GCATTTGCATATGCTACCTGCTTTGTCTCATGACACCTGTGTCCCTGACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263051	GCATTTGCATATGCTACCTGCTTTGTCTCATGACACCTGTGTCCCTGACA	263100

CU326367.19	851	AGGATGGAAAGACCTGACAGGTGATATGATTTCTCTGAGGTCTGAAGGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263101	AGGATGGAAAGACCTGACAGGTGATATGATTTCTCTGAGGTCTGAAGGTG	263150

CU326367.19	901	GGTGTCATGCCTGACCCACCCCCATCCCTGCCCCCAGTATCTCTTTCTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263151	GGTGTCATGCCTGACCCACCCCCATCCCTGCCCCCAGTATCTCTTTCTTT	263200

CU326367.19	951	CACTCAGTACTATTACTCAGTAGTTCAAGTCTAATTACTAACCTGCGGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263201	CACTCAGTACTATTACTCAGTAGTTCAAGTCTAATTACTAACCTGCGGCC	263250

CU326367.19	1001	AGTTAACCAAGCAGAAATAGAAACTGAGCAGCAAGGAGAGAGAGGAGAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263251	AGTTAACCAAGCAGAAATAGAAACTGAGCAGCAAGGAGAGAGAGGAGAAG	263300

CU326367.19	1051	CCCTCTGAGAAAAGAGATTGCACCTGGCTTCTCTGCACTCAGACAATGTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263301	CCCTCTGAGAAAAGAGATTGCACCTGGCTTCTCTGCACTCAGACAATGTT	263350

CU326367.19	1101	ACTTTTCTATGTCGAACAACCCCCACTCCACACACATACACACACCATTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263351	ACTTTTCTATGTCGAACAACCCCCACTCCACACACATACACACACCATTT	263400

CU326367.19	1151	AATACACTGTGCAACAGAGAGATCAGTCTAAAATAAATTTGTCTTTGGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263401	AATACACTGTGCAACAGAGAGATCAGTCTAAAATAAATTTGTCTTTGGTG	263450

CU326367.19	1201	ACATATTTCTTTAAAACAAATATTAAGCTCAGCTACTGGGGTCTTTGTAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263451	ACATATTTCTTTAAAACAAATATTAAGCTCAGCTACTGGGGTCTTTGTAG	263500

CU326367.19	1251	CATGTTATCAAAATAATGAGACATAACTGCTCCATTTATATACCACATGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263501	CATGTTATCAAAATAATGAGACATAACTGCTCCATTTATATACCACATGC	263550

CU326367.19	1301	CTTTTAATGAAGAGGAAAATATACACATCATTCCACAGACCTGATCTCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263551	CTTTTAATGAAGAGGAAAATATACACATCATTCCACAGACCTGATCTCAA	263600

CU326367.19	1351	ATTTATATTTAGATTATTCAGAAAAAGAATTTTTAAAACAGAAGTAGACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263601	ATTTATATTTAGATTATTCAGAAAAAGAATTTTTAAAACAGAAGTAGACT	263650

CU326367.19	1401	CTTCCCAGAGCTCTAGGCTGGAGGTCTGGGCAGCGGTAGTCAACGCTAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263651	CTTCCCAGAGCTCTAGGCTGGAGGTCTGGGCAGCGGTAGTCAACGCTAGC	263700

CU326367.19	1451	TCAGCCTTACCCAAGATTTCACAAAAGCTACAAGAAGCCACTATGTAGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263701	TCAGCCTTACCCAAGATTTCACAAAAGCTACAAGAAGCCACTATGTAGCA	263750

CU326367.19	1501	ACCCTAGGGCAAACCTGGAATCTTTCCCCAGGAGAGACAGTTTGCAAGAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263751	ACCCTAGGGCAAACCTGGAATCTTTCCCCAGGAGAGACAGTTTGCAAGAC	263800

CU326367.19	1551	AAAGGGCAGGCCAAAAGAAAACCAAAGTTCCCAAGTTCTAGTATGTGGAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263801	AAAGGGCAGGCCAAAAGAAAACCAAAGTTCCCAAGTTCTAGTATGTGGAT	263850

CU326367.19	1601	GAGATTATAACCCCCACACAAAAGTCACTCGTCTACCTGCAACACTGGCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263851	GAGATTATAACCCCCACACAAAAGTCACTCGTCTACCTGCAACACTGGCT	263900

CU326367.19	1651	ACTCTGCAGTTGAGCAAGTGCAGTCTGCAAAATGCTAGCATATGTTTGGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263901	ACTCTGCAGTTGAGCAAGTGCAGTCTGCAAAATGCTAGCATATGTTTGGT	263950

CU326367.19	1701	CTATTTGAAGTTACAGTTGCAGAAGTGGTTTCCTATAACTGATCCCATGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	263951	CTATTTGAAGTTACAGTTGCAGAAGTGGTTTCCTATAACTGATCCCATGT	264000

CU326367.19	1751	GCTTCTCCTCAAATCCTGTGAGTGACAGGTGAGAAAGCTCAGACCCAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	264001	GCTTCTCCTCAAATCCTGTGAGTGACAGGTGAGAAAGCTCAGACCCAAAA	264050

CU326367.19	1801	TCAGTAGCTGGAGCATGGACACTCAGAGGATGGTTTTGTCCCTGCAATGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	264051	TCAGTAGCTGGAGCATGGACACTCAGAGGATGGTTTTGTCCCTGCAATGC	264100

CU326367.19	1851	TGTTAGTGGAACAGCAGCACAAAGCTGGGGTGTGCCATGGTACAAGGCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	264101	TGTTAGTGGAACAGCAGCACAAAGCTGGGGTGTGCCATGGTACAAGGCTC	264150

CU326367.19	1901	AAGGTGCAGACTTCTTCAAGCCAGTATGAACTAGAAAAAGGGCCAGCAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	264151	AAGGTGCAGACTTCTTCAAGCCAGTATGAACTAGAAAAAGGGCCAGCAAG	264200

CU326367.19	1951	AGGGTTCAGTGGGTAAGGGCACTTGAGGCCAAGACTGATGATAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207392.14	264201	AGGGTTCAGTGGGTAAGGGCACTTGAGGCCAAGACTGATGATAGGAATTC	264250

Overview

Query
CU326367.19 - 137473 bps
Hit
CU207392.14 - 264250 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link